MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_013222	CTT	2	6	3286261	3286266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063565
55502	NC_013222	GCAG	2	8	3286294	3286301	25 %	0 %	50 %	25 %	260063565
55503	NC_013222	ACG	2	6	3286340	3286345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063565
55504	NC_013222	TTTGT	2	10	3286565	3286574	0 %	80 %	20 %	0 %	260063566
55505	NC_013222	TAG	2	6	3286702	3286707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063566
55506	NC_013222	GAG	2	6	3287035	3287040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063566
55507	NC_013222	CAG	2	6	3287098	3287103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063566
55508	NC_013222	GGC	2	6	3287167	3287172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063566
55509	NC_013222	ACCG	2	8	3287249	3287256	25 %	0 %	25 %	50 %	260063566
55510	NC_013222	GTT	2	6	3287257	3287262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063566
55511	NC_013222	GAT	2	6	3287284	3287289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063566
55512	NC_013222	TCC	2	6	3287342	3287347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063566
55513	NC_013222	GGC	2	6	3287401	3287406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063566
55514	NC_013222	CTT	2	6	3287410	3287415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063566
55515	NC_013222	TTC	2	6	3287545	3287550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063567
55516	NC_013222	AT	3	6	3287570	3287575	50 %	50 %	0 %	0 %	260063567
55517	NC_013222	GGC	2	6	3287595	3287600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063567
55518	NC_013222	CTG	2	6	3287623	3287628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063567
55519	NC_013222	CCGGT	2	10	3287654	3287663	0 %	20 %	40 %	40 %	260063567
55520	NC_013222	CTT	2	6	3287709	3287714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063567
55521	NC_013222	TCCCC	2	10	3287849	3287858	0 %	20 %	0 %	80 %	260063568
55522	NC_013222	CA	4	8	3287958	3287965	50 %	0 %	0 %	50 %	260063568
55523	NC_013222	GCC	2	6	3288058	3288063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063568
55524	NC_013222	CGG	2	6	3288311	3288316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063568
55525	NC_013222	GC	3	6	3288325	3288330	0 %	0 %	50 %	50 %	260063568
55526	NC_013222	CCA	2	6	3288383	3288388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063568
55527	NC_013222	CGC	2	6	3288452	3288457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063568
55528	NC_013222	CCG	2	6	3288535	3288540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063568
55529	NC_013222	TGT	2	6	3288554	3288559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063568
55530	NC_013222	GCT	2	6	3288617	3288622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063568
55531	NC_013222	AT	3	6	3288647	3288652	50 %	50 %	0 %	0 %	260063568
55532	NC_013222	GGC	2	6	3288675	3288680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063568
55533	NC_013222	C	6	6	3288760	3288765	0 %	0 %	0 %	100 %	260063568
55534	NC_013222	CCATT	2	10	3288849	3288858	20 %	40 %	0 %	40 %	260063568
55535	NC_013222	CCA	2	6	3288905	3288910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063568
55536	NC_013222	TC	3	6	3289005	3289010	0 %	50 %	0 %	50 %	260063569
55537	NC_013222	CGCC	2	8	3289015	3289022	0 %	0 %	25 %	75 %	260063569
55538	NC_013222	CTC	2	6	3289047	3289052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063569
55539	NC_013222	CGG	2	6	3289081	3289086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063569
55540	NC_013222	CGG	2	6	3289176	3289181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063569
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55542	NC_013222	GGC	2	6	3289206	3289211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063569
55543	NC_013222	G	6	6	3289228	3289233	0 %	0 %	100 %	0 %	260063569
55544	NC_013222	CGT	2	6	3289244	3289249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063569
55545	NC_013222	GCC	2	6	3289272	3289277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063569
55546	NC_013222	GGACC	2	10	3289313	3289322	20 %	0 %	40 %	40 %	260063569
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55548	NC_013222	CCCGG	2	10	3289397	3289406	0 %	0 %	40 %	60 %	260063569
55549	NC_013222	AGT	2	6	3289554	3289559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063569
55550	NC_013222	CAG	2	6	3289623	3289628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063569
55551	NC_013222	A	6	6	3289649	3289654	100 %	0 %	0 %	0 %	260063569
55552	NC_013222	GTTG	2	8	3289670	3289677	0 %	50 %	50 %	0 %	260063569
55553	NC_013222	GAT	2	6	3289834	3289839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063570
55554	NC_013222	ATC	2	6	3289862	3289867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063570
55555	NC_013222	TCTTGC	2	12	3289959	3289970	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260063570
55556	NC_013222	GTA	2	6	3289999	3290004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063570
55557	NC_013222	ATC	2	6	3290015	3290020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063570
55558	NC_013222	ATAC	2	8	3290055	3290062	50 %	25 %	0 %	25 %	260063570
55559	NC_013222	ACC	2	6	3290174	3290179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063570
55560	NC_013222	TGGT	2	8	3290231	3290238	0 %	50 %	50 %	0 %	260063570
55561	NC_013222	GCG	2	6	3290243	3290248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063570
55562	NC_013222	GCC	2	6	3290294	3290299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063570
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55565	NC_013222	C	7	7	3290332	3290338	0 %	0 %	0 %	100 %	260063570
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55584	NC_013222	TGGTC	2	10	3291252	3291261	0 %	40 %	40 %	20 %	260063570
55585	NC_013222	CGGT	2	8	3291350	3291357	0 %	25 %	50 %	25 %	260063570
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55600	NC_013222	TGA	2	6	3292291	3292296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063571
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55605	NC_013222	CCTCGT	2	12	3292411	3292422	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260063571
55606	NC_013222	GTC	2	6	3292448	3292453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063571
55607	NC_013222	TCCG	2	8	3292546	3292553	0 %	25 %	25 %	50 %	260063571
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55612	NC_013222	CCT	2	6	3292744	3292749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063571
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55616	NC_013222	TCAGCG	2	12	3292858	3292869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260063571
