MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012850	GTTT	2	8	597424	597431	0 %	75 %	25 %	0 %	241203321
12502	NC_012850	TTG	2	6	597454	597459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203321
12503	NC_012850	CAG	2	6	597498	597503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12504	NC_012850	TGG	2	6	597511	597516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203321
12505	NC_012850	TGC	2	6	597523	597528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12506	NC_012850	TGC	2	6	597559	597564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12507	NC_012850	AGC	2	6	597580	597585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12508	NC_012850	TCGA	2	8	597654	597661	25 %	25 %	25 %	25 %	241203321
12509	NC_012850	GA	3	6	597739	597744	50 %	0 %	50 %	0 %	241203321
12510	NC_012850	GATG	2	8	597752	597759	25 %	25 %	50 %	0 %	241203321
12511	NC_012850	ATGT	2	8	597906	597913	25 %	50 %	25 %	0 %	241203322
12512	NC_012850	TAT	2	6	597923	597928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203322
12513	NC_012850	CT	3	6	597940	597945	0 %	50 %	0 %	50 %	241203322
12514	NC_012850	CG	4	8	597975	597982	0 %	0 %	50 %	50 %	241203322
12515	NC_012850	GAA	2	6	597993	597998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203322
12516	NC_012850	GCGCC	2	10	598028	598037	0 %	0 %	40 %	60 %	241203322
12517	NC_012850	GCC	2	6	598077	598082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203322
12518	NC_012850	GGT	2	6	598106	598111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203322
12519	NC_012850	CAA	2	6	598121	598126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203322
12520	NC_012850	TTA	2	6	598310	598315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203322
12521	NC_012850	TGC	2	6	598322	598327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203322
12522	NC_012850	CCG	2	6	598648	598653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203323
12523	NC_012850	GCC	2	6	598680	598685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203323
12524	NC_012850	CG	3	6	598708	598713	0 %	0 %	50 %	50 %	241203323
12525	NC_012850	CTG	2	6	598714	598719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12526	NC_012850	CGA	2	6	598770	598775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12527	NC_012850	CGA	2	6	598821	598826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12528	NC_012850	ACC	2	6	598837	598842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203323
12529	NC_012850	TCG	2	6	598844	598849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12530	NC_012850	CGGCAG	2	12	598854	598865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203323
12531	NC_012850	GCC	2	6	598872	598877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203323
12532	NC_012850	CGG	2	6	598928	598933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203323
12533	NC_012850	TCG	2	6	598961	598966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12534	NC_012850	CGA	2	6	598971	598976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12535	NC_012850	CCG	2	6	599059	599064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203323
12536	NC_012850	CCGCAT	2	12	599100	599111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203323
12537	NC_012850	GGC	2	6	599116	599121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203323
12538	NC_012850	CCAG	2	8	599126	599133	25 %	0 %	25 %	50 %	241203323
12539	NC_012850	GCT	2	6	599145	599150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12540	NC_012850	GAT	2	6	599151	599156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203323
12541	NC_012850	GGC	2	6	599157	599162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203323
12542	NC_012850	CGG	2	6	599163	599168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203323
12543	NC_012850	TCG	2	6	599192	599197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12544	NC_012850	GC	3	6	599210	599215	0 %	0 %	50 %	50 %	241203323
12545	NC_012850	CGG	2	6	599237	599242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203323
12546	NC_012850	TCG	2	6	599330	599335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
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12549	NC_012850	CGAT	2	8	599393	599400	25 %	25 %	25 %	25 %	241203323
12550	NC_012850	GC	4	8	599437	599444	0 %	0 %	50 %	50 %	241203323
12551	NC_012850	GCC	2	6	599533	599538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203323
12552	NC_012850	TCG	2	6	599561	599566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203323
12553	NC_012850	GAG	2	6	599653	599658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203323
12554	NC_012850	CGG	2	6	599711	599716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203323
12555	NC_012850	ACC	2	6	599735	599740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203323
12556	NC_012850	GGCC	2	8	599763	599770	0 %	0 %	50 %	50 %	241203323
12557	NC_012850	GCC	2	6	599845	599850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203323
12558	NC_012850	CTG	2	6	599952	599957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203324
12559	NC_012850	CGC	2	6	599966	599971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203324
12560	NC_012850	CGG	2	6	599974	599979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203324
12561	NC_012850	GCC	2	6	599985	599990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203324
12562	NC_012850	A	6	6	600028	600033	100 %	0 %	0 %	0 %	241203324
12563	NC_012850	TGACGG	2	12	600043	600054	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203324
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12567	NC_012850	CGA	2	6	600323	600328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203324
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12589	NC_012850	TGG	2	6	601351	601356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203324
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12601	NC_012850	CGG	3	9	601799	601807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203324
12602	NC_012850	CGG	3	9	601814	601822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203324
12603	NC_012850	GATCG	2	10	601933	601942	20 %	20 %	40 %	20 %	241203325
12604	NC_012850	CGC	2	6	601983	601988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203325
12605	NC_012850	TGA	2	6	601989	601994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203325
12606	NC_012850	CGC	2	6	602005	602010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203325
12607	NC_012850	CGAT	2	8	602103	602110	25 %	25 %	25 %	25 %	241203325
12608	NC_012850	TCG	4	12	602112	602123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203325
12609	NC_012850	GC	3	6	602164	602169	0 %	0 %	50 %	50 %	241203325
12610	NC_012850	CAA	2	6	602287	602292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203325
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12615	NC_012850	GTC	3	9	602459	602467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203325
12616	NC_012850	CTT	2	6	602497	602502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203325
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12618	NC_012850	CGG	2	6	602590	602595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203325
12619	NC_012850	TGA	2	6	602622	602627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203325
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12623	NC_012850	TGA	2	6	602730	602735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203325
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12626	NC_012850	GCT	3	9	602833	602841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203325
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12967	NC_012850	GACGG	2	10	617776	617785	20 %	0 %	60 %	20 %	241203336
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12973	NC_012850	CCG	2	6	618011	618016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203336
12974	NC_012850	GCTC	2	8	618048	618055	0 %	25 %	25 %	50 %	241203336
12975	NC_012850	CGA	2	6	618062	618067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203336
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12977	NC_012850	GGC	2	6	618099	618104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203336
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12991	NC_012850	CGG	2	6	618683	618688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203337
12992	NC_012850	ATC	2	6	618713	618718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203337
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