MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_013222	C	6	6	1247434	1247439	0 %	0 %	0 %	100 %	260061715
21502	NC_013222	CGA	2	6	1247448	1247453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061715
21503	NC_013222	GCC	2	6	1247501	1247506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061715
21504	NC_013222	CCT	2	6	1247529	1247534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061715
21505	NC_013222	CGG	2	6	1247550	1247555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061715
21506	NC_013222	GC	3	6	1247567	1247572	0 %	0 %	50 %	50 %	260061715
21507	NC_013222	GCAGG	2	10	1247616	1247625	20 %	0 %	60 %	20 %	260061715
21508	NC_013222	TCT	2	6	1247637	1247642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061715
21509	NC_013222	TGA	2	6	1247661	1247666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061715
21510	NC_013222	ATC	2	6	1247675	1247680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061715
21511	NC_013222	CAT	2	6	1247761	1247766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061715
21512	NC_013222	GAT	2	6	1247788	1247793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061715
21513	NC_013222	CCA	3	9	1247835	1247843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061715
21514	NC_013222	GTC	2	6	1247848	1247853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061715
21515	NC_013222	A	7	7	1247914	1247920	100 %	0 %	0 %	0 %	260061715
21516	NC_013222	AAT	2	6	1248040	1248045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061716
21517	NC_013222	TTGA	2	8	1248063	1248070	25 %	50 %	25 %	0 %	260061716
21518	NC_013222	C	6	6	1248072	1248077	0 %	0 %	0 %	100 %	260061716
21519	NC_013222	CA	3	6	1248119	1248124	50 %	0 %	0 %	50 %	260061716
21520	NC_013222	CGGGAA	2	12	1248128	1248139	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260061716
21521	NC_013222	CAAAGC	2	12	1248175	1248186	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260061716
21522	NC_013222	T	6	6	1248264	1248269	0 %	100 %	0 %	0 %	260061716
21523	NC_013222	GGA	2	6	1248338	1248343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061716
21524	NC_013222	CAGG	2	8	1248425	1248432	25 %	0 %	50 %	25 %	260061716
21525	NC_013222	AGG	2	6	1248474	1248479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061716
21526	NC_013222	TTC	2	6	1248489	1248494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061716
21527	NC_013222	AGA	2	6	1248550	1248555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061716
21528	NC_013222	CATC	2	8	1248583	1248590	25 %	25 %	0 %	50 %	260061716
21529	NC_013222	GTT	2	6	1248695	1248700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061716
21530	NC_013222	GTC	2	6	1248725	1248730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061716
21531	NC_013222	TCC	2	6	1248741	1248746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061716
21532	NC_013222	AGG	2	6	1248774	1248779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061716
21533	NC_013222	TTG	2	6	1248780	1248785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061716
21534	NC_013222	A	6	6	1248838	1248843	100 %	0 %	0 %	0 %	260061716
21535	NC_013222	GAA	2	6	1248963	1248968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061716
21536	NC_013222	GTT	2	6	1249000	1249005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061716
21537	NC_013222	CAG	2	6	1249043	1249048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061716
21538	NC_013222	G	6	6	1249048	1249053	0 %	0 %	100 %	0 %	260061716
21539	NC_013222	GGC	2	6	1249100	1249105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061716
21540	NC_013222	T	6	6	1249138	1249143	0 %	100 %	0 %	0 %	260061716
21541	NC_013222	GAT	2	6	1249145	1249150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061716
21542	NC_013222	T	6	6	1249180	1249185	0 %	100 %	0 %	0 %	260061716
21543	NC_013222	CACGAT	2	12	1249202	1249213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260061716
21544	NC_013222	GCC	2	6	1249319	1249324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061716
21545	NC_013222	TCT	2	6	1249350	1249355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061716
21546	NC_013222	GCC	2	6	1249400	1249405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061716
21547	NC_013222	ATCGAT	2	12	1249724	1249735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260061717
21548	NC_013222	ACG	2	6	1249770	1249775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061717
21549	NC_013222	TGC	2	6	1249795	1249800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061717
21550	NC_013222	CAC	2	6	1249835	1249840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061717
21551	NC_013222	GAT	2	6	1249892	1249897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061717
21552	NC_013222	CCCA	2	8	1249971	1249978	25 %	0 %	0 %	75 %	260061717
21553	NC_013222	GCA	2	6	1250002	1250007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061717
21554	NC_013222	GGA	2	6	1250056	1250061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061717
21555	NC_013222	CAT	2	6	1250213	1250218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061718
21556	NC_013222	GCC	3	9	1250228	1250236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061718
21557	NC_013222	TCC	2	6	1250265	1250270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061718
21558	NC_013222	GGT	2	6	1250294	1250299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061718
21559	NC_013222	CTT	2	6	1250351	1250356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061718
21560	NC_013222	GAT	2	6	1250363	1250368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061718
21561	NC_013222	TCA	2	6	1250377	1250382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061718
21562	NC_013222	CGT	2	6	1250407	1250412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061718
