MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012850	TCC	2	6	550713	550718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203276
11502	NC_012850	TCG	2	6	550722	550727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11503	NC_012850	AGC	2	6	550734	550739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11504	NC_012850	GCCGA	2	10	550752	550761	20 %	0 %	40 %	40 %	241203276
11505	NC_012850	CAG	2	6	550799	550804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11506	NC_012850	TCG	2	6	550816	550821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11507	NC_012850	CCG	2	6	550840	550845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203276
11508	NC_012850	CGC	2	6	550870	550875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203276
11509	NC_012850	GCA	2	6	550882	550887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11510	NC_012850	TCG	2	6	550908	550913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11511	NC_012850	CGA	2	6	550984	550989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11512	NC_012850	AGA	2	6	551050	551055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203276
11513	NC_012850	AGC	2	6	551061	551066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11514	NC_012850	CGC	2	6	551068	551073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203276
11515	NC_012850	AGG	2	6	551110	551115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203276
11516	NC_012850	CCATCG	2	12	551149	551160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203276
11517	NC_012850	GAC	2	6	551198	551203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11518	NC_012850	CG	4	8	551230	551237	0 %	0 %	50 %	50 %	241203276
11519	NC_012850	GAT	2	6	551249	551254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203276
11520	NC_012850	GCG	2	6	551263	551268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203276
11521	NC_012850	CAG	2	6	551270	551275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11522	NC_012850	ATC	2	6	551292	551297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203276
11523	NC_012850	TGC	2	6	551344	551349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11524	NC_012850	CGC	2	6	551356	551361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203276
11525	NC_012850	CAG	2	6	551384	551389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11526	NC_012850	CAG	2	6	551414	551419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11527	NC_012850	CGTCGC	2	12	551455	551466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203276
11528	NC_012850	TGC	2	6	551527	551532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11529	NC_012850	CAC	2	6	551591	551596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203276
11530	NC_012850	GCGCC	2	10	551599	551608	0 %	0 %	40 %	60 %	241203276
11531	NC_012850	CGC	2	6	551625	551630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203276
11532	NC_012850	GGGT	2	8	551644	551651	0 %	25 %	75 %	0 %	241203276
11533	NC_012850	GAT	2	6	551666	551671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203276
11534	NC_012850	GAC	2	6	551684	551689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11535	NC_012850	CGGCGA	2	12	551698	551709	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203276
11536	NC_012850	CGG	2	6	551761	551766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203276
11537	NC_012850	CGGCG	2	10	551810	551819	0 %	0 %	60 %	40 %	241203276
11538	NC_012850	ACC	2	6	551820	551825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203276
11539	NC_012850	AGC	2	6	551835	551840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
11540	NC_012850	A	7	7	551854	551860	100 %	0 %	0 %	0 %	241203276
11541	NC_012850	CTT	2	6	552025	552030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203277
11542	NC_012850	GATC	2	8	552048	552055	25 %	25 %	25 %	25 %	241203277
11543	NC_012850	AAGG	2	8	552060	552067	50 %	0 %	50 %	0 %	241203277
11544	NC_012850	GCC	2	6	552079	552084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203277
11545	NC_012850	CGT	3	9	552090	552098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11546	NC_012850	TCC	2	6	552154	552159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203277
11547	NC_012850	CGA	2	6	552165	552170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11548	NC_012850	GCCT	2	8	552295	552302	0 %	25 %	25 %	50 %	241203277
11549	NC_012850	ACC	2	6	552355	552360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203277
11550	NC_012850	TCC	2	6	552367	552372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203277
11551	NC_012850	TGC	2	6	552377	552382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11552	NC_012850	AGC	3	9	552405	552413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11553	NC_012850	TCC	2	6	552439	552444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203277
11554	NC_012850	CGGC	2	8	552458	552465	0 %	0 %	50 %	50 %	241203277
11555	NC_012850	GGC	2	6	552469	552474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203277
11556	NC_012850	TAT	2	6	552601	552606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203277
11557	NC_012850	CGA	2	6	552615	552620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11558	NC_012850	TCG	2	6	552737	552742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11559	NC_012850	GCC	2	6	552769	552774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203277
11560	NC_012850	CAG	2	6	552814	552819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11561	NC_012850	CGA	2	6	552846	552851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203277
11562	NC_012850	TGA	2	6	552920	552925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203277
11563	NC_012850	CTCGAC	2	12	552957	552968	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203277
11564	NC_012850	CG	4	8	552969	552976	0 %	0 %	50 %	50 %	241203277
11565	NC_012850	GCG	2	6	553010	553015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203277
