MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013222	GAT	2	6	931353	931358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061432
16002	NC_013222	TGC	2	6	931364	931369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061432
16003	NC_013222	TGG	2	6	931450	931455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061432
16004	NC_013222	GGC	2	6	931521	931526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061432
16005	NC_013222	GGCC	2	8	931552	931559	0 %	0 %	50 %	50 %	260061432
16006	NC_013222	GTT	2	6	931571	931576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061432
16007	NC_013222	TTC	2	6	931600	931605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061432
16008	NC_013222	GGGAA	2	10	931658	931667	40 %	0 %	60 %	0 %	260061432
16009	NC_013222	T	6	6	931704	931709	0 %	100 %	0 %	0 %	260061432
16010	NC_013222	T	6	6	931740	931745	0 %	100 %	0 %	0 %	260061432
16011	NC_013222	CTG	2	6	931894	931899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061433
16012	NC_013222	ATG	2	6	931901	931906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061433
16013	NC_013222	CAC	2	6	931975	931980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061433
16014	NC_013222	AGGC	2	8	932022	932029	25 %	0 %	50 %	25 %	260061433
16015	NC_013222	GGAT	2	8	932039	932046	25 %	25 %	50 %	0 %	260061433
16016	NC_013222	TGA	2	6	932049	932054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061433
16017	NC_013222	GCA	2	6	932139	932144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061433
16018	NC_013222	CCG	2	6	932156	932161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061433
16019	NC_013222	GGC	2	6	932173	932178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061433
16020	NC_013222	ACC	2	6	932225	932230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061433
16021	NC_013222	GTT	2	6	932242	932247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061433
16022	NC_013222	ATG	2	6	932339	932344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061433
16023	NC_013222	TTG	2	6	932542	932547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061434
16024	NC_013222	GGT	2	6	932573	932578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061434
16025	NC_013222	AAGC	2	8	932584	932591	50 %	0 %	25 %	25 %	260061434
16026	NC_013222	GAG	2	6	932727	932732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061434
16027	NC_013222	AGT	3	9	932868	932876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061435
16028	NC_013222	GAA	2	6	932937	932942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061435
16029	NC_013222	T	6	6	933037	933042	0 %	100 %	0 %	0 %	260061435
16030	NC_013222	AGG	2	6	933050	933055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061435
16031	NC_013222	CGG	2	6	933180	933185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
16032	NC_013222	T	6	6	933253	933258	0 %	100 %	0 %	0 %	260061435
16033	NC_013222	GAT	2	6	933267	933272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061435
16034	NC_013222	GAT	2	6	933366	933371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061435
16035	NC_013222	GTC	2	6	933412	933417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061435
16036	NC_013222	CGG	2	6	933420	933425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
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16038	NC_013222	CATG	2	8	933471	933478	25 %	25 %	25 %	25 %	260061435
16039	NC_013222	GGC	2	6	933559	933564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
16040	NC_013222	GGT	2	6	933627	933632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061435
16041	NC_013222	CGG	3	9	933633	933641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061435
16042	NC_013222	AGC	2	6	933646	933651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061435
16043	NC_013222	C	6	6	933671	933676	0 %	0 %	0 %	100 %	260061435
16044	NC_013222	GGT	2	6	933693	933698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061435
16045	NC_013222	CTGC	2	8	933714	933721	0 %	25 %	25 %	50 %	260061435
16046	NC_013222	GAA	2	6	933742	933747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061435
16047	NC_013222	C	6	6	933779	933784	0 %	0 %	0 %	100 %	260061435
16048	NC_013222	CCA	2	6	933857	933862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061435
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16050	NC_013222	C	6	6	933945	933950	0 %	0 %	0 %	100 %	260061435
16051	NC_013222	GGT	2	6	933966	933971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061435
16052	NC_013222	CAA	2	6	934008	934013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061435
16053	NC_013222	AGG	2	6	934149	934154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061436
16054	NC_013222	T	9	9	934162	934170	0 %	100 %	0 %	0 %	260061436
16055	NC_013222	GC	3	6	934222	934227	0 %	0 %	50 %	50 %	260061436
16056	NC_013222	TCC	2	6	934230	934235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061436
16057	NC_013222	CGGT	2	8	934238	934245	0 %	25 %	50 %	25 %	260061436
16058	NC_013222	CAA	2	6	934246	934251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061436
16059	NC_013222	CAT	2	6	934321	934326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061436
16060	NC_013222	CCG	2	6	934353	934358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061436
16061	NC_013222	GAAC	2	8	934414	934421	50 %	0 %	25 %	25 %	260061436
16062	NC_013222	AAC	2	6	934602	934607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061436
16063	NC_013222	GAATTT	2	12	934670	934681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260061436
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16066	NC_013222	ACT	2	6	934951	934956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061437
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16068	NC_013222	GGA	2	6	935049	935054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061437
16069	NC_013222	GCCGG	2	10	935158	935167	0 %	0 %	60 %	40 %	260061437
16070	NC_013222	A	7	7	935222	935228	100 %	0 %	0 %	0 %	260061437
16071	NC_013222	ACT	2	6	935237	935242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061437
16072	NC_013222	GGA	2	6	935259	935264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061437
16073	NC_013222	A	6	6	935303	935308	100 %	0 %	0 %	0 %	260061437
16074	NC_013222	CGGCC	2	10	935416	935425	0 %	0 %	40 %	60 %	260061438
16075	NC_013222	GAT	2	6	935452	935457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061438
16076	NC_013222	CCGGAT	2	12	935521	935532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061438
16077	NC_013222	GAA	2	6	935549	935554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061438
16078	NC_013222	GGT	3	9	935626	935634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061438
16079	NC_013222	GAG	2	6	935690	935695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061438
16080	NC_013222	TCC	2	6	935748	935753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061438
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16082	NC_013222	GGGC	2	8	935827	935834	0 %	0 %	75 %	25 %	260061438
16083	NC_013222	AAG	2	6	935846	935851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061438
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16085	NC_013222	CAA	2	6	936004	936009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061438
