MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013222	CTG	2	6	761035	761040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061292
13002	NC_013222	TGT	2	6	761069	761074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061292
13003	NC_013222	AAG	2	6	761143	761148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061292
13004	NC_013222	CTC	2	6	761182	761187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061292
13005	NC_013222	CGCTT	2	10	761212	761221	0 %	40 %	20 %	40 %	260061292
13006	NC_013222	CGT	2	6	761247	761252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061292
13007	NC_013222	GTA	2	6	761320	761325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061292
13008	NC_013222	TCC	2	6	761341	761346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061292
13009	NC_013222	CCT	2	6	761376	761381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061292
13010	NC_013222	ATC	2	6	761428	761433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061292
13011	NC_013222	GGTTC	2	10	761460	761469	0 %	40 %	40 %	20 %	260061292
13012	NC_013222	TCCC	2	8	761629	761636	0 %	25 %	0 %	75 %	260061292
13013	NC_013222	TG	3	6	761683	761688	0 %	50 %	50 %	0 %	260061292
13014	NC_013222	TTG	2	6	761755	761760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061292
13015	NC_013222	ACC	2	6	761828	761833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061292
13016	NC_013222	GGCG	2	8	761897	761904	0 %	0 %	75 %	25 %	260061292
13017	NC_013222	TG	3	6	761921	761926	0 %	50 %	50 %	0 %	260061292
13018	NC_013222	GGC	2	6	761946	761951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061292
13019	NC_013222	C	6	6	761953	761958	0 %	0 %	0 %	100 %	260061292
13020	NC_013222	G	6	6	762076	762081	0 %	0 %	100 %	0 %	260061292
13021	NC_013222	CGA	2	6	762102	762107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061292
13022	NC_013222	A	6	6	762125	762130	100 %	0 %	0 %	0 %	260061292
13023	NC_013222	ACA	2	6	762168	762173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061292
13024	NC_013222	GAG	2	6	762277	762282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061292
13025	NC_013222	GCCG	2	8	762354	762361	0 %	0 %	50 %	50 %	260061292
13026	NC_013222	AAC	2	6	762407	762412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061292
13027	NC_013222	AAACAG	2	12	762442	762453	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	260061292
13028	NC_013222	CCA	2	6	762462	762467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061292
13029	NC_013222	CAG	3	9	762532	762540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061292
13030	NC_013222	GAG	2	6	762541	762546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061292
13031	NC_013222	CCG	2	6	762548	762553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061292
13032	NC_013222	ACAGGA	2	12	762558	762569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260061292
13033	NC_013222	GTA	2	6	762595	762600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061292
13034	NC_013222	ACC	2	6	762665	762670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061292
13035	NC_013222	TGA	2	6	762794	762799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061293
13036	NC_013222	AAC	2	6	762800	762805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061293
13037	NC_013222	CGTCCG	2	12	762807	762818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260061293
13038	NC_013222	CGG	2	6	762852	762857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061293
13039	NC_013222	ATT	2	6	762878	762883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061293
13040	NC_013222	A	6	6	762892	762897	100 %	0 %	0 %	0 %	260061293
13041	NC_013222	G	7	7	762901	762907	0 %	0 %	100 %	0 %	260061293
13042	NC_013222	GAA	2	6	762961	762966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061293
13043	NC_013222	TGA	2	6	763005	763010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061293
13044	NC_013222	AAG	2	6	763022	763027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061293
13045	NC_013222	CCGG	2	8	763125	763132	0 %	0 %	50 %	50 %	260061293
13046	NC_013222	A	7	7	763163	763169	100 %	0 %	0 %	0 %	260061293
13047	NC_013222	GAC	2	6	763363	763368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061293
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13049	NC_013222	GAC	2	6	763423	763428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061293
13050	NC_013222	GAG	2	6	763462	763467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061293
13051	NC_013222	TTGG	2	8	763511	763518	0 %	50 %	50 %	0 %	260061293
13052	NC_013222	C	6	6	763523	763528	0 %	0 %	0 %	100 %	260061293
13053	NC_013222	ACGGG	2	10	763584	763593	20 %	0 %	60 %	20 %	260061293
13054	NC_013222	A	6	6	763595	763600	100 %	0 %	0 %	0 %	260061293
13055	NC_013222	TGGAA	2	10	763622	763631	40 %	20 %	40 %	0 %	260061293
13056	NC_013222	CAA	2	6	763773	763778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061293
13057	NC_013222	ACC	2	6	763820	763825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061293
13058	NC_013222	GCA	2	6	763833	763838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061293
13059	NC_013222	GCC	2	6	763886	763891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061293
13060	NC_013222	TTC	2	6	763996	764001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061293
13061	NC_013222	GCAA	2	8	764036	764043	50 %	0 %	25 %	25 %	260061293
13062	NC_013222	AGG	2	6	764048	764053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061293
13063	NC_013222	GAC	2	6	764101	764106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061293
13064	NC_013222	TTC	2	6	764109	764114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061293
13065	NC_013222	GCC	2	6	764181	764186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061293
13066	NC_013222	CCTGGT	2	12	764193	764204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061293
13067	NC_013222	CAT	2	6	764235	764240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061293
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13069	NC_013222	CAT	2	6	764408	764413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061294
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13071	NC_013222	CTTT	2	8	764462	764469	0 %	75 %	0 %	25 %	260061294
13072	NC_013222	TCG	2	6	764495	764500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061294
