MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012850	CGG	2	6	619318	619323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203338
13002	NC_012850	CGG	2	6	619442	619447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203338
13003	NC_012850	CGA	2	6	619469	619474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203338
13004	NC_012850	GTG	2	6	619503	619508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203338
13005	NC_012850	GCGG	2	8	619554	619561	0 %	0 %	75 %	25 %	241203338
13006	NC_012850	GGAGG	2	10	619614	619623	20 %	0 %	80 %	0 %	241203338
13007	NC_012850	CCGCG	2	10	619637	619646	0 %	0 %	40 %	60 %	241203338
13008	NC_012850	ATGG	2	8	619683	619690	25 %	25 %	50 %	0 %	241203338
13009	NC_012850	CGT	2	6	619734	619739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203338
13010	NC_012850	TTCAT	2	10	619771	619780	20 %	60 %	0 %	20 %	241203338
13011	NC_012850	CAA	2	6	620132	620137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
13012	NC_012850	AAG	2	6	620160	620165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
13013	NC_012850	CAA	2	6	620192	620197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
13014	NC_012850	CGA	2	6	620210	620215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13015	NC_012850	GAA	2	6	620297	620302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
13016	NC_012850	CAA	2	6	620342	620347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
13017	NC_012850	CGC	3	9	620375	620383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13018	NC_012850	GACG	2	8	620417	620424	25 %	0 %	50 %	25 %	241203339
13019	NC_012850	AGG	2	6	620428	620433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203339
13020	NC_012850	GCC	2	6	620481	620486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13021	NC_012850	AGC	2	6	620496	620501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13022	NC_012850	ACGGC	2	10	620506	620515	20 %	0 %	40 %	40 %	241203339
13023	NC_012850	GAC	2	6	620528	620533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13024	NC_012850	CGA	2	6	620537	620542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13025	NC_012850	CAA	2	6	620549	620554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
13026	NC_012850	GATC	2	8	620591	620598	25 %	25 %	25 %	25 %	241203339
13027	NC_012850	CGT	2	6	620663	620668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13028	NC_012850	GCG	2	6	620680	620685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13029	NC_012850	GCC	2	6	620703	620708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13030	NC_012850	ACGGC	2	10	620740	620749	20 %	0 %	40 %	40 %	241203339
13031	NC_012850	TCA	2	6	620809	620814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
13032	NC_012850	TCGG	2	8	620823	620830	0 %	25 %	50 %	25 %	241203339
13033	NC_012850	CTA	2	6	620840	620845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
13034	NC_012850	CGG	2	6	620857	620862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13035	NC_012850	ACA	2	6	620869	620874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
13036	NC_012850	CGA	2	6	620915	620920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13037	NC_012850	ACG	2	6	620955	620960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13038	NC_012850	CCG	2	6	620986	620991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13039	NC_012850	GACC	2	8	621011	621018	25 %	0 %	25 %	50 %	241203339
13040	NC_012850	GC	3	6	621099	621104	0 %	0 %	50 %	50 %	241203339
13041	NC_012850	GGC	2	6	621137	621142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13042	NC_012850	GAA	2	6	621155	621160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
13043	NC_012850	TAT	2	6	621162	621167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203339
13044	NC_012850	CTG	2	6	621210	621215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13045	NC_012850	GCG	2	6	621399	621404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13046	NC_012850	ACC	2	6	621417	621422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203339
13047	NC_012850	CGG	2	6	621430	621435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13048	NC_012850	CAT	2	6	621488	621493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
13049	NC_012850	TCG	2	6	621577	621582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13050	NC_012850	CAC	2	6	621698	621703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203339
13051	NC_012850	GCG	2	6	621720	621725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13052	NC_012850	CTTCAA	2	12	621905	621916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
13053	NC_012850	CAG	2	6	621968	621973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13054	NC_012850	GCC	2	6	621984	621989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13055	NC_012850	GC	3	6	621993	621998	0 %	0 %	50 %	50 %	241203339
13056	NC_012850	GAC	2	6	622002	622007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13057	NC_012850	CG	3	6	622013	622018	0 %	0 %	50 %	50 %	241203339
13058	NC_012850	CGA	2	6	622024	622029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13059	NC_012850	GAT	2	6	622041	622046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
13060	NC_012850	GCC	3	9	622155	622163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13061	NC_012850	GTC	2	6	622218	622223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13062	NC_012850	ACC	2	6	622254	622259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203339
13063	NC_012850	GAC	2	6	622284	622289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13064	NC_012850	CGA	2	6	622295	622300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13065	NC_012850	CGA	2	6	622307	622312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13066	NC_012850	CAG	3	9	622346	622354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13067	NC_012850	CTG	2	6	622356	622361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13068	NC_012850	GCA	2	6	622399	622404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13069	NC_012850	GCC	2	6	622410	622415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
13070	NC_012850	GACC	2	8	622481	622488	25 %	0 %	25 %	50 %	241203339
13071	NC_012850	GAT	2	6	622505	622510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
13072	NC_012850	GGC	2	6	622622	622627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
13073	NC_012850	TGA	2	6	622702	622707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
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13075	NC_012850	CGA	2	6	622796	622801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
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13077	NC_012850	GACC	2	8	622823	622830	25 %	0 %	25 %	50 %	241203339
13078	NC_012850	AAC	2	6	622845	622850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
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13084	NC_012850	GAG	2	6	623037	623042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203339
