MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012855	CGC	2	6	317757	317762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589895
5002	NC_012855	GCCGGC	2	12	317793	317804	0 %	0 %	50 %	50 %	241589895
5003	NC_012855	GC	3	6	317811	317816	0 %	0 %	50 %	50 %	241589895
5004	NC_012855	AGC	2	6	318138	318143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589896
5005	NC_012855	CTTC	2	8	318237	318244	0 %	50 %	0 %	50 %	241589896
5006	NC_012855	GGA	2	6	318258	318263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589896
5007	NC_012855	TGA	2	6	318279	318284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589896
5008	NC_012855	CTG	2	6	318292	318297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589896
5009	NC_012855	CCAG	2	8	318314	318321	25 %	0 %	25 %	50 %	241589896
5010	NC_012855	C	6	6	318396	318401	0 %	0 %	0 %	100 %	241589897
5011	NC_012855	GGCGC	2	10	318440	318449	0 %	0 %	60 %	40 %	241589897
5012	NC_012855	CTT	2	6	318470	318475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589897
5013	NC_012855	GATG	2	8	318494	318501	25 %	25 %	50 %	0 %	241589897
5014	NC_012855	GC	4	8	318608	318615	0 %	0 %	50 %	50 %	241589897
5015	NC_012855	GC	3	6	318633	318638	0 %	0 %	50 %	50 %	241589897
5016	NC_012855	ACG	2	6	318663	318668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589897
5017	NC_012855	CAG	2	6	318693	318698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589897
5018	NC_012855	GAC	2	6	318741	318746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589897
5019	NC_012855	GTG	2	6	318877	318882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589898
5020	NC_012855	GAA	2	6	318997	319002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589898
5021	NC_012855	TCACCT	2	12	319038	319049	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241589898
5022	NC_012855	GCT	2	6	319072	319077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589898
5023	NC_012855	TGA	2	6	319079	319084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589898
5024	NC_012855	CATG	2	8	319165	319172	25 %	25 %	25 %	25 %	241589899
5025	NC_012855	TGG	2	6	319177	319182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589899
5026	NC_012855	GCA	2	6	319217	319222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589899
5027	NC_012855	ATC	2	6	319328	319333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589900
5028	NC_012855	CGAT	2	8	319374	319381	25 %	25 %	25 %	25 %	241589900
5029	NC_012855	CGA	2	6	319441	319446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589900
5030	NC_012855	GTT	2	6	319465	319470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589900
5031	NC_012855	TCTT	2	8	319485	319492	0 %	75 %	0 %	25 %	241589900
5032	NC_012855	CGAT	2	8	319509	319516	25 %	25 %	25 %	25 %	241589900
5033	NC_012855	GTA	2	6	319548	319553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589900
5034	NC_012855	GGA	2	6	319618	319623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589900
5035	NC_012855	ACG	2	6	319788	319793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589900
5036	NC_012855	CGT	2	6	319834	319839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589900
5037	NC_012855	GGT	2	6	319888	319893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589900
5038	NC_012855	TCG	2	6	319968	319973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589900
5039	NC_012855	TGC	2	6	320068	320073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589900
5040	NC_012855	GAC	2	6	320509	320514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5041	NC_012855	TCG	2	6	320516	320521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5042	NC_012855	TCG	2	6	320574	320579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5043	NC_012855	GCA	2	6	320611	320616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5044	NC_012855	CAT	2	6	320640	320645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589901
5045	NC_012855	ACG	2	6	320654	320659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5046	NC_012855	TC	3	6	320683	320688	0 %	50 %	0 %	50 %	241589901
5047	NC_012855	G	6	6	320844	320849	0 %	0 %	100 %	0 %	241589901
5048	NC_012855	TCG	2	6	320933	320938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5049	NC_012855	ACG	2	6	320966	320971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589901
5050	NC_012855	GTT	2	6	320980	320985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589901
5051	NC_012855	GCCT	2	8	321084	321091	0 %	25 %	25 %	50 %	241589902
5052	NC_012855	CGG	2	6	321103	321108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589902
5053	NC_012855	TCTCC	2	10	321142	321151	0 %	40 %	0 %	60 %	241589902
5054	NC_012855	GC	3	6	321177	321182	0 %	0 %	50 %	50 %	241589902
5055	NC_012855	GAG	2	6	321294	321299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589902
5056	NC_012855	TCCT	2	8	321333	321340	0 %	50 %	0 %	50 %	241589902
5057	NC_012855	CGG	2	6	321768	321773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589903
5058	NC_012855	ACGA	2	8	321794	321801	50 %	0 %	25 %	25 %	241589903
