MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012850	GCG	2	6	527869	527874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203255
11002	NC_012850	GTC	3	9	527882	527890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203255
11003	NC_012850	CCAT	2	8	527940	527947	25 %	25 %	0 %	50 %	241203255
11004	NC_012850	ACCGTC	2	12	527949	527960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203255
11005	NC_012850	GCA	2	6	527965	527970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203255
11006	NC_012850	GCC	2	6	528048	528053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203255
11007	NC_012850	GCCA	2	8	528068	528075	25 %	0 %	25 %	50 %	241203255
11008	NC_012850	CGA	3	9	528097	528105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203255
11009	NC_012850	CCAG	2	8	528166	528173	25 %	0 %	25 %	50 %	241203255
11010	NC_012850	TGA	2	6	528187	528192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203255
11011	NC_012850	GCATGC	2	12	528199	528210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203255
11012	NC_012850	AGC	2	6	528272	528277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203256
11013	NC_012850	CT	3	6	528309	528314	0 %	50 %	0 %	50 %	241203256
11014	NC_012850	GCG	2	6	528322	528327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203256
11015	NC_012850	GGC	2	6	528344	528349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203256
11016	NC_012850	CGG	3	9	528356	528364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203256
11017	NC_012850	GCA	2	6	528376	528381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203256
11018	NC_012850	ACA	2	6	528571	528576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203256
11019	NC_012850	ACC	2	6	528588	528593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203256
11020	NC_012850	CGGC	2	8	528642	528649	0 %	0 %	50 %	50 %	241203256
11021	NC_012850	GTC	2	6	528656	528661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203256
11022	NC_012850	GAC	2	6	528758	528763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203256
11023	NC_012850	GAC	2	6	528824	528829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203256
11024	NC_012850	TCTG	2	8	528841	528848	0 %	50 %	25 %	25 %	241203256
11025	NC_012850	CGC	2	6	528860	528865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203256
11026	NC_012850	CCG	2	6	528907	528912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203256
11027	NC_012850	GCCCG	2	10	528919	528928	0 %	0 %	40 %	60 %	241203256
11028	NC_012850	AGA	2	6	529171	529176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203257
11029	NC_012850	CG	3	6	529204	529209	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11030	NC_012850	TCG	2	6	529213	529218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11031	NC_012850	CGGC	2	8	529225	529232	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11032	NC_012850	CGC	2	6	529309	529314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203257
11033	NC_012850	CCTG	2	8	529346	529353	0 %	25 %	25 %	50 %	241203257
11034	NC_012850	TCT	2	6	529378	529383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203257
11035	NC_012850	CGC	2	6	529435	529440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203257
11036	NC_012850	ATG	3	9	529614	529622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203257
11037	NC_012850	GCG	2	6	529654	529659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203257
11038	NC_012850	CGG	2	6	529721	529726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203257
11039	NC_012850	CGA	2	6	529727	529732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11040	NC_012850	GGCC	2	8	529736	529743	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11041	NC_012850	TGC	2	6	529756	529761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11042	NC_012850	GC	3	6	529760	529765	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11043	NC_012850	CTG	2	6	529806	529811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11044	NC_012850	TTC	2	6	529893	529898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203257
11045	NC_012850	CGA	2	6	529979	529984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11046	NC_012850	GATC	2	8	530042	530049	25 %	25 %	25 %	25 %	241203257
11047	NC_012850	TAT	2	6	530073	530078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203257
11048	NC_012850	GTC	2	6	530139	530144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11049	NC_012850	TTCGG	2	10	530145	530154	0 %	40 %	40 %	20 %	241203257
11050	NC_012850	CGG	4	12	530156	530167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203257
11051	NC_012850	ATG	2	6	530173	530178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203257
11052	NC_012850	TGA	2	6	530245	530250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203257
11053	NC_012850	GAA	2	6	530258	530263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203257
11054	NC_012850	AGA	2	6	530350	530355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203257
11055	NC_012850	GC	3	6	530369	530374	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11056	NC_012850	GAA	2	6	530411	530416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203257
11057	NC_012850	CGC	2	6	530445	530450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203257
11058	NC_012850	CAT	2	6	530465	530470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203257
11059	NC_012850	GCG	2	6	530476	530481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203257
11060	NC_012850	GC	3	6	530486	530491	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11061	NC_012850	CGT	2	6	530498	530503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11062	NC_012850	GC	3	6	530574	530579	0 %	0 %	50 %	50 %	241203257
11063	NC_012850	TCG	2	6	530611	530616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11064	NC_012850	TGC	2	6	530636	530641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203257
11065	NC_012850	AGCG	2	8	530659	530666	25 %	0 %	50 %	25 %	241203257
11066	NC_012850	GCA	2	6	530716	530721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11067	NC_012850	CG	3	6	530774	530779	0 %	0 %	50 %	50 %	241203258
11068	NC_012850	GCCG	2	8	530813	530820	0 %	0 %	50 %	50 %	241203258
11069	NC_012850	GCC	2	6	530854	530859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203258
11070	NC_012850	GTCT	2	8	530925	530932	0 %	50 %	25 %	25 %	241203258
