MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_012858	CTG	2	6	614983	614988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667076
12003	NC_012858	GCG	2	6	615061	615066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
12004	NC_012858	GAC	2	6	615103	615108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
12005	NC_012858	GAA	2	6	615124	615129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667076
12006	NC_012858	CAC	2	6	615132	615137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667076
12007	NC_012858	CGG	2	6	615167	615172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
12008	NC_012858	CAGCC	2	10	615185	615194	20 %	0 %	20 %	60 %	241667076
12009	NC_012858	TCGG	2	8	615217	615224	0 %	25 %	50 %	25 %	241667076
12010	NC_012858	CAT	3	9	615234	615242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667076
12011	NC_012858	GCC	2	6	615246	615251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
12012	NC_012858	CTT	2	6	615298	615303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667076
12013	NC_012858	CAGC	2	8	615324	615331	25 %	0 %	25 %	50 %	241667076
12014	NC_012858	TCGA	2	8	615385	615392	25 %	25 %	25 %	25 %	241667076
12015	NC_012858	CGA	2	6	615465	615470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
12016	NC_012858	GAC	3	9	615501	615509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
12017	NC_012858	AGA	2	6	615551	615556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667076
12018	NC_012858	CGG	2	6	615583	615588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667076
12019	NC_012858	CTCG	2	8	615597	615604	0 %	25 %	25 %	50 %	241667076
12020	NC_012858	CGC	2	6	615650	615655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
12021	NC_012858	GCA	2	6	615711	615716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
12022	NC_012858	GCC	2	6	615775	615780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667076
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12024	NC_012858	CGA	2	6	615849	615854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667076
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12044	NC_012858	GCGG	2	8	617002	617009	0 %	0 %	75 %	25 %	241667078
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12102	NC_012858	GTC	2	6	619258	619263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667081
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12118	NC_012858	GGC	2	6	620237	620242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667082
12119	NC_012858	CTTCCG	2	12	620248	620259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241667082
12120	NC_012858	CCTT	2	8	620295	620302	0 %	50 %	0 %	50 %	241667082
12121	NC_012858	TCGGTC	2	12	620325	620336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667082
12122	NC_012858	ATCGAC	2	12	620351	620362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241667082
12123	NC_012858	GTG	2	6	620379	620384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667082
12124	NC_012858	GC	3	6	620446	620451	0 %	0 %	50 %	50 %	241667082
12125	NC_012858	CCGA	2	8	620476	620483	25 %	0 %	25 %	50 %	241667082
12126	NC_012858	GAT	2	6	620486	620491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667082
12127	NC_012858	GAC	2	6	620620	620625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667083
12128	NC_012858	AGC	2	6	620639	620644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667083
12129	NC_012858	TCT	2	6	620661	620666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667083
12130	NC_012858	GCG	2	6	620741	620746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667083
12131	NC_012858	GGT	2	6	620754	620759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667083
12132	NC_012858	CAT	2	6	620815	620820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667083
12133	NC_012858	ATC	3	9	620909	620917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667083
12134	NC_012858	CTC	3	9	620923	620931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667083
12135	NC_012858	AGC	2	6	620945	620950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667083
12136	NC_012858	CCT	2	6	621024	621029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667083
12137	NC_012858	GAC	2	6	621040	621045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667083
12138	NC_012858	GCA	2	6	621047	621052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667083
12139	NC_012858	GAT	2	6	621072	621077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667083
12140	NC_012858	GCG	2	6	621114	621119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667083
12141	NC_012858	AGG	2	6	621126	621131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667083
12142	NC_012858	TCAGCG	2	12	621177	621188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667083
12143	NC_012858	TCA	2	6	621898	621903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667084
12144	NC_012858	CCG	3	9	621904	621912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667084
12145	NC_012858	CGG	2	6	621934	621939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667084
12146	NC_012858	CGAC	2	8	621973	621980	25 %	0 %	25 %	50 %	241667084
12147	NC_012858	ACG	2	6	621999	622004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667084
12148	NC_012858	CGATGC	2	12	622049	622060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667084
12149	NC_012858	TCG	2	6	622072	622077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667084
12150	NC_012858	GAT	2	6	622193	622198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667084
12151	NC_012858	ATC	2	6	622251	622256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667084
12152	NC_012858	GGC	2	6	622322	622327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667084
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12154	NC_012858	ACG	2	6	622453	622458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667084
12155	NC_012858	GCC	2	6	622467	622472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667084
12156	NC_012858	CGCC	2	8	622478	622485	0 %	0 %	25 %	75 %	241667084
12157	NC_012858	CGG	2	6	622583	622588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667084
12158	NC_012858	CAT	2	6	622687	622692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667085
