MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 5837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012854	GCG	2	6	31363	31368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
502	NC_012854	CTG	2	6	31491	31496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554098
503	NC_012854	CCGC	2	8	31497	31504	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
504	NC_012854	GGC	2	6	31522	31527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
505	NC_012854	CTG	2	6	31576	31581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554098
506	NC_012854	GATC	2	8	31677	31684	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
507	NC_012854	GGC	3	9	31729	31737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
508	NC_012854	CAT	2	6	32049	32054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554099
509	NC_012854	CAT	2	6	32117	32122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554099
510	NC_012854	GCC	2	6	32172	32177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554099
511	NC_012854	AG	3	6	32295	32300	50 %	0 %	50 %	0 %	241554099
512	NC_012854	G	7	7	32319	32325	0 %	0 %	100 %	0 %	241554099
513	NC_012854	GAT	2	6	32331	32336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554099
514	NC_012854	GAC	2	6	32337	32342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554099
515	NC_012854	GAA	2	6	32388	32393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554099
516	NC_012854	GTC	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
517	NC_012854	TGGA	2	8	32683	32690	25 %	25 %	50 %	0 %	241554099
518	NC_012854	GTC	3	9	32692	32700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
519	NC_012854	CGGC	2	8	32754	32761	0 %	0 %	50 %	50 %	241554099
520	NC_012854	TGG	2	6	32797	32802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554099
521	NC_012854	CGCAT	2	10	32803	32812	20 %	20 %	20 %	40 %	241554099
522	NC_012854	GCC	2	6	32845	32850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554099
523	NC_012854	GGC	2	6	32880	32885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554099
524	NC_012854	AGC	2	6	32917	32922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554099
525	NC_012854	TGC	2	6	32936	32941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
526	NC_012854	CCG	2	6	32946	32951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554099
527	NC_012854	AAC	2	6	32977	32982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554099
528	NC_012854	GCT	2	6	33006	33011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
529	NC_012854	TCG	2	6	33017	33022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
530	NC_012854	TCGTC	2	10	33035	33044	0 %	40 %	20 %	40 %	241554099
531	NC_012854	GACTC	2	10	33051	33060	20 %	20 %	20 %	40 %	241554099
532	NC_012854	CT	3	6	33062	33067	0 %	50 %	0 %	50 %	241554099
533	NC_012854	CAA	2	6	33077	33082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554099
534	NC_012854	CAT	2	6	34539	34544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
535	NC_012854	GTC	2	6	34557	34562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
536	NC_012854	TCA	2	6	34583	34588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
537	NC_012854	GCG	2	6	34591	34596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554100
538	NC_012854	TGA	2	6	34673	34678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554100
539	NC_012854	GAT	2	6	34698	34703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554100
540	NC_012854	CGC	2	6	34758	34763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
541	NC_012854	TCG	2	6	34798	34803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
542	NC_012854	TGG	2	6	34817	34822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554100
543	NC_012854	CGT	2	6	34856	34861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
544	NC_012854	ACG	2	6	34876	34881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
545	NC_012854	GCC	2	6	34899	34904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
546	NC_012854	TCGACG	2	12	35014	35025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554100
547	NC_012854	CGA	2	6	35083	35088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
548	NC_012854	GCC	3	9	35091	35099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
549	NC_012854	ACG	2	6	35101	35106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
550	NC_012854	TCC	2	6	35179	35184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554100
551	NC_012854	CGC	4	12	35202	35213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
552	NC_012854	ATC	2	6	35217	35222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
553	NC_012854	T	7	7	35243	35249	0 %	100 %	0 %	0 %	241554100
554	NC_012854	GTC	2	6	35286	35291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
555	NC_012854	TCG	2	6	35320	35325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
556	NC_012854	TTG	2	6	35331	35336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554100
557	NC_012854	TTG	2	6	35347	35352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554100
558	NC_012854	TCG	2	6	35401	35406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
559	NC_012854	TCA	2	6	35458	35463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
560	NC_012854	GGA	2	6	35679	35684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554101
561	NC_012854	GCT	2	6	35724	35729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554101
562	NC_012854	CGG	2	6	35808	35813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554101
