MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013222	GCCC	2	8	1016053	1016060	0 %	0 %	25 %	75 %	260061510
17502	NC_013222	T	6	6	1016086	1016091	0 %	100 %	0 %	0 %	260061510
17503	NC_013222	TGAA	2	8	1016329	1016336	50 %	25 %	25 %	0 %	260061511
17504	NC_013222	CTA	2	6	1016415	1016420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061511
17505	NC_013222	CCT	2	6	1016472	1016477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061511
17506	NC_013222	CAA	2	6	1016685	1016690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061511
17507	NC_013222	GCA	3	9	1016768	1016776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061511
17508	NC_013222	CCT	2	6	1016796	1016801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061511
17509	NC_013222	CCG	2	6	1016835	1016840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061511
17510	NC_013222	AAC	2	6	1016893	1016898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061511
17511	NC_013222	CCA	2	6	1016924	1016929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061511
17512	NC_013222	GAG	2	6	1016983	1016988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061511
17513	NC_013222	GGA	2	6	1017105	1017110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061511
17514	NC_013222	TCA	2	6	1017128	1017133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061511
17515	NC_013222	AAG	2	6	1017278	1017283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061512
17516	NC_013222	ACG	2	6	1017350	1017355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061512
17517	NC_013222	AAG	2	6	1017400	1017405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061512
17518	NC_013222	TGG	2	6	1017421	1017426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061512
17519	NC_013222	ACA	2	6	1017542	1017547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061512
17520	NC_013222	AGG	2	6	1017623	1017628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061512
17521	NC_013222	GCC	2	6	1017637	1017642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061512
17522	NC_013222	CGATA	2	10	1017720	1017729	40 %	20 %	20 %	20 %	260061512
17523	NC_013222	GGAC	2	8	1017833	1017840	25 %	0 %	50 %	25 %	260061512
17524	NC_013222	GAAAT	2	10	1018016	1018025	60 %	20 %	20 %	0 %	260061512
17525	NC_013222	CCGG	2	8	1018089	1018096	0 %	0 %	50 %	50 %	260061512
17526	NC_013222	AGA	2	6	1018103	1018108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061512
17527	NC_013222	GGC	2	6	1018128	1018133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061512
17528	NC_013222	GAG	2	6	1018168	1018173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061512
17529	NC_013222	GCC	2	6	1018222	1018227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061512
17530	NC_013222	AAG	2	6	1018324	1018329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061512
17531	NC_013222	GAAC	2	8	1018353	1018360	50 %	0 %	25 %	25 %	260061512
17532	NC_013222	GTG	2	6	1018375	1018380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061512
17533	NC_013222	AGG	2	6	1018436	1018441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061512
17534	NC_013222	CCAA	2	8	1018498	1018505	50 %	0 %	0 %	50 %	260061512
17535	NC_013222	GGC	2	6	1018506	1018511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061512
17536	NC_013222	ACG	2	6	1018598	1018603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061512
17537	NC_013222	GCG	2	6	1018620	1018625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061512
17538	NC_013222	CGC	2	6	1018641	1018646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061512
17539	NC_013222	ACC	2	6	1018673	1018678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061512
17540	NC_013222	CGGG	2	8	1018767	1018774	0 %	0 %	75 %	25 %	260061512
17541	NC_013222	GGC	2	6	1018857	1018862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061513
17542	NC_013222	TAG	2	6	1018879	1018884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061513
17543	NC_013222	GTA	3	9	1018902	1018910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061513
17544	NC_013222	C	6	6	1018923	1018928	0 %	0 %	0 %	100 %	260061513
17545	NC_013222	GTT	2	6	1018980	1018985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061513
17546	NC_013222	GCCC	2	8	1019001	1019008	0 %	0 %	25 %	75 %	260061513
17547	NC_013222	GCC	2	6	1019015	1019020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061513
17548	NC_013222	GGGAT	2	10	1019098	1019107	20 %	20 %	60 %	0 %	260061513
17549	NC_013222	AAT	2	6	1019210	1019215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061513