5059	NC_012855	GCT	2	6	321819	321824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589903
5060	NC_012855	CGC	2	6	321870	321875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589903
5061	NC_012855	AGC	2	6	321897	321902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589903
5062	NC_012855	GC	3	6	321967	321972	0 %	0 %	50 %	50 %	241589903
5063	NC_012855	GC	4	8	322061	322068	0 %	0 %	50 %	50 %	241589903
5064	NC_012855	ACG	2	6	322107	322112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589903
5065	NC_012855	TC	3	6	322165	322170	0 %	50 %	0 %	50 %	241589903
5066	NC_012855	TTC	2	6	322256	322261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589903
5067	NC_012855	ACGTGT	2	12	322263	322274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241589903
5068	NC_012855	AGCA	2	8	322769	322776	50 %	0 %	25 %	25 %	241589904
5069	NC_012855	GCG	2	6	322801	322806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589904
5070	NC_012855	CCA	2	6	322807	322812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589904
5071	NC_012855	AGC	2	6	322849	322854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589904
5072	NC_012855	GC	3	6	322893	322898	0 %	0 %	50 %	50 %	241589904
5073	NC_012855	AGT	2	6	322965	322970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589904
5074	NC_012855	ATC	2	6	323038	323043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589904
5075	NC_012855	CGT	2	6	323074	323079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589904
5076	NC_012855	GCG	2	6	323107	323112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589904
5077	NC_012855	GGTC	2	8	323115	323122	0 %	25 %	50 %	25 %	241589904
5078	NC_012855	CGC	2	6	323150	323155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589904
5079	NC_012855	CCGA	2	8	323193	323200	25 %	0 %	25 %	50 %	241589904
5080	NC_012855	ACG	2	6	323356	323361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589904
5081	NC_012855	CTG	2	6	323412	323417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589904
5082	NC_012855	TTG	2	6	323605	323610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589904
5083	NC_012855	GTT	2	6	323666	323671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589904
5084	NC_012855	GGCAA	2	10	324025	324034	40 %	0 %	40 %	20 %	241589905
5085	NC_012855	CATC	2	8	324105	324112	25 %	25 %	0 %	50 %	241589905
5086	NC_012855	TC	3	6	324177	324182	0 %	50 %	0 %	50 %	241589905
5087	NC_012855	CAC	2	6	324258	324263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589905
5088	NC_012855	GC	3	6	324267	324272	0 %	0 %	50 %	50 %	241589905
5089	NC_012855	AGC	2	6	324289	324294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589905
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5091	NC_012855	TCG	2	6	324316	324321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589905
5092	NC_012855	CTG	2	6	324391	324396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589905
5093	NC_012855	CAAA	2	8	324410	324417	75 %	0 %	0 %	25 %	241589905
5094	NC_012855	CGC	2	6	324462	324467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589905
5095	NC_012855	ACGCG	2	10	324480	324489	20 %	0 %	40 %	40 %	241589905
5096	NC_012855	TCC	2	6	324518	324523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589905
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5098	NC_012855	TGC	2	6	324587	324592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589905
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5100	NC_012855	GTT	2	6	324931	324936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589906
5101	NC_012855	GC	3	6	324952	324957	0 %	0 %	50 %	50 %	241589906
5102	NC_012855	CCG	2	6	324963	324968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589906
5103	NC_012855	CCT	2	6	324974	324979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589906
5104	NC_012855	TTC	2	6	325005	325010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589906
5105	NC_012855	GGC	2	6	325032	325037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589906
5106	NC_012855	CTG	2	6	325047	325052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589906
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5108	NC_012855	TGGC	2	8	325228	325235	0 %	25 %	50 %	25 %	241589906
5109	NC_012855	CTG	2	6	325247	325252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589906
5110	NC_012855	CG	3	6	325257	325262	0 %	0 %	50 %	50 %	241589906
5111	NC_012855	GC	3	6	325283	325288	0 %	0 %	50 %	50 %	241589906
5112	NC_012855	TG	3	6	325306	325311	0 %	50 %	50 %	0 %	241589906
5113	NC_012855	GCT	2	6	325313	325318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589906
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5119	NC_012855	CG	4	8	325499	325506	0 %	0 %	50 %	50 %	241589906
5120	NC_012855	CGG	2	6	325511	325516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589906
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5122	NC_012855	GCC	2	6	325564	325569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589906
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