MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012852	GCC	2	6	269391	269396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258837
5502	NC_012852	ATA	2	6	269397	269402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241258837
5503	NC_012852	TA	3	6	269413	269418	50 %	50 %	0 %	0 %	241258837
5504	NC_012852	TGG	2	6	269432	269437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258837
5505	NC_012852	GTCG	2	8	269487	269494	0 %	25 %	50 %	25 %	241258837
5506	NC_012852	CT	3	6	269542	269547	0 %	50 %	0 %	50 %	241258837
5507	NC_012852	TTGC	2	8	269584	269591	0 %	50 %	25 %	25 %	241258837
5508	NC_012852	GCC	2	6	269602	269607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258837
5509	NC_012852	CGT	2	6	269616	269621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258837
5510	NC_012852	CGT	2	6	269646	269651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258837
5511	NC_012852	CCG	2	6	269710	269715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258837
5512	NC_012852	GA	3	6	269776	269781	50 %	0 %	50 %	0 %	241258837
5513	NC_012852	TCG	2	6	269840	269845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258837
5514	NC_012852	GCC	2	6	269910	269915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258837
5515	NC_012852	CA	3	6	269965	269970	50 %	0 %	0 %	50 %	241258837
5516	NC_012852	CAT	2	6	270005	270010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258837
5517	NC_012852	GAC	2	6	270051	270056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258837
5518	NC_012852	TCG	2	6	270151	270156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258837
5519	NC_012852	AAC	2	6	270262	270267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258837
5520	NC_012852	CAGG	2	8	270326	270333	25 %	0 %	50 %	25 %	241258837
5521	NC_012852	GGT	2	6	270353	270358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258837
5522	NC_012852	CCACC	2	10	270365	270374	20 %	0 %	0 %	80 %	241258837
5523	NC_012852	GTT	2	6	270432	270437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258837
5524	NC_012852	CAT	2	6	270461	270466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258837
5525	NC_012852	CCG	2	6	270553	270558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258837
5526	NC_012852	CAG	2	6	270588	270593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258837
5527	NC_012852	TATCG	2	10	271218	271227	20 %	40 %	20 %	20 %	241258838
5528	NC_012852	T	6	6	271241	271246	0 %	100 %	0 %	0 %	241258838
5529	NC_012852	TCA	2	6	271260	271265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258838
5530	NC_012852	TCTT	2	8	271275	271282	0 %	75 %	0 %	25 %	241258838
5531	NC_012852	CCG	2	6	271295	271300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258838
5532	NC_012852	GCT	2	6	271316	271321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258838
5533	NC_012852	GGC	2	6	271403	271408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258838
5534	NC_012852	A	6	6	271521	271526	100 %	0 %	0 %	0 %	241258838
5535	NC_012852	CCG	2	6	271545	271550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258838
5536	NC_012852	GTC	2	6	271586	271591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258838
5537	NC_012852	TTCCG	2	10	271622	271631	0 %	40 %	20 %	40 %	241258838
5538	NC_012852	CAG	2	6	271688	271693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258838
5539	NC_012852	GCT	2	6	271744	271749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258838
5540	NC_012852	GCA	2	6	271752	271757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258838
5541	NC_012852	GAT	2	6	271786	271791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258838
5542	NC_012852	GGA	2	6	271984	271989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258838
5543	NC_012852	GAG	2	6	272006	272011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258838
5544	NC_012852	TCG	2	6	272057	272062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258838
5545	NC_012852	CAC	2	6	272089	272094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258838
5546	NC_012852	CAT	2	6	272128	272133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258838
5547	NC_012852	GCGAA	2	10	272194	272203	40 %	0 %	40 %	20 %	241258838
5548	NC_012852	AGG	2	6	272299	272304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258838
5549	NC_012852	ACC	2	6	272312	272317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258838
5550	NC_012852	GCGAA	2	10	272353	272362	40 %	0 %	40 %	20 %	241258838
5551	NC_012852	AAC	2	6	272392	272397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258838
5552	NC_012852	TGT	2	6	272416	272421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258838
5553	NC_012852	CGCC	2	8	272466	272473	0 %	0 %	25 %	75 %	241258838
5554	NC_012852	AC	3	6	272495	272500	50 %	0 %	0 %	50 %	241258838
5555	NC_012852	TGA	2	6	272748	272753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258839
5556	NC_012852	CCAG	2	8	272768	272775	25 %	0 %	25 %	50 %	241258839
5557	NC_012852	CGA	2	6	272805	272810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5558	NC_012852	CTCG	2	8	272827	272834	0 %	25 %	25 %	50 %	241258839
5559	NC_012852	CAT	2	6	272851	272856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258839
5560	NC_012852	CAA	2	6	272860	272865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258839
5561	NC_012852	TCG	2	6	272925	272930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5562	NC_012852	GGC	2	6	272963	272968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258839
5563	NC_012852	GCC	2	6	272993	272998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258839
5564	NC_012852	CGA	2	6	273007	273012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5565	NC_012852	GC	3	6	273075	273080	0 %	0 %	50 %	50 %	241258839
5566	NC_012852	CTT	2	6	273083	273088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258839
