MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012853	C	6	6	203573	203578	0 %	0 %	0 %	100 %	241518352
3502	NC_012853	TGG	2	6	203695	203700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518352
3503	NC_012853	TCA	2	6	203711	203716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518352
3504	NC_012853	CT	3	6	203891	203896	0 %	50 %	0 %	50 %	241518353
3505	NC_012853	GCA	2	6	203928	203933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518353
3506	NC_012853	GAC	2	6	203934	203939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518353
3507	NC_012853	AGC	2	6	203947	203952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518353
3508	NC_012853	GCC	2	6	203976	203981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518353
3509	NC_012853	AGATCG	2	12	204013	204024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241518353
3510	NC_012853	TGA	2	6	204038	204043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518353
3511	NC_012853	CATGA	2	10	204060	204069	40 %	20 %	20 %	20 %	241518353
3512	NC_012853	ATG	2	6	204103	204108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518353
3513	NC_012853	ACG	2	6	204118	204123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518353
3514	NC_012853	CCG	2	6	204136	204141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518353
3515	NC_012853	CGC	2	6	204191	204196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518353
3516	NC_012853	GAA	2	6	204240	204245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518353
3517	NC_012853	CCG	2	6	204653	204658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518354
3518	NC_012853	AGCC	2	8	204677	204684	25 %	0 %	25 %	50 %	241518354
3519	NC_012853	CG	3	6	204703	204708	0 %	0 %	50 %	50 %	241518354
3520	NC_012853	TGTT	2	8	204835	204842	0 %	75 %	25 %	0 %	241518354
3521	NC_012853	TCA	2	6	204905	204910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518354
3522	NC_012853	GTC	2	6	205027	205032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518354
3523	NC_012853	GTC	2	6	205066	205071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518354
3524	NC_012853	AAG	2	6	205153	205158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518354
3525	NC_012853	ATCG	2	8	205168	205175	25 %	25 %	25 %	25 %	241518354
3526	NC_012853	CAA	2	6	205297	205302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518355
3527	NC_012853	CGGC	2	8	205416	205423	0 %	0 %	50 %	50 %	241518355
3528	NC_012853	CTT	2	6	205430	205435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518355
3529	NC_012853	CGT	2	6	205498	205503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3530	NC_012853	TGA	2	6	205512	205517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518355
3531	NC_012853	AT	3	6	205555	205560	50 %	50 %	0 %	0 %	241518355
3532	NC_012853	GCC	2	6	205574	205579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518355
3533	NC_012853	CTG	2	6	205628	205633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3534	NC_012853	GTC	2	6	205694	205699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3535	NC_012853	GGCC	2	8	205707	205714	0 %	0 %	50 %	50 %	241518355
3536	NC_012853	AAGT	2	8	205722	205729	50 %	25 %	25 %	0 %	241518355
3537	NC_012853	GGA	2	6	205769	205774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518355
3538	NC_012853	GAC	2	6	205870	205875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3539	NC_012853	TGC	2	6	205893	205898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3540	NC_012853	TTC	2	6	205979	205984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518355
3541	NC_012853	GCAG	2	8	206057	206064	25 %	0 %	50 %	25 %	241518355
3542	NC_012853	CGT	2	6	206092	206097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3543	NC_012853	TCG	2	6	206151	206156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518355
3544	NC_012853	CGAC	2	8	206199	206206	25 %	0 %	25 %	50 %	241518355
3545	NC_012853	CG	3	6	206282	206287	0 %	0 %	50 %	50 %	241518355
3546	NC_012853	CAAA	2	8	206293	206300	75 %	0 %	0 %	25 %	241518355
3547	NC_012853	ATGG	2	8	206450	206457	25 %	25 %	50 %	0 %	241518356
3548	NC_012853	CAT	2	6	206469	206474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518356
3549	NC_012853	GTC	2	6	206506	206511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518356
3550	NC_012853	TGA	2	6	206557	206562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518356
3551	NC_012853	CCG	2	6	206568	206573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518356
3552	NC_012853	AAG	2	6	206589	206594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518356
3553	NC_012853	GGT	2	6	206626	206631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518356
3554	NC_012853	CGC	2	6	206650	206655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518356
3555	NC_012853	GGC	2	6	206666	206671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518356
3556	NC_012853	AGC	2	6	206838	206843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518356
