MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_012850	CGA	2	6	818782	818787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203547
17003	NC_012850	CCG	2	6	818840	818845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203547
17004	NC_012850	TCC	2	6	818921	818926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203547
17005	NC_012850	GTG	2	6	819156	819161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203548
17006	NC_012850	TGC	2	6	819287	819292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203548
17007	NC_012850	CAA	2	6	819326	819331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203548
17008	NC_012850	GGTGA	2	10	819360	819369	20 %	20 %	60 %	0 %	241203548
17009	NC_012850	GAG	2	6	819372	819377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203548
17010	NC_012850	CGC	2	6	819384	819389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203548
17011	NC_012850	ACC	2	6	819423	819428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203548
17012	NC_012850	GCA	2	6	819460	819465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203548
17013	NC_012850	TCA	2	6	819466	819471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203548
17014	NC_012850	GGT	2	6	819482	819487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203548
17015	NC_012850	GCC	2	6	819500	819505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203548
17016	NC_012850	CCG	2	6	819511	819516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203548
17017	NC_012850	GCAC	2	8	819631	819638	25 %	0 %	25 %	50 %	241203548
17018	NC_012850	CGGC	2	8	819640	819647	0 %	0 %	50 %	50 %	241203548
17019	NC_012850	TCG	2	6	819676	819681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203548
17020	NC_012850	CGC	2	6	819688	819693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203548
17021	NC_012850	CGA	2	6	819749	819754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203548
17022	NC_012850	GCTG	2	8	819760	819767	0 %	25 %	50 %	25 %	241203548
17023	NC_012850	GCG	2	6	819769	819774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203548
17024	NC_012850	GCC	2	6	819783	819788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203548
17025	NC_012850	GCG	2	6	819790	819795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203548
17026	NC_012850	CGG	2	6	820043	820048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203549
17027	NC_012850	CGC	2	6	820112	820117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203549
17028	NC_012850	GCC	2	6	820133	820138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203549
17029	NC_012850	GCT	2	6	820174	820179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203549
17030	NC_012850	GGT	2	6	820291	820296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203549
17031	NC_012850	GC	3	6	820314	820319	0 %	0 %	50 %	50 %	241203549
17032	NC_012850	GCA	2	6	820360	820365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203549
17033	NC_012850	GCA	2	6	820384	820389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203549
17034	NC_012850	ATC	2	6	820413	820418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203549
17035	NC_012850	CCG	2	6	820438	820443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203549
17036	NC_012850	CT	3	6	820533	820538	0 %	50 %	0 %	50 %	241203549
17037	NC_012850	TGA	2	6	820666	820671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203549
17038	NC_012850	GC	3	6	820678	820683	0 %	0 %	50 %	50 %	241203549
17039	NC_012850	ATC	2	6	820746	820751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203549
17040	NC_012850	AGGCA	2	10	820761	820770	40 %	0 %	40 %	20 %	241203549
17041	NC_012850	GT	3	6	820819	820824	0 %	50 %	50 %	0 %	241203549
17042	NC_012850	GCG	2	6	820867	820872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203549
17043	NC_012850	ACCC	2	8	821043	821050	25 %	0 %	0 %	75 %	241203550
17044	NC_012850	G	6	6	821116	821121	0 %	0 %	100 %	0 %	241203550
17045	NC_012850	ATC	2	6	821127	821132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203550
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17047	NC_012850	GAG	2	6	821361	821366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203550
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17050	NC_012850	TGG	2	6	821621	821626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203550
17051	NC_012850	GCG	2	6	821713	821718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203550
17052	NC_012850	CGC	2	6	821723	821728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203550
17053	NC_012850	CAC	2	6	821762	821767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203550
17054	NC_012850	GGA	2	6	821781	821786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203550
17055	NC_012850	CAT	2	6	821839	821844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203551
17056	NC_012850	TCA	2	6	821865	821870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203551
17057	NC_012850	CGTT	2	8	821886	821893	0 %	50 %	25 %	25 %	241203551
17058	NC_012850	GCG	2	6	821900	821905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203551
17059	NC_012850	GCGG	2	8	822022	822029	0 %	0 %	75 %	25 %	241203551
17060	NC_012850	GCG	2	6	822093	822098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203551
17061	NC_012850	CG	3	6	822126	822131	0 %	0 %	50 %	50 %	241203551
17062	NC_012850	GC	3	6	822139	822144	0 %	0 %	50 %	50 %	241203551
17063	NC_012850	AG	3	6	822250	822255	50 %	0 %	50 %	0 %	241203551
17064	NC_012850	TCA	2	6	822351	822356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203551
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17067	NC_012850	CGT	2	6	822436	822441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203551
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17071	NC_012850	C	6	6	822520	822525	0 %	0 %	0 %	100 %	241203552
17072	NC_012850	CT	3	6	822539	822544	0 %	50 %	0 %	50 %	241203552
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17080	NC_012850	AGT	2	6	822976	822981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203552
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17119	NC_012850	CTT	2	6	826232	826237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203556
17120	NC_012850	CTG	2	6	826406	826411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203557
17121	NC_012850	CAT	2	6	826420	826425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203557
