MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012858	GGC	2	6	72956	72961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666559
1502	NC_012858	CAT	2	6	73021	73026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666559
1503	NC_012858	CGC	2	6	73027	73032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666559
1504	NC_012858	CGA	2	6	73039	73044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666559
1505	NC_012858	CTG	2	6	73120	73125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666559
1506	NC_012858	CTT	3	9	73178	73186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666560
1507	NC_012858	TCG	2	6	73236	73241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1508	NC_012858	GCA	2	6	73263	73268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1509	NC_012858	TCG	2	6	73320	73325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1510	NC_012858	TCG	2	6	73332	73337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1511	NC_012858	CAA	2	6	73345	73350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666560
1512	NC_012858	GCT	2	6	73366	73371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1513	NC_012858	GAC	2	6	73427	73432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1514	NC_012858	CCG	2	6	73461	73466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666560
1515	NC_012858	CGT	2	6	73471	73476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1516	NC_012858	TGGAAC	2	12	73478	73489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666560
1517	NC_012858	CGAAA	2	10	73504	73513	60 %	0 %	20 %	20 %	241666560
1518	NC_012858	ACGGCA	2	12	73536	73547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1519	NC_012858	TCGG	2	8	73679	73686	0 %	25 %	50 %	25 %	241666560
1520	NC_012858	CGA	2	6	73777	73782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1521	NC_012858	TCG	2	6	73842	73847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1522	NC_012858	GGCC	2	8	73891	73898	0 %	0 %	50 %	50 %	241666560
1523	NC_012858	GC	3	6	73985	73990	0 %	0 %	50 %	50 %	241666560
1524	NC_012858	AAC	2	6	73991	73996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666560
1525	NC_012858	CG	3	6	74022	74027	0 %	0 %	50 %	50 %	241666560
1526	NC_012858	GCGCC	2	10	74053	74062	0 %	0 %	40 %	60 %	241666560
1527	NC_012858	TCG	2	6	74091	74096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1528	NC_012858	GCC	2	6	74099	74104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666560
1529	NC_012858	CGA	2	6	74161	74166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1530	NC_012858	ACG	2	6	74190	74195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1531	NC_012858	GAA	2	6	74206	74211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666560
1532	NC_012858	CGGC	2	8	74223	74230	0 %	0 %	50 %	50 %	241666560
1533	NC_012858	CAT	2	6	74251	74256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666560
1534	NC_012858	CAA	2	6	74260	74265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666560
1535	NC_012858	GCA	2	6	74268	74273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1536	NC_012858	ATG	2	6	74312	74317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666560
1537	NC_012858	CAG	2	6	74318	74323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1538	NC_012858	CGC	2	6	74375	74380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666560
1539	NC_012858	ATC	2	6	74399	74404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666560
1540	NC_012858	CGC	2	6	74418	74423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666560
1541	NC_012858	CAA	2	6	74461	74466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666560
1542	NC_012858	CGT	2	6	74478	74483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1543	NC_012858	GAT	2	6	74492	74497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666560
1544	NC_012858	TGA	2	6	74514	74519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666560
1545	NC_012858	GCC	2	6	74522	74527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666560
1546	NC_012858	CGA	2	6	74566	74571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
1547	NC_012858	AAG	2	6	74645	74650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666560
1548	NC_012858	CGA	2	6	74875	74880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1549	NC_012858	GAG	2	6	74949	74954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666561
1550	NC_012858	TCG	2	6	74961	74966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1551	NC_012858	CCG	2	6	75118	75123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666561
1552	NC_012858	GGC	2	6	75146	75151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666561
1553	NC_012858	GGC	2	6	75206	75211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666561
1554	NC_012858	AAC	2	6	75240	75245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666561
1555	NC_012858	TAT	2	6	75264	75269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666561
1556	NC_012858	GAG	2	6	75282	75287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666561
1557	NC_012858	CGA	2	6	75385	75390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1558	NC_012858	GCA	2	6	75435	75440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1559	NC_012858	TGA	2	6	75493	75498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666561
1560	NC_012858	CGG	2	6	75569	75574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666561
1561	NC_012858	GCC	2	6	75579	75584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666561
1562	NC_012858	CGGG	2	8	75659	75666	0 %	0 %	75 %	25 %	241666561
1563	NC_012858	GCG	2	6	75687	75692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666561
1564	NC_012858	ATG	2	6	75693	75698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666561
