MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013222	CCT	2	6	674814	674819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061204
11502	NC_013222	GAC	2	6	674834	674839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061204
11503	NC_013222	TGA	2	6	675107	675112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061205
11504	NC_013222	GGA	2	6	675210	675215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061205
11505	NC_013222	ACC	2	6	675305	675310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061205
11506	NC_013222	CGG	2	6	675447	675452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061205
11507	NC_013222	GCC	2	6	675514	675519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061205
11508	NC_013222	CCA	2	6	675530	675535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061205
11509	NC_013222	ATC	2	6	675544	675549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061205
11510	NC_013222	C	6	6	675554	675559	0 %	0 %	0 %	100 %	260061205
11511	NC_013222	GGA	2	6	675588	675593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061205
11512	NC_013222	CGA	2	6	675645	675650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061205
11513	NC_013222	CTG	2	6	675799	675804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061205
11514	NC_013222	ACCT	2	8	675877	675884	25 %	25 %	0 %	50 %	260061205
11515	NC_013222	GGCA	2	8	675987	675994	25 %	0 %	50 %	25 %	260061205
11516	NC_013222	GCT	2	6	676005	676010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061205
11517	NC_013222	A	6	6	676150	676155	100 %	0 %	0 %	0 %	260061205
11518	NC_013222	CG	3	6	676171	676176	0 %	0 %	50 %	50 %	260061205
11519	NC_013222	CCAG	2	8	676364	676371	25 %	0 %	25 %	50 %	260061206
11520	NC_013222	C	6	6	676419	676424	0 %	0 %	0 %	100 %	260061206
11521	NC_013222	CCGG	2	8	676478	676485	0 %	0 %	50 %	50 %	260061206
11522	NC_013222	CCA	2	6	676491	676496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061206
11523	NC_013222	TGA	2	6	676631	676636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061206
11524	NC_013222	CCG	2	6	676645	676650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061206
11525	NC_013222	TCC	2	6	676656	676661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061206
11526	NC_013222	TCC	2	6	676762	676767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061206
11527	NC_013222	GCC	2	6	676790	676795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061206
11528	NC_013222	CGT	2	6	676835	676840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061206
11529	NC_013222	TCG	2	6	676888	676893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061206
11530	NC_013222	GCC	2	6	676896	676901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061206
11531	NC_013222	GCGG	2	8	676910	676917	0 %	0 %	75 %	25 %	260061206
11532	NC_013222	TTG	2	6	676965	676970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061206
11533	NC_013222	GTCCC	2	10	677017	677026	0 %	20 %	20 %	60 %	260061206
11534	NC_013222	AT	3	6	677029	677034	50 %	50 %	0 %	0 %	260061206
11535	NC_013222	GTC	2	6	677046	677051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061206
11536	NC_013222	CGG	2	6	677075	677080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061206
11537	NC_013222	C	6	6	677147	677152	0 %	0 %	0 %	100 %	260061206
11538	NC_013222	GGCC	2	8	677186	677193	0 %	0 %	50 %	50 %	260061206
11539	NC_013222	GCC	2	6	677196	677201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061206
11540	NC_013222	GCC	2	6	677329	677334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061207
11541	NC_013222	GTTGT	2	10	677481	677490	0 %	60 %	40 %	0 %	260061208
11542	NC_013222	TAGG	2	8	677666	677673	25 %	25 %	50 %	0 %	260061208
11543	NC_013222	CCCTG	2	10	677731	677740	0 %	20 %	20 %	60 %	260061208
11544	NC_013222	CCA	2	6	677833	677838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061208
11545	NC_013222	GTTG	2	8	677899	677906	0 %	50 %	50 %	0 %	260061208
11546	NC_013222	GGC	2	6	677930	677935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061208
11547	NC_013222	TCC	2	6	677940	677945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061208
11548	NC_013222	GTT	2	6	677948	677953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061208
11549	NC_013222	CGG	2	6	678013	678018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061208
11550	NC_013222	AAC	2	6	678210	678215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061209
11551	NC_013222	TCC	2	6	678270	678275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061209
11552	NC_013222	CAC	2	6	678518	678523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061210
11553	NC_013222	GGC	2	6	678526	678531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061210
11554	NC_013222	GCA	2	6	678583	678588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061210
11555	NC_013222	GAG	2	6	678680	678685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061210
11556	NC_013222	TTG	2	6	678702	678707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061210
11557	NC_013222	CAT	2	6	678713	678718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061210
11558	NC_013222	CGA	2	6	678721	678726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061210
11559	NC_013222	CGG	2	6	678736	678741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061210
11560	NC_013222	CCA	2	6	678745	678750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061210
11561	NC_013222	C	6	6	678762	678767	0 %	0 %	0 %	100 %	260061210
