MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012855	GC	3	6	187527	187532	0 %	0 %	50 %	50 %	241589740
3002	NC_012855	GCT	2	6	187542	187547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589740
3003	NC_012855	CGG	2	6	187551	187556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589740
3004	NC_012855	GC	3	6	187639	187644	0 %	0 %	50 %	50 %	241589740
3005	NC_012855	CCG	2	6	187777	187782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589740
3006	NC_012855	TCT	2	6	187860	187865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589740
3007	NC_012855	ATCC	2	8	187893	187900	25 %	25 %	0 %	50 %	241589740
3008	NC_012855	GCTC	2	8	188020	188027	0 %	25 %	25 %	50 %	241589740
3009	NC_012855	GAA	2	6	188043	188048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589740
3010	NC_012855	TCG	2	6	188049	188054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589740
3011	NC_012855	CAG	2	6	188134	188139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589740
3012	NC_012855	AG	3	6	188157	188162	50 %	0 %	50 %	0 %	241589740
3013	NC_012855	CGA	2	6	188274	188279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589740
3014	NC_012855	CGG	2	6	188318	188323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589740
3015	NC_012855	CCT	2	6	188349	188354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589740
3016	NC_012855	GAG	2	6	188395	188400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589740
3017	NC_012855	GCA	2	6	188449	188454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589740
3018	NC_012855	GCC	2	6	188481	188486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589740
3019	NC_012855	ACT	2	6	188523	188528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589740
3020	NC_012855	GCC	2	6	188568	188573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589740
3021	NC_012855	CAC	2	6	188724	188729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589740
3022	NC_012855	AGC	2	6	188802	188807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589741
3023	NC_012855	ATC	3	9	188824	188832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589741
3024	NC_012855	TGA	2	6	188886	188891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589741
3025	NC_012855	CCG	2	6	188934	188939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589741
3026	NC_012855	GAA	2	6	189012	189017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589741
3027	NC_012855	GTC	2	6	189139	189144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589741
3028	NC_012855	CCAG	2	8	189170	189177	25 %	0 %	25 %	50 %	241589741
3029	NC_012855	TGA	2	6	189215	189220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589741
3030	NC_012855	GAC	2	6	189257	189262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589741
3031	NC_012855	GTGCA	2	10	189406	189415	20 %	20 %	40 %	20 %	241589742
3032	NC_012855	CCG	2	6	189460	189465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589742
3033	NC_012855	GTT	2	6	189487	189492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589742
3034	NC_012855	GGT	2	6	189944	189949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589743
3035	NC_012855	TGCT	2	8	189954	189961	0 %	50 %	25 %	25 %	241589743
3036	NC_012855	CCT	2	6	189968	189973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589743
3037	NC_012855	CAAA	2	8	190086	190093	75 %	0 %	0 %	25 %	241589743
3038	NC_012855	GCC	2	6	190218	190223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589744
3039	NC_012855	GCAA	2	8	190235	190242	50 %	0 %	25 %	25 %	241589744
3040	NC_012855	TAC	2	6	190261	190266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589744
3041	NC_012855	TGA	2	6	190792	190797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589745
3042	NC_012855	GGC	2	6	190805	190810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589745
3043	NC_012855	CGG	2	6	190927	190932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589745
3044	NC_012855	ACA	2	6	190933	190938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589745
3045	NC_012855	CCTG	2	8	191000	191007	0 %	25 %	25 %	50 %	241589745
3046	NC_012855	ACA	2	6	191153	191158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589745
3047	NC_012855	TGT	2	6	191204	191209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589745
3048	NC_012855	GC	3	6	191216	191221	0 %	0 %	50 %	50 %	241589745
3049	NC_012855	GCT	2	6	191241	191246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589745
3050	NC_012855	AGCA	2	8	191320	191327	50 %	0 %	25 %	25 %	241589746
3051	NC_012855	GTT	2	6	191425	191430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589746
3052	NC_012855	ACG	2	6	191450	191455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589746
3053	NC_012855	TGA	2	6	191658	191663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589747
3054	NC_012855	CGT	2	6	192479	192484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589748
3055	NC_012855	GAAGGT	2	12	192526	192537	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241589748
3056	NC_012855	GCC	2	6	192562	192567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589748
3057	NC_012855	GGT	2	6	192623	192628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589748
3058	NC_012855	TGG	2	6	192711	192716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589748
3059	NC_012855	GTC	2	6	192721	192726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589748
3060	NC_012855	CG	3	6	192768	192773	0 %	0 %	50 %	50 %	241589748
3061	NC_012855	TGCT	2	8	192802	192809	0 %	50 %	25 %	25 %	241589748
3062	NC_012855	ACA	2	6	192985	192990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589749