1565	NC_012858	CGA	2	6	75736	75741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1566	NC_012858	CTT	2	6	75744	75749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666561
1567	NC_012858	AGC	2	6	75876	75881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1568	NC_012858	GTC	2	6	76089	76094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1569	NC_012858	GTC	2	6	76175	76180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1570	NC_012858	TG	3	6	76241	76246	0 %	50 %	50 %	0 %	241666561
1571	NC_012858	CGA	2	6	76256	76261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666561
1572	NC_012858	GCG	2	6	76548	76553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666562
1573	NC_012858	GGC	2	6	76554	76559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666562
1574	NC_012858	CGGG	2	8	76597	76604	0 %	0 %	75 %	25 %	241666562
1575	NC_012858	GCG	2	6	76631	76636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666562
1576	NC_012858	GAC	2	6	76650	76655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1577	NC_012858	CAT	2	6	76661	76666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666562
1578	NC_012858	CAGC	2	8	76684	76691	25 %	0 %	25 %	50 %	241666562
1579	NC_012858	TGC	2	6	76702	76707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1580	NC_012858	TCG	2	6	76711	76716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1581	NC_012858	CTG	2	6	76731	76736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1582	NC_012858	CCA	2	6	76841	76846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666562
1583	NC_012858	TCG	2	6	76864	76869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1584	NC_012858	CG	3	6	76888	76893	0 %	0 %	50 %	50 %	241666562
1585	NC_012858	TGG	2	6	76918	76923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666562
1586	NC_012858	GTC	2	6	76941	76946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1587	NC_012858	CGA	2	6	76973	76978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1588	NC_012858	TCGT	2	8	77008	77015	0 %	50 %	25 %	25 %	241666562
1589	NC_012858	CGA	2	6	77038	77043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666562
1590	NC_012858	CGGC	3	12	77048	77059	0 %	0 %	50 %	50 %	241666562
1591	NC_012858	GATC	2	8	77093	77100	25 %	25 %	25 %	25 %	241666562
1592	NC_012858	TCTG	2	8	77183	77190	0 %	50 %	25 %	25 %	241666562
1593	NC_012858	CAC	2	6	77270	77275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666562
1594	NC_012858	TGGCG	2	10	77456	77465	0 %	20 %	60 %	20 %	241666562
1595	NC_012858	CG	3	6	77464	77469	0 %	0 %	50 %	50 %	241666562
1596	NC_012858	CCGG	2	8	77513	77520	0 %	0 %	50 %	50 %	241666562
1597	NC_012858	GCG	2	6	77604	77609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666563
1598	NC_012858	GTC	2	6	77623	77628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666563
1599	NC_012858	CGA	2	6	77637	77642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666563
1600	NC_012858	CCT	2	6	77722	77727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666563
1601	NC_012858	CAG	2	6	77797	77802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666563
1602	NC_012858	ATC	2	6	77809	77814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666563
1603	NC_012858	ATC	2	6	77854	77859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666563
1604	NC_012858	CGA	2	6	78051	78056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666563
1605	NC_012858	GGC	2	6	78060	78065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666563
1606	NC_012858	CGA	2	6	78113	78118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666563
1607	NC_012858	CAT	2	6	78129	78134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666563
1608	NC_012858	CGC	2	6	78135	78140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666563
1609	NC_012858	ACGG	2	8	78407	78414	25 %	0 %	50 %	25 %	241666564
1610	NC_012858	TCG	2	6	78445	78450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666564
1611	NC_012858	TCG	2	6	78520	78525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666564
1612	NC_012858	CGA	2	6	78569	78574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666564
1613	NC_012858	GGCC	2	8	78587	78594	0 %	0 %	50 %	50 %	241666564
1614	NC_012858	CGG	2	6	78602	78607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666564
1615	NC_012858	GAG	2	6	78639	78644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666564
1616	NC_012858	GCG	2	6	78664	78669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666564
1617	NC_012858	ACA	2	6	78697	78702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666564
1618	NC_012858	TCT	2	6	78707	78712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666564
1619	NC_012858	AT	3	6	78728	78733	50 %	50 %	0 %	0 %	241666564
1620	NC_012858	AAC	2	6	78762	78767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666564
1621	NC_012858	T	6	6	78776	78781	0 %	100 %	0 %	0 %	241666564
1622	NC_012858	ACG	2	6	78850	78855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666564
1623	NC_012858	CCA	2	6	78916	78921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666564
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1995	NC_012858	TTC	2	6	97348	97353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666583
1996	NC_012858	CAG	2	6	97386	97391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666583
1997	NC_012858	TTG	2	6	97393	97398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666583
1998	NC_012858	CAGC	2	8	97418	97425	25 %	0 %	25 %	50 %	241666583
1999	NC_012858	GCCG	2	8	97431	97438	0 %	0 %	50 %	50 %	241666583
2000	NC_012858	AGG	2	6	97442	97447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666583

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