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13085	NC_013222	CAGG	2	8	765229	765236	25 %	0 %	50 %	25 %	260061294
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13088	NC_013222	CAGC	2	8	765272	765279	25 %	0 %	25 %	50 %	260061294
13089	NC_013222	A	6	6	765301	765306	100 %	0 %	0 %	0 %	260061294
13090	NC_013222	GCA	2	6	765519	765524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061295
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13093	NC_013222	GGGTA	2	10	765588	765597	20 %	20 %	60 %	0 %	260061295
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13098	NC_013222	AAAC	2	8	765919	765926	75 %	0 %	0 %	25 %	260061296
13099	NC_013222	GCG	2	6	766032	766037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061296
13100	NC_013222	GGC	2	6	766079	766084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061297
13101	NC_013222	TTC	2	6	766137	766142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061297
13102	NC_013222	ATA	2	6	766179	766184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061297
13103	NC_013222	TGG	2	6	766204	766209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061297
13104	NC_013222	TCC	2	6	766218	766223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061297
13105	NC_013222	TCT	2	6	766239	766244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061297
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13107	NC_013222	TCTT	2	8	766339	766346	0 %	75 %	0 %	25 %	260061297
13108	NC_013222	CCT	2	6	766796	766801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061298
13109	NC_013222	TCC	2	6	766861	766866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061298
13110	NC_013222	ACT	2	6	766963	766968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061298
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13112	NC_013222	TCC	2	6	767125	767130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061298
13113	NC_013222	CCGCTG	2	12	767134	767145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260061298
13114	NC_013222	TGA	2	6	767219	767224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061298
13115	NC_013222	GTT	2	6	767367	767372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061298
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13117	NC_013222	G	6	6	767453	767458	0 %	0 %	100 %	0 %	260061298
13118	NC_013222	CAG	2	6	767493	767498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061298
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13120	NC_013222	GTC	2	6	767613	767618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061298
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13122	NC_013222	CCA	2	6	767642	767647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061298
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13239	NC_013222	CGG	2	6	774901	774906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061301
13240	NC_013222	GAC	2	6	774920	774925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13241	NC_013222	ATC	2	6	775025	775030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
13242	NC_013222	GGT	2	6	775111	775116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061301
13243	NC_013222	ACG	2	6	775128	775133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13244	NC_013222	CTG	2	6	775139	775144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13245	NC_013222	CCA	2	6	775206	775211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061301
13246	NC_013222	AAC	2	6	775224	775229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061301
13247	NC_013222	CAA	2	6	775270	775275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061301
13248	NC_013222	CGCCTG	2	12	775282	775293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260061301
13249	NC_013222	GTG	2	6	775349	775354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061301
13250	NC_013222	ACG	2	6	775425	775430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
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13252	NC_013222	GCT	2	6	775501	775506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061301
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13255	NC_013222	CAC	2	6	775681	775686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061301
13256	NC_013222	TAC	3	9	775751	775759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
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13259	NC_013222	GAC	2	6	775868	775873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
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13262	NC_013222	CAT	2	6	776113	776118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
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13269	NC_013222	GCCG	2	8	776401	776408	0 %	0 %	50 %	50 %	260061301
13270	NC_013222	CCTG	2	8	776532	776539	0 %	25 %	25 %	50 %	260061301
13271	NC_013222	CCA	2	6	776547	776552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061301
13272	NC_013222	GAC	2	6	776735	776740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
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13274	NC_013222	ATC	2	6	776834	776839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
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13279	NC_013222	CCGGC	2	10	777093	777102	0 %	0 %	40 %	60 %	260061301
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13287	NC_013222	CAA	2	6	777628	777633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061301
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13320	NC_013222	GGCCAC	2	12	779665	779676	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260061301
13321	NC_013222	CGACC	2	10	779683	779692	20 %	0 %	20 %	60 %	260061301
13322	NC_013222	TGCC	2	8	779811	779818	0 %	25 %	25 %	50 %	260061301
13323	NC_013222	GAC	2	6	779843	779848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
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13327	NC_013222	ACT	2	6	780117	780122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
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13333	NC_013222	CGG	2	6	780477	780482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061301
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13342	NC_013222	AGC	2	6	780905	780910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
