MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012852	GCC	2	6	76445	76450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258666
1502	NC_012852	CGA	2	6	76452	76457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258666
1503	NC_012852	TAC	2	6	76462	76467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258666
1504	NC_012852	AGC	2	6	76519	76524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258666
1505	NC_012852	GAA	2	6	76528	76533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258666
1506	NC_012852	CGA	2	6	76590	76595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258666
1507	NC_012852	TGCC	2	8	76671	76678	0 %	25 %	25 %	50 %	241258666
1508	NC_012852	GCC	2	6	76708	76713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258666
1509	NC_012852	GGA	2	6	76752	76757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258666
1510	NC_012852	CG	3	6	76816	76821	0 %	0 %	50 %	50 %	241258666
1511	NC_012852	ACG	2	6	76895	76900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258666
1512	NC_012852	GGC	2	6	77004	77009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258667
1513	NC_012852	GCC	2	6	77175	77180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258667
1514	NC_012852	GC	3	6	77247	77252	0 %	0 %	50 %	50 %	241258667
1515	NC_012852	GCGG	2	8	77261	77268	0 %	0 %	75 %	25 %	241258667
1516	NC_012852	CGG	2	6	77276	77281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258667
1517	NC_012852	C	6	6	77310	77315	0 %	0 %	0 %	100 %	241258667
1518	NC_012852	CCGGG	2	10	77320	77329	0 %	0 %	60 %	40 %	241258667
1519	NC_012852	CCG	2	6	77330	77335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258667
1520	NC_012852	GGCA	2	8	77387	77394	25 %	0 %	50 %	25 %	241258667
1521	NC_012852	GAC	2	6	77520	77525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258667
1522	NC_012852	AGC	2	6	77551	77556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258667
1523	NC_012852	GGC	2	6	77583	77588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258667
1524	NC_012852	CTT	2	6	77696	77701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258667
1525	NC_012852	CCGT	2	8	77816	77823	0 %	25 %	25 %	50 %	241258668
1526	NC_012852	TATCG	2	10	77834	77843	20 %	40 %	20 %	20 %	241258668
1527	NC_012852	TTCCA	2	10	77936	77945	20 %	40 %	0 %	40 %	241258668
1528	NC_012852	CGCATG	2	12	77948	77959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241258668
1529	NC_012852	AAG	2	6	77960	77965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258668
1530	NC_012852	GAA	2	6	77975	77980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258668
1531	NC_012852	GCC	2	6	77984	77989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258668
1532	NC_012852	TGCC	2	8	78055	78062	0 %	25 %	25 %	50 %	241258668
1533	NC_012852	TCG	2	6	78063	78068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258668
1534	NC_012852	CAT	2	6	78070	78075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258668
1535	NC_012852	CGCA	2	8	78125	78132	25 %	0 %	25 %	50 %	241258668
1536	NC_012852	GTC	2	6	78155	78160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258668
1537	NC_012852	GC	3	6	78171	78176	0 %	0 %	50 %	50 %	241258668
1538	NC_012852	TGA	2	6	78195	78200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258668
1539	NC_012852	GAA	2	6	78205	78210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258668
1540	NC_012852	CGT	2	6	78217	78222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258668
1541	NC_012852	GGCG	2	8	78297	78304	0 %	0 %	75 %	25 %	241258668
1542	NC_012852	CGATGT	2	12	78385	78396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241258668
1543	NC_012852	ACC	2	6	78494	78499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258668
1544	NC_012852	CGT	2	6	78532	78537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258668
1545	NC_012852	GC	3	6	78549	78554	0 %	0 %	50 %	50 %	241258668
1546	NC_012852	CGGC	2	8	78693	78700	0 %	0 %	50 %	50 %	241258669
1547	NC_012852	TCT	2	6	78701	78706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258669
1548	NC_012852	GC	3	6	78742	78747	0 %	0 %	50 %	50 %	241258669
1549	NC_012852	GTC	2	6	78765	78770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258669
1550	NC_012852	GCG	2	6	78804	78809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258669
1551	NC_012852	GGC	2	6	78873	78878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258669
1552	NC_012852	GAA	2	6	78887	78892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258669
1553	NC_012852	GCCTC	2	10	79015	79024	0 %	20 %	20 %	60 %	241258669
1554	NC_012852	CGT	2	6	79052	79057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258669
1555	NC_012852	TCG	2	6	79132	79137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258669
1556	NC_012852	GAGG	2	8	79223	79230	25 %	0 %	75 %	0 %	241258669
1557	NC_012852	CTGC	2	8	79346	79353	0 %	25 %	25 %	50 %	241258670
1558	NC_012852	GGC	2	6	79445	79450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258670
1559	NC_012852	CCG	2	6	79491	79496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258670
1560	NC_012852	CGG	2	6	79504	79509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258670
1561	NC_012852	GCC	2	6	79572	79577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258670
1562	NC_012852	GGC	2	6	79634	79639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258670
1563	NC_012852	CCG	2	6	79657	79662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258670
1564	NC_012852	CCG	2	6	79668	79673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258670
1565	NC_012852	CTG	2	6	79737	79742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258670
1566	NC_012852	GGT	2	6	79887	79892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258670
1567	NC_012852	TCG	2	6	79918	79923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258670
1568	NC_012852	CTG	2	6	79941	79946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258670
1569	NC_012852	CGATC	2	10	79967	79976	20 %	20 %	20 %	40 %	241258670
1570	NC_012852	TAC	2	6	79977	79982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258670
1571	NC_012852	GGCATG	2	12	80073	80084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241258670
1572	NC_012852	GGCATG	2	12	80154	80165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241258670
