MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50012	NC_013222	ATGCC	2	10	2963891	2963900	20 %	20 %	20 %	40 %	260063296
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50118	NC_013222	GCC	2	6	2970717	2970722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063303
50119	NC_013222	A	6	6	2970755	2970760	100 %	0 %	0 %	0 %	260063303
50120	NC_013222	T	6	6	2970788	2970793	0 %	100 %	0 %	0 %	260063303
50121	NC_013222	TCCA	2	8	2970830	2970837	25 %	25 %	0 %	50 %	260063303
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50136	NC_013222	AGGA	2	8	2971908	2971915	50 %	0 %	50 %	0 %	260063303
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50152	NC_013222	AAT	2	6	2973287	2973292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063304
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50223	NC_013222	GCTTGC	2	12	2977800	2977811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063307
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50226	NC_013222	TCC	2	6	2978045	2978050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063307
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50228	NC_013222	CCA	2	6	2978091	2978096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063307
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50231	NC_013222	CGGTC	2	10	2978319	2978328	0 %	20 %	40 %	40 %	260063307
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50233	NC_013222	CCG	2	6	2978471	2978476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063307
50234	NC_013222	ACC	2	6	2978477	2978482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063307
50235	NC_013222	TCCT	2	8	2978488	2978495	0 %	50 %	0 %	50 %	260063307
50236	NC_013222	TCC	2	6	2978570	2978575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063307
50237	NC_013222	GTC	2	6	2978599	2978604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063307
50238	NC_013222	GAA	2	6	2978816	2978821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063307
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50240	NC_013222	CTT	2	6	2979048	2979053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063307
50241	NC_013222	GAT	2	6	2979058	2979063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063307
50242	NC_013222	CACAGG	2	12	2979238	2979249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063307
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50245	NC_013222	ATTT	2	8	2979339	2979346	25 %	75 %	0 %	0 %	260063307
50246	NC_013222	AAATC	2	10	2979502	2979511	60 %	20 %	0 %	20 %	260063308
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50265	NC_013222	TGC	2	6	2980844	2980849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063309
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50318	NC_013222	CTGC	2	8	2984177	2984184	0 %	25 %	25 %	50 %	260063312
50319	NC_013222	ACG	2	6	2984296	2984301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063312
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50322	NC_013222	CTGGG	2	10	2984430	2984439	0 %	20 %	60 %	20 %	260063312
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50325	NC_013222	CGA	2	6	2984465	2984470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063312
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50329	NC_013222	TGA	2	6	2984575	2984580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063312
50330	NC_013222	TGG	2	6	2984689	2984694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
50331	NC_013222	TCCTGG	2	12	2984704	2984715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063312
50332	NC_013222	GGT	2	6	2984744	2984749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
50333	NC_013222	TCC	2	6	2984791	2984796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063312
50334	NC_013222	TGA	3	9	2984845	2984853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063312
50335	NC_013222	GGC	2	6	2984859	2984864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063312
50336	NC_013222	GTG	2	6	2984949	2984954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
50337	NC_013222	TCT	2	6	2984956	2984961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063312
50338	NC_013222	CAT	2	6	2984963	2984968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063312
50339	NC_013222	TGG	2	6	2984995	2985000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063312
50340	NC_013222	GCC	2	6	2985001	2985006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063312
50341	NC_013222	CCA	2	6	2985070	2985075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063313
50342	NC_013222	CGCCC	2	10	2985197	2985206	0 %	0 %	20 %	80 %	260063313
50343	NC_013222	GTGCC	2	10	2985234	2985243	0 %	20 %	40 %	40 %	260063313
50344	NC_013222	GAT	2	6	2985316	2985321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063313
50345	NC_013222	TCA	2	6	2985328	2985333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063313
50346	NC_013222	G	6	6	2985346	2985351	0 %	0 %	100 %	0 %	260063313
50347	NC_013222	GTT	2	6	2985358	2985363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063313
50348	NC_013222	CAT	2	6	2985389	2985394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063313
50349	NC_013222	ATA	2	6	2985407	2985412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063313
50350	NC_013222	CTG	2	6	2985415	2985420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063313
50351	NC_013222	CTT	2	6	2985529	2985534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063313
50352	NC_013222	TCC	2	6	2985594	2985599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063313
50353	NC_013222	ACC	2	6	2985657	2985662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063313
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50356	NC_013222	TCC	2	6	2985810	2985815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063313
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50360	NC_013222	CAA	2	6	2985934	2985939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063313
