MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012850	CAG	2	6	663558	663563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14002	NC_012850	CAC	2	6	663612	663617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203375
14003	NC_012850	CG	3	6	663623	663628	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14004	NC_012850	TCG	2	6	663700	663705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14005	NC_012850	TCG	2	6	663859	663864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14006	NC_012850	TGA	2	6	663881	663886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203375
14007	NC_012850	GAA	2	6	663909	663914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203375
14008	NC_012850	GC	3	6	663981	663986	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14009	NC_012850	CGC	2	6	664028	664033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14010	NC_012850	ATCG	2	8	664056	664063	25 %	25 %	25 %	25 %	241203375
14011	NC_012850	GAT	2	6	664080	664085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203375
14012	NC_012850	TCG	2	6	664144	664149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14013	NC_012850	CCG	2	6	664150	664155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14014	NC_012850	GC	3	6	664158	664163	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14015	NC_012850	GCATC	2	10	664217	664226	20 %	20 %	20 %	40 %	241203375
14016	NC_012850	CGG	2	6	664229	664234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14017	NC_012850	GGTCGA	2	12	664268	664279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203375
14018	NC_012850	GCT	2	6	664304	664309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14019	NC_012850	GGC	2	6	664310	664315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14020	NC_012850	GCG	2	6	664353	664358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14021	NC_012850	AGCTCG	2	12	664417	664428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14022	NC_012850	GGC	2	6	664455	664460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14023	NC_012850	TCA	2	6	664475	664480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203375
14024	NC_012850	TGG	2	6	664540	664545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203375
14025	NC_012850	CCGA	2	8	664552	664559	25 %	0 %	25 %	50 %	241203375
14026	NC_012850	CGT	2	6	664580	664585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14027	NC_012850	CGA	2	6	664586	664591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14028	NC_012850	CG	3	6	664639	664644	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14029	NC_012850	GCC	2	6	664764	664769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14030	NC_012850	AGGCC	2	10	664771	664780	20 %	0 %	40 %	40 %	241203375
14031	NC_012850	CCAGCT	2	12	664880	664891	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203375
14032	NC_012850	CGG	2	6	664952	664957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14033	NC_012850	CCGA	2	8	665017	665024	25 %	0 %	25 %	50 %	241203375
14034	NC_012850	GCC	2	6	665040	665045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14035	NC_012850	TGC	2	6	665093	665098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14036	NC_012850	GAA	2	6	665103	665108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203375
14037	NC_012850	CGC	2	6	665145	665150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14038	NC_012850	TCG	2	6	665158	665163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14039	NC_012850	CTTC	2	8	665173	665180	0 %	50 %	0 %	50 %	241203375
14040	NC_012850	CGC	2	6	665184	665189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14041	NC_012850	TCC	2	6	665242	665247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203375
14042	NC_012850	GGA	2	6	665268	665273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203375
14043	NC_012850	GAA	2	6	665376	665381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203375
14044	NC_012850	GAT	3	9	665391	665399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203375
14045	NC_012850	CGG	2	6	665405	665410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14046	NC_012850	GAT	2	6	665415	665420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203375
14047	NC_012850	GCC	2	6	665493	665498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14048	NC_012850	TCT	2	6	665510	665515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203375
14049	NC_012850	GAA	2	6	665553	665558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203375
14050	NC_012850	CGG	3	9	665559	665567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14051	NC_012850	GCG	2	6	665572	665577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203375
14052	NC_012850	GCC	2	6	665587	665592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14053	NC_012850	CG	3	6	665660	665665	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14054	NC_012850	C	6	6	665723	665728	0 %	0 %	0 %	100 %	241203375
14055	NC_012850	CCG	2	6	665733	665738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
14056	NC_012850	GAA	2	6	665766	665771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203375
14057	NC_012850	GC	3	6	665817	665822	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14058	NC_012850	GCCG	2	8	665832	665839	0 %	0 %	50 %	50 %	241203375
14059	NC_012850	TCA	2	6	665846	665851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203375
14060	NC_012850	AGA	2	6	665861	665866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203375
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14062	NC_012850	GAT	2	6	665928	665933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203375
14063	NC_012850	ATGA	2	8	665955	665962	50 %	25 %	25 %	0 %	241203375
14064	NC_012850	AGC	2	6	665980	665985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14065	NC_012850	TCTCC	2	10	666005	666014	0 %	40 %	0 %	60 %	241203375
