MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013222	ATTCA	2	10	351995	352004	40 %	40 %	0 %	20 %	260060900
6002	NC_013222	CCA	2	6	352059	352064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060900
6003	NC_013222	TGC	2	6	352114	352119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060900
6004	NC_013222	ATA	2	6	352142	352147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060900
6005	NC_013222	TGA	2	6	352161	352166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060900
6006	NC_013222	TAA	2	6	352207	352212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060900
6007	NC_013222	GGT	2	6	352216	352221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060900
6008	NC_013222	T	7	7	352286	352292	0 %	100 %	0 %	0 %	260060900
6009	NC_013222	TTCCG	2	10	352312	352321	0 %	40 %	20 %	40 %	260060900
6010	NC_013222	AAT	2	6	352406	352411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060900
6011	NC_013222	AAT	2	6	352456	352461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060900
6012	NC_013222	A	7	7	352593	352599	100 %	0 %	0 %	0 %	260060900
6013	NC_013222	TCC	2	6	353020	353025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060901
6014	NC_013222	TCT	2	6	353029	353034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060901
6015	NC_013222	AGT	2	6	353077	353082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060901
6016	NC_013222	TGC	2	6	353095	353100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060901
6017	NC_013222	AT	3	6	353102	353107	50 %	50 %	0 %	0 %	260060901
6018	NC_013222	CTT	2	6	353151	353156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060901
6019	NC_013222	CTTT	2	8	353183	353190	0 %	75 %	0 %	25 %	260060901
6020	NC_013222	CTT	2	6	353213	353218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060901
6021	NC_013222	GTTT	2	8	353240	353247	0 %	75 %	25 %	0 %	260060901
6022	NC_013222	GTCC	2	8	353306	353313	0 %	25 %	25 %	50 %	260060901
6023	NC_013222	T	8	8	353315	353322	0 %	100 %	0 %	0 %	260060901
6024	NC_013222	ATCC	2	8	353358	353365	25 %	25 %	0 %	50 %	260060901
6025	NC_013222	TTA	2	6	353426	353431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060901
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6030	NC_013222	T	6	6	353628	353633	0 %	100 %	0 %	0 %	260060902
6031	NC_013222	CTT	2	6	353635	353640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060902
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6033	NC_013222	TATT	2	8	353668	353675	25 %	75 %	0 %	0 %	260060902
6034	NC_013222	TCC	2	6	353711	353716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060902
6035	NC_013222	GTT	2	6	353795	353800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060902
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6037	NC_013222	CA	3	6	353842	353847	50 %	0 %	0 %	50 %	260060902
6038	NC_013222	TGGA	2	8	353887	353894	25 %	25 %	50 %	0 %	260060902
6039	NC_013222	CAT	2	6	353921	353926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060902
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6041	NC_013222	TCT	2	6	354118	354123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060902
6042	NC_013222	GCA	2	6	354149	354154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060902
6043	NC_013222	ATG	2	6	354301	354306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060902
6044	NC_013222	T	8	8	354433	354440	0 %	100 %	0 %	0 %	260060903
6045	NC_013222	GCA	2	6	354496	354501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060903
6046	NC_013222	T	6	6	354537	354542	0 %	100 %	0 %	0 %	260060903
6047	NC_013222	ATC	2	6	354580	354585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060903
6048	NC_013222	T	7	7	354589	354595	0 %	100 %	0 %	0 %	260060903
6049	NC_013222	TGT	2	6	354607	354612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060903
6050	NC_013222	CATC	2	8	354620	354627	25 %	25 %	0 %	50 %	260060903
6051	NC_013222	TTG	2	6	354868	354873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060904
6052	NC_013222	GCG	2	6	354898	354903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060904
6053	NC_013222	TTTC	2	8	354905	354912	0 %	75 %	0 %	25 %	260060904
6054	NC_013222	TGC	2	6	355092	355097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060904
6055	NC_013222	CTTA	2	8	355200	355207	25 %	50 %	0 %	25 %	260060904
6056	NC_013222	TAGGT	2	10	355519	355528	20 %	40 %	40 %	0 %	260060905
6057	NC_013222	TTC	2	6	355620	355625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060905
6058	NC_013222	GC	3	6	355646	355651	0 %	0 %	50 %	50 %	260060905
6059	NC_013222	GAT	2	6	355677	355682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060905
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6063	NC_013222	T	6	6	356014	356019	0 %	100 %	0 %	0 %	260060905
6064	NC_013222	GAC	2	6	356069	356074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060905
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6066	NC_013222	AATT	2	8	356204	356211	50 %	50 %	0 %	0 %	260060905
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6071	NC_013222	T	7	7	356706	356712	0 %	100 %	0 %	0 %	260060905
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6090	NC_013222	TACT	2	8	357755	357762	25 %	50 %	0 %	25 %	260060907
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6106	NC_013222	TCTG	2	8	358531	358538	0 %	50 %	25 %	25 %	260060908
6107	NC_013222	TCA	2	6	358605	358610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060908
6108	NC_013222	ATGGG	2	10	358739	358748	20 %	20 %	60 %	0 %	260060908
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6119	NC_013222	GAAAT	2	10	359423	359432	60 %	20 %	20 %	0 %	260060908
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6122	NC_013222	TA	3	6	359686	359691	50 %	50 %	0 %	0 %	260060908
