MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_013222	CAG	2	6	3427384	3427389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063702
58002	NC_013222	CTG	2	6	3427407	3427412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063702
58003	NC_013222	AACC	2	8	3427466	3427473	50 %	0 %	0 %	50 %	260063702
58004	NC_013222	G	7	7	3427479	3427485	0 %	0 %	100 %	0 %	260063702
58005	NC_013222	G	6	6	3427557	3427562	0 %	0 %	100 %	0 %	260063702
58006	NC_013222	CGGTTA	2	12	3427585	3427596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260063702
58007	NC_013222	TGGC	2	8	3427602	3427609	0 %	25 %	50 %	25 %	260063702
58008	NC_013222	CGC	2	6	3427776	3427781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063703
58009	NC_013222	CCGG	2	8	3427832	3427839	0 %	0 %	50 %	50 %	260063703
58010	NC_013222	GTC	2	6	3427875	3427880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
58011	NC_013222	GCA	2	6	3427913	3427918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063703
58012	NC_013222	TCCG	2	8	3428025	3428032	0 %	25 %	25 %	50 %	260063703
58013	NC_013222	TGC	2	6	3428063	3428068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
58014	NC_013222	TCG	2	6	3428095	3428100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
58015	NC_013222	CTC	2	6	3428147	3428152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063703
58016	NC_013222	CAC	2	6	3428274	3428279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063703
58017	NC_013222	GTC	2	6	3428349	3428354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063703
58018	NC_013222	GAT	2	6	3428355	3428360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063703
58019	NC_013222	C	6	6	3428397	3428402	0 %	0 %	0 %	100 %	260063703
58020	NC_013222	GCC	2	6	3428503	3428508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063703
58021	NC_013222	AAGG	2	8	3428511	3428518	50 %	0 %	50 %	0 %	260063703
58022	NC_013222	TCC	2	6	3428675	3428680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063704
58023	NC_013222	CCT	2	6	3428705	3428710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063704
58024	NC_013222	ACG	2	6	3428759	3428764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063704
58025	NC_013222	TGC	2	6	3428783	3428788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063704
58026	NC_013222	CCTG	2	8	3428826	3428833	0 %	25 %	25 %	50 %	260063704
58027	NC_013222	GGAC	2	8	3428838	3428845	25 %	0 %	50 %	25 %	260063704
58028	NC_013222	CGT	2	6	3428925	3428930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063704
58029	NC_013222	TGG	2	6	3429239	3429244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063704
58030	NC_013222	CTG	2	6	3429403	3429408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58031	NC_013222	ACC	2	6	3429529	3429534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063705
58032	NC_013222	CGGG	2	8	3429555	3429562	0 %	0 %	75 %	25 %	260063705
58033	NC_013222	CAG	2	6	3429589	3429594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58034	NC_013222	ACCA	2	8	3429664	3429671	50 %	0 %	0 %	50 %	260063705
58035	NC_013222	CTG	2	6	3429700	3429705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58036	NC_013222	GCC	2	6	3429718	3429723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063705
58037	NC_013222	AGGG	2	8	3429731	3429738	25 %	0 %	75 %	0 %	260063705
58038	NC_013222	CTG	2	6	3429784	3429789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58039	NC_013222	CTG	2	6	3429835	3429840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58040	NC_013222	CCT	2	6	3429843	3429848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063705
58041	NC_013222	GCCTG	2	10	3429869	3429878	0 %	20 %	40 %	40 %	260063705
58042	NC_013222	TGT	3	9	3429881	3429889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063705
58043	NC_013222	ATC	2	6	3429934	3429939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063705
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58045	NC_013222	CAA	2	6	3430086	3430091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063705
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58048	NC_013222	TGG	2	6	3430229	3430234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063705
58049	NC_013222	GGAT	2	8	3430298	3430305	25 %	25 %	50 %	0 %	260063705
58050	NC_013222	CGGA	2	8	3430353	3430360	25 %	0 %	50 %	25 %	260063705
58051	NC_013222	GAA	2	6	3430375	3430380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063705
58052	NC_013222	GC	3	6	3430393	3430398	0 %	0 %	50 %	50 %	260063705
58053	NC_013222	TCG	2	6	3430451	3430456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58054	NC_013222	ACG	2	6	3430508	3430513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063705
58055	NC_013222	CATCCT	2	12	3430521	3430532	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260063705
58056	NC_013222	GGGATT	2	12	3430546	3430557	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260063705
58057	NC_013222	ATC	2	6	3430657	3430662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063705
58058	NC_013222	CAC	2	6	3430669	3430674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063705
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58060	NC_013222	TA	3	6	3431233	3431238	50 %	50 %	0 %	0 %	260063706
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58065	NC_013222	CTGCC	2	10	3431450	3431459	0 %	20 %	20 %	60 %	260063707
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58071	NC_013222	CCCT	2	8	3431730	3431737	0 %	25 %	0 %	75 %	260063707
