MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_013222	GAA	2	6	3114254	3114259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063417
52502	NC_013222	CAC	2	6	3114279	3114284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063417
52503	NC_013222	AAG	2	6	3114311	3114316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063417
52504	NC_013222	CAC	2	6	3114328	3114333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063417
52505	NC_013222	CAT	2	6	3114384	3114389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063417
52506	NC_013222	GAA	2	6	3114399	3114404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063417
52507	NC_013222	GCC	3	9	3114417	3114425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063417
52508	NC_013222	GAA	2	6	3114444	3114449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063417
52509	NC_013222	ATC	2	6	3114519	3114524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063417
52510	NC_013222	GTC	2	6	3114540	3114545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063417
52511	NC_013222	TCT	2	6	3114604	3114609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063417
52512	NC_013222	TGG	2	6	3114613	3114618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063417
52513	NC_013222	GCCTT	2	10	3114839	3114848	0 %	40 %	20 %	40 %	260063417
52514	NC_013222	CTT	2	6	3114898	3114903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063418
52515	NC_013222	TTC	2	6	3114928	3114933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063418
52516	NC_013222	CGT	3	9	3114945	3114953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063418
52517	NC_013222	TTG	2	6	3115039	3115044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063418
52518	NC_013222	ATT	2	6	3115052	3115057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063418
52519	NC_013222	TCTTT	2	10	3115088	3115097	0 %	80 %	0 %	20 %	260063418
52520	NC_013222	ACC	2	6	3115211	3115216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063418
52521	NC_013222	TCT	2	6	3115232	3115237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063418
52522	NC_013222	ATA	2	6	3115375	3115380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063418
52523	NC_013222	TTC	2	6	3115417	3115422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063419
52524	NC_013222	CAT	2	6	3115443	3115448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063419
52525	NC_013222	GAT	2	6	3115608	3115613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063420
52526	NC_013222	CGG	2	6	3115636	3115641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063420
52527	NC_013222	TTCT	2	8	3115644	3115651	0 %	75 %	0 %	25 %	260063420
52528	NC_013222	TTGG	2	8	3115705	3115712	0 %	50 %	50 %	0 %	260063420
52529	NC_013222	TTCGG	2	10	3115738	3115747	0 %	40 %	40 %	20 %	260063420
52530	NC_013222	TTG	2	6	3115788	3115793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063421
52531	NC_013222	AGT	2	6	3115809	3115814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063421
52532	NC_013222	TTA	2	6	3115825	3115830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063421
52533	NC_013222	CCG	2	6	3115852	3115857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063421
52534	NC_013222	TCT	2	6	3115933	3115938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063421
52535	NC_013222	GGTTT	2	10	3116145	3116154	0 %	60 %	40 %	0 %	260063422
52536	NC_013222	GTA	2	6	3116215	3116220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063422
52537	NC_013222	ACC	2	6	3116276	3116281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063422
52538	NC_013222	CAT	2	6	3116332	3116337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063422
52539	NC_013222	TA	3	6	3116401	3116406	50 %	50 %	0 %	0 %	260063422
52540	NC_013222	TAA	2	6	3116436	3116441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063422
52541	NC_013222	CAC	2	6	3116467	3116472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063422
52542	NC_013222	TGA	2	6	3116579	3116584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063422
52543	NC_013222	CAC	2	6	3116758	3116763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063422
52544	NC_013222	GCA	2	6	3116811	3116816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063422
52545	NC_013222	CCTG	2	8	3117268	3117275	0 %	25 %	25 %	50 %	260063423
52546	NC_013222	TTTG	2	8	3117322	3117329	0 %	75 %	25 %	0 %	260063423
52547	NC_013222	TCCA	2	8	3117474	3117481	25 %	25 %	0 %	50 %	260063423
52548	NC_013222	TTCAT	2	10	3117491	3117500	20 %	60 %	0 %	20 %	260063424
52549	NC_013222	ACT	2	6	3117539	3117544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063424
52550	NC_013222	CTTG	2	8	3117561	3117568	0 %	50 %	25 %	25 %	260063424
52551	NC_013222	CCG	2	6	3117617	3117622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063424
52552	NC_013222	GCT	2	6	3117694	3117699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063424
52553	NC_013222	CTT	2	6	3117857	3117862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063425
52554	NC_013222	CCA	2	6	3117879	3117884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063425
52555	NC_013222	CTT	2	6	3117950	3117955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063425
52556	NC_013222	TCC	2	6	3117964	3117969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063425
52557	NC_013222	CCT	2	6	3117973	3117978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063425
52558	NC_013222	T	6	6	3118023	3118028	0 %	100 %	0 %	0 %	260063425
52559	NC_013222	TCA	2	6	3118055	3118060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063425
