MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013222	GGGAA	2	10	903995	904004	40 %	0 %	60 %	0 %	260061409
15502	NC_013222	C	6	6	904278	904283	0 %	0 %	0 %	100 %	260061410
15503	NC_013222	AGC	2	6	904342	904347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061410
15504	NC_013222	TGCC	2	8	904451	904458	0 %	25 %	25 %	50 %	260061410
15505	NC_013222	GTTT	2	8	904513	904520	0 %	75 %	25 %	0 %	260061410
15506	NC_013222	TCC	2	6	904530	904535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061410
15507	NC_013222	AAG	2	6	904541	904546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061410
15508	NC_013222	T	6	6	904596	904601	0 %	100 %	0 %	0 %	260061410
15509	NC_013222	GAG	2	6	904703	904708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061410
15510	NC_013222	ATCA	2	8	905127	905134	50 %	25 %	0 %	25 %	260061411
15511	NC_013222	GAT	2	6	905167	905172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
15512	NC_013222	AAAT	2	8	905262	905269	75 %	25 %	0 %	0 %	260061411
15513	NC_013222	TAA	2	6	905278	905283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
15514	NC_013222	CAAA	2	8	905312	905319	75 %	0 %	0 %	25 %	260061411
15515	NC_013222	TTAA	2	8	905363	905370	50 %	50 %	0 %	0 %	260061411
15516	NC_013222	AC	3	6	905381	905386	50 %	0 %	0 %	50 %	260061411
15517	NC_013222	CGA	2	6	905412	905417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061411
15518	NC_013222	GAT	2	6	905488	905493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
15519	NC_013222	A	7	7	905575	905581	100 %	0 %	0 %	0 %	260061411
15520	NC_013222	AGA	2	6	905588	905593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
15521	NC_013222	T	6	6	905630	905635	0 %	100 %	0 %	0 %	260061411
15522	NC_013222	GAAGG	2	10	905636	905645	40 %	0 %	60 %	0 %	260061411
15523	NC_013222	ATG	2	6	905670	905675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
15524	NC_013222	GAG	2	6	905702	905707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061411
15525	NC_013222	ATG	2	6	905718	905723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
15526	NC_013222	AATCC	2	10	905734	905743	40 %	20 %	0 %	40 %	260061411
15527	NC_013222	A	6	6	905776	905781	100 %	0 %	0 %	0 %	260061411
15528	NC_013222	AAG	2	6	905879	905884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
15529	NC_013222	ATC	2	6	905916	905921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061411
15530	NC_013222	CTC	2	6	905929	905934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061411
15531	NC_013222	GATTT	2	10	905945	905954	20 %	60 %	20 %	0 %	260061411
15532	NC_013222	GATAA	2	10	905969	905978	60 %	20 %	20 %	0 %	260061411
15533	NC_013222	TTA	2	6	906008	906013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061411
15534	NC_013222	CTA	2	6	906075	906080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061411
15535	NC_013222	ATC	2	6	906144	906149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061411
15536	NC_013222	GAA	2	6	906227	906232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
15537	NC_013222	ATG	2	6	906267	906272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
15538	NC_013222	T	7	7	906303	906309	0 %	100 %	0 %	0 %	260061411
15539	NC_013222	ATA	2	6	906333	906338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
15540	NC_013222	GAA	2	6	906370	906375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061411
15541	NC_013222	T	6	6	906404	906409	0 %	100 %	0 %	0 %	260061411
15542	NC_013222	TTGAAA	2	12	906423	906434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260061411
15543	NC_013222	C	6	6	906443	906448	0 %	0 %	0 %	100 %	260061411
15544	NC_013222	AAT	2	6	906475	906480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
15545	NC_013222	TAA	2	6	906561	906566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061411
15546	NC_013222	ATG	2	6	906690	906695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061411
15547	NC_013222	ATT	2	6	906739	906744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061411
15548	NC_013222	AG	3	6	906881	906886	50 %	0 %	50 %	0 %	260061412
15549	NC_013222	GCC	2	6	906941	906946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061412
15550	NC_013222	GCC	2	6	906980	906985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061412
15551	NC_013222	GGC	2	6	907000	907005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061412
15552	NC_013222	CGG	2	6	907086	907091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061412
15553	NC_013222	TGC	2	6	907134	907139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061412
15554	NC_013222	ATC	2	6	907151	907156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061412
15555	NC_013222	GGCC	2	8	907231	907238	0 %	0 %	50 %	50 %	260061412
15556	NC_013222	TCA	2	6	907283	907288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061412
15557	NC_013222	CCA	2	6	907405	907410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061413
15558	NC_013222	TCACG	2	10	907412	907421	20 %	20 %	20 %	40 %	260061413
15559	NC_013222	GCTG	2	8	907426	907433	0 %	25 %	50 %	25 %	260061413