5567	NC_012852	GCG	2	6	273089	273094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258839
5568	NC_012852	CTCG	2	8	273160	273167	0 %	25 %	25 %	50 %	241258839
5569	NC_012852	GTC	2	6	273187	273192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5570	NC_012852	T	6	6	273262	273267	0 %	100 %	0 %	0 %	241258839
5571	NC_012852	GC	3	6	273306	273311	0 %	0 %	50 %	50 %	241258839
5572	NC_012852	CGT	2	6	273328	273333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5573	NC_012852	TGG	2	6	273365	273370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258839
5574	NC_012852	CAG	2	6	273373	273378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5575	NC_012852	CGC	2	6	273396	273401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258839
5576	NC_012852	CTG	2	6	273440	273445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5577	NC_012852	CAT	3	9	273508	273516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258839
5578	NC_012852	CTT	2	6	273698	273703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258839
5579	NC_012852	ATG	2	6	273746	273751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258839
5580	NC_012852	CTATT	2	10	273755	273764	20 %	60 %	0 %	20 %	241258839
5581	NC_012852	ATG	2	6	273815	273820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258839
5582	NC_012852	ATC	2	6	273827	273832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258839
5583	NC_012852	TCA	2	6	273849	273854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258839
5584	NC_012852	TCT	2	6	273882	273887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258839
5585	NC_012852	GGC	2	6	273898	273903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258839
5586	NC_012852	TGGCA	2	10	273924	273933	20 %	20 %	40 %	20 %	241258839
5587	NC_012852	GCG	2	6	274021	274026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258839
5588	NC_012852	TGC	2	6	274068	274073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258839
5589	NC_012852	CCTG	2	8	274078	274085	0 %	25 %	25 %	50 %	241258839
5590	NC_012852	CTT	2	6	274199	274204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258839
5591	NC_012852	GGAT	2	8	274235	274242	25 %	25 %	50 %	0 %	241258839
5592	NC_012852	CGCTG	2	10	274822	274831	0 %	20 %	40 %	40 %	241258840
5593	NC_012852	GGC	2	6	274854	274859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258840
5594	NC_012852	TCA	2	6	274904	274909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258840
5595	NC_012852	GCC	2	6	275081	275086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258840
5596	NC_012852	TGCGC	2	10	275087	275096	0 %	20 %	40 %	40 %	241258840
5597	NC_012852	GCC	2	6	275111	275116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258840
5598	NC_012852	GGTC	2	8	275147	275154	0 %	25 %	50 %	25 %	241258840
5599	NC_012852	CATGC	2	10	275235	275244	20 %	20 %	20 %	40 %	241258840
5600	NC_012852	GGT	2	6	275286	275291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258840
5601	NC_012852	CCA	2	6	275299	275304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258840
5602	NC_012852	GAC	2	6	275316	275321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258840
5603	NC_012852	GCA	2	6	275419	275424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258840
5604	NC_012852	CA	3	6	275502	275507	50 %	0 %	0 %	50 %	241258840
5605	NC_012852	GCT	2	6	275536	275541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258840
5606	NC_012852	CGA	2	6	275585	275590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258840
5607	NC_012852	TGA	2	6	275654	275659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258840
5608	NC_012852	GCG	2	6	275740	275745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258840
5609	NC_012852	ATA	2	6	275812	275817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241258840
5610	NC_012852	GC	3	6	275823	275828	0 %	0 %	50 %	50 %	241258840
5611	NC_012852	CCT	2	6	275837	275842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258840
5612	NC_012852	GA	4	8	275878	275885	50 %	0 %	50 %	0 %	241258840
5613	NC_012852	CCT	2	6	275904	275909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258841
5614	NC_012852	CCA	2	6	275930	275935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258841
5615	NC_012852	GAC	2	6	276019	276024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258841
5616	NC_012852	CG	3	6	276041	276046	0 %	0 %	50 %	50 %	241258841
5617	NC_012852	CTT	2	6	276049	276054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258841
5618	NC_012852	TGC	2	6	276057	276062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258841
5619	NC_012852	ATG	2	6	276081	276086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258841
5620	NC_012852	AGG	2	6	276111	276116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258841
5621	NC_012852	CGC	2	6	276127	276132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258841
5622	NC_012852	CAGC	2	8	276172	276179	25 %	0 %	25 %	50 %	241258841
5623	NC_012852	CGA	2	6	276208	276213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258841
5624	NC_012852	TCCA	2	8	276273	276280	25 %	25 %	0 %	50 %	241258841
5625	NC_012852	AGCGC	2	10	276343	276352	20 %	0 %	40 %	40 %	241258841
5626	NC_012852	AGC	2	6	276390	276395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258841
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5630	NC_012852	CGA	2	6	276508	276513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258841
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5632	NC_012852	GCC	2	6	276621	276626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258841
5633	NC_012852	GAT	2	6	276767	276772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258841
5634	NC_012852	CG	3	6	276778	276783	0 %	0 %	50 %	50 %	241258841