3063	NC_012855	GGC	2	6	193073	193078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589749
3064	NC_012855	CGG	2	6	193192	193197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589749
3065	NC_012855	CGT	2	6	193213	193218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3066	NC_012855	CAG	2	6	193219	193224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3067	NC_012855	CA	3	6	193264	193269	50 %	0 %	0 %	50 %	241589749
3068	NC_012855	AGC	2	6	193272	193277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3069	NC_012855	GGC	2	6	193291	193296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589749
3070	NC_012855	GCC	2	6	193307	193312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589749
3071	NC_012855	CTG	2	6	193337	193342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3072	NC_012855	GCA	2	6	193368	193373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3073	NC_012855	ACG	2	6	193392	193397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3074	NC_012855	GCCA	2	8	193415	193422	25 %	0 %	25 %	50 %	241589749
3075	NC_012855	GGCC	2	8	193429	193436	0 %	0 %	50 %	50 %	241589749
3076	NC_012855	GGT	2	6	193447	193452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589749
3077	NC_012855	CGA	2	6	193588	193593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3078	NC_012855	GCG	2	6	193632	193637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589749
3079	NC_012855	GTC	2	6	193646	193651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3080	NC_012855	AGC	2	6	193691	193696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3081	NC_012855	CGC	3	9	193725	193733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589749
3082	NC_012855	AGCG	2	8	193780	193787	25 %	0 %	50 %	25 %	241589749
3083	NC_012855	GGT	2	6	193801	193806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589749
3084	NC_012855	CAG	2	6	193872	193877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589749
3085	NC_012855	ACGA	2	8	193917	193924	50 %	0 %	25 %	25 %	241589749
3086	NC_012855	GAG	2	6	193976	193981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589749
3087	NC_012855	CAC	2	6	194018	194023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589749
3088	NC_012855	CAA	2	6	194179	194184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589749
3089	NC_012855	GGA	2	6	194194	194199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589749
3090	NC_012855	CGAC	2	8	194218	194225	25 %	0 %	25 %	50 %	241589749
3091	NC_012855	GAA	2	6	194659	194664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589750
3092	NC_012855	TGG	2	6	194694	194699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589750
3093	NC_012855	GCC	2	6	194729	194734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589750
3094	NC_012855	AAGC	2	8	194756	194763	50 %	0 %	25 %	25 %	241589750
3095	NC_012855	TGA	2	6	194815	194820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589750
3096	NC_012855	CGT	2	6	194854	194859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589750
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3098	NC_012855	GGAAG	2	10	195121	195130	40 %	0 %	60 %	0 %	241589751
3099	NC_012855	CTG	2	6	195158	195163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589751
3100	NC_012855	AGG	2	6	195171	195176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589751
3101	NC_012855	CGA	2	6	195184	195189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589751
3102	NC_012855	GGAT	2	8	195220	195227	25 %	25 %	50 %	0 %	241589751
3103	NC_012855	GTC	2	6	195287	195292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589751
3104	NC_012855	CG	3	6	195408	195413	0 %	0 %	50 %	50 %	241589751
3105	NC_012855	GCA	2	6	195436	195441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589751
3106	NC_012855	TTC	2	6	195494	195499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589751
3107	NC_012855	ACG	2	6	195503	195508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589751
3108	NC_012855	GTG	2	6	195526	195531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589751
3109	NC_012855	CGC	2	6	195552	195557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589751
3110	NC_012855	AGG	2	6	195894	195899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589751
3111	NC_012855	TCT	2	6	195990	195995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589751
3112	NC_012855	GCGA	2	8	196042	196049	25 %	0 %	50 %	25 %	241589751
3113	NC_012855	TGT	2	6	196075	196080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589751
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3116	NC_012855	CG	3	6	196141	196146	0 %	0 %	50 %	50 %	241589751
3117	NC_012855	CGG	2	6	196517	196522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589752
3118	NC_012855	GGTC	2	8	196563	196570	0 %	25 %	50 %	25 %	241589752
3119	NC_012855	GGC	2	6	196617	196622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589752
3120	NC_012855	CCGG	2	8	196647	196654	0 %	0 %	50 %	50 %	241589752
3121	NC_012855	CGCC	2	8	196700	196707	0 %	0 %	25 %	75 %	241589752
3122	NC_012855	AGC	2	6	196919	196924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589753
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3125	NC_012855	GCA	2	6	197018	197023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589753
3126	NC_012855	GTC	2	6	197048	197053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589753
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3231	NC_012855	GCCG	2	8	204753	204760	0 %	0 %	50 %	50 %	241589761
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3233	NC_012855	AGCG	2	8	204789	204796	25 %	0 %	50 %	25 %	241589761