15560	NC_013222	CAA	2	6	907454	907459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061413
15561	NC_013222	ACC	2	6	907651	907656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061413
15562	NC_013222	TTCCAC	2	12	907686	907697	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260061413
15563	NC_013222	TCCATG	2	12	907981	907992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260061414
15564	NC_013222	GGGA	2	8	908023	908030	25 %	0 %	75 %	0 %	260061414
15565	NC_013222	AGC	2	6	908031	908036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
15566	NC_013222	CTG	2	6	908083	908088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061414
15567	NC_013222	CCGG	2	8	908133	908140	0 %	0 %	50 %	50 %	260061414
15568	NC_013222	GATGCA	2	12	908163	908174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260061414
15569	NC_013222	ACG	2	6	908249	908254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
15570	NC_013222	GGGA	2	8	908342	908349	25 %	0 %	75 %	0 %	260061414
15571	NC_013222	TCG	2	6	908405	908410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061414
15572	NC_013222	ACC	3	9	908486	908494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061414
15573	NC_013222	CCCCTA	2	12	908553	908564	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260061414
15574	NC_013222	TTGCGG	2	12	908574	908585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260061414
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15579	NC_013222	C	6	6	908834	908839	0 %	0 %	0 %	100 %	260061414
15580	NC_013222	GCC	2	6	908848	908853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061414
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15584	NC_013222	CGA	2	6	908928	908933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
15585	NC_013222	AATCG	2	10	908934	908943	40 %	20 %	20 %	20 %	260061414
15586	NC_013222	CAGC	2	8	908949	908956	25 %	0 %	25 %	50 %	260061414
15587	NC_013222	CGA	2	6	908982	908987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061414
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15591	NC_013222	GGC	2	6	909147	909152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061414
15592	NC_013222	CG	3	6	909156	909161	0 %	0 %	50 %	50 %	260061414
15593	NC_013222	CGG	2	6	909225	909230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061414
15594	NC_013222	AC	3	6	909231	909236	50 %	0 %	0 %	50 %	260061414
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15600	NC_013222	T	6	6	909614	909619	0 %	100 %	0 %	0 %	260061414
15601	NC_013222	GAG	2	6	909625	909630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061414
15602	NC_013222	GGCAG	2	10	909638	909647	20 %	0 %	60 %	20 %	260061414
15603	NC_013222	GATT	2	8	909694	909701	25 %	50 %	25 %	0 %	260061414
15604	NC_013222	GTA	2	6	909758	909763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061415
15605	NC_013222	GGTGGC	2	12	909871	909882	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260061415
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15607	NC_013222	ATC	2	6	909987	909992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061415
15608	NC_013222	CTT	2	6	910085	910090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061415
15609	NC_013222	CCG	2	6	910155	910160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061415
15610	NC_013222	CG	3	6	910171	910176	0 %	0 %	50 %	50 %	260061415
15611	NC_013222	CTT	2	6	910204	910209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061415
15612	NC_013222	TCCA	2	8	910221	910228	25 %	25 %	0 %	50 %	260061415
15613	NC_013222	GGTC	2	8	910270	910277	0 %	25 %	50 %	25 %	260061415
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15616	NC_013222	GCCAC	2	10	910402	910411	20 %	0 %	20 %	60 %	260061415
15617	NC_013222	GGT	2	6	910459	910464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061415
15618	NC_013222	CTT	2	6	910484	910489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061415
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15620	NC_013222	TGC	3	9	910527	910535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061415
15621	NC_013222	CCA	3	9	910693	910701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061416
15622	NC_013222	TGG	2	6	910711	910716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061416
15623	NC_013222	TGG	2	6	910801	910806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061416
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15740	NC_013222	GAT	2	6	917696	917701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061423
15741	NC_013222	GCT	2	6	917739	917744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061423
15742	NC_013222	TAC	2	6	917772	917777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061423
15743	NC_013222	T	6	6	917807	917812	0 %	100 %	0 %	0 %	260061423
15744	NC_013222	CCA	2	6	917836	917841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061423
15745	NC_013222	GTG	2	6	917850	917855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061423
15746	NC_013222	GGC	2	6	917867	917872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061423
15747	NC_013222	CAA	3	9	917942	917950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061423
