MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012853	ATGGG	2	10	397822	397831	20 %	20 %	60 %	0 %	241518528
6502	NC_012853	GCA	2	6	397838	397843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6503	NC_012853	ACA	2	6	397858	397863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518528
6504	NC_012853	AACG	2	8	397960	397967	50 %	0 %	25 %	25 %	241518528
6505	NC_012853	CCG	2	6	398034	398039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518528
6506	NC_012853	CGG	2	6	398114	398119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518528
6507	NC_012853	CGTGC	2	10	398130	398139	0 %	20 %	40 %	40 %	241518528
6508	NC_012853	GGC	2	6	398159	398164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518528
6509	NC_012853	GGA	2	6	398167	398172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518528
6510	NC_012853	ACCAA	2	10	398199	398208	60 %	0 %	0 %	40 %	241518528
6511	NC_012853	CTG	2	6	398244	398249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6512	NC_012853	ATCG	2	8	398303	398310	25 %	25 %	25 %	25 %	241518528
6513	NC_012853	CG	3	6	398338	398343	0 %	0 %	50 %	50 %	241518528
6514	NC_012853	GTG	2	6	398422	398427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518528
6515	NC_012853	CGA	2	6	398450	398455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6516	NC_012853	CAA	2	6	398513	398518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518528
6517	NC_012853	GGGT	2	8	398534	398541	0 %	25 %	75 %	0 %	241518528
6518	NC_012853	GC	3	6	398559	398564	0 %	0 %	50 %	50 %	241518528
6519	NC_012853	GC	3	6	398644	398649	0 %	0 %	50 %	50 %	241518528
6520	NC_012853	AAG	2	6	398650	398655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518528
6521	NC_012853	TCGC	2	8	398779	398786	0 %	25 %	25 %	50 %	241518528
6522	NC_012853	CG	3	6	398843	398848	0 %	0 %	50 %	50 %	241518528
6523	NC_012853	GC	3	6	398857	398862	0 %	0 %	50 %	50 %	241518528
6524	NC_012853	GTC	2	6	398868	398873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6525	NC_012853	GCT	2	6	398893	398898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6526	NC_012853	GCT	2	6	398978	398983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6527	NC_012853	TCA	2	6	398992	398997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518528
6528	NC_012853	CAG	3	9	399006	399014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518528
6529	NC_012853	TCG	2	6	399067	399072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518529
6530	NC_012853	TGG	2	6	399094	399099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518529
6531	NC_012853	GTC	2	6	399107	399112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518529
6532	NC_012853	TGGGC	2	10	399129	399138	0 %	20 %	60 %	20 %	241518529
6533	NC_012853	CCG	2	6	399167	399172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518529
6534	NC_012853	GCC	2	6	399226	399231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518529
6535	NC_012853	CGGC	2	8	399348	399355	0 %	0 %	50 %	50 %	241518529
6536	NC_012853	TGG	2	6	399374	399379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518529
6537	NC_012853	GAT	2	6	399394	399399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518529
6538	NC_012853	CATC	2	8	399411	399418	25 %	25 %	0 %	50 %	241518529
6539	NC_012853	TGCC	2	8	399441	399448	0 %	25 %	25 %	50 %	241518529
6540	NC_012853	CGAT	2	8	399465	399472	25 %	25 %	25 %	25 %	241518529
6541	NC_012853	GAC	2	6	399548	399553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518529
6542	NC_012853	CT	3	6	399594	399599	0 %	50 %	0 %	50 %	241518529
6543	NC_012853	CGA	2	6	399601	399606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518529
6544	NC_012853	GC	3	6	399618	399623	0 %	0 %	50 %	50 %	241518529
6545	NC_012853	ATC	2	6	399661	399666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518530
6546	NC_012853	TC	3	6	399682	399687	0 %	50 %	0 %	50 %	241518530
6547	NC_012853	TC	3	6	399690	399695	0 %	50 %	0 %	50 %	241518530
6548	NC_012853	TGT	2	6	399789	399794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518530
6549	NC_012853	TGCTGG	2	12	399809	399820	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241518530
6550	NC_012853	GACG	2	8	399844	399851	25 %	0 %	50 %	25 %	241518530
6551	NC_012853	GGC	2	6	399903	399908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518530
6552	NC_012853	TCA	2	6	399917	399922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518530
6553	NC_012853	CAG	2	6	400009	400014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518530
6554	NC_012853	TGG	3	9	400015	400023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518530
6555	NC_012853	GAT	2	6	400039	400044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518530