52560	NC_013222	TTG	2	6	3118113	3118118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063425
52561	NC_013222	CTC	2	6	3118119	3118124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063425
52562	NC_013222	CGGTGG	2	12	3118166	3118177	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260063425
52563	NC_013222	CAT	2	6	3118271	3118276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063425
52564	NC_013222	CA	3	6	3118361	3118366	50 %	0 %	0 %	50 %	260063425
52565	NC_013222	TGG	2	6	3118391	3118396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063425
52566	NC_013222	TGC	2	6	3118558	3118563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063425
52567	NC_013222	GCT	2	6	3118587	3118592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063425
52568	NC_013222	TCT	2	6	3118619	3118624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063425
52569	NC_013222	CCA	2	6	3118652	3118657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063425
52570	NC_013222	CGC	2	6	3118658	3118663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063425
52571	NC_013222	TCGG	2	8	3118686	3118693	0 %	25 %	50 %	25 %	260063425
52572	NC_013222	CCA	2	6	3118790	3118795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063425
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52575	NC_013222	TG	3	6	3118940	3118945	0 %	50 %	50 %	0 %	260063425
52576	NC_013222	TCA	2	6	3118948	3118953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063425
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52581	NC_013222	T	6	6	3118999	3119004	0 %	100 %	0 %	0 %	260063425
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52583	NC_013222	CGGC	2	8	3119065	3119072	0 %	0 %	50 %	50 %	260063425
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52587	NC_013222	C	6	6	3119218	3119223	0 %	0 %	0 %	100 %	260063425
52588	NC_013222	ATG	2	6	3119239	3119244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063425
52589	NC_013222	CGG	2	6	3119245	3119250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063425
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52616	NC_013222	GTA	2	6	3120880	3120885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063427
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52619	NC_013222	GTA	2	6	3121114	3121119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063427
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52732	NC_013222	ATTTCG	2	12	3129412	3129423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	260063440
52733	NC_013222	GGACT	2	10	3129430	3129439	20 %	20 %	40 %	20 %	260063440
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52747	NC_013222	GGGTTC	2	12	3130557	3130568	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260063441
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52753	NC_013222	GCT	2	6	3130908	3130913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063441
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52841	NC_013222	GATCC	2	10	3135408	3135417	20 %	20 %	20 %	40 %	260063444
52842	NC_013222	GCC	2	6	3135449	3135454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063444
52843	NC_013222	GGT	2	6	3135509	3135514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063444
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52847	NC_013222	TC	3	6	3135628	3135633	0 %	50 %	0 %	50 %	260063444
52848	NC_013222	AAT	2	6	3135781	3135786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063444
52849	NC_013222	TTG	2	6	3135801	3135806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063444
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52959	NC_013222	TACTG	2	10	3142100	3142109	20 %	40 %	20 %	20 %	260063449
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52964	NC_013222	TGG	2	6	3142343	3142348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063449
52965	NC_013222	CGT	2	6	3142427	3142432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063449
52966	NC_013222	CGGG	2	8	3142478	3142485	0 %	0 %	75 %	25 %	260063449
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52968	NC_013222	GAA	2	6	3142518	3142523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063449
52969	NC_013222	GTC	2	6	3142614	3142619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063449
52970	NC_013222	GGCCCC	2	12	3142626	3142637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063449
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52975	NC_013222	TGA	2	6	3143012	3143017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063449
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52982	NC_013222	CGT	2	6	3143456	3143461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063449
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52985	NC_013222	CGGG	2	8	3143543	3143550	0 %	0 %	75 %	25 %	260063449
52986	NC_013222	AC	3	6	3143564	3143569	50 %	0 %	0 %	50 %	260063449
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52988	NC_013222	C	6	6	3143710	3143715	0 %	0 %	0 %	100 %	260063449
52989	NC_013222	GCG	2	6	3143746	3143751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063449
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52992	NC_013222	ACC	2	6	3143848	3143853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063449
52993	NC_013222	AT	3	6	3143947	3143952	50 %	50 %	0 %	0 %	260063449
52994	NC_013222	CGG	2	6	3143960	3143965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063449
52995	NC_013222	GGCC	2	8	3144008	3144015	0 %	0 %	50 %	50 %	260063449
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52997	NC_013222	CCG	2	6	3144184	3144189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063449
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