11071	NC_012850	CGCC	2	8	531107	531114	0 %	0 %	25 %	75 %	241203258
11072	NC_012850	TGC	2	6	531115	531120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11073	NC_012850	GCC	2	6	531124	531129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203258
11074	NC_012850	GTC	2	6	531171	531176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11075	NC_012850	GAC	2	6	531294	531299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11076	NC_012850	GAC	2	6	531324	531329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203258
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11078	NC_012850	CGA	2	6	531382	531387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11079	NC_012850	GCCG	2	8	531390	531397	0 %	0 %	50 %	50 %	241203258
11080	NC_012850	CGA	2	6	531458	531463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11081	NC_012850	TGC	2	6	531548	531553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11082	NC_012850	GCA	2	6	531600	531605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203258
11083	NC_012850	CGC	2	6	531647	531652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203258
11084	NC_012850	CGG	3	9	531728	531736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203258
11085	NC_012850	ACCATC	2	12	531842	531853	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	241203258
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11087	NC_012850	CCTT	2	8	531987	531994	0 %	50 %	0 %	50 %	241203259
11088	NC_012850	GTC	3	9	532136	532144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203259
11089	NC_012850	TCG	2	6	532188	532193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203259
11090	NC_012850	CGCC	2	8	532213	532220	0 %	0 %	25 %	75 %	241203259
11091	NC_012850	CCA	2	6	532242	532247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203259
11092	NC_012850	GGC	2	6	532254	532259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203259
11093	NC_012850	CAG	2	6	532265	532270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203259
11094	NC_012850	TCG	2	6	532308	532313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203259
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11096	NC_012850	GC	3	6	532396	532401	0 %	0 %	50 %	50 %	241203259
11097	NC_012850	GCCT	2	8	532448	532455	0 %	25 %	25 %	50 %	241203259
11098	NC_012850	GC	3	6	532459	532464	0 %	0 %	50 %	50 %	241203259
11099	NC_012850	ATC	2	6	532505	532510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203259
11100	NC_012850	GTGC	2	8	532517	532524	0 %	25 %	50 %	25 %	241203259
11101	NC_012850	GCGCC	2	10	532630	532639	0 %	0 %	40 %	60 %	241203260
11102	NC_012850	CGAG	2	8	532646	532653	25 %	0 %	50 %	25 %	241203260
11103	NC_012850	TTC	2	6	532708	532713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203260
11104	NC_012850	GGC	2	6	532800	532805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203260
11105	NC_012850	AGC	2	6	532807	532812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203260
11106	NC_012850	GGCC	2	8	532853	532860	0 %	0 %	50 %	50 %	241203260
11107	NC_012850	CAG	2	6	532890	532895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203260
11108	NC_012850	TGC	2	6	532899	532904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203260
11109	NC_012850	AGA	2	6	532990	532995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203260
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11111	NC_012850	GTT	2	6	533019	533024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203260
11112	NC_012850	ACG	2	6	533372	533377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203261
11113	NC_012850	A	6	6	533389	533394	100 %	0 %	0 %	0 %	241203261
11114	NC_012850	CAT	2	6	533401	533406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203261
11115	NC_012850	CGC	2	6	533500	533505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203261
11116	NC_012850	TC	3	6	533534	533539	0 %	50 %	0 %	50 %	241203261
11117	NC_012850	ATC	2	6	533564	533569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203261
11118	NC_012850	A	6	6	533640	533645	100 %	0 %	0 %	0 %	241203261
11119	NC_012850	CTG	2	6	533661	533666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203261
11120	NC_012850	GCC	2	6	533669	533674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203261
11121	NC_012850	CGC	2	6	533761	533766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203261
11122	NC_012850	CAA	2	6	533779	533784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203261
11123	NC_012850	GCT	2	6	533824	533829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203261
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11237	NC_012850	TCG	2	6	539471	539476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203266
11238	NC_012850	GCT	2	6	539511	539516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203266
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11351	NC_012850	GGCT	2	8	544623	544630	0 %	25 %	50 %	25 %	241203270
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11353	NC_012850	GATC	2	8	544661	544668	25 %	25 %	25 %	25 %	241203270
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11475	NC_012850	GATCG	2	10	549574	549583	20 %	20 %	40 %	20 %	241203275
11476	NC_012850	AGG	2	6	549586	549591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203275
11477	NC_012850	AGG	2	6	549710	549715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203275
11478	NC_012850	TGC	2	6	549767	549772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203275
11479	NC_012850	TGTC	2	8	549786	549793	0 %	50 %	25 %	25 %	241203275
11480	NC_012850	GTG	2	6	549794	549799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203275
11481	NC_012850	CGTCC	2	10	549817	549826	0 %	20 %	20 %	60 %	241203275
11482	NC_012850	GCT	2	6	549869	549874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203275
11483	NC_012850	CGA	2	6	549900	549905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203275
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11491	NC_012850	TCGA	2	8	550368	550375	25 %	25 %	25 %	25 %	241203276
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11494	NC_012850	GCCG	2	8	550502	550509	0 %	0 %	50 %	50 %	241203276
11495	NC_012850	GCA	2	6	550513	550518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203276
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11498	NC_012850	CGCC	2	8	550614	550621	0 %	0 %	25 %	75 %	241203276
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