MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012853	AGAA	2	8	122510	122517	75 %	0 %	25 %	0 %	241518274
2002	NC_012853	GAT	2	6	122518	122523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518274
2003	NC_012853	GCC	2	6	122557	122562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518274
2004	NC_012853	ACG	2	6	122567	122572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518274
2005	NC_012853	GGC	2	6	122611	122616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518274
2006	NC_012853	GC	3	6	122629	122634	0 %	0 %	50 %	50 %	241518274
2007	NC_012853	CCG	2	6	122707	122712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518274
2008	NC_012853	GCGG	2	8	122731	122738	0 %	0 %	75 %	25 %	241518274
2009	NC_012853	CGG	2	6	122757	122762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518274
2010	NC_012853	TGCT	2	8	122777	122784	0 %	50 %	25 %	25 %	241518274
2011	NC_012853	AGA	2	6	122789	122794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518274
2012	NC_012853	GCCA	2	8	122834	122841	25 %	0 %	25 %	50 %	241518274
2013	NC_012853	CGCC	2	8	122856	122863	0 %	0 %	25 %	75 %	241518274
2014	NC_012853	CAT	2	6	122908	122913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518274
2015	NC_012853	GGTGCC	2	12	122941	122952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241518274
2016	NC_012853	GCC	3	9	122950	122958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518274
2017	NC_012853	CAG	2	6	122977	122982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518274
2018	NC_012853	CCA	2	6	123000	123005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518274
2019	NC_012853	GAA	2	6	123049	123054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518274
2020	NC_012853	GCG	2	6	123074	123079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518274
2021	NC_012853	ATA	2	6	123081	123086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518274
2022	NC_012853	CGA	2	6	123165	123170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518274
2023	NC_012853	CTG	2	6	123175	123180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518274
2024	NC_012853	CCGA	2	8	123182	123189	25 %	0 %	25 %	50 %	241518274
2025	NC_012853	CCAGCA	2	12	123231	123242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241518274
2026	NC_012853	GAA	2	6	123253	123258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518274
2027	NC_012853	CGC	2	6	123273	123278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518274
2028	NC_012853	GCG	2	6	123296	123301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518274
2029	NC_012853	AGC	2	6	123308	123313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518274
2030	NC_012853	AGG	2	6	123375	123380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518274
2031	NC_012853	CG	4	8	123415	123422	0 %	0 %	50 %	50 %	241518275
2032	NC_012853	CG	3	6	123432	123437	0 %	0 %	50 %	50 %	241518275
2033	NC_012853	CACC	2	8	123507	123514	25 %	0 %	0 %	75 %	241518275
2034	NC_012853	GAT	2	6	123532	123537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518275
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2036	NC_012853	CGAGC	2	10	123562	123571	20 %	0 %	40 %	40 %	241518275
2037	NC_012853	CCG	2	6	123572	123577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518275
2038	NC_012853	CAC	2	6	123670	123675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518275
2039	NC_012853	GACGGC	2	12	123817	123828	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241518275
2040	NC_012853	TCA	2	6	123840	123845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518275
2041	NC_012853	ATG	2	6	123851	123856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518275
2042	NC_012853	CGG	2	6	123858	123863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518275
2043	NC_012853	CGG	2	6	123914	123919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518275
2044	NC_012853	AGC	2	6	123983	123988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518275
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2046	NC_012853	ATCGCG	2	12	124067	124078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518275
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2048	NC_012853	CGT	2	6	124105	124110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518275
2049	NC_012853	ACCAGG	2	12	124112	124123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518275
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2051	NC_012853	ATG	2	6	124178	124183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518275
2052	NC_012853	CGC	2	6	124204	124209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518275
2053	NC_012853	AGC	2	6	124232	124237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518275
2054	NC_012853	GTC	2	6	124301	124306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518276
2055	NC_012853	CGG	2	6	124318	124323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518276
2056	NC_012853	CAT	2	6	124352	124357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518276
2057	NC_012853	CGA	2	6	124405	124410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518276
2058	NC_012853	GGC	2	6	124448	124453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518276
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2060	NC_012853	CAAGGC	2	12	124480	124491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518276
2061	NC_012853	AGC	2	6	124506	124511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518276
2062	NC_012853	CCA	2	6	124546	124551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518276
2063	NC_012853	CTG	3	9	124553	124561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518276
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2065	NC_012853	CGC	2	6	124593	124598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518276
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2069	NC_012853	TCG	2	6	124782	124787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518276