11562	NC_013222	ATC	2	6	678870	678875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061210
11563	NC_013222	TCC	2	6	678960	678965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061210
11564	NC_013222	GTC	2	6	679028	679033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061210
11565	NC_013222	CCA	2	6	679048	679053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061210
11566	NC_013222	GATTT	2	10	679258	679267	20 %	60 %	20 %	0 %	260061211
11567	NC_013222	T	6	6	679265	679270	0 %	100 %	0 %	0 %	260061211
11568	NC_013222	ATG	2	6	679298	679303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061211
11569	NC_013222	TGCAT	2	10	679308	679317	20 %	40 %	20 %	20 %	260061211
11570	NC_013222	TCT	2	6	679339	679344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061211
11571	NC_013222	CCT	2	6	679346	679351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061211
11572	NC_013222	GCT	2	6	679354	679359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061211
11573	NC_013222	GATG	2	8	679425	679432	25 %	25 %	50 %	0 %	260061211
11574	NC_013222	CAA	2	6	679499	679504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260061211
11575	NC_013222	ATC	2	6	679551	679556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061211
11576	NC_013222	GCT	2	6	679704	679709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061212
11577	NC_013222	CGG	2	6	679794	679799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061212
11578	NC_013222	GCA	2	6	679800	679805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061212
11579	NC_013222	TCC	2	6	679808	679813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061212
11580	NC_013222	GGC	2	6	679831	679836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061212
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11582	NC_013222	TCC	2	6	679946	679951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061212
11583	NC_013222	A	6	6	680026	680031	100 %	0 %	0 %	0 %	260061212
11584	NC_013222	TGCC	2	8	680040	680047	0 %	25 %	25 %	50 %	260061212
11585	NC_013222	GGC	2	6	680050	680055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061212
11586	NC_013222	G	6	6	680082	680087	0 %	0 %	100 %	0 %	260061212
11587	NC_013222	TCG	2	6	680132	680137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061212
11588	NC_013222	AGG	2	6	680151	680156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061212
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11590	NC_013222	TTG	2	6	680222	680227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061212
11591	NC_013222	CAGGT	2	10	680234	680243	20 %	20 %	40 %	20 %	260061212
11592	NC_013222	C	7	7	680305	680311	0 %	0 %	0 %	100 %	260061212
11593	NC_013222	GGC	2	6	680347	680352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061212
11594	NC_013222	TTGT	2	8	680368	680375	0 %	75 %	25 %	0 %	260061212
11595	NC_013222	GTC	2	6	680407	680412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061213
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11599	NC_013222	TCC	2	6	680486	680491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061213
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11601	NC_013222	TCT	2	6	680504	680509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061213
11602	NC_013222	CGAT	2	8	680617	680624	25 %	25 %	25 %	25 %	260061213
11603	NC_013222	CCG	2	6	680630	680635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061213
11604	NC_013222	TGT	2	6	680688	680693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061213
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11607	NC_013222	CCT	2	6	681150	681155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061213
11608	NC_013222	GTC	2	6	681184	681189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061213
11609	NC_013222	GCG	2	6	681277	681282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061213
11610	NC_013222	GCC	2	6	681296	681301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061213
11611	NC_013222	GCCC	2	8	681384	681391	0 %	0 %	25 %	75 %	260061213
11612	NC_013222	CAT	2	6	681430	681435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061213
11613	NC_013222	TCA	2	6	681483	681488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061213
11614	NC_013222	G	7	7	681509	681515	0 %	0 %	100 %	0 %	260061213
11615	NC_013222	TTC	2	6	681617	681622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061213
11616	NC_013222	ATG	2	6	681635	681640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061213
11617	NC_013222	TCCAGG	2	12	681659	681670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061213
11618	NC_013222	GTG	2	6	681677	681682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061213
11619	NC_013222	TCCGG	2	10	681687	681696	0 %	20 %	40 %	40 %	260061213
11620	NC_013222	TGG	2	6	681704	681709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061213
11621	NC_013222	TGG	2	6	681783	681788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061213
11622	NC_013222	AGCC	2	8	681878	681885	25 %	0 %	25 %	50 %	260061213
11623	NC_013222	GGT	2	6	681924	681929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061213
11624	NC_013222	CGG	2	6	682031	682036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061213
11625	NC_013222	TTC	2	6	682048	682053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061213
11626	NC_013222	CGG	2	6	682055	682060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061213