55617	NC_013222	TAAA	2	8	3293018	3293025	75 %	25 %	0 %	0 %	260063572
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55732	NC_013222	AGG	2	6	3300115	3300120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063582
55733	NC_013222	GACG	2	8	3300142	3300149	25 %	0 %	50 %	25 %	260063582
55734	NC_013222	CGG	2	6	3300160	3300165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063582
55735	NC_013222	GCC	2	6	3300293	3300298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063582
55736	NC_013222	CTG	2	6	3300299	3300304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063582
55737	NC_013222	TCC	2	6	3300360	3300365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063582
55738	NC_013222	GGA	2	6	3300382	3300387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063582
55739	NC_013222	C	6	6	3300399	3300404	0 %	0 %	0 %	100 %	260063582
55740	NC_013222	CAA	2	6	3300430	3300435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063582
55741	NC_013222	CCA	2	6	3300468	3300473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063582
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55743	NC_013222	CGG	2	6	3300782	3300787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063583
55744	NC_013222	TCG	2	6	3300815	3300820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063583
55745	NC_013222	ACAT	2	8	3300868	3300875	50 %	25 %	0 %	25 %	260063583
55746	NC_013222	CCG	2	6	3300896	3300901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063583
55747	NC_013222	GCA	2	6	3300908	3300913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063583
55748	NC_013222	CCT	2	6	3300949	3300954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063583
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55750	NC_013222	GGC	2	6	3301063	3301068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063583
55751	NC_013222	TTC	2	6	3301123	3301128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063583
55752	NC_013222	GCG	2	6	3301133	3301138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063583
55753	NC_013222	CGC	2	6	3301176	3301181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063583
55754	NC_013222	GCC	2	6	3301186	3301191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063583
55755	NC_013222	TGCCA	2	10	3301201	3301210	20 %	20 %	20 %	40 %	260063583
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55757	NC_013222	GGC	2	6	3301278	3301283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063583
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55762	NC_013222	GCT	2	6	3301526	3301531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063584
55763	NC_013222	C	6	6	3301555	3301560	0 %	0 %	0 %	100 %	260063584
55764	NC_013222	CGT	2	6	3301572	3301577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063584
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55767	NC_013222	A	7	7	3301679	3301685	100 %	0 %	0 %	0 %	260063584
55768	NC_013222	A	7	7	3301691	3301697	100 %	0 %	0 %	0 %	260063584
55769	NC_013222	GGCC	2	8	3301718	3301725	0 %	0 %	50 %	50 %	260063584
55770	NC_013222	CTG	2	6	3301836	3301841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063584
55771	NC_013222	CGGC	2	8	3301854	3301861	0 %	0 %	50 %	50 %	260063584
55772	NC_013222	CCA	2	6	3301891	3301896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063584
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55789	NC_013222	GCAG	2	8	3302706	3302713	25 %	0 %	50 %	25 %	260063585
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55820	NC_013222	ACT	2	6	3304116	3304121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063586
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55830	NC_013222	C	6	6	3304704	3304709	0 %	0 %	0 %	100 %	260063586
55831	NC_013222	CTG	2	6	3304742	3304747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063586
55832	NC_013222	GGT	2	6	3304768	3304773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063586
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55835	NC_013222	CGC	2	6	3304950	3304955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063586
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55837	NC_013222	AGAA	3	12	3305068	3305079	75 %	0 %	25 %	0 %	260063587
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55840	NC_013222	TTG	2	6	3305399	3305404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063588
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55844	NC_013222	GAA	2	6	3305642	3305647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063588
55845	NC_013222	CCT	2	6	3305653	3305658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063588
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55964	NC_013222	GGA	2	6	3311831	3311836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063594
55965	NC_013222	GGC	2	6	3311957	3311962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063594
55966	NC_013222	TAA	2	6	3311972	3311977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063594
55967	NC_013222	CTG	2	6	3311985	3311990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063594
55968	NC_013222	CCG	2	6	3312004	3312009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063594
55969	NC_013222	ACC	2	6	3312031	3312036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063594
55970	NC_013222	CAG	2	6	3312060	3312065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063594
55971	NC_013222	CGGG	2	8	3312111	3312118	0 %	0 %	75 %	25 %	260063594
55972	NC_013222	CAG	2	6	3312119	3312124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063594
55973	NC_013222	GAAG	2	8	3312185	3312192	50 %	0 %	50 %	0 %	260063594
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55978	NC_013222	CGCGG	2	10	3312401	3312410	0 %	0 %	60 %	40 %	260063594
55979	NC_013222	TGG	2	6	3312460	3312465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063594
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55991	NC_013222	A	6	6	3313661	3313666	100 %	0 %	0 %	0 %	260063596
55992	NC_013222	GAC	2	6	3313783	3313788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063596
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55994	NC_013222	GAC	2	6	3313804	3313809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063596
55995	NC_013222	AAGG	2	8	3313825	3313832	50 %	0 %	50 %	0 %	260063596
55996	NC_013222	TA	3	6	3313862	3313867	50 %	50 %	0 %	0 %	260063596
55997	NC_013222	GGAA	2	8	3313892	3313899	50 %	0 %	50 %	0 %	260063596
55998	NC_013222	CCA	2	6	3314028	3314033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063596
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