563	NC_012854	CAG	2	6	35885	35890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554101
564	NC_012854	CGC	2	6	35916	35921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554101
565	NC_012854	GCC	2	6	36034	36039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554101
566	NC_012854	CAC	2	6	36088	36093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554101
567	NC_012854	TTC	2	6	36193	36198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554101
568	NC_012854	GAT	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554101
569	NC_012854	CGA	2	6	36252	36257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554101
570	NC_012854	GTG	2	6	36284	36289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554101
571	NC_012854	CGTG	2	8	36297	36304	0 %	25 %	50 %	25 %	241554101
572	NC_012854	GCC	2	6	36376	36381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554101
573	NC_012854	GCC	2	6	36385	36390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554101
574	NC_012854	CCGGC	2	10	36621	36630	0 %	0 %	40 %	60 %	241554102
575	NC_012854	CGA	2	6	36641	36646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554102
576	NC_012854	TCG	2	6	36710	36715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554102
577	NC_012854	CGA	2	6	36719	36724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554102
578	NC_012854	TCG	2	6	36737	36742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554102
579	NC_012854	TCA	2	6	36878	36883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554102
580	NC_012854	CGCGG	2	10	36941	36950	0 %	0 %	60 %	40 %	241554102
581	NC_012854	TGA	2	6	36992	36997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554102
582	NC_012854	GCA	2	6	37005	37010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554102
583	NC_012854	CGT	2	6	37024	37029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554102
584	NC_012854	ATG	2	6	37042	37047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554102
585	NC_012854	TCG	2	6	37049	37054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554102
586	NC_012854	CAA	2	6	37140	37145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554102
587	NC_012854	AG	3	6	37162	37167	50 %	0 %	50 %	0 %	241554102
588	NC_012854	CGA	2	6	37185	37190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554102
589	NC_012854	CGA	2	6	37202	37207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554102
590	NC_012854	CG	3	6	37235	37240	0 %	0 %	50 %	50 %	241554102
591	NC_012854	CCG	2	6	37245	37250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554102
592	NC_012854	TGA	2	6	37316	37321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554102
593	NC_012854	CAA	2	6	37368	37373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554102
594	NC_012854	GTT	2	6	37437	37442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554102
595	NC_012854	GGC	2	6	37467	37472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554102
596	NC_012854	ATG	2	6	37697	37702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554103
597	NC_012854	CAA	2	6	37710	37715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554103
598	NC_012854	GGC	2	6	37717	37722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554103
599	NC_012854	TGTCC	2	10	37738	37747	0 %	40 %	20 %	40 %	241554103
600	NC_012854	TGG	2	6	37753	37758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554103
601	NC_012854	CCG	2	6	37779	37784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554103
602	NC_012854	GAG	2	6	37838	37843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554103
603	NC_012854	ACC	2	6	37848	37853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554103
604	NC_012854	TCG	2	6	37860	37865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554103
605	NC_012854	GAA	2	6	37873	37878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554103
606	NC_012854	CGT	2	6	37887	37892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554103
607	NC_012854	GCCGAT	2	12	37913	37924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554103
608	NC_012854	ACA	2	6	37933	37938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554103
609	NC_012854	CGG	2	6	38001	38006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554103
610	NC_012854	CCG	2	6	38007	38012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554103
611	NC_012854	AAGGC	2	10	38079	38088	40 %	0 %	40 %	20 %	241554103
612	NC_012854	ACA	2	6	38109	38114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554103
613	NC_012854	GGCAA	2	10	38123	38132	40 %	0 %	40 %	20 %	241554103
614	NC_012854	CCGA	2	8	38174	38181	25 %	0 %	25 %	50 %	241554103
615	NC_012854	GGC	3	9	38183	38191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554103
616	NC_012854	CCGA	2	8	38213	38220	25 %	0 %	25 %	50 %	241554103
617	NC_012854	GCG	2	6	38268	38273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554103
618	NC_012854	GGGC	2	8	38334	38341	0 %	0 %	75 %	25 %	241554103
619	NC_012854	TCG	2	6	38370	38375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554103
620	NC_012854	GCA	2	6	38429	38434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554103
621	NC_012854	GCC	2	6	38449	38454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554103
622	NC_012854	ATG	2	6	38466	38471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554103
623	NC_012854	CGA	2	6	38472	38477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554103