16086	NC_013222	ATC	2	6	936032	936037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
16087	NC_013222	ACA	2	6	936066	936071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061438
16088	NC_013222	TCG	2	6	936081	936086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061438
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16091	NC_013222	GAT	2	6	936220	936225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061438
16092	NC_013222	GAT	2	6	936232	936237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061438
16093	NC_013222	TCA	2	6	936402	936407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
16094	NC_013222	AT	3	6	936445	936450	50 %	50 %	0 %	0 %	260061438
16095	NC_013222	GC	3	6	936567	936572	0 %	0 %	50 %	50 %	260061438
16096	NC_013222	TAC	2	6	936644	936649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061438
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16099	NC_013222	GGC	2	6	936745	936750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061438
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16103	NC_013222	CGG	2	6	937178	937183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061439
16104	NC_013222	TCCGC	2	10	937254	937263	0 %	20 %	20 %	60 %	260061439
16105	NC_013222	CTG	2	6	937283	937288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061439
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16109	NC_013222	GTG	2	6	937333	937338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061439
16110	NC_013222	CATT	2	8	937416	937423	25 %	50 %	0 %	25 %	260061439
16111	NC_013222	T	6	6	937422	937427	0 %	100 %	0 %	0 %	260061439
16112	NC_013222	G	6	6	937499	937504	0 %	0 %	100 %	0 %	260061439
16113	NC_013222	TTG	2	6	937526	937531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061439
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16120	NC_013222	A	6	6	937954	937959	100 %	0 %	0 %	0 %	260061439
16121	NC_013222	GAT	2	6	937978	937983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061439
16122	NC_013222	TTC	2	6	938002	938007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061439
16123	NC_013222	TGG	2	6	938101	938106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061440
16124	NC_013222	TCC	2	6	938282	938287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061440
16125	NC_013222	GCT	2	6	938303	938308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061440
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16130	NC_013222	GCA	2	6	938776	938781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061441
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16139	NC_013222	CCGG	2	8	939524	939531	0 %	0 %	50 %	50 %	260061442
16140	NC_013222	TGT	2	6	939556	939561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061442
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16142	NC_013222	GT	4	8	939591	939598	0 %	50 %	50 %	0 %	260061442
16143	NC_013222	GGTC	2	8	939616	939623	0 %	25 %	50 %	25 %	260061442
16144	NC_013222	A	6	6	939629	939634	100 %	0 %	0 %	0 %	260061442
16145	NC_013222	CCGGG	2	10	939650	939659	0 %	0 %	60 %	40 %	260061442
16146	NC_013222	GTC	2	6	939698	939703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061442
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16148	NC_013222	A	7	7	939971	939977	100 %	0 %	0 %	0 %	260061442
16149	NC_013222	TGC	2	6	940093	940098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061442
16150	NC_013222	CA	3	6	940247	940252	50 %	0 %	0 %	50 %	260061443
16151	NC_013222	CTC	2	6	940277	940282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061443
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16153	NC_013222	CAT	2	6	940316	940321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061443
16154	NC_013222	GCA	2	6	940384	940389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061443
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16158	NC_013222	TGG	2	6	940501	940506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061443
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16214	NC_013222	CAG	2	6	943221	943226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061445
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16226	NC_013222	GCA	2	6	943720	943725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061445
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16228	NC_013222	GAG	2	6	943770	943775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061445
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16230	NC_013222	CCA	2	6	943823	943828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061445
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16232	NC_013222	GAT	2	6	943914	943919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061445
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16237	NC_013222	GAA	2	6	944095	944100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061445
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16239	NC_013222	GAT	2	6	944115	944120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061445
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16359	NC_013222	CGG	2	6	950092	950097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061451
16360	NC_013222	AGC	2	6	950106	950111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061451
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16363	NC_013222	TCA	2	6	950376	950381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061452
16364	NC_013222	CTG	2	6	950386	950391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061452
16365	NC_013222	CCG	2	6	950405	950410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061452
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16367	NC_013222	TCG	2	6	950508	950513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061452
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16369	NC_013222	ATG	2	6	950639	950644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061452
16370	NC_013222	CGG	2	6	950709	950714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061452
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16374	NC_013222	GCTG	2	8	950940	950947	0 %	25 %	50 %	25 %	260061452
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16393	NC_013222	T	6	6	951993	951998	0 %	100 %	0 %	0 %	260061453
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16420	NC_013222	CAG	2	6	953491	953496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061454
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16460	NC_013222	AAGG	2	8	955846	955853	50 %	0 %	50 %	0 %	260061457
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16470	NC_013222	AGAAC	2	10	956238	956247	60 %	0 %	20 %	20 %	260061457
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16474	NC_013222	CTATT	2	10	956440	956449	20 %	60 %	0 %	20 %	260061457
16475	NC_013222	GGCC	2	8	956523	956530	0 %	0 %	50 %	50 %	260061457
16476	NC_013222	CTA	2	6	956538	956543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061457
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16480	NC_013222	CAA	2	6	956661	956666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061457
16481	NC_013222	GCC	2	6	956674	956679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061457
16482	NC_013222	GAA	2	6	956713	956718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061457
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