3557	NC_012853	GCA	2	6	206864	206869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518356
3558	NC_012853	AGCG	2	8	206913	206920	25 %	0 %	50 %	25 %	241518356
3559	NC_012853	ATC	2	6	206965	206970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518356
3560	NC_012853	ACG	2	6	206972	206977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518356
3561	NC_012853	TCG	2	6	207040	207045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518357
3562	NC_012853	CTG	2	6	207180	207185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518357
3563	NC_012853	TCG	2	6	207268	207273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518357
3564	NC_012853	TC	3	6	207307	207312	0 %	50 %	0 %	50 %	241518357
3565	NC_012853	TCG	2	6	207329	207334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518357
3566	NC_012853	CGC	2	6	207372	207377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518357
3567	NC_012853	A	6	6	207423	207428	100 %	0 %	0 %	0 %	241518358
3568	NC_012853	CCG	2	6	207432	207437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518358
3569	NC_012853	GA	3	6	207447	207452	50 %	0 %	50 %	0 %	241518358
3570	NC_012853	GCCAG	2	10	207511	207520	20 %	0 %	40 %	40 %	241518358
3571	NC_012853	GCG	2	6	207555	207560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518358
3572	NC_012853	GCCA	2	8	207677	207684	25 %	0 %	25 %	50 %	241518358
3573	NC_012853	CGT	2	6	207731	207736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518358
3574	NC_012853	TCG	2	6	207846	207851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518358
3575	NC_012853	GATCA	2	10	207905	207914	40 %	20 %	20 %	20 %	241518358
3576	NC_012853	CGA	2	6	207916	207921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518358
3577	NC_012853	CTGG	2	8	207948	207955	0 %	25 %	50 %	25 %	241518358
3578	NC_012853	GCG	2	6	207956	207961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518358
3579	NC_012853	GA	3	6	207962	207967	50 %	0 %	50 %	0 %	241518358
3580	NC_012853	GCGT	2	8	208006	208013	0 %	25 %	50 %	25 %	241518358
3581	NC_012853	GCG	2	6	208052	208057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518358
3582	NC_012853	GCA	2	6	209393	209398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518359
3583	NC_012853	ACGA	2	8	209452	209459	50 %	0 %	25 %	25 %	241518359
3584	NC_012853	ACT	2	6	209499	209504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518359
3585	NC_012853	GCT	2	6	209515	209520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518359
3586	NC_012853	ATC	2	6	209558	209563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518359
3587	NC_012853	GCC	2	6	209603	209608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518359
3588	NC_012853	CGG	2	6	210490	210495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518360
3589	NC_012853	GC	3	6	210549	210554	0 %	0 %	50 %	50 %	241518360
3590	NC_012853	CGC	3	9	210556	210564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518360
3591	NC_012853	GGC	2	6	210659	210664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518360
3592	NC_012853	GTC	2	6	210683	210688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518360
3593	NC_012853	GAC	2	6	210689	210694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518360
3594	NC_012853	AGCG	2	8	210882	210889	25 %	0 %	50 %	25 %	241518361
3595	NC_012853	AGCCT	2	10	210899	210908	20 %	20 %	20 %	40 %	241518361
3596	NC_012853	CT	3	6	210910	210915	0 %	50 %	0 %	50 %	241518361
3597	NC_012853	GC	3	6	210999	211004	0 %	0 %	50 %	50 %	241518361
3598	NC_012853	GAA	2	6	211141	211146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518362
3599	NC_012853	CGC	2	6	211160	211165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518362
3600	NC_012853	TGC	2	6	211181	211186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518362
3601	NC_012853	GCC	2	6	211253	211258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518362
3602	NC_012853	TTG	2	6	212876	212881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518363
3603	NC_012853	CGA	2	6	212905	212910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3604	NC_012853	GTC	2	6	212918	212923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3605	NC_012853	CGAA	2	8	212957	212964	50 %	0 %	25 %	25 %	241518363
3606	NC_012853	CTGG	2	8	212965	212972	0 %	25 %	50 %	25 %	241518363
3607	NC_012853	CG	3	6	213024	213029	0 %	0 %	50 %	50 %	241518363
3608	NC_012853	CCAA	2	8	213070	213077	50 %	0 %	0 %	50 %	241518363
3609	NC_012853	CAC	2	6	213094	213099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518363
3610	NC_012853	TTTC	2	8	213107	213114	0 %	75 %	0 %	25 %	241518363
3611	NC_012853	CAG	2	6	213134	213139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3612	NC_012853	AGCC	2	8	213173	213180	25 %	0 %	25 %	50 %	241518363
3613	NC_012853	ACG	2	6	213185	213190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3614	NC_012853	GGC	2	6	213208	213213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518363
