MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012858	CTTCGC	2	12	339069	339080	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666796
7002	NC_012858	GC	3	6	339204	339209	0 %	0 %	50 %	50 %	241666796
7003	NC_012858	CGC	2	6	339253	339258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666796
7004	NC_012858	GCCTGC	2	12	339269	339280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666796
7005	NC_012858	CCT	2	6	339291	339296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666796
7006	NC_012858	GGCAA	2	10	339361	339370	40 %	0 %	40 %	20 %	241666796
7007	NC_012858	CG	3	6	339389	339394	0 %	0 %	50 %	50 %	241666796
7008	NC_012858	TGA	2	6	339425	339430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666796
7009	NC_012858	CGA	2	6	339516	339521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666796
7010	NC_012858	GTC	2	6	339667	339672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666796
7011	NC_012858	TGGC	2	8	339981	339988	0 %	25 %	50 %	25 %	241666797
7012	NC_012858	GCA	2	6	340009	340014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666797
7013	NC_012858	TGG	2	6	340023	340028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666797
7014	NC_012858	TCT	2	6	340153	340158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666798
7015	NC_012858	ACC	2	6	340203	340208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666798
7016	NC_012858	TCT	2	6	340236	340241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666798
7017	NC_012858	GTA	2	6	340243	340248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666798
7018	NC_012858	GCT	2	6	340352	340357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666798
7019	NC_012858	GAT	2	6	340390	340395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666798
7020	NC_012858	GGGC	2	8	340427	340434	0 %	0 %	75 %	25 %	241666798
7021	NC_012858	GTC	2	6	340886	340891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7022	NC_012858	TTC	3	9	340979	340987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666799
7023	NC_012858	GCG	2	6	340988	340993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666799
7024	NC_012858	CTG	2	6	341003	341008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7025	NC_012858	TGG	2	6	341096	341101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666799
7026	NC_012858	CG	3	6	341163	341168	0 %	0 %	50 %	50 %	241666799
7027	NC_012858	GCC	2	6	341172	341177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666799
7028	NC_012858	ATCT	2	8	341204	341211	25 %	50 %	0 %	25 %	241666799
7029	NC_012858	GGT	2	6	341227	341232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666799
7030	NC_012858	CGGC	2	8	341356	341363	0 %	0 %	50 %	50 %	241666799
7031	NC_012858	GTC	2	6	341414	341419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7032	NC_012858	CTG	2	6	341444	341449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7033	NC_012858	TCG	2	6	341466	341471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7034	NC_012858	AGT	2	6	341516	341521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666799
7035	NC_012858	CGT	2	6	341557	341562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7036	NC_012858	ATC	2	6	341585	341590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666799
7037	NC_012858	GC	3	6	341599	341604	0 %	0 %	50 %	50 %	241666799
7038	NC_012858	AGC	2	6	341615	341620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7039	NC_012858	CGC	2	6	341806	341811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666799
7040	NC_012858	GAG	2	6	341840	341845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666799
7041	NC_012858	CGC	2	6	341868	341873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666799
7042	NC_012858	CGG	2	6	341951	341956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666799
7043	NC_012858	AAG	2	6	341963	341968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666799
7044	NC_012858	TGA	2	6	342009	342014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666799
7045	NC_012858	GCG	2	6	342024	342029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666799
7046	NC_012858	TCG	2	6	342033	342038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7047	NC_012858	GGAG	2	8	342045	342052	25 %	0 %	75 %	0 %	241666799
7048	NC_012858	CGGC	2	8	342073	342080	0 %	0 %	50 %	50 %	241666799
7049	NC_012858	ATT	2	6	342093	342098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666799
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7051	NC_012858	TCG	3	9	342159	342167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7052	NC_012858	CGC	2	6	342195	342200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666799
7053	NC_012858	TGC	2	6	342201	342206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666799
7054	NC_012858	CCGGC	2	10	342211	342220	0 %	0 %	40 %	60 %	241666799
7055	NC_012858	GCC	2	6	342236	342241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666799
7056	NC_012858	CGC	2	6	342251	342256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666799
7057	NC_012858	ACG	2	6	342759	342764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666800
7058	NC_012858	GCG	2	6	342781	342786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666800
7059	NC_012858	GCGG	2	8	342814	342821	0 %	0 %	75 %	25 %	241666800
7060	NC_012858	CG	3	6	342841	342846	0 %	0 %	50 %	50 %	241666800
7061	NC_012858	TCG	2	6	342912	342917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666800
7062	NC_012858	CCG	2	6	342972	342977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666800
7063	NC_012858	GCCA	2	8	342981	342988	25 %	0 %	25 %	50 %	241666800
7064	NC_012858	GCAG	2	8	343020	343027	25 %	0 %	50 %	25 %	241666800
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7073	NC_012858	CGT	2	6	343859	343864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666801
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7103	NC_012858	GCC	2	6	345200	345205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666803
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7105	NC_012858	CGGCA	2	10	345254	345263	20 %	0 %	40 %	40 %	241666803
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7120	NC_012858	CAG	2	6	346211	346216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666805