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2080	NC_012853	TCG	2	6	125027	125032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518277
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2120	NC_012853	CGG	2	6	126417	126422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518278
2121	NC_012853	CGA	2	6	126428	126433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518278
2122	NC_012853	GCCGTC	2	12	126453	126464	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241518278
2123	NC_012853	GCC	2	6	126477	126482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518278
2124	NC_012853	CTT	2	6	126486	126491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518278
2125	NC_012853	AGA	2	6	126551	126556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518278
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2127	NC_012853	CTG	2	6	126609	126614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518278
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2130	NC_012853	CGA	2	6	126716	126721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518278
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2144	NC_012853	GCA	2	6	127352	127357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518279
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2152	NC_012853	GTC	2	6	127783	127788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518279
2153	NC_012853	GGT	2	6	127842	127847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518279
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2230	NC_012853	TCGGC	2	10	132271	132280	0 %	20 %	40 %	40 %	241518283
2231	NC_012853	CAT	2	6	132304	132309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518283
2232	NC_012853	CTG	2	6	132332	132337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518283
2233	NC_012853	CCAGC	2	10	132352	132361	20 %	0 %	20 %	60 %	241518283
2234	NC_012853	AAG	2	6	132362	132367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518283
2235	NC_012853	CAG	2	6	132574	132579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518284
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2237	NC_012853	TCA	2	6	132629	132634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518284
2238	NC_012853	GCC	2	6	132638	132643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518284
2239	NC_012853	TCG	2	6	132708	132713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518284
2240	NC_012853	GCTTT	2	10	132726	132735	0 %	60 %	20 %	20 %	241518284
2241	NC_012853	GAA	2	6	132788	132793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518284
2242	NC_012853	CGG	2	6	132795	132800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518284
2243	NC_012853	CAC	2	6	132817	132822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518284
2244	NC_012853	CTT	2	6	132823	132828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518284
2245	NC_012853	CTT	2	6	132847	132852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518284
2246	NC_012853	CGG	2	6	132870	132875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518284
2247	NC_012853	TTGT	2	8	132890	132897	0 %	75 %	25 %	0 %	241518284
2248	NC_012853	TCG	2	6	132908	132913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518284
2249	NC_012853	CGGCC	2	10	132976	132985	0 %	0 %	40 %	60 %	241518284
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2253	NC_012853	GCCT	2	8	133554	133561	0 %	25 %	25 %	50 %	241518285
2254	NC_012853	TCA	2	6	133652	133657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518285
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2348	NC_012853	CGAT	2	8	140615	140622	25 %	25 %	25 %	25 %	241518292
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2362	NC_012853	CT	3	6	141673	141678	0 %	50 %	0 %	50 %	241518293
2363	NC_012853	GGA	2	6	141721	141726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518293
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2366	NC_012853	GCC	2	6	142198	142203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518294
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2481	NC_012853	GCTGA	2	10	149742	149751	20 %	20 %	40 %	20 %	241518301
2482	NC_012853	GGC	2	6	149759	149764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518301
2483	NC_012853	CAT	2	6	149787	149792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518301
2484	NC_012853	GGA	2	6	149804	149809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518301
2485	NC_012853	TGA	2	6	149948	149953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518302
2486	NC_012853	AGG	2	6	149979	149984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518302
2487	NC_012853	AGC	2	6	149985	149990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518302
2488	NC_012853	GGAC	2	8	150030	150037	25 %	0 %	50 %	25 %	241518302
2489	NC_012853	GTCT	2	8	150042	150049	0 %	50 %	25 %	25 %	241518302
2490	NC_012853	GC	3	6	150083	150088	0 %	0 %	50 %	50 %	241518302
2491	NC_012853	GC	3	6	150132	150137	0 %	0 %	50 %	50 %	241518302
2492	NC_012853	AG	3	6	150145	150150	50 %	0 %	50 %	0 %	241518302
2493	NC_012853	GCA	2	6	150156	150161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518302
2494	NC_012853	CGA	2	6	150179	150184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518302
2495	NC_012853	CCA	2	6	150306	150311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518303
2496	NC_012853	GGCC	2	8	150313	150320	0 %	0 %	50 %	50 %	241518303
2497	NC_012853	TCG	2	6	150334	150339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518303
2498	NC_012853	CG	3	6	150338	150343	0 %	0 %	50 %	50 %	241518303
2499	NC_012853	TCT	2	6	150367	150372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518303
2500	NC_012853	CAA	2	6	150375	150380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518303

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