MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012858	CGA	2	6	524456	524461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666999
10002	NC_012858	TCT	2	6	524500	524505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666999
10003	NC_012858	CGA	2	6	524552	524557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666999
10004	NC_012858	GAT	2	6	524585	524590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666999
10005	NC_012858	CCA	2	6	524645	524650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666999
10006	NC_012858	GAT	2	6	524655	524660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666999
10007	NC_012858	GGC	2	6	524711	524716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666999
10008	NC_012858	ATCTA	2	10	524719	524728	40 %	40 %	0 %	20 %	241666999
10009	NC_012858	CGA	2	6	524959	524964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667000
10010	NC_012858	CAA	2	6	524992	524997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667000
10011	NC_012858	CGC	2	6	525016	525021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667000
10012	NC_012858	GCTGGC	2	12	525052	525063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667000
10013	NC_012858	TCG	2	6	525069	525074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667000
10014	NC_012858	CGC	2	6	525091	525096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667000
10015	NC_012858	GGCG	2	8	525121	525128	0 %	0 %	75 %	25 %	241667000
10016	NC_012858	CGG	2	6	525187	525192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667000
10017	NC_012858	GC	3	6	525198	525203	0 %	0 %	50 %	50 %	241667000
10018	NC_012858	GC	3	6	525236	525241	0 %	0 %	50 %	50 %	241667000
10019	NC_012858	GCC	2	6	525251	525256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667000
10020	NC_012858	GAG	2	6	525272	525277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667000
10021	NC_012858	GCG	2	6	525399	525404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667000
10022	NC_012858	ATCG	2	8	525449	525456	25 %	25 %	25 %	25 %	241667000
10023	NC_012858	CG	3	6	525455	525460	0 %	0 %	50 %	50 %	241667000
10024	NC_012858	ATC	2	6	525542	525547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667000
10025	NC_012858	GGCC	2	8	525563	525570	0 %	0 %	50 %	50 %	241667000
10026	NC_012858	TCG	2	6	525603	525608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667000
10027	NC_012858	CGG	2	6	525648	525653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667000
10028	NC_012858	AGGCCA	2	12	525696	525707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667000
10029	NC_012858	TCA	2	6	525741	525746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667000
10030	NC_012858	CGCC	2	8	525811	525818	0 %	0 %	25 %	75 %	241667000
10031	NC_012858	TCGACG	2	12	525885	525896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667000
10032	NC_012858	GCT	2	6	525922	525927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667000
10033	NC_012858	TGA	2	6	525987	525992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667000
10034	NC_012858	CG	3	6	526017	526022	0 %	0 %	50 %	50 %	241667000
10035	NC_012858	CGGC	2	8	526047	526054	0 %	0 %	50 %	50 %	241667000
10036	NC_012858	TCA	2	6	526238	526243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667001
10037	NC_012858	TCT	2	6	526257	526262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667001
10038	NC_012858	CGC	2	6	526263	526268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667001
10039	NC_012858	TCA	2	6	526391	526396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667001
10040	NC_012858	CCCG	2	8	526414	526421	0 %	0 %	25 %	75 %	241667001
10041	NC_012858	CAA	2	6	526551	526556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667001
10042	NC_012858	TGA	2	6	526640	526645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667002
10043	NC_012858	AAC	2	6	526656	526661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667002
10044	NC_012858	CGT	2	6	526707	526712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667002
10045	NC_012858	CTT	2	6	526734	526739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667002
10046	NC_012858	GGT	2	6	526751	526756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667002
10047	NC_012858	CGTG	2	8	526802	526809	0 %	25 %	50 %	25 %	241667002
10048	NC_012858	TCT	2	6	526909	526914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667002
10049	NC_012858	CGA	2	6	526919	526924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667002
10050	NC_012858	CGC	2	6	526927	526932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667002
10051	NC_012858	GTG	2	6	526940	526945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667002
10052	NC_012858	TCG	2	6	526954	526959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667002
10053	NC_012858	ATG	2	6	526999	527004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667002
10054	NC_012858	CGC	2	6	527047	527052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667002
10055	NC_012858	GC	3	6	527115	527120	0 %	0 %	50 %	50 %	241667002
10056	NC_012858	TCC	2	6	527160	527165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667003
