MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012853	GGA	2	6	67389	67394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518220
1002	NC_012853	GTC	2	6	67414	67419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518220
1003	NC_012853	GAT	2	6	67791	67796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518221
1004	NC_012853	GAC	2	6	67815	67820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518221
1005	NC_012853	GCA	2	6	67837	67842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518221
1006	NC_012853	CGGG	2	8	67917	67924	0 %	0 %	75 %	25 %	241518221
1007	NC_012853	CGA	2	6	67938	67943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518221
1008	NC_012853	GCT	2	6	68004	68009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518221
1009	NC_012853	TGC	2	6	68030	68035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518221
1010	NC_012853	CTT	2	6	68053	68058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518221
1011	NC_012853	GCG	2	6	68259	68264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518221
1012	NC_012853	GCG	2	6	68400	68405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518221
1013	NC_012853	TTGCC	2	10	68503	68512	0 %	40 %	20 %	40 %	241518222
1014	NC_012853	CGT	2	6	68527	68532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518222
1015	NC_012853	GC	3	6	68614	68619	0 %	0 %	50 %	50 %	241518222
1016	NC_012853	GGC	2	6	68708	68713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518222
1017	NC_012853	CTG	2	6	68729	68734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518222
1018	NC_012853	CCG	2	6	68767	68772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518222
1019	NC_012853	AGC	2	6	68813	68818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518222
1020	NC_012853	GATA	2	8	68857	68864	50 %	25 %	25 %	0 %	241518222
1021	NC_012853	G	6	6	68888	68893	0 %	0 %	100 %	0 %	241518222
1022	NC_012853	GAC	2	6	68908	68913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518222
1023	NC_012853	GTC	2	6	68927	68932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518222
1024	NC_012853	GGA	2	6	68977	68982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518222
1025	NC_012853	GCC	2	6	69002	69007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518222
1026	NC_012853	ATC	2	6	69092	69097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518222
1027	NC_012853	CCAT	2	8	69174	69181	25 %	25 %	0 %	50 %	241518222
1028	NC_012853	CCG	2	6	69225	69230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518222
1029	NC_012853	ATC	2	6	69281	69286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518222
1030	NC_012853	TCGA	3	12	69287	69298	25 %	25 %	25 %	25 %	241518222
1031	NC_012853	GCC	2	6	69309	69314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518222
1032	NC_012853	GGC	2	6	69350	69355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518222
1033	NC_012853	GCA	2	6	69385	69390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518222
1034	NC_012853	CGC	2	6	69416	69421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518223
1035	NC_012853	GCG	2	6	69475	69480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518223
1036	NC_012853	CAA	2	6	69504	69509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518223
1037	NC_012853	CCGGT	2	10	69526	69535	0 %	20 %	40 %	40 %	241518223
1038	NC_012853	TGC	2	6	69554	69559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518223
1039	NC_012853	GGC	2	6	69573	69578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518223
1040	NC_012853	CGG	2	6	69590	69595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518223
1041	NC_012853	GTG	2	6	69630	69635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518223
1042	NC_012853	TCG	2	6	69670	69675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518223
1043	NC_012853	ACC	2	6	69775	69780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518224
1044	NC_012853	CG	3	6	69802	69807	0 %	0 %	50 %	50 %	241518224
1045	NC_012853	CCT	2	6	69822	69827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518224
1046	NC_012853	GCG	2	6	69868	69873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518224
1047	NC_012853	ATC	2	6	69874	69879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518224
1048	NC_012853	GTC	2	6	69889	69894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518224
1049	NC_012853	GCG	2	6	69922	69927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518224
1050	NC_012853	TCG	2	6	69941	69946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518224
1051	NC_012853	ATG	2	6	69958	69963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518224
1052	NC_012853	CCT	2	6	70019	70024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518224
1053	NC_012853	TCC	2	6	70036	70041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518224
1054	NC_012853	ATC	2	6	70150	70155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518225
1055	NC_012853	TGGC	2	8	70178	70185	0 %	25 %	50 %	25 %	241518225
1056	NC_012853	GAACG	2	10	70228	70237	40 %	0 %	40 %	20 %	241518225
1057	NC_012853	GAT	2	6	70287	70292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518225
1058	NC_012853	CGA	2	6	70377	70382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1059	NC_012853	ACG	2	6	70386	70391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1060	NC_012853	CAT	2	6	70437	70442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518225
1061	NC_012853	CCGA	2	8	70456	70463	25 %	0 %	25 %	50 %	241518225
1062	NC_012853	TCGA	2	8	70470	70477	25 %	25 %	25 %	25 %	241518225
1063	NC_012853	CGA	2	6	70500	70505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1064	NC_012853	CCG	2	6	70625	70630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518225
1065	NC_012853	GCG	3	9	70634	70642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518225
1066	NC_012853	ACC	2	6	70703	70708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518225
1067	NC_012853	CCG	2	6	70754	70759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518225
1068	NC_012853	GGA	2	6	70788	70793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518225
1069	NC_012853	GTG	2	6	70807	70812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518225
1070	NC_012853	GATGC	2	10	70864	70873	20 %	20 %	40 %	20 %	241518225
1071	NC_012853	GTC	2	6	70890	70895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1072	NC_012853	GAG	2	6	70918	70923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518225
1073	NC_012853	AAG	2	6	70951	70956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518225
