MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_012850	CGG	2	6	641071	641076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13503	NC_012850	GGCC	2	8	641092	641099	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
13504	NC_012850	TCGAGG	2	12	641104	641115	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203354
13505	NC_012850	GCGCC	2	10	641119	641128	0 %	0 %	40 %	60 %	241203354
13506	NC_012850	CGG	2	6	641154	641159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13507	NC_012850	GCCG	2	8	641209	641216	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
13508	NC_012850	ATC	2	6	641267	641272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203354
13509	NC_012850	CGA	2	6	641311	641316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13510	NC_012850	GCC	2	6	641339	641344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
13511	NC_012850	CGG	2	6	641428	641433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13512	NC_012850	G	6	6	641455	641460	0 %	0 %	100 %	0 %	241203354
13513	NC_012850	CGGG	2	8	641479	641486	0 %	0 %	75 %	25 %	241203354
13514	NC_012850	TCA	2	6	641755	641760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203355
13515	NC_012850	TCC	2	6	641794	641799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203355
13516	NC_012850	GAG	3	9	641824	641832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203355
13517	NC_012850	CCA	2	6	641841	641846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203355
13518	NC_012850	GCC	2	6	641869	641874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203355
13519	NC_012850	CGGC	2	8	641905	641912	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
13520	NC_012850	ATCGC	2	10	641923	641932	20 %	20 %	20 %	40 %	241203355
13521	NC_012850	CCGG	2	8	641933	641940	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
13522	NC_012850	CAG	2	6	641946	641951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
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13524	NC_012850	GAC	2	6	641982	641987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
13525	NC_012850	GC	3	6	642010	642015	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
13526	NC_012850	CGC	2	6	642146	642151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203355
13527	NC_012850	GATC	2	8	642200	642207	25 %	25 %	25 %	25 %	241203355
13528	NC_012850	TCC	2	6	642208	642213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203355
13529	NC_012850	GCCA	2	8	642229	642236	25 %	0 %	25 %	50 %	241203355
13530	NC_012850	CAG	2	6	642255	642260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
13531	NC_012850	CGGC	2	8	642310	642317	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
13532	NC_012850	TCA	2	6	642320	642325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203355
13533	NC_012850	ATGCGG	2	12	642423	642434	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203355
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13535	NC_012850	CGA	2	6	642503	642508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
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13537	NC_012850	GC	3	6	642530	642535	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
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13544	NC_012850	CTG	2	6	642901	642906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203356
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13554	NC_012850	TCA	2	6	643185	643190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203356
13555	NC_012850	GGT	2	6	643240	643245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203356
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13621	NC_012850	CCT	2	6	645906	645911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203360
13622	NC_012850	TCC	2	6	645919	645924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203360
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13739	NC_012850	TGC	2	6	651590	651595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
13740	NC_012850	CAT	2	6	651606	651611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203364
13741	NC_012850	GCT	2	6	651687	651692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
13742	NC_012850	TGCTT	2	10	651704	651713	0 %	60 %	20 %	20 %	241203364
13743	NC_012850	GCT	2	6	651753	651758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
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13746	NC_012850	GCGATC	2	12	651829	651840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203364
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13974	NC_012850	GAA	2	6	662330	662335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203374
13975	NC_012850	GTCCCA	2	12	662354	662365	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203374
13976	NC_012850	GCG	2	6	662369	662374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203374
13977	NC_012850	GC	3	6	662404	662409	0 %	0 %	50 %	50 %	241203374
13978	NC_012850	GGCG	2	8	662437	662444	0 %	0 %	75 %	25 %	241203374
13979	NC_012850	GCC	2	6	662447	662452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203374
13980	NC_012850	GGC	2	6	662453	662458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203374
13981	NC_012850	CG	3	6	662476	662481	0 %	0 %	50 %	50 %	241203374
13982	NC_012850	GAG	2	6	662484	662489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203374
13983	NC_012850	GCC	3	9	662492	662500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203374
13984	NC_012850	GGT	2	6	662633	662638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203374
13985	NC_012850	CGC	2	6	662703	662708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203374
13986	NC_012850	CGA	2	6	662800	662805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203374
13987	NC_012850	GGT	2	6	662840	662845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203374
13988	NC_012850	GCC	2	6	663116	663121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
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13991	NC_012850	TGC	2	6	663228	663233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
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13994	NC_012850	GCTTCA	2	12	663368	663379	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241203375
13995	NC_012850	TCG	2	6	663415	663420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
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13997	NC_012850	TCG	2	6	663484	663489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203375
13998	NC_012850	CCA	2	6	663503	663508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203375
13999	NC_012850	CGGA	2	8	663528	663535	25 %	0 %	50 %	25 %	241203375
14000	NC_012850	GCGA	2	8	663547	663554	25 %	0 %	50 %	25 %	241203375

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