10057	NC_012858	CGA	2	6	527168	527173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667003
10058	NC_012858	CAA	2	6	527204	527209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667003
10059	NC_012858	CGAG	2	8	527212	527219	25 %	0 %	50 %	25 %	241667003
10060	NC_012858	ATC	2	6	527231	527236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667003
10061	NC_012858	CA	3	6	527312	527317	50 %	0 %	0 %	50 %	241667003
10062	NC_012858	CGTC	2	8	527320	527327	0 %	25 %	25 %	50 %	241667003
10063	NC_012858	CCCG	2	8	527330	527337	0 %	0 %	25 %	75 %	241667003
10064	NC_012858	GGT	2	6	527390	527395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667003
10065	NC_012858	CGGG	2	8	527427	527434	0 %	0 %	75 %	25 %	241667003
10066	NC_012858	GTA	2	6	527516	527521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667003
10067	NC_012858	CATGC	2	10	527531	527540	20 %	20 %	20 %	40 %	241667003
10068	NC_012858	GGC	2	6	527559	527564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667003
10069	NC_012858	CCT	2	6	527629	527634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667003
10070	NC_012858	TCG	2	6	527797	527802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667004
10071	NC_012858	GC	3	6	527819	527824	0 %	0 %	50 %	50 %	241667004
10072	NC_012858	ATC	2	6	527901	527906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667004
10073	NC_012858	TGT	2	6	527909	527914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241667004
10074	NC_012858	GCT	2	6	528073	528078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667004
10075	NC_012858	GAA	2	6	528096	528101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667004
10076	NC_012858	CAGC	2	8	528158	528165	25 %	0 %	25 %	50 %	241667004
10077	NC_012858	CCA	2	6	528233	528238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667004
10078	NC_012858	TCT	2	6	528241	528246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667004
10079	NC_012858	CTG	3	9	528278	528286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667004
10080	NC_012858	GAC	2	6	528303	528308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667004
10081	NC_012858	GTCT	2	8	528345	528352	0 %	50 %	25 %	25 %	241667004
10082	NC_012858	GCATC	2	10	528397	528406	20 %	20 %	20 %	40 %	241667004
10083	NC_012858	CGG	2	6	528569	528574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667004
10084	NC_012858	CAG	2	6	528668	528673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667005
10085	NC_012858	GCT	2	6	528676	528681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667005
10086	NC_012858	TTC	2	6	528684	528689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667005
10087	NC_012858	TCT	2	6	528738	528743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667005
10088	NC_012858	TCC	2	6	528771	528776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667005
10089	NC_012858	GCA	2	6	528822	528827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667005
10090	NC_012858	A	7	7	529024	529030	100 %	0 %	0 %	0 %	241667006
10091	NC_012858	CCG	2	6	529061	529066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667006
10092	NC_012858	TCG	3	9	529148	529156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667006
10093	NC_012858	GGC	2	6	529158	529163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667006
10094	NC_012858	CAG	2	6	529164	529169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667006
10095	NC_012858	GAC	2	6	529216	529221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667006
10096	NC_012858	CAG	2	6	529240	529245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667006
10097	NC_012858	GACC	2	8	529251	529258	25 %	0 %	25 %	50 %	241667006
10098	NC_012858	AGA	2	6	529262	529267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667006
10099	NC_012858	TCA	2	6	529341	529346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667006
10100	NC_012858	CGA	2	6	529458	529463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667006
10101	NC_012858	GGC	2	6	529491	529496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667006
10102	NC_012858	CGGC	2	8	529504	529511	0 %	0 %	50 %	50 %	241667006
10103	NC_012858	CAT	2	6	529519	529524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667006
10104	NC_012858	CAT	2	6	530407	530412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667007
10105	NC_012858	TGA	2	6	530417	530422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667007
10106	NC_012858	GAT	2	6	530469	530474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667007
10107	NC_012858	CAT	2	6	530540	530545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667007
10108	NC_012858	GCGTCA	2	12	530564	530575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10109	NC_012858	CG	3	6	530606	530611	0 %	0 %	50 %	50 %	241667007
10110	NC_012858	CGG	2	6	530613	530618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667007
10111	NC_012858	CGA	2	6	530627	530632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10112	NC_012858	CTC	2	6	530664	530669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667007
10113	NC_012858	GAT	2	6	530670	530675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667007