50361	NC_013222	CTT	2	6	2985997	2986002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063313
50362	NC_013222	GTA	2	6	2986118	2986123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063313
50363	NC_013222	GC	3	6	2986139	2986144	0 %	0 %	50 %	50 %	260063313
50364	NC_013222	CGC	2	6	2986175	2986180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063313
50365	NC_013222	CGG	2	6	2986222	2986227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063313
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50368	NC_013222	CTG	2	6	2986543	2986548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063314
50369	NC_013222	CGG	2	6	2986655	2986660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063314
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50372	NC_013222	GGA	2	6	2986719	2986724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063314
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50375	NC_013222	GCCC	2	8	2986860	2986867	0 %	0 %	25 %	75 %	260063314
50376	NC_013222	G	6	6	2986868	2986873	0 %	0 %	100 %	0 %	260063314
50377	NC_013222	GCA	2	6	2986942	2986947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063314
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50379	NC_013222	CTGC	2	8	2987069	2987076	0 %	25 %	25 %	50 %	260063314
50380	NC_013222	TTA	2	6	2987112	2987117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063314
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50383	NC_013222	CCA	2	6	2987228	2987233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063314
50384	NC_013222	C	6	6	2987306	2987311	0 %	0 %	0 %	100 %	260063314
50385	NC_013222	ACG	2	6	2987328	2987333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063314
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50388	NC_013222	C	6	6	2987391	2987396	0 %	0 %	0 %	100 %	260063314
50389	NC_013222	TCC	2	6	2987414	2987419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063314
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50400	NC_013222	GTG	2	6	2988213	2988218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063314
50401	NC_013222	GGT	2	6	2988234	2988239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063314
50402	NC_013222	C	7	7	2988264	2988270	0 %	0 %	0 %	100 %	260063314
50403	NC_013222	ACGGG	2	10	2988276	2988285	20 %	0 %	60 %	20 %	260063314
50404	NC_013222	TCA	2	6	2988296	2988301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063314
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50407	NC_013222	CGGG	2	8	2988435	2988442	0 %	0 %	75 %	25 %	260063314
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50410	NC_013222	GAGAA	2	10	2988530	2988539	60 %	0 %	40 %	0 %	260063314
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50416	NC_013222	GAG	2	6	2988703	2988708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063314
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50418	NC_013222	TAT	2	6	2988757	2988762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063314
50419	NC_013222	GCCG	2	8	2988789	2988796	0 %	0 %	50 %	50 %	260063314
50420	NC_013222	CCGG	2	8	2988871	2988878	0 %	0 %	50 %	50 %	260063314
50421	NC_013222	A	6	6	2988899	2988904	100 %	0 %	0 %	0 %	260063314
50422	NC_013222	GATC	2	8	2988930	2988937	25 %	25 %	25 %	25 %	260063314
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50429	NC_013222	GCCG	2	8	2989649	2989656	0 %	0 %	50 %	50 %	260063315
50430	NC_013222	TGC	2	6	2989723	2989728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063315
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50433	NC_013222	CGGAT	2	10	2989853	2989862	20 %	20 %	40 %	20 %	260063315
50434	NC_013222	T	7	7	2989951	2989957	0 %	100 %	0 %	0 %	260063315
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50445	NC_013222	GCT	2	6	2990626	2990631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063316
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50447	NC_013222	GTCC	2	8	2990680	2990687	0 %	25 %	25 %	50 %	260063316
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50449	NC_013222	TGC	2	6	2990747	2990752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063316
50450	NC_013222	CTT	2	6	2990840	2990845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063316
50451	NC_013222	GGT	2	6	2990854	2990859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063316
50452	NC_013222	CCGG	2	8	2990908	2990915	0 %	0 %	50 %	50 %	260063316
50453	NC_013222	A	6	6	2990922	2990927	100 %	0 %	0 %	0 %	260063316
50454	NC_013222	CCCGG	2	10	2990942	2990951	0 %	0 %	40 %	60 %	260063316
50455	NC_013222	GGC	2	6	2991032	2991037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063316
50456	NC_013222	TTC	2	6	2991065	2991070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063316
50457	NC_013222	TCCCCA	2	12	2991076	2991087	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260063316
50458	NC_013222	TGG	2	6	2991109	2991114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063316
50459	NC_013222	GGA	2	6	2991227	2991232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063316
50460	NC_013222	CGCC	2	8	2991271	2991278	0 %	0 %	25 %	75 %	260063316
50461	NC_013222	GGC	2	6	2991314	2991319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063316
50462	NC_013222	ACC	2	6	2991406	2991411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063316
50463	NC_013222	TCC	2	6	2991521	2991526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063317
50464	NC_013222	CGG	2	6	2991577	2991582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063317
50465	NC_013222	A	7	7	2991622	2991628	100 %	0 %	0 %	0 %	260063317
50466	NC_013222	GCG	2	6	2991660	2991665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063317
50467	NC_013222	GTC	2	6	2991701	2991706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063317
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