15748	NC_013222	CTG	2	6	918015	918020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061423
15749	NC_013222	ATA	2	6	918076	918081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061423
15750	NC_013222	GGGC	2	8	918097	918104	0 %	0 %	75 %	25 %	260061424
15751	NC_013222	CAG	2	6	918135	918140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
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15753	NC_013222	G	6	6	918206	918211	0 %	0 %	100 %	0 %	260061424
15754	NC_013222	ACC	2	6	918262	918267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061424
15755	NC_013222	CAGG	2	8	918278	918285	25 %	0 %	50 %	25 %	260061424
15756	NC_013222	TCCG	2	8	918352	918359	0 %	25 %	25 %	50 %	260061424
15757	NC_013222	CCT	2	6	918443	918448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061424
15758	NC_013222	TGC	2	6	918484	918489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
15759	NC_013222	TGC	2	6	918595	918600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
15760	NC_013222	GGA	2	6	918602	918607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
15761	NC_013222	T	6	6	918658	918663	0 %	100 %	0 %	0 %	260061424
15762	NC_013222	TTC	2	6	918756	918761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061424
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15764	NC_013222	TCC	2	6	918817	918822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061424
15765	NC_013222	CAG	2	6	918858	918863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
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15772	NC_013222	T	6	6	919540	919545	0 %	100 %	0 %	0 %	260061424
15773	NC_013222	CGG	2	6	919569	919574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061424
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15777	NC_013222	CAG	2	6	919965	919970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061424
15778	NC_013222	CCA	2	6	920012	920017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061424
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15783	NC_013222	AGG	2	6	920273	920278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061424
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15794	NC_013222	GTC	2	6	920793	920798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061424
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15847	NC_013222	CGGA	2	8	923321	923328	25 %	0 %	50 %	25 %	260061426
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15851	NC_013222	CCTG	2	8	923501	923508	0 %	25 %	25 %	50 %	260061426
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15855	NC_013222	GAT	2	6	923706	923711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061427
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15859	NC_013222	GCA	2	6	923885	923890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061427
15860	NC_013222	GCA	2	6	923983	923988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061427
15861	NC_013222	GCCG	2	8	924011	924018	0 %	0 %	50 %	50 %	260061427
15862	NC_013222	GAC	2	6	924027	924032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061427
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15979	NC_013222	TCC	2	6	930358	930363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061431
15980	NC_013222	A	6	6	930381	930386	100 %	0 %	0 %	0 %	260061431
15981	NC_013222	T	6	6	930426	930431	0 %	100 %	0 %	0 %	260061431
15982	NC_013222	CAC	2	6	930435	930440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061431
15983	NC_013222	CCT	2	6	930512	930517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061431
15984	NC_013222	CGT	2	6	930518	930523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061431
15985	NC_013222	TGA	2	6	930530	930535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061431
15986	NC_013222	GCA	2	6	930557	930562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061431
15987	NC_013222	TCCA	2	8	930580	930587	25 %	25 %	0 %	50 %	260061431
15988	NC_013222	GCC	2	6	930810	930815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061431
15989	NC_013222	CAC	2	6	930819	930824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061431
15990	NC_013222	GCA	2	6	930857	930862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061431
15991	NC_013222	TCC	2	6	930886	930891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061431
15992	NC_013222	C	7	7	930959	930965	0 %	0 %	0 %	100 %	260061431
15993	NC_013222	AAT	2	6	931030	931035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061431
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15995	NC_013222	C	6	6	931178	931183	0 %	0 %	0 %	100 %	260061432
15996	NC_013222	CCAG	2	8	931232	931239	25 %	0 %	25 %	50 %	260061432
15997	NC_013222	ACG	2	6	931248	931253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061432
15998	NC_013222	GGTT	2	8	931274	931281	0 %	50 %	50 %	0 %	260061432
15999	NC_013222	TCC	2	6	931288	931293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061432
16000	NC_013222	T	6	6	931308	931313	0 %	100 %	0 %	0 %	260061432

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