MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012858	GCA	2	6	161467	161472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666646
3502	NC_012858	TCT	2	6	161489	161494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666646
3503	NC_012858	GTC	2	6	161539	161544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666646
3504	NC_012858	GGCG	2	8	161585	161592	0 %	0 %	75 %	25 %	241666646
3505	NC_012858	TGG	2	6	161620	161625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666646
3506	NC_012858	CGA	2	6	161633	161638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666646
3507	NC_012858	GCC	2	6	161664	161669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666646
3508	NC_012858	GGC	2	6	161691	161696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666646
3509	NC_012858	GGA	2	6	161703	161708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666646
3510	NC_012858	GCC	2	6	161712	161717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666646
3511	NC_012858	GTCG	2	8	161772	161779	0 %	25 %	50 %	25 %	241666646
3512	NC_012858	TGC	2	6	161801	161806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666646
3513	NC_012858	GA	3	6	162348	162353	50 %	0 %	50 %	0 %	241666647
3514	NC_012858	GAA	2	6	162452	162457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666647
3515	NC_012858	ATC	2	6	162468	162473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666647
3516	NC_012858	ATC	2	6	162493	162498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666647
3517	NC_012858	TCG	2	6	162505	162510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666647
3518	NC_012858	TCC	2	6	162547	162552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666647
3519	NC_012858	AG	4	8	162682	162689	50 %	0 %	50 %	0 %	241666647
3520	NC_012858	GGCA	2	8	162724	162731	25 %	0 %	50 %	25 %	241666647
3521	NC_012858	CGCGG	2	10	162753	162762	0 %	0 %	60 %	40 %	241666647
3522	NC_012858	ATC	2	6	162780	162785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666647
3523	NC_012858	GATT	2	8	162801	162808	25 %	50 %	25 %	0 %	241666647
3524	NC_012858	GAA	2	6	162809	162814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666647
3525	NC_012858	GAT	3	9	162863	162871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666647
3526	NC_012858	GCG	2	6	163309	163314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666648
3527	NC_012858	CAT	2	6	163343	163348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666648
3528	NC_012858	GTC	2	6	163371	163376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3529	NC_012858	TG	3	6	163399	163404	0 %	50 %	50 %	0 %	241666648
3530	NC_012858	GCC	2	6	163412	163417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666648
3531	NC_012858	ACC	2	6	163420	163425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666648
3532	NC_012858	CGA	2	6	163440	163445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3533	NC_012858	TCC	2	6	163513	163518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666648
3534	NC_012858	GATG	2	8	163766	163773	25 %	25 %	50 %	0 %	241666648
3535	NC_012858	TGG	2	6	163805	163810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666648
3536	NC_012858	ATC	2	6	163812	163817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666648
3537	NC_012858	CG	3	6	163847	163852	0 %	0 %	50 %	50 %	241666648
3538	NC_012858	A	7	7	163908	163914	100 %	0 %	0 %	0 %	241666648
3539	NC_012858	CTG	2	6	163950	163955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3540	NC_012858	CGA	2	6	163982	163987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3541	NC_012858	CGC	2	6	164016	164021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666648
3542	NC_012858	CGT	2	6	164063	164068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3543	NC_012858	TTG	2	6	164080	164085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666648
3544	NC_012858	TCA	2	6	164102	164107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666648
3545	NC_012858	TCG	2	6	164165	164170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3546	NC_012858	CAC	2	6	164217	164222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666648
3547	NC_012858	CGT	2	6	164243	164248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3548	NC_012858	GTT	2	6	164295	164300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666648
3549	NC_012858	CAG	2	6	164331	164336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3550	NC_012858	C	6	6	164341	164346	0 %	0 %	0 %	100 %	241666648
3551	NC_012858	TCG	2	6	164351	164356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3552	NC_012858	TGC	2	6	164368	164373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3553	NC_012858	GTCT	2	8	164518	164525	0 %	50 %	25 %	25 %	241666649
3554	NC_012858	TGG	2	6	164566	164571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666649
3555	NC_012858	CAC	2	6	164694	164699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666649
3556	NC_012858	CGG	3	9	164700	164708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666649
3557	NC_012858	CGA	2	6	164709	164714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3558	NC_012858	GCA	2	6	164855	164860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3559	NC_012858	CGC	2	6	164920	164925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666649
3560	NC_012858	ACA	2	6	165003	165008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666649
3561	NC_012858	GGC	2	6	165058	165063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666649
3562	NC_012858	GGC	2	6	165070	165075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666649
3563	NC_012858	GAC	3	9	165103	165111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3564	NC_012858	GCA	3	9	165114	165122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3565	NC_012858	TGG	2	6	165155	165160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666649
3566	NC_012858	CCGG	2	8	165201	165208	0 %	0 %	50 %	50 %	241666649
3567	NC_012858	AAG	2	6	165235	165240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666649
3568	NC_012858	ACG	2	6	165248	165253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3569	NC_012858	GGT	2	6	165283	165288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666649
3570	NC_012858	AAG	2	6	165346	165351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666649
3571	NC_012858	GGC	2	6	165358	165363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666649
3572	NC_012858	GAC	2	6	165367	165372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3573	NC_012858	CGA	2	6	165459	165464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
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3575	NC_012858	GGA	2	6	165481	165486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666649