17550	NC_013222	GAAA	2	8	1019266	1019273	75 %	0 %	25 %	0 %	260061513
17551	NC_013222	TCC	2	6	1019357	1019362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061513
17552	NC_013222	CAG	2	6	1019397	1019402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061513
17553	NC_013222	GGC	2	6	1019424	1019429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061513
17554	NC_013222	TCC	2	6	1019542	1019547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061513
17555	NC_013222	AGGT	2	8	1019581	1019588	25 %	25 %	50 %	0 %	260061513
17556	NC_013222	GAA	2	6	1019589	1019594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061513
17557	NC_013222	GCA	2	6	1019630	1019635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061513
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17559	NC_013222	CGG	2	6	1019791	1019796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061513
17560	NC_013222	TTG	2	6	1019803	1019808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061513
17561	NC_013222	CTGCC	2	10	1019833	1019842	0 %	20 %	20 %	60 %	260061513
17562	NC_013222	GTT	2	6	1019844	1019849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061513
17563	NC_013222	C	7	7	1019903	1019909	0 %	0 %	0 %	100 %	260061513
17564	NC_013222	GC	3	6	1019913	1019918	0 %	0 %	50 %	50 %	260061513
17565	NC_013222	C	6	6	1019928	1019933	0 %	0 %	0 %	100 %	260061513
17566	NC_013222	CCCAAA	2	12	1019970	1019981	50 %	0 %	0 %	50 %	260061513
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17591	NC_013222	TCG	2	6	1021431	1021436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061514
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17600	NC_013222	GGCCG	2	10	1021823	1021832	0 %	0 %	60 %	40 %	260061515
17601	NC_013222	CTGC	2	8	1021841	1021848	0 %	25 %	25 %	50 %	260061515
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17604	NC_013222	AAAG	2	8	1021934	1021941	75 %	0 %	25 %	0 %	260061515
17605	NC_013222	CGACC	2	10	1021974	1021983	20 %	0 %	20 %	60 %	260061515
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17608	NC_013222	CGCC	2	8	1022096	1022103	0 %	0 %	25 %	75 %	260061515
17609	NC_013222	GCG	2	6	1022185	1022190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061515
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17615	NC_013222	CCGGG	2	10	1022363	1022372	0 %	0 %	60 %	40 %	260061515
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17617	NC_013222	AAGT	2	8	1022568	1022575	50 %	25 %	25 %	0 %	260061516
17618	NC_013222	GAT	2	6	1022731	1022736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061516
17619	NC_013222	GGT	2	6	1022776	1022781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061516
17620	NC_013222	ACC	2	6	1022831	1022836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061516
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17622	NC_013222	GCA	2	6	1022934	1022939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061516
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17733	NC_013222	CGGA	2	8	1028382	1028389	25 %	0 %	50 %	25 %	260061521
17734	NC_013222	A	6	6	1028545	1028550	100 %	0 %	0 %	0 %	260061522
17735	NC_013222	TCT	2	6	1028564	1028569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061522
17736	NC_013222	CTAC	2	8	1028581	1028588	25 %	25 %	0 %	50 %	260061522
17737	NC_013222	GATATG	2	12	1028750	1028761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061522
17738	NC_013222	ATC	2	6	1028768	1028773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061522
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17833	NC_013222	GGGC	2	8	1034012	1034019	0 %	0 %	75 %	25 %	260061526
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17843	NC_013222	GGGT	2	8	1034495	1034502	0 %	25 %	75 %	0 %	260061526
17844	NC_013222	GCA	3	9	1034559	1034567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061526
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17847	NC_013222	GCC	2	6	1034653	1034658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061526
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17849	NC_013222	ACC	2	6	1034875	1034880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061526
17850	NC_013222	ACA	2	6	1034897	1034902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061526
17851	NC_013222	CACC	2	8	1034937	1034944	25 %	0 %	0 %	75 %	260061526
17852	NC_013222	TTCC	2	8	1034979	1034986	0 %	50 %	0 %	50 %	260061526
17853	NC_013222	ACGG	2	8	1035028	1035035	25 %	0 %	50 %	25 %	260061526
17854	NC_013222	AGA	2	6	1035077	1035082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061526