1074	NC_012853	TTC	2	6	70978	70983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518225
1075	NC_012853	TCG	2	6	71081	71086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1076	NC_012853	GTC	2	6	71107	71112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1077	NC_012853	CGAC	2	8	71216	71223	25 %	0 %	25 %	50 %	241518225
1078	NC_012853	GCCT	2	8	71237	71244	0 %	25 %	25 %	50 %	241518225
1079	NC_012853	TC	3	6	71292	71297	0 %	50 %	0 %	50 %	241518225
1080	NC_012853	ACCC	2	8	71357	71364	25 %	0 %	0 %	75 %	241518225
1081	NC_012853	CAC	2	6	71369	71374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518225
1082	NC_012853	CCG	2	6	71508	71513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518225
1083	NC_012853	TGC	2	6	71558	71563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1084	NC_012853	CTTG	2	8	71572	71579	0 %	50 %	25 %	25 %	241518225
1085	NC_012853	CGG	2	6	71580	71585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518225
1086	NC_012853	CGG	2	6	71601	71606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518225
1087	NC_012853	CGA	2	6	71607	71612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1088	NC_012853	GTC	2	6	71649	71654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1089	NC_012853	TGG	2	6	71696	71701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518225
1090	NC_012853	GTCG	2	8	71780	71787	0 %	25 %	50 %	25 %	241518225
1091	NC_012853	CCG	2	6	71985	71990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518225
1092	NC_012853	GC	3	6	72011	72016	0 %	0 %	50 %	50 %	241518225
1093	NC_012853	CGA	2	6	72033	72038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1094	NC_012853	TTGC	2	8	72124	72131	0 %	50 %	25 %	25 %	241518225
1095	NC_012853	CAT	2	6	72165	72170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518225
1096	NC_012853	AG	3	6	72183	72188	50 %	0 %	50 %	0 %	241518225
1097	NC_012853	CTGC	2	8	72204	72211	0 %	25 %	25 %	50 %	241518225
1098	NC_012853	AGATCG	2	12	72278	72289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241518225
1099	NC_012853	GCC	2	6	72341	72346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518225
1100	NC_012853	TCGT	2	8	72379	72386	0 %	50 %	25 %	25 %	241518225
1101	NC_012853	GAC	2	6	72403	72408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1102	NC_012853	GAA	2	6	72433	72438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518225
1103	NC_012853	TGC	2	6	72489	72494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518225
1104	NC_012853	GC	3	6	72543	72548	0 %	0 %	50 %	50 %	241518226
1105	NC_012853	CAA	2	6	72616	72621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518226
1106	NC_012853	CAGC	2	8	72685	72692	25 %	0 %	25 %	50 %	241518226
1107	NC_012853	TGC	2	6	72735	72740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518226
1108	NC_012853	GTC	2	6	72809	72814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518226
1109	NC_012853	CGA	2	6	72853	72858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518226
1110	NC_012853	GGACG	2	10	72910	72919	20 %	0 %	60 %	20 %	241518226
1111	NC_012853	CGC	2	6	72985	72990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518226
1112	NC_012853	CGG	2	6	72999	73004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518226
1113	NC_012853	GAA	2	6	73019	73024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518226
1114	NC_012853	CCA	2	6	73026	73031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518226
1115	NC_012853	CCA	2	6	73093	73098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518226
1116	NC_012853	GCA	2	6	73108	73113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518226
1117	NC_012853	GAT	2	6	73162	73167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518226
1118	NC_012853	AGA	2	6	73212	73217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518226
1119	NC_012853	AG	3	6	73220	73225	50 %	0 %	50 %	0 %	241518226
1120	NC_012853	ATG	2	6	73268	73273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518226
1121	NC_012853	TCA	2	6	73349	73354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518227
1122	NC_012853	TGG	2	6	73355	73360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518227
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1124	NC_012853	GCC	2	6	73396	73401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518227
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1249	NC_012853	CG	4	8	80174	80181	0 %	0 %	50 %	50 %	241518234
1250	NC_012853	AAGCCG	2	12	80218	80229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518234
1251	NC_012853	GCACC	2	10	80350	80359	20 %	0 %	20 %	60 %	241518234
1252	NC_012853	GGC	2	6	80398	80403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518234
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1254	NC_012853	GGTC	2	8	80505	80512	0 %	25 %	50 %	25 %	241518234
1255	NC_012853	CCT	2	6	80550	80555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518234
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1257	NC_012853	GCC	2	6	80777	80782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518235
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1353	NC_012853	AACA	2	8	88161	88168	75 %	0 %	0 %	25 %	241518240
1354	NC_012853	CCCGT	2	10	88216	88225	0 %	20 %	20 %	60 %	241518240
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1367	NC_012853	CGCAT	2	10	89191	89200	20 %	20 %	20 %	40 %	241518241
1368	NC_012853	CG	3	6	89247	89252	0 %	0 %	50 %	50 %	241518241
1369	NC_012853	AGC	2	6	89301	89306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518241
1370	NC_012853	GGCGA	2	10	89337	89346	20 %	0 %	60 %	20 %	241518241
1371	NC_012853	CCGAT	2	10	89389	89398	20 %	20 %	20 %	40 %	241518241
1372	NC_012853	GCA	2	6	89443	89448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518241
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1374	NC_012853	ACG	2	6	89539	89544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518241
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1392	NC_012853	GAT	2	6	90284	90289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518242
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1497	NC_012853	CCA	2	6	94808	94813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518247
1498	NC_012853	CAT	2	6	94825	94830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518247
1499	NC_012853	CGA	2	6	94833	94838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518247
1500	NC_012853	ATG	2	6	94850	94855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518247

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