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13086	NC_012850	ACG	2	6	623098	623103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13087	NC_012850	TCA	2	6	623191	623196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
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13090	NC_012850	GCT	2	6	623312	623317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13091	NC_012850	CAG	2	6	623358	623363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
13092	NC_012850	TGA	2	6	623374	623379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
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13103	NC_012850	CTG	2	6	623912	623917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203340
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13107	NC_012850	GTG	2	6	624093	624098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203340
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13113	NC_012850	CCGAG	2	10	624475	624484	20 %	0 %	40 %	40 %	241203340
13114	NC_012850	GCC	2	6	624499	624504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203340
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13118	NC_012850	GCC	2	6	624650	624655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203340
13119	NC_012850	CCT	2	6	624730	624735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203340
13120	NC_012850	AGG	2	6	624753	624758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203340
13121	NC_012850	GAG	2	6	624765	624770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203340
13122	NC_012850	CGA	2	6	624844	624849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203340
13123	NC_012850	AGCGA	2	10	624854	624863	40 %	0 %	40 %	20 %	241203340
13124	NC_012850	GAG	2	6	624866	624871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203340
13125	NC_012850	TCGCC	2	10	625062	625071	0 %	20 %	20 %	60 %	241203341
13126	NC_012850	CTC	2	6	625078	625083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203341
13127	NC_012850	GCC	3	9	625154	625162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203341
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13129	NC_012850	GCA	2	6	625226	625231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203341
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13131	NC_012850	GCGAG	2	10	625308	625317	20 %	0 %	60 %	20 %	241203341
13132	NC_012850	CGC	2	6	625336	625341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203341
13133	NC_012850	GCA	2	6	625359	625364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203341
13134	NC_012850	CG	3	6	625392	625397	0 %	0 %	50 %	50 %	241203341
13135	NC_012850	AGC	2	6	625418	625423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203341
13136	NC_012850	GCCG	2	8	625428	625435	0 %	0 %	50 %	50 %	241203341
13137	NC_012850	TCG	2	6	625452	625457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203341
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13142	NC_012850	GCG	2	6	625934	625939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203341
13143	NC_012850	GCC	2	6	625943	625948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203341
13144	NC_012850	CTGC	2	8	625956	625963	0 %	25 %	25 %	50 %	241203341
13145	NC_012850	ATCG	2	8	625978	625985	25 %	25 %	25 %	25 %	241203341
13146	NC_012850	GAT	2	6	626066	626071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203342
13147	NC_012850	CTGC	2	8	626122	626129	0 %	25 %	25 %	50 %	241203342
13148	NC_012850	ACCG	2	8	626166	626173	25 %	0 %	25 %	50 %	241203342
13149	NC_012850	CGG	2	6	626191	626196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203342
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13152	NC_012850	CG	3	6	626349	626354	0 %	0 %	50 %	50 %	241203342
13153	NC_012850	TCC	2	6	626388	626393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203342
13154	NC_012850	ATC	2	6	626409	626414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203342
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13158	NC_012850	GCC	2	6	626548	626553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203342
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13161	NC_012850	GGCT	2	8	626747	626754	0 %	25 %	50 %	25 %	241203343
13162	NC_012850	GATATC	2	12	626791	626802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241203343
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13170	NC_012850	GTC	2	6	627282	627287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203344
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13173	NC_012850	CTC	2	6	627374	627379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203344
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13187	NC_012850	CGA	2	6	627932	627937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203344
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13197	NC_012850	GCG	2	6	628237	628242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203344
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13222	NC_012850	GGA	2	6	629458	629463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203346
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13228	NC_012850	TCG	2	6	629693	629698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203346
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13230	NC_012850	CTC	2	6	629740	629745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203346
13231	NC_012850	CAG	2	6	629794	629799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203346
13232	NC_012850	CCGG	2	8	629814	629821	0 %	0 %	50 %	50 %	241203346
13233	NC_012850	GCGCCC	2	12	629850	629861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203346
13234	NC_012850	TGA	2	6	629895	629900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203346
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13236	NC_012850	TTG	2	6	629939	629944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203346
13237	NC_012850	CGA	2	6	629973	629978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203346
13238	NC_012850	TCG	2	6	629999	630004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203346
13239	NC_012850	TG	3	6	630020	630025	0 %	50 %	50 %	0 %	241203346
13240	NC_012850	CGT	2	6	630031	630036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203346
13241	NC_012850	TCC	2	6	630053	630058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203346
13242	NC_012850	CGG	2	6	630138	630143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203346
13243	NC_012850	TGT	2	6	630165	630170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203346
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13247	NC_012850	CGG	2	6	630716	630721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203347
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13251	NC_012850	TGC	2	6	630881	630886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203347
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13256	NC_012850	CGCC	2	8	631094	631101	0 %	0 %	25 %	75 %	241203347