1573	NC_012852	GGC	2	6	80223	80228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258670
1574	NC_012852	GCTC	2	8	80272	80279	0 %	25 %	25 %	50 %	241258670
1575	NC_012852	CGA	2	6	80285	80290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258670
1576	NC_012852	ATG	2	6	80538	80543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258671
1577	NC_012852	TGC	2	6	80565	80570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258671
1578	NC_012852	TC	3	6	80590	80595	0 %	50 %	0 %	50 %	241258671
1579	NC_012852	GC	3	6	80655	80660	0 %	0 %	50 %	50 %	241258671
1580	NC_012852	GTCG	2	8	80707	80714	0 %	25 %	50 %	25 %	241258671
1581	NC_012852	TCG	2	6	80736	80741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258671
1582	NC_012852	GATC	2	8	80764	80771	25 %	25 %	25 %	25 %	241258671
1583	NC_012852	TC	3	6	80810	80815	0 %	50 %	0 %	50 %	241258671
1584	NC_012852	GCT	2	6	80833	80838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258671
1585	NC_012852	TCA	2	6	80865	80870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258671
1586	NC_012852	TC	3	6	80883	80888	0 %	50 %	0 %	50 %	241258671
1587	NC_012852	GA	3	6	80903	80908	50 %	0 %	50 %	0 %	241258671
1588	NC_012852	GCT	2	6	80914	80919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258671
1589	NC_012852	TCT	2	6	80923	80928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258671
1590	NC_012852	ACC	2	6	81298	81303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258672
1591	NC_012852	CG	3	6	81339	81344	0 %	0 %	50 %	50 %	241258672
1592	NC_012852	TAT	2	6	81364	81369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241258672
1593	NC_012852	GTC	2	6	81389	81394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258672
1594	NC_012852	GCC	2	6	81525	81530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258673
1595	NC_012852	GAG	2	6	81585	81590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258673
1596	NC_012852	CTG	2	6	82018	82023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1597	NC_012852	CCG	2	6	82027	82032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258674
1598	NC_012852	GGC	2	6	82220	82225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258674
1599	NC_012852	ACC	2	6	82264	82269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258674
1600	NC_012852	CGA	2	6	82306	82311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1601	NC_012852	AGC	3	9	82334	82342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1602	NC_012852	GCC	2	6	82346	82351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258674
1603	NC_012852	CCGAT	2	10	82388	82397	20 %	20 %	20 %	40 %	241258674
1604	NC_012852	GAC	2	6	82426	82431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1605	NC_012852	GAT	2	6	82453	82458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258674
1606	NC_012852	CGA	2	6	82503	82508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1607	NC_012852	GCA	2	6	82537	82542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1608	NC_012852	CGA	2	6	82554	82559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1609	NC_012852	GAC	2	6	82564	82569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1610	NC_012852	TGC	2	6	82606	82611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1611	NC_012852	CGC	2	6	82655	82660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258674
1612	NC_012852	CAG	2	6	82666	82671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1613	NC_012852	GTC	2	6	82739	82744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1614	NC_012852	TGG	2	6	82926	82931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258674
1615	NC_012852	ACG	2	6	82988	82993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258674
1616	NC_012852	CCG	2	6	83078	83083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258674
1617	NC_012852	GAA	2	6	83115	83120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258674
1618	NC_012852	CAC	2	6	83122	83127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258674
1619	NC_012852	GCAG	2	8	83146	83153	25 %	0 %	50 %	25 %	241258674
1620	NC_012852	GCC	2	6	83181	83186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258674
1621	NC_012852	GACGTG	2	12	84297	84308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241258675
1622	NC_012852	GGT	2	6	84378	84383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258675
1623	NC_012852	GCC	3	9	84409	84417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258675
1624	NC_012852	CAC	2	6	84433	84438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258675
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1881	NC_012852	CG	3	6	98304	98309	0 %	0 %	50 %	50 %	241258686
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1975	NC_012852	GCT	2	6	102003	102008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258689
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1986	NC_012852	AAG	2	6	102445	102450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258690
1987	NC_012852	CATG	2	8	102503	102510	25 %	25 %	25 %	25 %	241258690
1988	NC_012852	GACG	2	8	102543	102550	25 %	0 %	50 %	25 %	241258690
1989	NC_012852	TC	3	6	102587	102592	0 %	50 %	0 %	50 %	241258690
1990	NC_012852	GCGT	2	8	102611	102618	0 %	25 %	50 %	25 %	241258690
1991	NC_012852	CTC	2	6	102637	102642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258690
1992	NC_012852	A	6	6	102678	102683	100 %	0 %	0 %	0 %	241258690
1993	NC_012852	CAT	2	6	102894	102899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258691
1994	NC_012852	TGA	2	6	103016	103021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258691
1995	NC_012852	CAA	2	6	103057	103062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258691
1996	NC_012852	GAG	2	6	103114	103119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258691
1997	NC_012852	AGG	2	6	103163	103168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258691
1998	NC_012852	TCT	2	6	103250	103255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258691
1999	NC_012852	GAA	2	6	103297	103302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258691
2000	NC_012852	TGA	2	6	103332	103337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258691

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