624	NC_012854	ATC	2	6	38495	38500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554103
625	NC_012854	TCG	2	6	38541	38546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554103
626	NC_012854	CCGCTG	2	12	38547	38558	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241554103
627	NC_012854	CGT	2	6	38647	38652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554103
628	NC_012854	CTG	2	6	38655	38660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554103
629	NC_012854	ATC	2	6	38678	38683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554103
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632	NC_012854	AAG	2	6	38741	38746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554103
633	NC_012854	ATA	2	6	38761	38766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241554103
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642	NC_012854	CGG	2	6	39294	39299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554104
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654	NC_012854	CAA	2	6	39585	39590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554104
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747	NC_012854	GCA	2	6	43376	43381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554109
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750	NC_012854	GCA	2	6	43416	43421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554109
751	NC_012854	GGC	2	6	43804	43809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554110
752	NC_012854	CCG	2	6	43869	43874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554110
753	NC_012854	AGA	2	6	43888	43893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554110
754	NC_012854	CTGG	2	8	43939	43946	0 %	25 %	50 %	25 %	241554110
755	NC_012854	TCG	2	6	43953	43958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554110
756	NC_012854	CTA	2	6	43960	43965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554110
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759	NC_012854	GCT	2	6	44207	44212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554110
760	NC_012854	TCGC	2	8	44461	44468	0 %	25 %	25 %	50 %	241554111
761	NC_012854	CCA	2	6	44484	44489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554111
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764	NC_012854	GTCG	2	8	44642	44649	0 %	25 %	50 %	25 %	241554111
765	NC_012854	CCT	2	6	44725	44730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554111
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772	NC_012854	CGC	2	6	44989	44994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554111
773	NC_012854	GCG	2	6	45007	45012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554111
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776	NC_012854	CG	3	6	45118	45123	0 %	0 %	50 %	50 %	241554111
777	NC_012854	GCC	2	6	45158	45163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554111
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780	NC_012854	GCC	2	6	45394	45399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554111
781	NC_012854	TCC	2	6	45435	45440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554112
782	NC_012854	GCC	2	6	45496	45501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554112
783	NC_012854	CCA	2	6	45504	45509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554112
784	NC_012854	GTT	2	6	45594	45599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554112
785	NC_012854	ACA	2	6	45627	45632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554112
786	NC_012854	GTGGC	2	10	45737	45746	0 %	20 %	60 %	20 %	241554112
787	NC_012854	TGC	3	9	45768	45776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554112
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789	NC_012854	GAAA	2	8	45893	45900	75 %	0 %	25 %	0 %	241554112
790	NC_012854	ATG	2	6	45980	45985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554112
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793	NC_012854	CCAGG	2	10	46045	46054	20 %	0 %	40 %	40 %	241554112
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852	NC_012854	GAT	3	9	50596	50604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554120
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862	NC_012854	TG	3	6	51389	51394	0 %	50 %	50 %	0 %	241554121
863	NC_012854	GC	3	6	51412	51417	0 %	0 %	50 %	50 %	241554121
864	NC_012854	GCT	2	6	51425	51430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
865	NC_012854	AGGT	2	8	51468	51475	25 %	25 %	50 %	0 %	241554121
866	NC_012854	TGG	2	6	51476	51481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554121
867	NC_012854	GCG	2	6	51495	51500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554121
868	NC_012854	GCG	2	6	51511	51516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554121
869	NC_012854	ATC	2	6	51534	51539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554121
870	NC_012854	CTG	2	6	51556	51561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
871	NC_012854	CCA	2	6	51805	51810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554121
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873	NC_012854	CG	3	6	51956	51961	0 %	0 %	50 %	50 %	241554121
874	NC_012854	GTC	2	6	51975	51980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
875	NC_012854	GACT	2	8	52036	52043	25 %	25 %	25 %	25 %	241554121
876	NC_012854	CCT	2	6	52275	52280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554122
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