10114	NC_012858	TTC	2	6	530719	530724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667007
10115	NC_012858	AGCACC	2	12	530740	530751	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241667007
10116	NC_012858	CTG	2	6	530752	530757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10117	NC_012858	CGA	2	6	530807	530812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10118	NC_012858	GATC	2	8	530906	530913	25 %	25 %	25 %	25 %	241667007
10119	NC_012858	GGCCGG	2	12	530933	530944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667007
10120	NC_012858	GGC	2	6	530979	530984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667007
10121	NC_012858	CCG	2	6	531134	531139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667007
10122	NC_012858	TCA	2	6	531155	531160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667007
10123	NC_012858	CGA	2	6	531188	531193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10124	NC_012858	CGA	2	6	531257	531262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10125	NC_012858	CAC	2	6	531309	531314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667007
10126	NC_012858	GGT	2	6	531336	531341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667007
10127	NC_012858	ACG	2	6	531352	531357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667007
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10129	NC_012858	CGA	2	6	531404	531409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667007
10130	NC_012858	GCG	2	6	531440	531445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667007
10131	NC_012858	GAT	2	6	531456	531461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667007
10132	NC_012858	TCGT	2	8	531493	531500	0 %	50 %	25 %	25 %	241667007
10133	NC_012858	CGGC	2	8	531511	531518	0 %	0 %	50 %	50 %	241667007
10134	NC_012858	TGC	2	6	531537	531542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667007
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10138	NC_012858	GAT	2	6	531678	531683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667007
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10143	NC_012858	TGC	2	6	532392	532397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667008
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10146	NC_012858	GCG	2	6	532440	532445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667008
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10152	NC_012858	ATG	2	6	532664	532669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667008
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10154	NC_012858	GCT	2	6	532723	532728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667008
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10173	NC_012858	CCGGCG	2	12	533426	533437	0 %	0 %	50 %	50 %	241667008
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10222	NC_012858	ACG	3	9	535519	535527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667009
10223	NC_012858	GC	3	6	535571	535576	0 %	0 %	50 %	50 %	241667009
10224	NC_012858	CGCGT	2	10	535617	535626	0 %	20 %	40 %	40 %	241667010
10225	NC_012858	CGG	2	6	535633	535638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667010
10226	NC_012858	TCG	2	6	535641	535646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667010
10227	NC_012858	TGC	2	6	535648	535653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667010
10228	NC_012858	GCC	2	6	535732	535737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667010
10229	NC_012858	CCCG	3	12	535754	535765	0 %	0 %	25 %	75 %	241667010
10230	NC_012858	CGG	2	6	535810	535815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667010
10231	NC_012858	CAT	2	6	535828	535833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667010
10232	NC_012858	CAGC	2	8	535837	535844	25 %	0 %	25 %	50 %	241667010
10233	NC_012858	ACA	2	6	535893	535898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241667010
10234	NC_012858	CTTC	2	8	535929	535936	0 %	50 %	0 %	50 %	241667010
10235	NC_012858	GAC	2	6	535946	535951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667010
10236	NC_012858	CTTCAC	2	12	535957	535968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241667010
10237	NC_012858	CGA	2	6	536014	536019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667010
10238	NC_012858	TGG	2	6	536030	536035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667010
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10354	NC_012858	CGT	2	6	540669	540674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667013
10355	NC_012858	AGCC	2	8	540722	540729	25 %	0 %	25 %	50 %	241667013
10356	NC_012858	CG	3	6	540740	540745	0 %	0 %	50 %	50 %	241667013
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10473	NC_012858	CGA	2	6	545569	545574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667016
10474	NC_012858	GCT	2	6	545593	545598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667016
10475	NC_012858	GCC	2	6	545613	545618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667016
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10481	NC_012858	CAG	2	6	545864	545869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667016
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