11566	NC_012850	CCG	2	6	553019	553024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203277
11567	NC_012850	CTT	2	6	553031	553036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203277
11568	NC_012850	CCA	2	6	553037	553042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203277
11569	NC_012850	GGA	2	6	553074	553079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203277
11570	NC_012850	ATCG	2	8	553276	553283	25 %	25 %	25 %	25 %	241203277
11571	NC_012850	TGA	2	6	553525	553530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203278
11572	NC_012850	TGC	2	6	553580	553585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203278
11573	NC_012850	GGCG	2	8	553592	553599	0 %	0 %	75 %	25 %	241203278
11574	NC_012850	CTT	2	6	553613	553618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203278
11575	NC_012850	TGG	2	6	553638	553643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203278
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11578	NC_012850	CAA	2	6	553688	553693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203278
11579	NC_012850	CCGG	2	8	553721	553728	0 %	0 %	50 %	50 %	241203278
11580	NC_012850	TGGC	2	8	553733	553740	0 %	25 %	50 %	25 %	241203278
11581	NC_012850	GAA	2	6	553746	553751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203278
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11583	NC_012850	TCA	2	6	553792	553797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203278
11584	NC_012850	CGATC	2	10	553799	553808	20 %	20 %	20 %	40 %	241203278
11585	NC_012850	CG	3	6	553816	553821	0 %	0 %	50 %	50 %	241203278
11586	NC_012850	CGG	2	6	553829	553834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203278
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11588	NC_012850	GGCC	2	8	553875	553882	0 %	0 %	50 %	50 %	241203278
11589	NC_012850	GAG	2	6	553914	553919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203278
11590	NC_012850	GCG	2	6	553939	553944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203278
11591	NC_012850	GAA	2	6	553952	553957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203278
11592	NC_012850	CGG	2	6	553978	553983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203278
11593	NC_012850	CCGGA	2	10	553984	553993	20 %	0 %	40 %	40 %	241203278
11594	NC_012850	GCC	2	6	554002	554007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203278
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11596	NC_012850	CG	3	6	554065	554070	0 %	0 %	50 %	50 %	241203278
11597	NC_012850	ATCGC	2	10	554095	554104	20 %	20 %	20 %	40 %	241203278
11598	NC_012850	TGG	2	6	554107	554112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203278
11599	NC_012850	GTC	2	6	554119	554124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203278
11600	NC_012850	CGG	3	9	554198	554206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203278
11601	NC_012850	TCG	2	6	554209	554214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203278
11602	NC_012850	GGCC	2	8	554223	554230	0 %	0 %	50 %	50 %	241203278
11603	NC_012850	CGA	2	6	554322	554327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203278
11604	NC_012850	A	6	6	554393	554398	100 %	0 %	0 %	0 %	241203279
11605	NC_012850	TGAC	2	8	554399	554406	25 %	25 %	25 %	25 %	241203279
11606	NC_012850	AAG	2	6	554416	554421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203279
11607	NC_012850	GGC	2	6	554443	554448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203279
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11609	NC_012850	GCA	2	6	554556	554561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203279
11610	NC_012850	GTC	2	6	554883	554888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203280
11611	NC_012850	CGC	2	6	554937	554942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
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11614	NC_012850	GAC	2	6	555080	555085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203280
11615	NC_012850	CGC	2	6	555110	555115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
11616	NC_012850	ATT	2	6	555190	555195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203280
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11618	NC_012850	GCC	3	9	555259	555267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
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11843	NC_012850	CTGGAG	2	12	565710	565721	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203288
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11975	NC_012850	GCG	2	6	571602	571607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203295
11976	NC_012850	TCCA	2	8	571673	571680	25 %	25 %	0 %	50 %	241203295
11977	NC_012850	GACC	2	8	571738	571745	25 %	0 %	25 %	50 %	241203295
11978	NC_012850	CGG	2	6	571770	571775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203295
11979	NC_012850	CCA	2	6	571851	571856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203295
11980	NC_012850	TCG	2	6	572531	572536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203296
11981	NC_012850	CGC	2	6	572637	572642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203296
11982	NC_012850	TCA	2	6	572651	572656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203296
11983	NC_012850	CGG	2	6	572696	572701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203296
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11986	NC_012850	GCCC	2	8	572731	572738	0 %	0 %	25 %	75 %	241203296
11987	NC_012850	GCG	2	6	572740	572745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203296
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11998	NC_012850	GAT	2	6	573096	573101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203296
11999	NC_012850	GCT	2	6	573129	573134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203296
12000	NC_012850	TGC	2	6	573140	573145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203296

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