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6124	NC_013222	A	6	6	359728	359733	100 %	0 %	0 %	0 %	260060908
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6127	NC_013222	T	6	6	359908	359913	0 %	100 %	0 %	0 %	260060908
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6242	NC_013222	T	6	6	368432	368437	0 %	100 %	0 %	0 %	260060915
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6371	NC_013222	TTG	2	6	375558	375563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060923
6372	NC_013222	GTT	2	6	375570	375575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060923
6373	NC_013222	AGC	2	6	375744	375749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060923
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6375	NC_013222	GTC	2	6	376113	376118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060923
6376	NC_013222	GGA	2	6	376137	376142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060923
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6379	NC_013222	CTT	2	6	376336	376341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060923
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6381	NC_013222	ATAC	2	8	376467	376474	50 %	25 %	0 %	25 %	260060923
6382	NC_013222	TCC	2	6	376504	376509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060923
6383	NC_013222	CAG	2	6	376566	376571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060923
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6385	NC_013222	A	7	7	377103	377109	100 %	0 %	0 %	0 %	260060924
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6389	NC_013222	T	7	7	377528	377534	0 %	100 %	0 %	0 %	260060924
6390	NC_013222	CCT	2	6	377576	377581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060924
6391	NC_013222	CAA	2	6	377649	377654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060924
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6397	NC_013222	ATGT	2	8	377876	377883	25 %	50 %	25 %	0 %	260060925
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6399	NC_013222	ATCGCC	2	12	377912	377923	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260060925
6400	NC_013222	CAT	2	6	377947	377952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060925
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6402	NC_013222	ACA	2	6	378003	378008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060925
6403	NC_013222	CTG	2	6	378020	378025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060925
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6406	NC_013222	ACG	2	6	378192	378197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060925
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6420	NC_013222	GGCA	2	8	378874	378881	25 %	0 %	50 %	25 %	260060925
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6442	NC_013222	GGA	2	6	380287	380292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060926
6443	NC_013222	GCATCC	2	12	380310	380321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260060926
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6450	NC_013222	GGA	2	6	380767	380772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060927
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6458	NC_013222	GGA	2	6	381268	381273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060927
6459	NC_013222	GCT	2	6	381290	381295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060927
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6461	NC_013222	GAG	2	6	381428	381433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060927
6462	NC_013222	ACG	2	6	381678	381683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060927
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6466	NC_013222	CTG	2	6	381890	381895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060927
6467	NC_013222	A	7	7	381906	381912	100 %	0 %	0 %	0 %	260060927
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6469	NC_013222	ATT	2	6	382020	382025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060927
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6474	NC_013222	TCG	2	6	382408	382413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060928
6475	NC_013222	AGG	2	6	382414	382419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060928
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6477	NC_013222	ACC	2	6	382431	382436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060928
6478	NC_013222	ACCG	2	8	382521	382528	25 %	0 %	25 %	50 %	260060928
6479	NC_013222	TGG	2	6	382543	382548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060928
6480	NC_013222	ATC	2	6	382569	382574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060928
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6482	NC_013222	CCGG	2	8	382670	382677	0 %	0 %	50 %	50 %	260060929
6483	NC_013222	AGGG	2	8	382732	382739	25 %	0 %	75 %	0 %	260060929
6484	NC_013222	A	6	6	382788	382793	100 %	0 %	0 %	0 %	260060929
6485	NC_013222	GGC	2	6	382924	382929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060929
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6490	NC_013222	C	6	6	383318	383323	0 %	0 %	0 %	100 %	260060929
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6492	NC_013222	AAC	2	6	383515	383520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060929
6493	NC_013222	CGA	2	6	383583	383588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060930
6494	NC_013222	GCT	2	6	383589	383594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060930
6495	NC_013222	CGA	2	6	383688	383693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060930
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6497	NC_013222	GCT	2	6	383727	383732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060930
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