3615	NC_012853	CGT	2	6	213214	213219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3616	NC_012853	TCCGTC	2	12	213263	213274	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241518363
3617	NC_012853	GCC	2	6	213422	213427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518363
3618	NC_012853	CAC	2	6	213445	213450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518363
3619	NC_012853	GCT	2	6	213500	213505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3620	NC_012853	CAG	2	6	213529	213534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518363
3621	NC_012853	CAG	3	9	213568	213576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518363
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3742	NC_012853	CGG	2	6	221609	221614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518368
3743	NC_012853	TCAA	2	8	221652	221659	50 %	25 %	0 %	25 %	241518368
3744	NC_012853	CTGC	2	8	222647	222654	0 %	25 %	25 %	50 %	241518369
3745	NC_012853	AAT	2	6	222707	222712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518369
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3749	NC_012853	CAT	2	6	222974	222979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518369
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3754	NC_012853	CTC	2	6	223095	223100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518369
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3833	NC_012853	GAT	2	6	227631	227636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518373
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3845	NC_012853	GAT	2	6	228411	228416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518375
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3850	NC_012853	TCC	2	6	228619	228624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518375
3851	NC_012853	CCGGAT	2	12	228650	228661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518375
3852	NC_012853	CG	3	6	228663	228668	0 %	0 %	50 %	50 %	241518375
3853	NC_012853	CAAG	2	8	228722	228729	50 %	0 %	25 %	25 %	241518375
3854	NC_012853	ATC	2	6	228841	228846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518375
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3856	NC_012853	GTTG	2	8	229096	229103	0 %	50 %	50 %	0 %	241518376
3857	NC_012853	TGG	2	6	229389	229394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518376
3858	NC_012853	TCG	2	6	229401	229406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518376
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3862	NC_012853	A	6	6	229947	229952	100 %	0 %	0 %	0 %	241518377
3863	NC_012853	GAA	2	6	229990	229995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518377
3864	NC_012853	GAT	2	6	230446	230451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518378
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3866	NC_012853	ACG	2	6	230514	230519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518378
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3870	NC_012853	AAG	2	6	230701	230706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518379
3871	NC_012853	TCA	2	6	230792	230797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518379
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3901	NC_012853	CTTAT	2	10	235709	235718	20 %	60 %	0 %	20 %	241518384
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3982	NC_012853	AACCG	2	10	239913	239922	40 %	0 %	20 %	40 %	241518386
3983	NC_012853	GCC	2	6	239937	239942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518386
3984	NC_012853	GC	3	6	240027	240032	0 %	0 %	50 %	50 %	241518386
3985	NC_012853	TGTC	2	8	240224	240231	0 %	50 %	25 %	25 %	241518386
3986	NC_012853	GTC	2	6	240235	240240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386
3987	NC_012853	ACCTC	2	10	240251	240260	20 %	20 %	0 %	60 %	241518386
3988	NC_012853	GCC	2	6	240261	240266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518386
3989	NC_012853	ACCG	2	8	240273	240280	25 %	0 %	25 %	50 %	241518386
3990	NC_012853	CCTT	2	8	240304	240311	0 %	50 %	0 %	50 %	241518386
3991	NC_012853	CGT	2	6	240440	240445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386
3992	NC_012853	TGC	2	6	240495	240500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386
3993	NC_012853	GCTTTC	2	12	240520	240531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241518386
3994	NC_012853	CGT	2	6	240552	240557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386
3995	NC_012853	CTG	2	6	240558	240563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386
3996	NC_012853	CTG	2	6	240657	240662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386
3997	NC_012853	T	7	7	240717	240723	0 %	100 %	0 %	0 %	241518386
3998	NC_012853	GGC	2	6	240801	240806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518386
3999	NC_012853	GCG	2	6	240856	240861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518386
4000	NC_012853	GCT	2	6	240880	240885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518386

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