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58102	NC_013222	T	7	7	3433018	3433024	0 %	100 %	0 %	0 %	260063708
58103	NC_013222	CTG	2	6	3433049	3433054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063708
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58115	NC_013222	GCC	2	6	3433434	3433439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063708
58116	NC_013222	TCG	2	6	3433452	3433457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063708
58117	NC_013222	TGT	2	6	3433510	3433515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063708
58118	NC_013222	GTT	2	6	3433541	3433546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063708
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58123	NC_013222	CTG	2	6	3433730	3433735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063708
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58217	NC_013222	A	7	7	3438877	3438883	100 %	0 %	0 %	0 %	260063713
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58220	NC_013222	CTC	2	6	3438914	3438919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063713
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58222	NC_013222	TTC	2	6	3438966	3438971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063713
58223	NC_013222	GTCC	2	8	3439058	3439065	0 %	25 %	25 %	50 %	260063713
58224	NC_013222	GAT	2	6	3439178	3439183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063713
58225	NC_013222	CAA	2	6	3439187	3439192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063713
58226	NC_013222	C	6	6	3439208	3439213	0 %	0 %	0 %	100 %	260063713
58227	NC_013222	GGC	2	6	3439250	3439255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063713
58228	NC_013222	TCCCGG	2	12	3439341	3439352	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260063713
58229	NC_013222	GC	3	6	3439367	3439372	0 %	0 %	50 %	50 %	260063713
58230	NC_013222	ATC	2	6	3439380	3439385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063713
58231	NC_013222	GCC	2	6	3439395	3439400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063713
58232	NC_013222	CAC	2	6	3439427	3439432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063713
58233	NC_013222	TGG	2	6	3439471	3439476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063713
58234	NC_013222	ACC	2	6	3439512	3439517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063713
58235	NC_013222	GAT	2	6	3439526	3439531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063713
58236	NC_013222	GAT	2	6	3439577	3439582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063713
58237	NC_013222	GTG	2	6	3439632	3439637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063713
58238	NC_013222	CAC	2	6	3439646	3439651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063713
58239	NC_013222	TGC	2	6	3439663	3439668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063713
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58243	NC_013222	TGT	2	6	3439966	3439971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063714
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58262	NC_013222	GGT	2	6	3440740	3440745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063714
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58329	NC_013222	ACCG	2	8	3444187	3444194	25 %	0 %	25 %	50 %	260063717
58330	NC_013222	GTA	2	6	3444222	3444227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
58331	NC_013222	GTC	2	6	3444279	3444284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063717
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58335	NC_013222	TGA	2	6	3444545	3444550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
58336	NC_013222	CCAGG	2	10	3444645	3444654	20 %	0 %	40 %	40 %	260063717
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58339	NC_013222	GGA	2	6	3444822	3444827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063717
58340	NC_013222	CCA	2	6	3444926	3444931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
58341	NC_013222	CCA	2	6	3444944	3444949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063717
58342	NC_013222	TCC	2	6	3444955	3444960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063717
58343	NC_013222	GCC	2	6	3444964	3444969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063717
58344	NC_013222	GTA	2	6	3445038	3445043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
58345	NC_013222	TACCG	2	10	3445113	3445122	20 %	20 %	20 %	40 %	260063717
58346	NC_013222	TGG	2	6	3445162	3445167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063717
58347	NC_013222	AAT	2	6	3445227	3445232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063717
58348	NC_013222	C	6	6	3445298	3445303	0 %	0 %	0 %	100 %	260063717
58349	NC_013222	TCA	2	6	3445357	3445362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063717
58350	NC_013222	GCT	2	6	3445424	3445429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063717
58351	NC_013222	GAT	2	6	3445434	3445439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063717
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58354	NC_013222	TTG	2	6	3445537	3445542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063717
58355	NC_013222	GCT	2	6	3445562	3445567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063717
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58422	NC_013222	AGGCA	2	10	3449484	3449493	40 %	0 %	40 %	20 %	260063724