6556	NC_012853	TCAT	2	8	400130	400137	25 %	50 %	0 %	25 %	241518530
6557	NC_012853	GCA	2	6	400260	400265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518530
6558	NC_012853	GCA	2	6	400329	400334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518530
6559	NC_012853	CCG	2	6	400348	400353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518530
6560	NC_012853	GCC	2	6	400405	400410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518530
6561	NC_012853	CGG	2	6	400433	400438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518530
6562	NC_012853	GCT	2	6	400525	400530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518530
6563	NC_012853	CAA	2	6	400563	400568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518530
6564	NC_012853	CCTA	2	8	400616	400623	25 %	25 %	0 %	50 %	241518530
6565	NC_012853	TCC	2	6	400646	400651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518531
6566	NC_012853	CGA	2	6	400676	400681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518531
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6570	NC_012853	TCT	2	6	400799	400804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518531
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6572	NC_012853	TGGCGA	2	12	400819	400830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241518531
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6574	NC_012853	ATG	2	6	400914	400919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518531
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6581	NC_012853	AGC	2	6	401334	401339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518531
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6592	NC_012853	GACT	2	8	401770	401777	25 %	25 %	25 %	25 %	241518531
6593	NC_012853	TGG	2	6	401785	401790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518531
6594	NC_012853	TCG	3	9	401830	401838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518531
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6602	NC_012853	ACCTC	2	10	402210	402219	20 %	20 %	0 %	60 %	241518531
6603	NC_012853	CAGC	2	8	402254	402261	25 %	0 %	25 %	50 %	241518531
6604	NC_012853	TCG	2	6	402282	402287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518531
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6613	NC_012853	TGG	2	6	402786	402791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518532
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6742	NC_012853	CAC	2	6	412128	412133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518544
6743	NC_012853	CACC	2	8	412214	412221	25 %	0 %	0 %	75 %	241518544
6744	NC_012853	GATCGC	2	12	412302	412313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6745	NC_012853	GCT	2	6	412364	412369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6746	NC_012853	CTCG	2	8	412383	412390	0 %	25 %	25 %	50 %	241518544
6747	NC_012853	GAT	2	6	412488	412493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518544
6748	NC_012853	TCG	2	6	412567	412572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6749	NC_012853	CGA	2	6	412619	412624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6750	NC_012853	GAC	2	6	412662	412667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6751	NC_012853	TCG	2	6	412708	412713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6752	NC_012853	GC	3	6	412741	412746	0 %	0 %	50 %	50 %	241518544
6753	NC_012853	CGG	2	6	412750	412755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518544
6754	NC_012853	TCA	2	6	412837	412842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518544
6755	NC_012853	CGC	2	6	412881	412886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518544
6756	NC_012853	CGA	2	6	412910	412915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518544
6757	NC_012853	TCCAT	2	10	412939	412948	20 %	40 %	0 %	40 %	241518544
6758	NC_012853	CG	3	6	413950	413955	0 %	0 %	50 %	50 %	241518545
6759	NC_012853	AACA	2	8	413970	413977	75 %	0 %	0 %	25 %	241518545
6760	NC_012853	GAC	2	6	414011	414016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518545
6761	NC_012853	GAG	2	6	414019	414024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518545
6762	NC_012853	GAAC	2	8	414027	414034	50 %	0 %	25 %	25 %	241518545
6763	NC_012853	CGA	2	6	414133	414138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518546
6764	NC_012853	TG	3	6	414265	414270	0 %	50 %	50 %	0 %	241518546
6765	NC_012853	AG	3	6	414274	414279	50 %	0 %	50 %	0 %	241518546
6766	NC_012853	CGG	2	6	414313	414318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518546
6767	NC_012853	CA	3	6	414429	414434	50 %	0 %	0 %	50 %	241518546
6768	NC_012853	CGA	2	6	414499	414504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518546