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7133	NC_012858	GTTTC	2	10	346809	346818	0 %	60 %	20 %	20 %	241666806
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7242	NC_012858	GGC	2	6	353086	353091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
7243	NC_012858	ATG	2	6	353137	353142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666814
7244	NC_012858	CTTCT	2	10	353197	353206	0 %	60 %	0 %	40 %	241666814
7245	NC_012858	ATA	2	6	353230	353235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666814
7246	NC_012858	TCC	2	6	353254	353259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
7247	NC_012858	GAA	2	6	353270	353275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666814
7248	NC_012858	CTG	2	6	353277	353282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666814
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7250	NC_012858	GTT	2	6	353337	353342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666814
7251	NC_012858	CGA	2	6	353382	353387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
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7253	NC_012858	CGG	2	6	353467	353472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
7254	NC_012858	CCT	2	6	353475	353480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
7255	NC_012858	GAT	2	6	353499	353504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666814
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7257	NC_012858	C	6	6	353530	353535	0 %	0 %	0 %	100 %	241666814
7258	NC_012858	CCA	2	6	353537	353542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666814
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7265	NC_012858	TCTG	2	8	353828	353835	0 %	50 %	25 %	25 %	241666814
7266	NC_012858	TCGCG	2	10	353837	353846	0 %	20 %	40 %	40 %	241666814
7267	NC_012858	GAT	2	6	353895	353900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666814
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7272	NC_012858	CGA	2	6	354050	354055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
7273	NC_012858	TCT	2	6	354158	354163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666814
7274	NC_012858	CGG	2	6	354164	354169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
7275	NC_012858	CGG	2	6	354185	354190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
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7281	NC_012858	GC	3	6	354318	354323	0 %	0 %	50 %	50 %	241666814
7282	NC_012858	GA	3	6	354349	354354	50 %	0 %	50 %	0 %	241666814
7283	NC_012858	CAG	2	6	354425	354430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
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7345	NC_012858	GAC	2	6	357826	357831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666817
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7348	NC_012858	AACGG	2	10	357970	357979	40 %	0 %	40 %	20 %	241666817
7349	NC_012858	CGT	2	6	358020	358025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666817
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7358	NC_012858	ACGA	2	8	358339	358346	50 %	0 %	25 %	25 %	241666817
7359	NC_012858	CCA	2	6	358367	358372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666817
7360	NC_012858	CAT	2	6	358439	358444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666817
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7362	NC_012858	GCT	2	6	358521	358526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666817
7363	NC_012858	ATT	2	6	358559	358564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666817
7364	NC_012858	CGGA	2	8	358601	358608	25 %	0 %	50 %	25 %	241666817
7365	NC_012858	CGA	2	6	358617	358622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666817
7366	NC_012858	AGCAA	2	10	358646	358655	60 %	0 %	20 %	20 %	241666817
7367	NC_012858	GGGC	2	8	358664	358671	0 %	0 %	75 %	25 %	241666817
7368	NC_012858	CA	3	6	358747	358752	50 %	0 %	0 %	50 %	241666817
7369	NC_012858	GCGG	2	8	358790	358797	0 %	0 %	75 %	25 %	241666817
7370	NC_012858	CACC	2	8	358815	358822	25 %	0 %	0 %	75 %	241666817
7371	NC_012858	CGC	2	6	358897	358902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666817
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7375	NC_012858	GC	3	6	359109	359114	0 %	0 %	50 %	50 %	241666817
7376	NC_012858	AGCA	2	8	359132	359139	50 %	0 %	25 %	25 %	241666817
7377	NC_012858	CGC	2	6	359163	359168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666817
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7395	NC_012858	CGC	2	6	360182	360187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666818
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7482	NC_012858	TGCG	2	8	365323	365330	0 %	25 %	50 %	25 %	241666822
7483	NC_012858	GGC	3	9	365340	365348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666822
7484	NC_012858	CG	4	8	365371	365378	0 %	0 %	50 %	50 %	241666822
7485	NC_012858	GCTC	2	8	365382	365389	0 %	25 %	25 %	50 %	241666822
7486	NC_012858	CCG	2	6	365405	365410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666822
7487	NC_012858	TCG	2	6	365434	365439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666822
7488	NC_012858	CGC	2	6	365460	365465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666822
7489	NC_012858	TGC	2	6	365478	365483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666822
7490	NC_012858	AGC	2	6	365503	365508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666822
7491	NC_012858	GC	3	6	365515	365520	0 %	0 %	50 %	50 %	241666822
7492	NC_012858	GCCGT	2	10	365554	365563	0 %	20 %	40 %	40 %	241666822
7493	NC_012858	CCT	2	6	365579	365584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666822
7494	NC_012858	TC	3	6	365627	365632	0 %	50 %	0 %	50 %	241666822
7495	NC_012858	CGA	2	6	365780	365785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666822
7496	NC_012858	CGC	2	6	365791	365796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666822
7497	NC_012858	GAT	2	6	365838	365843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666822
7498	NC_012858	GC	3	6	365845	365850	0 %	0 %	50 %	50 %	241666822
7499	NC_012858	GCAA	2	8	365863	365870	50 %	0 %	25 %	25 %	241666822
7500	NC_012858	CGC	2	6	365879	365884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666822

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