5635	NC_012852	CGA	2	6	276796	276801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258841
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5649	NC_012852	CGA	2	6	277407	277412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258842
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5651	NC_012852	GCG	2	6	277596	277601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258843
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5653	NC_012852	GGGAT	2	10	277737	277746	20 %	20 %	60 %	0 %	241258843
5654	NC_012852	CGGA	2	8	277756	277763	25 %	0 %	50 %	25 %	241258843
5655	NC_012852	CTT	2	6	277809	277814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258843
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5664	NC_012852	AGC	2	6	278140	278145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258843
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5670	NC_012852	TCG	2	6	278568	278573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258843
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5678	NC_012852	CGA	2	6	278811	278816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258844
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5687	NC_012852	GCTT	2	8	279078	279085	0 %	50 %	25 %	25 %	241258844
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5710	NC_012852	TGG	2	6	280165	280170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258845
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5723	NC_012852	CGA	2	6	281460	281465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258846
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5725	NC_012852	GGC	2	6	281510	281515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258846
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5729	NC_012852	GCT	2	6	281964	281969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258847
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5732	NC_012852	GCT	2	6	282011	282016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258847
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5735	NC_012852	GC	5	10	282159	282168	0 %	0 %	50 %	50 %	241258847
5736	NC_012852	TCG	2	6	282175	282180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258847
5737	NC_012852	GAAG	2	8	282251	282258	50 %	0 %	50 %	0 %	241258847
5738	NC_012852	CCA	2	6	282323	282328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258847
5739	NC_012852	CCT	2	6	282356	282361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258847
5740	NC_012852	GC	3	6	282423	282428	0 %	0 %	50 %	50 %	241258847
5741	NC_012852	CCCTG	2	10	282452	282461	0 %	20 %	20 %	60 %	241258847
5742	NC_012852	CT	3	6	282526	282531	0 %	50 %	0 %	50 %	241258847
5743	NC_012852	AT	3	6	282630	282635	50 %	50 %	0 %	0 %	241258847
5744	NC_012852	GT	3	6	282653	282658	0 %	50 %	50 %	0 %	241258847
5745	NC_012852	TCG	2	6	282706	282711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258847
5746	NC_012852	CGA	2	6	282740	282745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258847
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5748	NC_012852	CTG	3	9	282803	282811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258847
5749	NC_012852	CGC	2	6	282872	282877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258847
5750	NC_012852	GAC	2	6	282897	282902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258847
5751	NC_012852	GC	5	10	282917	282926	0 %	0 %	50 %	50 %	241258847
5752	NC_012852	AGCT	2	8	282954	282961	25 %	25 %	25 %	25 %	241258847
5753	NC_012852	GCG	2	6	282980	282985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258847
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5758	NC_012852	CG	3	6	283236	283241	0 %	0 %	50 %	50 %	241258847
5759	NC_012852	ACG	2	6	283285	283290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258847
5760	NC_012852	TTGGTG	2	12	283300	283311	0 %	50 %	50 %	0 %	241258847
5761	NC_012852	GCGAC	2	10	283320	283329	20 %	0 %	40 %	40 %	241258847
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5782	NC_012852	GTA	2	6	284494	284499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258848
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5794	NC_012852	GTC	2	6	285040	285045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258849
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5828	NC_012852	CTG	2	6	286995	287000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258850
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5833	NC_012852	GAC	2	6	287360	287365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258851
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5850	NC_012852	CATT	2	8	288877	288884	25 %	50 %	0 %	25 %	241258852
5851	NC_012852	TGC	2	6	288968	288973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258852
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5854	NC_012852	CGT	2	6	289070	289075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258852
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5858	NC_012852	GCCGAC	2	12	289359	289370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241258852
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5861	NC_012852	GAA	2	6	289530	289535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258852
5862	NC_012852	TCGG	2	8	289582	289589	0 %	25 %	50 %	25 %	241258852
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5985	NC_012852	GAA	2	6	296292	296297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258857
5986	NC_012852	GCA	2	6	296328	296333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258857
5987	NC_012852	GAA	2	6	296334	296339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258857
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5991	NC_012852	GCA	2	6	296382	296387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258857
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