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6770	NC_012853	TCA	2	6	414744	414749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518546
6771	NC_012853	ATC	2	6	414865	414870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518546
6772	NC_012853	CGA	2	6	414949	414954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518547
6773	NC_012853	AGG	3	9	415065	415073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518547
6774	NC_012853	TGC	2	6	415085	415090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518547
6775	NC_012853	GC	3	6	415098	415103	0 %	0 %	50 %	50 %	241518547
6776	NC_012853	GGA	2	6	415132	415137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518547
6777	NC_012853	TGAC	2	8	415700	415707	25 %	25 %	25 %	25 %	241518548
6778	NC_012853	ATACG	2	10	415709	415718	40 %	20 %	20 %	20 %	241518548
6779	NC_012853	GCT	2	6	415751	415756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518548
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6781	NC_012853	CAA	2	6	415869	415874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518548
6782	NC_012853	CGTGC	2	10	415883	415892	0 %	20 %	40 %	40 %	241518548
6783	NC_012853	CGA	2	6	415914	415919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518548
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6786	NC_012853	AAT	2	6	416179	416184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518549
6787	NC_012853	CGA	2	6	416330	416335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518549
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6798	NC_012853	CGA	2	6	417441	417446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518551
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6801	NC_012853	GAA	2	6	417651	417656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518551
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6821	NC_012853	TCG	3	9	418370	418378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518551
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6849	NC_012853	GA	3	6	419913	419918	50 %	0 %	50 %	0 %	241518553
6850	NC_012853	TGA	2	6	420003	420008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518553
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6852	NC_012853	AT	3	6	420219	420224	50 %	50 %	0 %	0 %	241518553
6853	NC_012853	GC	3	6	420327	420332	0 %	0 %	50 %	50 %	241518554
6854	NC_012853	GACA	2	8	420334	420341	50 %	0 %	25 %	25 %	241518554
6855	NC_012853	GCG	2	6	420421	420426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518554
6856	NC_012853	TC	3	6	420535	420540	0 %	50 %	0 %	50 %	241518554
6857	NC_012853	CT	3	6	420545	420550	0 %	50 %	0 %	50 %	241518554
6858	NC_012853	TGC	2	6	420576	420581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518554
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6860	NC_012853	CGA	2	6	420598	420603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518554
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6982	NC_012853	GCG	2	6	431475	431480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518564
6983	NC_012853	GAC	2	6	431555	431560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518564
6984	NC_012853	AGC	2	6	431572	431577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518564
6985	NC_012853	TCTT	2	8	431649	431656	0 %	75 %	0 %	25 %	241518564
6986	NC_012853	ACT	2	6	431760	431765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518564
6987	NC_012853	T	6	6	431815	431820	0 %	100 %	0 %	0 %	241518564
6988	NC_012853	GCAT	2	8	431823	431830	25 %	25 %	25 %	25 %	241518564
6989	NC_012853	GTCT	2	8	431855	431862	0 %	50 %	25 %	25 %	241518564
6990	NC_012853	GCCA	2	8	431885	431892	25 %	0 %	25 %	50 %	241518564
6991	NC_012853	TCC	2	6	431964	431969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518564
6992	NC_012853	AAC	2	6	432014	432019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518564
6993	NC_012853	CTG	2	6	432020	432025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518564
6994	NC_012853	GCT	2	6	432038	432043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518564
6995	NC_012853	CTT	2	6	432052	432057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518564
6996	NC_012853	CCG	2	6	432078	432083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518564
6997	NC_012853	TCA	2	6	432114	432119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518564
6998	NC_012853	TCC	2	6	432126	432131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518564
6999	NC_012853	GCG	2	6	432145	432150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518564
7000	NC_012853	GCC	2	6	432224	432229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518564

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