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17862	NC_013222	CGG	2	6	1035618	1035623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061526
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17865	NC_013222	GGC	2	6	1035792	1035797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061526
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17951	NC_013222	ACC	2	6	1041364	1041369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061532
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17953	NC_013222	A	6	6	1041492	1041497	100 %	0 %	0 %	0 %	260061532
17954	NC_013222	TCA	2	6	1041547	1041552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061532
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17958	NC_013222	CGATA	2	10	1041610	1041619	40 %	20 %	20 %	20 %	260061532
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17960	NC_013222	CAG	2	6	1041656	1041661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061532
17961	NC_013222	CGA	2	6	1041670	1041675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061532
17962	NC_013222	GCAA	2	8	1041705	1041712	50 %	0 %	25 %	25 %	260061532
17963	NC_013222	CCA	2	6	1041769	1041774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061532
17964	NC_013222	CCA	2	6	1041784	1041789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061532
17965	NC_013222	GAA	2	6	1041827	1041832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061532
17966	NC_013222	AGGA	2	8	1041849	1041856	50 %	0 %	50 %	0 %	260061532
17967	NC_013222	ATC	2	6	1041924	1041929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061532
17968	NC_013222	CGG	2	6	1042164	1042169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061533
17969	NC_013222	CGG	2	6	1042199	1042204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061533
17970	NC_013222	CGC	2	6	1042207	1042212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061533
17971	NC_013222	CCG	2	6	1042263	1042268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061533
17972	NC_013222	CTG	2	6	1042412	1042417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061533
17973	NC_013222	GGA	2	6	1042518	1042523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061533
17974	NC_013222	GAC	2	6	1042535	1042540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061533
17975	NC_013222	ACG	2	6	1042650	1042655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061533
17976	NC_013222	CTG	2	6	1042703	1042708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061533
17977	NC_013222	TGA	2	6	1042722	1042727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061533
17978	NC_013222	CCAG	2	8	1042777	1042784	25 %	0 %	25 %	50 %	260061533
17979	NC_013222	CGGC	2	8	1042812	1042819	0 %	0 %	50 %	50 %	260061533
17980	NC_013222	GTT	2	6	1042842	1042847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061533
17981	NC_013222	T	6	6	1042867	1042872	0 %	100 %	0 %	0 %	260061533
17982	NC_013222	GCT	2	6	1042949	1042954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061533
17983	NC_013222	CAC	2	6	1043042	1043047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061533
17984	NC_013222	T	7	7	1043143	1043149	0 %	100 %	0 %	0 %	260061533
17985	NC_013222	CAC	2	6	1043212	1043217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061533
17986	NC_013222	GAT	2	6	1043219	1043224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061533
17987	NC_013222	GAA	2	6	1043252	1043257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061533
17988	NC_013222	GGCC	2	8	1043357	1043364	0 %	0 %	50 %	50 %	260061534
17989	NC_013222	GGA	2	6	1043404	1043409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061534
17990	NC_013222	GCCC	2	8	1043655	1043662	0 %	0 %	25 %	75 %	260061534
17991	NC_013222	CCA	2	6	1043675	1043680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061534
17992	NC_013222	CGG	2	6	1043724	1043729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061534
17993	NC_013222	TGCG	2	8	1043873	1043880	0 %	25 %	50 %	25 %	260061534
17994	NC_013222	CG	3	6	1043920	1043925	0 %	0 %	50 %	50 %	260061534
17995	NC_013222	ACC	2	6	1044007	1044012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061534
17996	NC_013222	CAA	2	6	1044243	1044248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061534
17997	NC_013222	CTG	2	6	1044424	1044429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061534
17998	NC_013222	ACGAC	2	10	1044550	1044559	40 %	0 %	20 %	40 %	260061535
17999	NC_013222	CGGG	2	8	1044690	1044697	0 %	0 %	75 %	25 %	260061535
18000	NC_013222	GGC	2	6	1044727	1044732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061535

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