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13344	NC_013222	ACG	2	6	781314	781319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13345	NC_013222	CGG	2	6	781342	781347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061301
13346	NC_013222	CTT	2	6	781488	781493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061301
13347	NC_013222	ACC	2	6	781532	781537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061301
13348	NC_013222	GCGG	2	8	781559	781566	0 %	0 %	75 %	25 %	260061301
13349	NC_013222	TCA	2	6	781578	781583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
13350	NC_013222	GAT	2	6	781748	781753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061301
13351	NC_013222	ACA	2	6	781824	781829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061301
13352	NC_013222	ACA	2	6	782001	782006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061301
13353	NC_013222	TCA	2	6	782028	782033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061301
13354	NC_013222	ACG	2	6	782076	782081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13355	NC_013222	GTTACC	2	12	782093	782104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260061301
13356	NC_013222	GACTTT	2	12	782117	782128	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	260061301
13357	NC_013222	CCCA	2	8	782153	782160	25 %	0 %	0 %	75 %	260061301
13358	NC_013222	GCC	2	6	782201	782206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061301
13359	NC_013222	AAC	2	6	782369	782374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061301
13360	NC_013222	GGCG	2	8	782479	782486	0 %	0 %	75 %	25 %	260061301
13361	NC_013222	CGA	2	6	782530	782535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13362	NC_013222	TGC	2	6	782638	782643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061301
13363	NC_013222	GCG	2	6	782646	782651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061301
13364	NC_013222	ATT	2	6	782709	782714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260061301
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13367	NC_013222	GCCCA	2	10	783071	783080	20 %	0 %	20 %	60 %	260061301
13368	NC_013222	TCACCG	2	12	783117	783128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260061301
13369	NC_013222	GGT	2	6	783134	783139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061301
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13380	NC_013222	GGA	2	6	783877	783882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061301
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13386	NC_013222	GCG	2	6	784290	784295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061301
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13400	NC_013222	ACGG	2	8	785015	785022	25 %	0 %	50 %	25 %	260061301
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13455	NC_013222	T	6	6	788382	788387	0 %	100 %	0 %	0 %	260061304
13456	NC_013222	AT	3	6	788417	788422	50 %	50 %	0 %	0 %	260061304
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13458	NC_013222	A	6	6	788455	788460	100 %	0 %	0 %	0 %	260061304
13459	NC_013222	CCAG	2	8	788516	788523	25 %	0 %	25 %	50 %	260061304
13460	NC_013222	CAG	2	6	788553	788558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061304
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13462	NC_013222	CAG	2	6	788661	788666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061304
13463	NC_013222	GTTG	2	8	788696	788703	0 %	50 %	50 %	0 %	260061304
13464	NC_013222	GCT	2	6	788727	788732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061304
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13468	NC_013222	T	6	6	788945	788950	0 %	100 %	0 %	0 %	260061305
13469	NC_013222	CCCTG	2	10	789086	789095	0 %	20 %	20 %	60 %	260061305
13470	NC_013222	GCC	2	6	789102	789107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061305
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13474	NC_013222	TCC	2	6	789216	789221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061305
13475	NC_013222	CGT	2	6	789389	789394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061305
13476	NC_013222	CAC	2	6	789432	789437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061305
13477	NC_013222	GC	3	6	789536	789541	0 %	0 %	50 %	50 %	260061305
13478	NC_013222	TCA	2	6	789770	789775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061306
13479	NC_013222	TAA	2	6	789782	789787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061306
13480	NC_013222	GAT	2	6	789835	789840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061306
13481	NC_013222	TCCTGG	2	12	789890	789901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13482	NC_013222	GCC	2	6	789956	789961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061306
13483	NC_013222	TAA	2	6	790103	790108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061306
13484	NC_013222	TGC	2	6	790164	790169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13485	NC_013222	CCA	2	6	790185	790190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061306
13486	NC_013222	AGC	2	6	790223	790228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13487	NC_013222	TTCTTG	2	12	790253	790264	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260061306
13488	NC_013222	TGG	2	6	790274	790279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061306
13489	NC_013222	TCG	2	6	790331	790336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13490	NC_013222	GCT	3	9	790365	790373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13491	NC_013222	TTG	2	6	790430	790435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061306
13492	NC_013222	GTT	2	6	790471	790476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061306
13493	NC_013222	TGC	2	6	790529	790534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13494	NC_013222	CGG	2	6	790635	790640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061306
13495	NC_013222	CCCGT	2	10	790650	790659	0 %	20 %	20 %	60 %	260061306
13496	NC_013222	CCGA	2	8	790717	790724	25 %	0 %	25 %	50 %	260061306
13497	NC_013222	GTC	2	6	790750	790755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13498	NC_013222	CAG	2	6	790767	790772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061306
13499	NC_013222	GTT	2	6	790813	790818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061306
13500	NC_013222	CAC	2	6	790843	790848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061306

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