MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_012850	GCC	2	6	573189	573194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203296
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12004	NC_012850	TCG	2	6	573341	573346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203296
12005	NC_012850	GGC	2	6	573406	573411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203296
12006	NC_012850	AGG	2	6	573419	573424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203296
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12008	NC_012850	CGT	2	6	573528	573533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203296
12009	NC_012850	CGC	2	6	573555	573560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203296
12010	NC_012850	CGA	2	6	573605	573610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203296
12011	NC_012850	AAT	2	6	573620	573625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203296
12012	NC_012850	GTCG	2	8	574098	574105	0 %	25 %	50 %	25 %	241203297
12013	NC_012850	TGC	2	6	574125	574130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203297
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12017	NC_012850	GCT	2	6	574302	574307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203297
12018	NC_012850	CTGG	2	8	574357	574364	0 %	25 %	50 %	25 %	241203297
12019	NC_012850	CGC	2	6	574419	574424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203297
12020	NC_012850	GCG	2	6	574454	574459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203297
12021	NC_012850	CTT	2	6	574465	574470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203297
12022	NC_012850	TCG	2	6	574490	574495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203297
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12025	NC_012850	GAG	2	6	574603	574608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203297
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12052	NC_012850	TCG	2	6	575549	575554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203298
12053	NC_012850	CG	3	6	575561	575566	0 %	0 %	50 %	50 %	241203298
12054	NC_012850	TTC	2	6	575587	575592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203298
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12089	NC_012850	TCCA	2	8	577459	577466	25 %	25 %	0 %	50 %	241203299
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12118	NC_012850	TCA	2	6	579147	579152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203301
12119	NC_012850	AGA	2	6	579164	579169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203301
12120	NC_012850	CGG	2	6	579186	579191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203301
12121	NC_012850	GCTGCC	2	12	579238	579249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203301
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12123	NC_012850	TTC	2	6	579379	579384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203301
12124	NC_012850	TCT	2	6	579392	579397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203301
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12126	NC_012850	CCAG	2	8	579461	579468	25 %	0 %	25 %	50 %	241203301
12127	NC_012850	ATC	2	6	579469	579474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203301
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12132	NC_012850	TCG	2	6	579707	579712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203301
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12134	NC_012850	TTC	2	6	579755	579760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203301
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12233	NC_012850	ATC	2	6	584529	584534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203308
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12237	NC_012850	GGC	2	6	584913	584918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203308
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12342	NC_012850	ATCGC	2	10	590009	590018	20 %	20 %	20 %	40 %	241203314
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12350	NC_012850	CGG	4	12	590247	590258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203314
12351	NC_012850	AG	3	6	590262	590267	50 %	0 %	50 %	0 %	241203314
12352	NC_012850	CCG	2	6	590268	590273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203314
12353	NC_012850	GA	3	6	590291	590296	50 %	0 %	50 %	0 %	241203314
12354	NC_012850	TCC	2	6	590303	590308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203314
12355	NC_012850	GTC	2	6	590309	590314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203314
12356	NC_012850	GCA	2	6	590340	590345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203314
12357	NC_012850	GGC	2	6	590368	590373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203314
12358	NC_012850	AAGAC	2	10	590376	590385	60 %	0 %	20 %	20 %	241203314
12359	NC_012850	CGAG	2	8	590397	590404	25 %	0 %	50 %	25 %	241203314
12360	NC_012850	CAT	2	6	590416	590421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203314
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12362	NC_012850	TCG	2	6	590519	590524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203314
12363	NC_012850	TCG	2	6	590531	590536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203314
12364	NC_012850	GCA	2	6	590538	590543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203314
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12368	NC_012850	TTC	2	6	590800	590805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203314
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12371	NC_012850	CGC	2	6	591070	591075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203315
12372	NC_012850	CTG	2	6	591076	591081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203315
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12375	NC_012850	CGG	2	6	591135	591140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203315
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12383	NC_012850	GCCG	2	8	591451	591458	0 %	0 %	50 %	50 %	241203316
12384	NC_012850	CGT	2	6	591465	591470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203316
12385	NC_012850	GC	3	6	591499	591504	0 %	0 %	50 %	50 %	241203316
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12392	NC_012850	CGGC	2	8	591732	591739	0 %	0 %	50 %	50 %	241203316
12393	NC_012850	CGG	2	6	591744	591749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203316
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12471	NC_012850	GCG	2	6	595812	595817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203320
12472	NC_012850	CTG	2	6	595826	595831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203320
12473	NC_012850	CGG	2	6	595840	595845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203320
12474	NC_012850	TC	3	6	595852	595857	0 %	50 %	0 %	50 %	241203320
12475	NC_012850	GGC	2	6	595864	595869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203320
12476	NC_012850	CTTTA	2	10	596001	596010	20 %	60 %	0 %	20 %	241203321
12477	NC_012850	GCA	2	6	596098	596103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12478	NC_012850	CGG	2	6	596219	596224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203321
12479	NC_012850	GGT	2	6	596265	596270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203321
12480	NC_012850	CGA	2	6	596318	596323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12481	NC_012850	ATT	2	6	596326	596331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203321
12482	NC_012850	GGAGC	2	10	596370	596379	20 %	0 %	60 %	20 %	241203321
12483	NC_012850	A	7	7	596526	596532	100 %	0 %	0 %	0 %	241203321
12484	NC_012850	GCC	2	6	596549	596554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203321
12485	NC_012850	GCG	2	6	596589	596594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203321
12486	NC_012850	GCG	2	6	596719	596724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203321
12487	NC_012850	GTG	2	6	596735	596740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203321
12488	NC_012850	GCC	2	6	596892	596897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203321
12489	NC_012850	GGC	2	6	596933	596938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203321
12490	NC_012850	GTCT	2	8	596948	596955	0 %	50 %	25 %	25 %	241203321
12491	NC_012850	CAGG	2	8	597029	597036	25 %	0 %	50 %	25 %	241203321
12492	NC_012850	AAG	2	6	597042	597047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203321
12493	NC_012850	GC	4	8	597057	597064	0 %	0 %	50 %	50 %	241203321
12494	NC_012850	ATGGT	2	10	597068	597077	20 %	40 %	40 %	0 %	241203321
12495	NC_012850	CGT	2	6	597146	597151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203321
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12498	NC_012850	GAC	2	6	597242	597247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203321
12499	NC_012850	T	6	6	597304	597309	0 %	100 %	0 %	0 %	241203321
12500	NC_012850	TGG	2	6	597346	597351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203321

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