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21564	NC_013222	CGG	2	6	1250626	1250631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061718
21565	NC_013222	CGT	2	6	1250650	1250655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061718
21566	NC_013222	CTT	2	6	1250666	1250671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061718
21567	NC_013222	CCG	2	6	1250721	1250726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061718
21568	NC_013222	GAACCG	2	12	1250832	1250843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061718
21569	NC_013222	TCG	2	6	1250851	1250856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061718
21570	NC_013222	CTC	2	6	1250933	1250938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061718
21571	NC_013222	GCG	2	6	1250990	1250995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061718
21572	NC_013222	GCG	2	6	1251021	1251026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061718
21573	NC_013222	ACC	2	6	1251054	1251059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061718
21574	NC_013222	GAT	2	6	1251095	1251100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061718
21575	NC_013222	CAG	2	6	1251101	1251106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061718
21576	NC_013222	GCA	2	6	1251142	1251147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061718
21577	NC_013222	TGG	2	6	1251157	1251162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061718
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21581	NC_013222	CCTT	2	8	1251327	1251334	0 %	50 %	0 %	50 %	260061718
21582	NC_013222	TTG	2	6	1251342	1251347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061718
21583	NC_013222	TCGTC	2	10	1251373	1251382	0 %	40 %	20 %	40 %	260061718
21584	NC_013222	GTT	2	6	1251383	1251388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061718
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21586	NC_013222	GGC	2	6	1251398	1251403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061718
21587	NC_013222	T	6	6	1251437	1251442	0 %	100 %	0 %	0 %	260061718
21588	NC_013222	GCTT	2	8	1251444	1251451	0 %	50 %	25 %	25 %	260061718
21589	NC_013222	CGA	2	6	1251463	1251468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061718
21590	NC_013222	CCTT	2	8	1251540	1251547	0 %	50 %	0 %	50 %	260061718
21591	NC_013222	AGT	2	6	1251575	1251580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061718
21592	NC_013222	CCT	2	6	1251619	1251624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061718
21593	NC_013222	ACC	2	6	1251702	1251707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061718
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21597	NC_013222	GCCG	2	8	1252365	1252372	0 %	0 %	50 %	50 %	260061720
21598	NC_013222	CCT	2	6	1252448	1252453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061720
21599	NC_013222	ACC	2	6	1252564	1252569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061720
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21602	NC_013222	ATT	2	6	1252693	1252698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061720
21603	NC_013222	T	6	6	1252759	1252764	0 %	100 %	0 %	0 %	260061721
21604	NC_013222	T	6	6	1252805	1252810	0 %	100 %	0 %	0 %	260061721
21605	NC_013222	TCA	2	6	1252852	1252857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061721
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21607	NC_013222	CTGC	2	8	1252915	1252922	0 %	25 %	25 %	50 %	260061721
21608	NC_013222	TCGGG	2	10	1253002	1253011	0 %	20 %	60 %	20 %	260061721
21609	NC_013222	C	6	6	1253034	1253039	0 %	0 %	0 %	100 %	260061721
21610	NC_013222	GGC	2	6	1253170	1253175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061721
21611	NC_013222	CCA	2	6	1253320	1253325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061721
21612	NC_013222	CCT	2	6	1253356	1253361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061721
21613	NC_013222	TGA	2	6	1253443	1253448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061721
21614	NC_013222	GCC	2	6	1253556	1253561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061721
21615	NC_013222	CTT	2	6	1253587	1253592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061721
21616	NC_013222	TGC	2	6	1253634	1253639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061721
21617	NC_013222	TGG	2	6	1253730	1253735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061722
21618	NC_013222	GCG	2	6	1253736	1253741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061722
21619	NC_013222	AGA	2	6	1253782	1253787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061722
21620	NC_013222	CGA	2	6	1253917	1253922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061722
21621	NC_013222	CCAGGT	2	12	1253959	1253970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061722
21622	NC_013222	C	7	7	1254106	1254112	0 %	0 %	0 %	100 %	260061722
21623	NC_013222	AGG	2	6	1254153	1254158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061722
21624	NC_013222	TTTCCT	2	12	1254305	1254316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061723
21625	NC_013222	TTC	2	6	1254330	1254335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061723
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21627	NC_013222	TGGGG	2	10	1254370	1254379	0 %	20 %	80 %	0 %	260061723
21628	NC_013222	CGG	2	6	1254431	1254436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061723
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21630	NC_013222	TTC	2	6	1254498	1254503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061723
21631	NC_013222	TGT	2	6	1254518	1254523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061723
21632	NC_013222	CTT	2	6	1254549	1254554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061723
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21641	NC_013222	CTTTTC	2	12	1254960	1254971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061723