3576	NC_012858	CGA	2	6	165489	165494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3577	NC_012858	AGAT	2	8	165533	165540	50 %	25 %	25 %	0 %	241666649
3578	NC_012858	ACG	2	6	165548	165553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666649
3579	NC_012858	GC	3	6	165579	165584	0 %	0 %	50 %	50 %	241666649
3580	NC_012858	CT	3	6	165603	165608	0 %	50 %	0 %	50 %	241666649
3581	NC_012858	GAG	2	6	165667	165672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666649
3582	NC_012858	TCA	2	6	165675	165680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666649
3583	NC_012858	GGC	4	12	165688	165699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666649
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3585	NC_012858	TCA	2	6	165768	165773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666649
3586	NC_012858	GAG	2	6	165802	165807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666649
3587	NC_012858	TCA	2	6	165822	165827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666649
3588	NC_012858	GGC	2	6	165850	165855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666649
3589	NC_012858	TCA	2	6	165864	165869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666649
3590	NC_012858	GCCG	2	8	165954	165961	0 %	0 %	50 %	50 %	241666650
3591	NC_012858	GCC	2	6	165967	165972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666650
3592	NC_012858	CG	3	6	166179	166184	0 %	0 %	50 %	50 %	241666650
3593	NC_012858	GCC	2	6	166332	166337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666650
3594	NC_012858	CGG	2	6	166357	166362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666650
3595	NC_012858	TCG	2	6	166444	166449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666650
3596	NC_012858	GGAC	2	8	166458	166465	25 %	0 %	50 %	25 %	241666650
3597	NC_012858	CGT	2	6	166568	166573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666650
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3599	NC_012858	GA	3	6	166633	166638	50 %	0 %	50 %	0 %	241666650
3600	NC_012858	CGA	2	6	166658	166663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666650
3601	NC_012858	GC	3	6	166690	166695	0 %	0 %	50 %	50 %	241666650
3602	NC_012858	CGA	2	6	166724	166729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666650
3603	NC_012858	GAC	2	6	166731	166736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666650
3604	NC_012858	GC	3	6	166761	166766	0 %	0 %	50 %	50 %	241666650
3605	NC_012858	TTG	2	6	166783	166788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666650
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3607	NC_012858	CGT	2	6	166833	166838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666650
3608	NC_012858	CGC	2	6	166977	166982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666651
3609	NC_012858	GGA	2	6	167056	167061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666651
3610	NC_012858	GCC	2	6	167101	167106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666651
3611	NC_012858	TGAAA	2	10	167214	167223	60 %	20 %	20 %	0 %	241666651
3612	NC_012858	GC	3	6	167248	167253	0 %	0 %	50 %	50 %	241666651
3613	NC_012858	TCG	2	6	167268	167273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666651
3614	NC_012858	CGG	2	6	167306	167311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666651
3615	NC_012858	GTC	2	6	167387	167392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666651
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3618	NC_012858	A	6	6	167457	167462	100 %	0 %	0 %	0 %	241666651
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3620	NC_012858	GCG	2	6	167568	167573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666651
3621	NC_012858	CGG	2	6	167684	167689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666651
3622	NC_012858	CAT	2	6	167692	167697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666651
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3624	NC_012858	GCG	2	6	167746	167751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666652
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3737	NC_012858	TGC	2	6	173035	173040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666656
3738	NC_012858	GTTT	2	8	173102	173109	0 %	75 %	25 %	0 %	241666656
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3862	NC_012858	TCGC	2	8	179380	179387	0 %	25 %	25 %	50 %	241666662
3863	NC_012858	TTC	2	6	179425	179430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666662
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3865	NC_012858	GC	4	8	179491	179498	0 %	0 %	50 %	50 %	241666662
3866	NC_012858	CGTTT	2	10	179540	179549	0 %	60 %	20 %	20 %	241666662
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3979	NC_012858	GCAA	2	8	185257	185264	50 %	0 %	25 %	25 %	241666666
3980	NC_012858	TGA	2	6	185269	185274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666666
3981	NC_012858	CG	3	6	185275	185280	0 %	0 %	50 %	50 %	241666666
3982	NC_012858	GC	3	6	185281	185286	0 %	0 %	50 %	50 %	241666666
3983	NC_012858	GAC	2	6	185288	185293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666666
3984	NC_012858	CAT	2	6	185330	185335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666666
3985	NC_012858	CAT	2	6	185381	185386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666666
3986	NC_012858	CGC	2	6	185398	185403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666666
3987	NC_012858	ATC	2	6	185424	185429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666666
3988	NC_012858	ATC	3	9	185442	185450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666666
3989	NC_012858	TGT	2	6	185509	185514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666666
3990	NC_012858	CTG	2	6	185523	185528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666666
3991	NC_012858	CGG	2	6	185540	185545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666666
3992	NC_012858	CAT	2	6	185546	185551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666666
3993	NC_012858	CGG	2	6	185665	185670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666667
3994	NC_012858	CCA	2	6	185686	185691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666667
3995	NC_012858	GCC	2	6	185733	185738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666667
3996	NC_012858	AAC	2	6	185781	185786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666667
3997	NC_012858	GCC	2	6	185859	185864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666667
3998	NC_012858	CCAG	2	8	185914	185921	25 %	0 %	25 %	50 %	241666667
3999	NC_012858	CGC	2	6	185954	185959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666667
4000	NC_012858	CGA	2	6	185965	185970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666667

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