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12160	NC_012858	ATT	2	6	622782	622787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241667085
12161	NC_012858	CGG	2	6	622788	622793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667085
12162	NC_012858	CTG	2	6	622873	622878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667085
12163	NC_012858	TCG	3	9	622905	622913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667085
12164	NC_012858	GGC	2	6	622956	622961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667085
12165	NC_012858	GTC	2	6	623033	623038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667085
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12168	NC_012858	TCG	2	6	623127	623132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667085
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12170	NC_012858	GC	3	6	623188	623193	0 %	0 %	50 %	50 %	241667085
12171	NC_012858	CGGC	2	8	623259	623266	0 %	0 %	50 %	50 %	241667085
12172	NC_012858	TGGCT	2	10	623267	623276	0 %	40 %	40 %	20 %	241667085
12173	NC_012858	CGA	2	6	623281	623286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667085
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12177	NC_012858	CCG	2	6	623374	623379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667085
12178	NC_012858	TGA	2	6	623421	623426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667085
12179	NC_012858	TTC	2	6	623498	623503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667085
12180	NC_012858	CAT	2	6	623605	623610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667085
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12182	NC_012858	CGC	2	6	623707	623712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667085
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12184	NC_012858	GCA	2	6	623770	623775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667085
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12186	NC_012858	CCTG	2	8	623868	623875	0 %	25 %	25 %	50 %	241667085
12187	NC_012858	CGC	2	6	623884	623889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667085
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12189	NC_012858	CTG	2	6	624252	624257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
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12191	NC_012858	TGC	2	6	624271	624276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12192	NC_012858	GCC	2	6	624297	624302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667086
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12195	NC_012858	CCCT	2	8	624366	624373	0 %	25 %	0 %	75 %	241667086
12196	NC_012858	ATG	2	6	624388	624393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667086
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12199	NC_012858	TAT	2	6	624528	624533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241667086
12200	NC_012858	CGG	2	6	624554	624559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667086
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12203	NC_012858	GC	3	6	624771	624776	0 %	0 %	50 %	50 %	241667086
12204	NC_012858	GC	3	6	624847	624852	0 %	0 %	50 %	50 %	241667086
12205	NC_012858	TCA	2	6	624874	624879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667086
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12209	NC_012858	CGG	2	6	624953	624958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667086
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12214	NC_012858	GCT	2	6	625121	625126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12215	NC_012858	TGCC	2	8	625201	625208	0 %	25 %	25 %	50 %	241667086
12216	NC_012858	TCA	2	6	625236	625241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667086
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12219	NC_012858	CGT	2	6	625313	625318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12220	NC_012858	TGCCGA	2	12	625388	625399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12221	NC_012858	CG	3	6	625420	625425	0 %	0 %	50 %	50 %	241667086
12222	NC_012858	ACG	2	6	625434	625439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12223	NC_012858	AGCC	2	8	625460	625467	25 %	0 %	25 %	50 %	241667086
12224	NC_012858	GCC	2	6	625581	625586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667086
12225	NC_012858	GCC	2	6	625656	625661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667086
12226	NC_012858	GAC	2	6	625665	625670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12227	NC_012858	GCC	2	6	625673	625678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667086
12228	NC_012858	GC	3	6	625839	625844	0 %	0 %	50 %	50 %	241667086
12229	NC_012858	CGA	2	6	625903	625908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12230	NC_012858	AAG	2	6	625911	625916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667086
12231	NC_012858	TCG	2	6	625969	625974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12232	NC_012858	GGCGAA	2	12	625997	626008	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241667086
12233	NC_012858	AGC	2	6	626021	626026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12234	NC_012858	AAG	2	6	626031	626036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667086
12235	NC_012858	GAG	2	6	626086	626091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667086
12236	NC_012858	TGC	2	6	626125	626130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667086
12237	NC_012858	CGG	2	6	626134	626139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667086
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12474	NC_012858	CAG	2	6	635875	635880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667094
12475	NC_012858	AAGC	2	8	635903	635910	50 %	0 %	25 %	25 %	241667094
12476	NC_012858	CG	3	6	635919	635924	0 %	0 %	50 %	50 %	241667094
12477	NC_012858	CGA	2	6	635939	635944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667094
12478	NC_012858	CGA	2	6	636095	636100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667094
12479	NC_012858	CTGG	2	8	636101	636108	0 %	25 %	50 %	25 %	241667094
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12495	NC_012858	CGA	2	6	636650	636655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667094
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12500	NC_012858	GGCG	2	8	636806	636813	0 %	0 %	75 %	25 %	241667094

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