13257	NC_012850	GCCG	2	8	631112	631119	0 %	0 %	50 %	50 %	241203347
13258	NC_012850	ACG	3	9	631165	631173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203347
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13261	NC_012850	GAT	2	6	631346	631351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203347
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13264	NC_012850	TCG	2	6	631486	631491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203347
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13266	NC_012850	GC	4	8	631545	631552	0 %	0 %	50 %	50 %	241203347
13267	NC_012850	GCC	2	6	631609	631614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203347
13268	NC_012850	GC	3	6	631625	631630	0 %	0 %	50 %	50 %	241203347
13269	NC_012850	CTCG	2	8	631688	631695	0 %	25 %	25 %	50 %	241203347
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13273	NC_012850	CGG	2	6	631838	631843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203347
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13275	NC_012850	CGA	2	6	631886	631891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203347
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13339	NC_012850	TGC	2	6	634388	634393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203350
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13347	NC_012850	GAT	2	6	634832	634837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203350
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13351	NC_012850	GC	3	6	634928	634933	0 %	0 %	50 %	50 %	241203350
13352	NC_012850	GAC	2	6	634940	634945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203350
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13354	NC_012850	GGCCG	2	10	634962	634971	0 %	0 %	60 %	40 %	241203350
13355	NC_012850	GCC	2	6	635081	635086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203350
13356	NC_012850	GGC	2	6	635127	635132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203350
13357	NC_012850	CGT	2	6	635153	635158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203350
13358	NC_012850	GCT	2	6	635249	635254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203350
13359	NC_012850	CGC	2	6	635349	635354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203351
13360	NC_012850	GGGGA	2	10	635363	635372	20 %	0 %	80 %	0 %	241203351
13361	NC_012850	CGA	2	6	635403	635408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203351
13362	NC_012850	GCA	2	6	635426	635431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203351
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13364	NC_012850	CAG	2	6	635512	635517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203351
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13367	NC_012850	CG	3	6	635670	635675	0 %	0 %	50 %	50 %	241203351
13368	NC_012850	ATCG	2	8	635716	635723	25 %	25 %	25 %	25 %	241203351
13369	NC_012850	GCA	3	9	635748	635756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203351
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13373	NC_012850	TCG	2	6	635882	635887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203351
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13375	NC_012850	ACC	2	6	635933	635938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203351
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13384	NC_012850	CGT	2	6	636531	636536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203352
13385	NC_012850	CTCG	2	8	636537	636544	0 %	25 %	25 %	50 %	241203352
13386	NC_012850	CGA	2	6	636558	636563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203352
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13393	NC_012850	CGG	2	6	636807	636812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203352
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13424	NC_012850	GGCC	2	8	638343	638350	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
13425	NC_012850	GCAG	2	8	638421	638428	25 %	0 %	50 %	25 %	241203353
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13456	NC_012850	CCCG	2	8	639230	639237	0 %	0 %	25 %	75 %	241203353
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13459	NC_012850	TCCA	2	8	639675	639682	25 %	25 %	0 %	50 %	241203354
13460	NC_012850	CGAG	2	8	639697	639704	25 %	0 %	50 %	25 %	241203354
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13470	NC_012850	CGACGC	2	12	640024	640035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241203354
13471	NC_012850	CGC	2	6	640039	640044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
13472	NC_012850	CAT	2	6	640072	640077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203354
13473	NC_012850	TCG	2	6	640116	640121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13474	NC_012850	GCC	3	9	640122	640130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
13475	NC_012850	CAC	2	6	640133	640138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203354
13476	NC_012850	GTG	2	6	640152	640157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203354
13477	NC_012850	CGA	2	6	640204	640209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13478	NC_012850	CGT	2	6	640258	640263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13479	NC_012850	GC	3	6	640281	640286	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
13480	NC_012850	GCG	2	6	640308	640313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13481	NC_012850	CGG	2	6	640342	640347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13482	NC_012850	GGC	2	6	640442	640447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13483	NC_012850	CGA	2	6	640456	640461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13484	NC_012850	GTC	2	6	640466	640471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13485	NC_012850	GGC	2	6	640475	640480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
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13490	NC_012850	GAC	2	6	640634	640639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13491	NC_012850	GCA	2	6	640690	640695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
13492	NC_012850	GGT	2	6	640696	640701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203354
13493	NC_012850	GCC	2	6	640760	640765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
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13495	NC_012850	CTT	2	6	640841	640846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203354
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13497	NC_012850	CGG	2	6	640919	640924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
13498	NC_012850	TGTCGT	2	12	640936	640947	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241203354
13499	NC_012850	GC	3	6	640964	640969	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
13500	NC_012850	GCCG	2	8	641009	641016	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354

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