3234	NC_012855	GCCAT	2	10	204998	205007	20 %	20 %	20 %	40 %	241589762
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3239	NC_012855	CG	4	8	205271	205278	0 %	0 %	50 %	50 %	241589762
3240	NC_012855	CAA	2	6	205330	205335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589762
3241	NC_012855	CGT	2	6	205422	205427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589763
3242	NC_012855	TGT	2	6	205436	205441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589763
3243	NC_012855	TGT	2	6	205450	205455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589763
3244	NC_012855	GC	4	8	205463	205470	0 %	0 %	50 %	50 %	241589763
3245	NC_012855	GC	3	6	205637	205642	0 %	0 %	50 %	50 %	241589763
3246	NC_012855	CTC	2	6	205688	205693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589763
3247	NC_012855	ATG	2	6	205700	205705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589763
3248	NC_012855	GTT	2	6	205784	205789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589764
3249	NC_012855	AGCGA	2	10	205834	205843	40 %	0 %	40 %	20 %	241589764
3250	NC_012855	GCA	2	6	205967	205972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589764
3251	NC_012855	AGC	2	6	205984	205989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589764
3252	NC_012855	AGCGC	2	10	206006	206015	20 %	0 %	40 %	40 %	241589764
3253	NC_012855	CGAC	2	8	206065	206072	25 %	0 %	25 %	50 %	241589764
3254	NC_012855	TGA	2	6	206167	206172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589764
3255	NC_012855	CGGC	3	12	206220	206231	0 %	0 %	50 %	50 %	241589764
3256	NC_012855	TGCC	2	8	206233	206240	0 %	25 %	25 %	50 %	241589764
3257	NC_012855	TCG	2	6	206276	206281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589764
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3259	NC_012855	AGC	2	6	206365	206370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589764
3260	NC_012855	CCGC	2	8	206535	206542	0 %	0 %	25 %	75 %	241589764
3261	NC_012855	GCT	2	6	206691	206696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589764
3262	NC_012855	CGAG	2	8	206931	206938	25 %	0 %	50 %	25 %	241589765
3263	NC_012855	ACC	2	6	206969	206974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589765
3264	NC_012855	TGA	2	6	206984	206989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589765
3265	NC_012855	TGTA	2	8	207062	207069	25 %	50 %	25 %	0 %	241589765
3266	NC_012855	GCTG	2	8	207072	207079	0 %	25 %	50 %	25 %	241589765
3267	NC_012855	GGAG	2	8	207222	207229	25 %	0 %	75 %	0 %	241589765
3268	NC_012855	GGC	2	6	207241	207246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589765
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3270	NC_012855	TGG	2	6	207308	207313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589765
3271	NC_012855	GAC	2	6	207325	207330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589765
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3273	NC_012855	TGCG	2	8	207494	207501	0 %	25 %	50 %	25 %	241589765
3274	NC_012855	GTT	2	6	207546	207551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589766
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3282	NC_012855	TCT	2	6	208258	208263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589766
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3300	NC_012855	CGT	2	6	210056	210061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589769
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3350	NC_012855	CAAG	2	8	214389	214396	50 %	0 %	25 %	25 %	241589776
3351	NC_012855	CTC	2	6	214576	214581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589776
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3355	NC_012855	GCA	2	6	214733	214738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589776
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3359	NC_012855	CG	3	6	214940	214945	0 %	0 %	50 %	50 %	241589777
3360	NC_012855	GAG	2	6	214960	214965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589777
3361	NC_012855	TGA	2	6	215003	215008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589777
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3363	NC_012855	GTG	3	9	215235	215243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589778
3364	NC_012855	GCC	2	6	215270	215275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589778
3365	NC_012855	GTT	2	6	215289	215294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589778
3366	NC_012855	CTG	2	6	215315	215320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589778
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3372	NC_012855	GCT	2	6	215812	215817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589780
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3384	NC_012855	CTG	2	6	216366	216371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589780
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3485	NC_012855	TTGT	2	8	222676	222683	0 %	75 %	25 %	0 %	241589788
3486	NC_012855	AAG	2	6	222728	222733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589788
3487	NC_012855	GACG	2	8	222754	222761	25 %	0 %	50 %	25 %	241589788
3488	NC_012855	GTTG	2	8	222858	222865	0 %	50 %	50 %	0 %	241589788
3489	NC_012855	CGAG	2	8	222992	222999	25 %	0 %	50 %	25 %	241589788
3490	NC_012855	GCGA	2	8	223046	223053	25 %	0 %	50 %	25 %	241589788
3491	NC_012855	CG	3	6	223097	223102	0 %	0 %	50 %	50 %	241589788
3492	NC_012855	TCAT	2	8	223117	223124	25 %	50 %	0 %	25 %	241589788
3493	NC_012855	GGA	2	6	223161	223166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589788
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