58423	NC_013222	CGTG	2	8	3449612	3449619	0 %	25 %	50 %	25 %	260063724
58424	NC_013222	TCC	2	6	3449734	3449739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063724
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58445	NC_013222	GAC	2	6	3451348	3451353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063726
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58447	NC_013222	CTG	2	6	3451492	3451497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063726
58448	NC_013222	ACC	2	6	3451683	3451688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
58449	NC_013222	CGCC	2	8	3451711	3451718	0 %	0 %	25 %	75 %	260063727
58450	NC_013222	GCA	2	6	3451885	3451890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063727
58451	NC_013222	TGG	2	6	3451914	3451919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063727
58452	NC_013222	A	6	6	3451920	3451925	100 %	0 %	0 %	0 %	260063727
58453	NC_013222	GTTCGG	2	12	3451988	3451999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260063727
58454	NC_013222	ACC	2	6	3452073	3452078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
58455	NC_013222	ACCG	2	8	3452093	3452100	25 %	0 %	25 %	50 %	260063727
58456	NC_013222	CGG	2	6	3452155	3452160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063727
58457	NC_013222	GCT	2	6	3452176	3452181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063727
58458	NC_013222	ACC	2	6	3452199	3452204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
58459	NC_013222	TTA	2	6	3452233	3452238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063727
58460	NC_013222	CTC	2	6	3452260	3452265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063727
58461	NC_013222	CAC	2	6	3452278	3452283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
58462	NC_013222	GAAAC	2	10	3452304	3452313	60 %	0 %	20 %	20 %	260063727
58463	NC_013222	ACC	2	6	3452325	3452330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063727
58464	NC_013222	AAC	2	6	3452333	3452338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063727
58465	NC_013222	GCC	2	6	3452352	3452357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063727
58466	NC_013222	TCG	2	6	3452388	3452393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063727
58467	NC_013222	CTGCA	2	10	3452559	3452568	20 %	20 %	20 %	40 %	260063727
58468	NC_013222	CGG	2	6	3452702	3452707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063727
58469	NC_013222	GCC	2	6	3452711	3452716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063727
58470	NC_013222	CTG	2	6	3452732	3452737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063727
58471	NC_013222	GGGC	2	8	3452802	3452809	0 %	0 %	75 %	25 %	260063727
58472	NC_013222	GAAG	2	8	3452929	3452936	50 %	0 %	50 %	0 %	260063727
58473	NC_013222	ACG	2	6	3453036	3453041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063727
58474	NC_013222	TAC	2	6	3453182	3453187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063727
58475	NC_013222	ATGG	2	8	3453202	3453209	25 %	25 %	50 %	0 %	260063727
58476	NC_013222	AGG	2	6	3453228	3453233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063727
58477	NC_013222	CTA	2	6	3453274	3453279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063727
58478	NC_013222	CGGGC	2	10	3453307	3453316	0 %	0 %	60 %	40 %	260063728
58479	NC_013222	AGT	2	6	3453348	3453353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063728
58480	NC_013222	TGG	2	6	3453369	3453374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063728
58481	NC_013222	CCA	2	6	3453423	3453428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063728
58482	NC_013222	TGG	2	6	3453434	3453439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063728
58483	NC_013222	TCC	2	6	3453455	3453460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063728
58484	NC_013222	TTTG	2	8	3453502	3453509	0 %	75 %	25 %	0 %	260063728
58485	NC_013222	ACAG	2	8	3453521	3453528	50 %	0 %	25 %	25 %	260063728
58486	NC_013222	CCG	2	6	3453560	3453565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063728
58487	NC_013222	ATGT	2	8	3453636	3453643	25 %	50 %	25 %	0 %	260063728
58488	NC_013222	G	6	6	3453667	3453672	0 %	0 %	100 %	0 %	260063729
58489	NC_013222	TCC	2	6	3453792	3453797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063729
58490	NC_013222	CTC	2	6	3453949	3453954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063729
58491	NC_013222	GCA	2	6	3453993	3453998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063729
58492	NC_013222	TAA	2	6	3454028	3454033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063729
58493	NC_013222	ACC	2	6	3454073	3454078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063729
58494	NC_013222	GCC	3	9	3454091	3454099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063729
58495	NC_013222	TCA	2	6	3454107	3454112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063729
58496	NC_013222	GGT	2	6	3454167	3454172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063729
58497	NC_013222	ACC	2	6	3454223	3454228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063729
58498	NC_013222	TGA	2	6	3454260	3454265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063729
58499	NC_013222	AAAAT	2	10	3454288	3454297	80 %	20 %	0 %	0 %	260063729
58500	NC_013222	AGA	2	6	3454311	3454316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063729

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