21642	NC_013222	CATATT	2	12	1254984	1254995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	260061723
21643	NC_013222	GCA	2	6	1255076	1255081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061723
21644	NC_013222	GGT	2	6	1255092	1255097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061723
21645	NC_013222	C	6	6	1255134	1255139	0 %	0 %	0 %	100 %	260061723
21646	NC_013222	GAT	2	6	1255293	1255298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061723
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21652	NC_013222	GAT	2	6	1255699	1255704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061724
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21655	NC_013222	CTG	2	6	1255840	1255845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061724
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21692	NC_013222	TGG	2	6	1258219	1258224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061725
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21694	NC_013222	GC	3	6	1258279	1258284	0 %	0 %	50 %	50 %	260061725
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21720	NC_013222	GAC	2	6	1260265	1260270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061726
21721	NC_013222	GGA	2	6	1260282	1260287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061726
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21723	NC_013222	GGC	2	6	1260407	1260412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061726
21724	NC_013222	GAG	3	9	1260469	1260477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061726
21725	NC_013222	CCA	2	6	1260518	1260523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061726
21726	NC_013222	A	6	6	1260637	1260642	100 %	0 %	0 %	0 %	260061726
21727	NC_013222	A	6	6	1260718	1260723	100 %	0 %	0 %	0 %	260061726
21728	NC_013222	CCT	2	6	1260740	1260745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061726
21729	NC_013222	CAAGGG	2	12	1260765	1260776	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260061726
21730	NC_013222	TCA	2	6	1260791	1260796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061726
21731	NC_013222	GAA	2	6	1260865	1260870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061726
21732	NC_013222	AAG	3	9	1260883	1260891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061726
21733	NC_013222	GAG	2	6	1260925	1260930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061726
21734	NC_013222	AAG	2	6	1261057	1261062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061726
21735	NC_013222	A	6	6	1261072	1261077	100 %	0 %	0 %	0 %	260061726
21736	NC_013222	TGC	2	6	1261157	1261162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061727
21737	NC_013222	AGG	2	6	1261205	1261210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061727
21738	NC_013222	CCT	2	6	1261242	1261247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061727
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21743	NC_013222	ATC	2	6	1261423	1261428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061727
21744	NC_013222	GCT	2	6	1261434	1261439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061727
21745	NC_013222	GAG	2	6	1261441	1261446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061727
21746	NC_013222	ATC	2	6	1261450	1261455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061727
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21749	NC_013222	GGA	3	9	1261569	1261577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061727
21750	NC_013222	TCC	2	6	1261585	1261590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061727
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21834	NC_013222	CTG	2	6	1266723	1266728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061731
21835	NC_013222	CGA	3	9	1266764	1266772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061731
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21838	NC_013222	CGA	2	6	1267244	1267249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061732
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21840	NC_013222	CGG	2	6	1267276	1267281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061732
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21843	NC_013222	CGG	2	6	1267432	1267437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061732
21844	NC_013222	CCGG	2	8	1267469	1267476	0 %	0 %	50 %	50 %	260061732
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21846	NC_013222	C	6	6	1267534	1267539	0 %	0 %	0 %	100 %	260061732
21847	NC_013222	CCGG	2	8	1267564	1267571	0 %	0 %	50 %	50 %	260061732
21848	NC_013222	ACC	2	6	1267675	1267680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061732
21849	NC_013222	ATC	2	6	1267710	1267715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061732
21850	NC_013222	T	6	6	1267749	1267754	0 %	100 %	0 %	0 %	260061732
21851	NC_013222	GCA	2	6	1267774	1267779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061732
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21856	NC_013222	GCC	2	6	1268041	1268046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061732
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21870	NC_013222	CGA	2	6	1268876	1268881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061733
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21872	NC_013222	CTGG	2	8	1268907	1268914	0 %	25 %	50 %	25 %	260061733
21873	NC_013222	TCC	2	6	1268921	1268926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061733
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21938	NC_013222	ATC	2	6	1272602	1272607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061736
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21963	NC_013222	GAT	2	6	1273708	1273713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061736
21964	NC_013222	TGG	2	6	1273731	1273736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061736
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