11627	NC_013222	GAG	2	6	682076	682081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061213
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11630	NC_013222	GAT	2	6	682216	682221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061213
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11632	NC_013222	GTT	2	6	682300	682305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061213
11633	NC_013222	CGA	2	6	682317	682322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061213
11634	NC_013222	GCT	2	6	682338	682343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061213
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11637	NC_013222	CCA	2	6	682449	682454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061213
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11649	NC_013222	GGT	2	6	683100	683105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061214
11650	NC_013222	TCC	2	6	683113	683118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061214
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11652	NC_013222	CTGTC	2	10	683336	683345	0 %	40 %	20 %	40 %	260061215
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11656	NC_013222	TTC	2	6	683432	683437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061215
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11658	NC_013222	GTCG	2	8	683575	683582	0 %	25 %	50 %	25 %	260061215
11659	NC_013222	G	6	6	683582	683587	0 %	0 %	100 %	0 %	260061215
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11695	NC_013222	GCAG	2	8	685758	685765	25 %	0 %	50 %	25 %	260061217
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11726	NC_013222	CGGGAC	2	12	687996	688007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260061220
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11731	NC_013222	A	8	8	688340	688347	100 %	0 %	0 %	0 %	260061221
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11734	NC_013222	TGTTCC	2	12	688410	688421	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260061221
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11737	NC_013222	CCCAA	2	10	688542	688551	40 %	0 %	0 %	60 %	260061221
11738	NC_013222	AAT	2	6	688631	688636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061221
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11740	NC_013222	GCA	2	6	688703	688708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061221
11741	NC_013222	AGG	2	6	688734	688739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061221
11742	NC_013222	TGC	2	6	688744	688749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061221
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11754	NC_013222	CCTG	2	8	689790	689797	0 %	25 %	25 %	50 %	260061222
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11757	NC_013222	A	6	6	689952	689957	100 %	0 %	0 %	0 %	260061222
11758	NC_013222	CCTC	2	8	690047	690054	0 %	25 %	0 %	75 %	260061222
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11762	NC_013222	CTT	2	6	690199	690204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061222
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11767	NC_013222	CCGG	2	8	690680	690687	0 %	0 %	50 %	50 %	260061223
11768	NC_013222	TCCT	2	8	690720	690727	0 %	50 %	0 %	50 %	260061223
11769	NC_013222	GCT	2	6	690898	690903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061223
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11857	NC_013222	TTCC	2	8	696294	696301	0 %	50 %	0 %	50 %	260061229
11858	NC_013222	GGA	2	6	696360	696365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061229
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11862	NC_013222	CTG	2	6	696516	696521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061229
11863	NC_013222	GCT	3	9	696539	696547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061229
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11980	NC_013222	CCA	2	6	703322	703327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061236
11981	NC_013222	ACC	2	6	703399	703404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061236
11982	NC_013222	GAG	2	6	703419	703424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061236
11983	NC_013222	ACC	2	6	703426	703431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061236
11984	NC_013222	CCG	2	6	703474	703479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061236
11985	NC_013222	CCA	2	6	703487	703492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061236
11986	NC_013222	CTT	2	6	703605	703610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061236
11987	NC_013222	CAG	2	6	703628	703633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061236
11988	NC_013222	TTAT	2	8	703694	703701	25 %	75 %	0 %	0 %	260061237
11989	NC_013222	TCT	2	6	703865	703870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061237
11990	NC_013222	GTG	2	6	703897	703902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061237
11991	NC_013222	CAG	2	6	704130	704135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061237
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11994	NC_013222	CCA	2	6	704258	704263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061238
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11999	NC_013222	ATC	2	6	704416	704421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061238
12000	NC_013222	ATC	2	6	704461	704466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061238

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