17122	NC_012850	TCC	2	6	826448	826453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203557
17123	NC_012850	TCG	2	6	826462	826467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203557
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17126	NC_012850	TC	3	6	826673	826678	0 %	50 %	0 %	50 %	241203557
17127	NC_012850	CATG	2	8	826687	826694	25 %	25 %	25 %	25 %	241203557
17128	NC_012850	GGC	2	6	826784	826789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203557
17129	NC_012850	AGCG	2	8	826790	826797	25 %	0 %	50 %	25 %	241203557
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17134	NC_012850	AGC	2	6	827001	827006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203558
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17225	NC_012850	CATC	2	8	831587	831594	25 %	25 %	0 %	50 %	241203563
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17231	NC_012850	CAGT	2	8	831935	831942	25 %	25 %	25 %	25 %	241203564
17232	NC_012850	TCG	2	6	831979	831984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203564
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17234	NC_012850	GCA	2	6	832133	832138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203564
17235	NC_012850	GGT	2	6	832151	832156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203564
17236	NC_012850	ATG	2	6	832201	832206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203564
17237	NC_012850	CAT	2	6	832232	832237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203564
17238	NC_012850	GCA	2	6	832241	832246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203564
17239	NC_012850	GCG	3	9	832351	832359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203564
17240	NC_012850	CGC	2	6	832404	832409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203564
17241	NC_012850	AAG	2	6	832448	832453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203565
17242	NC_012850	GAC	2	6	832576	832581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203565
17243	NC_012850	CGC	2	6	832599	832604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203565
17244	NC_012850	TG	3	6	832622	832627	0 %	50 %	50 %	0 %	241203565
17245	NC_012850	GCG	2	6	832641	832646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203565
17246	NC_012850	CCG	2	6	832667	832672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203565
17247	NC_012850	GCC	2	6	832720	832725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203565
17248	NC_012850	GTCG	2	8	832740	832747	0 %	25 %	50 %	25 %	241203565
17249	NC_012850	GGTC	2	8	832797	832804	0 %	25 %	50 %	25 %	241203565
17250	NC_012850	CGGC	2	8	832999	833006	0 %	0 %	50 %	50 %	241203566
17251	NC_012850	GCC	2	6	833152	833157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203566
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17255	NC_012850	GCG	2	6	833563	833568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203567
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17343	NC_012850	GATC	2	8	837987	837994	25 %	25 %	25 %	25 %	241203573
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17351	NC_012850	GC	4	8	838190	838197	0 %	0 %	50 %	50 %	241203573
17352	NC_012850	CAG	2	6	838222	838227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203573
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17355	NC_012850	TCG	2	6	838274	838279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203573
17356	NC_012850	TC	3	6	838280	838285	0 %	50 %	0 %	50 %	241203573
17357	NC_012850	TGC	2	6	838291	838296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203573
17358	NC_012850	TGC	2	6	838531	838536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203573
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17472	NC_012850	TGA	2	6	844070	844075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203582
17473	NC_012850	CGG	2	6	844085	844090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203582
17474	NC_012850	TGA	2	6	844094	844099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203582
17475	NC_012850	CGATC	2	10	844158	844167	20 %	20 %	20 %	40 %	241203582
17476	NC_012850	GGC	2	6	844336	844341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203583
17477	NC_012850	TGA	2	6	844364	844369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203583
17478	NC_012850	CAGG	2	8	844419	844426	25 %	0 %	50 %	25 %	241203583
17479	NC_012850	GGC	2	6	844460	844465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203583
17480	NC_012850	GCA	2	6	844471	844476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203583
17481	NC_012850	GATTG	2	10	844480	844489	20 %	40 %	40 %	0 %	241203583
17482	NC_012850	GGC	2	6	844531	844536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203583
17483	NC_012850	ATT	2	6	844641	844646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203584
17484	NC_012850	TGG	2	6	844730	844735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203584
17485	NC_012850	GAACAG	2	12	844766	844777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241203584
17486	NC_012850	ATC	2	6	844817	844822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203584
17487	NC_012850	GTCG	2	8	844859	844866	0 %	25 %	50 %	25 %	241203585
17488	NC_012850	CTG	2	6	844898	844903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203585
17489	NC_012850	GCG	3	9	844960	844968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203585
17490	NC_012850	CCG	2	6	844996	845001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203585
17491	NC_012850	GCT	2	6	845026	845031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203585
17492	NC_012850	CGGAT	2	10	845058	845067	20 %	20 %	40 %	20 %	241203585
17493	NC_012850	CAT	2	6	845077	845082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203585
17494	NC_012850	ATCG	2	8	845112	845119	25 %	25 %	25 %	25 %	241203585
17495	NC_012850	GTCC	2	8	845129	845136	0 %	25 %	25 %	50 %	241203585
17496	NC_012850	GTC	2	6	845157	845162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203585
17497	NC_012850	TGC	2	6	845227	845232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203585
17498	NC_012850	GCC	2	6	845267	845272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203585
17499	NC_012850	CG	4	8	845307	845314	0 %	0 %	50 %	50 %	241203585
17500	NC_012850	GGCGAC	2	12	845336	845347	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203585

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