MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 2

Total Repeats: 29572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_012857	AGCG	2	8	1320072	1320079	25 %	0 %	50 %	25 %	241666213
29502	NC_012857	CGC	2	6	1320086	1320091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666213
29503	NC_012857	CGA	2	6	1320092	1320097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666213
29504	NC_012857	CGAC	2	8	1320121	1320128	25 %	0 %	25 %	50 %	241666213
29505	NC_012857	TCA	2	6	1320130	1320135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666213
29506	NC_012857	GC	3	6	1320204	1320209	0 %	0 %	50 %	50 %	241666213
29507	NC_012857	GCGG	2	8	1320223	1320230	0 %	0 %	75 %	25 %	241666213
29508	NC_012857	CAC	2	6	1320259	1320264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666213
29509	NC_012857	GGCT	2	8	1320357	1320364	0 %	25 %	50 %	25 %	241666213
29510	NC_012857	ACC	2	6	1320370	1320375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666213
29511	NC_012857	GCGCT	2	10	1320393	1320402	0 %	20 %	40 %	40 %	241666213
29512	NC_012857	GCG	2	6	1320406	1320411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666213
29513	NC_012857	CGG	2	6	1320464	1320469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666213
29514	NC_012857	TCG	2	6	1320520	1320525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666213
29515	NC_012857	CCGG	2	8	1320566	1320573	0 %	0 %	50 %	50 %	241666213
29516	NC_012857	GC	3	6	1320596	1320601	0 %	0 %	50 %	50 %	241666213
29517	NC_012857	CGC	2	6	1320608	1320613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666213
29518	NC_012857	CTG	2	6	1320618	1320623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666213
29519	NC_012857	CAC	2	6	1320667	1320672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666213
29520	NC_012857	CGC	2	6	1320674	1320679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666213
29521	NC_012857	AC	3	6	1320708	1320713	50 %	0 %	0 %	50 %	241666214
29522	NC_012857	GC	3	6	1320725	1320730	0 %	0 %	50 %	50 %	241666214
29523	NC_012857	CTG	2	6	1320815	1320820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666214
29524	NC_012857	GCTG	2	8	1320862	1320869	0 %	25 %	50 %	25 %	241666214
29525	NC_012857	GCC	2	6	1320886	1320891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666214
29526	NC_012857	GCTG	2	8	1320896	1320903	0 %	25 %	50 %	25 %	241666214
29527	NC_012857	GC	3	6	1320948	1320953	0 %	0 %	50 %	50 %	241666215
29528	NC_012857	CAG	2	6	1321022	1321027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666215
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29531	NC_012857	GGC	2	6	1321086	1321091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666215
29532	NC_012857	TGT	2	6	1321094	1321099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666215
29533	NC_012857	TCT	2	6	1321115	1321120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666215
29534	NC_012857	GCA	2	6	1321157	1321162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666215
29535	NC_012857	GC	3	6	1321240	1321245	0 %	0 %	50 %	50 %	241666215
29536	NC_012857	TGCGG	2	10	1321272	1321281	0 %	20 %	60 %	20 %	241666215
29537	NC_012857	CG	3	6	1321307	1321312	0 %	0 %	50 %	50 %	241666215
29538	NC_012857	AGC	2	6	1321327	1321332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666215
29539	NC_012857	GCCA	2	8	1321335	1321342	25 %	0 %	25 %	50 %	241666215
29540	NC_012857	GCA	2	6	1321379	1321384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666215
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29542	NC_012857	GGC	2	6	1321500	1321505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666215
29543	NC_012857	TGC	2	6	1321540	1321545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666215
29544	NC_012857	GC	3	6	1321561	1321566	0 %	0 %	50 %	50 %	241666215
29545	NC_012857	TTC	2	6	1321572	1321577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666215
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29549	NC_012857	CTG	2	6	1321881	1321886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666215
29550	NC_012857	TGC	2	6	1321900	1321905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666215
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29552	NC_012857	CGTC	2	8	1321968	1321975	0 %	25 %	25 %	50 %	241666215
29553	NC_012857	GCG	2	6	1322310	1322315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666216
29554	NC_012857	CGG	2	6	1322338	1322343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666216
29555	NC_012857	CGC	2	6	1322344	1322349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666216
29556	NC_012857	GC	3	6	1322348	1322353	0 %	0 %	50 %	50 %	241666216
29557	NC_012857	CAC	2	6	1322377	1322382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666216
29558	NC_012857	GC	3	6	1322437	1322442	0 %	0 %	50 %	50 %	241666216
29559	NC_012857	CAG	2	6	1322467	1322472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666216
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29571	NC_012857	CCG	2	6	1323224	1323229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666217
29572	NC_012857	ACC	2	6	1323239	1323244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666217

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.