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14068	NC_012850	ACG	2	6	666190	666195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203375
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14070	NC_012850	CGA	2	6	666207	666212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203375
14071	NC_012850	GAAAC	2	10	666218	666227	60 %	0 %	20 %	20 %	241203375
14072	NC_012850	TTC	2	6	666235	666240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203375
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14083	NC_012850	CAT	2	6	667309	667314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203377
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14086	NC_012850	CG	4	8	667496	667503	0 %	0 %	50 %	50 %	241203377
14087	NC_012850	CGA	2	6	667522	667527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203377
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14090	NC_012850	GCG	2	6	667878	667883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203378
14091	NC_012850	GGC	2	6	667933	667938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203378
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14095	NC_012850	TGG	2	6	668310	668315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203378
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14101	NC_012850	ATG	2	6	668486	668491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203378
14102	NC_012850	CGC	2	6	668493	668498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203378
14103	NC_012850	TGCC	2	8	668502	668509	0 %	25 %	25 %	50 %	241203378
14104	NC_012850	GTC	2	6	668702	668707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203379
14105	NC_012850	CGA	2	6	668737	668742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203379
14106	NC_012850	GCC	2	6	668756	668761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203379
14107	NC_012850	GC	3	6	668861	668866	0 %	0 %	50 %	50 %	241203379
14108	NC_012850	GCA	2	6	668902	668907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203379
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14110	NC_012850	CGC	2	6	668977	668982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203379
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14112	NC_012850	TGCC	2	8	669043	669050	0 %	25 %	25 %	50 %	241203379
14113	NC_012850	CGT	2	6	669115	669120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203379
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14238	NC_012850	ATC	2	6	675721	675726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203387
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14355	NC_012850	CGGCGC	2	12	681262	681273	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
14356	NC_012850	GC	3	6	681279	681284	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
14357	NC_012850	CAT	2	6	681316	681321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203391
14358	NC_012850	CGGC	2	8	681348	681355	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
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14360	NC_012850	CGGC	2	8	681444	681451	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
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14472	NC_012850	GTC	2	6	686601	686606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14473	NC_012850	TCG	2	6	686635	686640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14474	NC_012850	GGT	2	6	686681	686686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203398
14475	NC_012850	GCC	2	6	686815	686820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203398
14476	NC_012850	GTC	2	6	686823	686828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14477	NC_012850	GAC	2	6	686969	686974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14478	NC_012850	GTCG	2	8	686978	686985	0 %	25 %	50 %	25 %	241203398
14479	NC_012850	CGGC	2	8	686992	686999	0 %	0 %	50 %	50 %	241203398
14480	NC_012850	TCA	2	6	687001	687006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203398
14481	NC_012850	CGA	2	6	687067	687072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14482	NC_012850	GTG	2	6	687087	687092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203398
14483	NC_012850	GCAG	2	8	687095	687102	25 %	0 %	50 %	25 %	241203398
14484	NC_012850	TCA	2	6	687121	687126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203398
14485	NC_012850	TCG	2	6	687127	687132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14486	NC_012850	GC	3	6	687133	687138	0 %	0 %	50 %	50 %	241203398
14487	NC_012850	CTC	2	6	687143	687148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203398
14488	NC_012850	TCG	2	6	687163	687168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
14489	NC_012850	CAGGG	2	10	687179	687188	20 %	0 %	60 %	20 %	241203398
14490	NC_012850	GAA	2	6	687191	687196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203398
14491	NC_012850	ATCC	2	8	687197	687204	25 %	25 %	0 %	50 %	241203398
14492	NC_012850	GC	3	6	687212	687217	0 %	0 %	50 %	50 %	241203398
14493	NC_012850	CGGC	2	8	687268	687275	0 %	0 %	50 %	50 %	241203398
14494	NC_012850	ATC	2	6	687306	687311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203398
14495	NC_012850	GCT	2	6	687583	687588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203399
14496	NC_012850	TTC	2	6	687704	687709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203399
14497	NC_012850	GCA	2	6	687721	687726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203399
14498	NC_012850	CCGC	2	8	687732	687739	0 %	0 %	25 %	75 %	241203399
14499	NC_012850	CGCTGC	2	12	687753	687764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203399
14500	NC_012850	CGC	2	6	687767	687772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203399

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