MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78502	NC_012850	CGG	2	6	3781679	3781684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206413
78503	NC_012850	GAT	2	6	3781707	3781712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206413
78504	NC_012850	GTC	2	6	3781728	3781733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78505	NC_012850	CCG	2	6	3781780	3781785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206413
78506	NC_012850	TCG	2	6	3781825	3781830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78507	NC_012850	CTC	2	6	3781838	3781843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241206413
78508	NC_012850	CGA	2	6	3781874	3781879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78509	NC_012850	TCG	2	6	3781939	3781944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78510	NC_012850	CCG	2	6	3781978	3781983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206413
78511	NC_012850	TCT	2	6	3782011	3782016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206413
78512	NC_012850	GAC	2	6	3782049	3782054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78513	NC_012850	GTC	2	6	3782085	3782090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78514	NC_012850	CGA	2	6	3782114	3782119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206413
78515	NC_012850	GGCCT	2	10	3782151	3782160	0 %	20 %	40 %	40 %	241206413
78516	NC_012850	GCC	2	6	3782202	3782207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206413
78517	NC_012850	GGC	2	6	3782271	3782276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206413
78518	NC_012850	GGA	2	6	3782321	3782326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241206413
78519	NC_012850	CCG	2	6	3782332	3782337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206413
78520	NC_012850	TGA	2	6	3782347	3782352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206413
78521	NC_012850	T	6	6	3782538	3782543	0 %	100 %	0 %	0 %	241206414
78522	NC_012850	ATC	2	6	3782553	3782558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206414
78523	NC_012850	CTT	2	6	3782564	3782569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206414
78524	NC_012850	GCT	2	6	3782630	3782635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206414
78525	NC_012850	TCCTTG	2	12	3782650	3782661	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241206414
78526	NC_012850	GGCC	2	8	3782669	3782676	0 %	0 %	50 %	50 %	241206414
78527	NC_012850	CCA	2	6	3782814	3782819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206415
78528	NC_012850	CATC	2	8	3782826	3782833	25 %	25 %	0 %	50 %	241206415
78529	NC_012850	AGG	2	6	3782894	3782899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241206415
78530	NC_012850	ATC	2	6	3782948	3782953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206415
78531	NC_012850	CGTCAG	2	12	3783055	3783066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241206415
78532	NC_012850	GAC	2	6	3783100	3783105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206415
78533	NC_012850	CGA	2	6	3783228	3783233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206415
78534	NC_012850	CTG	2	6	3783239	3783244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206415
78535	NC_012850	AGCC	2	8	3783331	3783338	25 %	0 %	25 %	50 %	241206415
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78538	NC_012850	GGCT	2	8	3783623	3783630	0 %	25 %	50 %	25 %	241206416
78539	NC_012850	GATC	2	8	3783648	3783655	25 %	25 %	25 %	25 %	241206416
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78543	NC_012850	TCG	2	6	3783881	3783886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206416
78544	NC_012850	CT	3	6	3783887	3783892	0 %	50 %	0 %	50 %	241206416
78545	NC_012850	GCC	2	6	3783990	3783995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206416
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78547	NC_012850	TCG	2	6	3784124	3784129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206416
78548	NC_012850	TCC	2	6	3784268	3784273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241206416
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78550	NC_012850	GCG	3	9	3784391	3784399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206416
78551	NC_012850	GCT	2	6	3784432	3784437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206416
78552	NC_012850	AGC	2	6	3784448	3784453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206416
78553	NC_012850	CGG	2	6	3784488	3784493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206416
78554	NC_012850	GC	3	6	3784544	3784549	0 %	0 %	50 %	50 %	241206416
78555	NC_012850	GTC	2	6	3784552	3784557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206416
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78558	NC_012850	GCT	2	6	3784698	3784703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206416
78559	NC_012850	GCT	2	6	3784739	3784744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206416
78560	NC_012850	CT	3	6	3784743	3784748	0 %	50 %	0 %	50 %	241206416
78561	NC_012850	GCA	2	6	3784817	3784822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206416
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78572	NC_012850	CGT	2	6	3785225	3785230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206417
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78582	NC_012850	GCCGC	2	10	3785563	3785572	0 %	0 %	40 %	60 %	241206417
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78602	NC_012850	GCA	2	6	3786537	3786542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206419
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78960	NC_012850	ATC	2	6	3802984	3802989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206437
78961	NC_012850	GC	3	6	3802992	3802997	0 %	0 %	50 %	50 %	241206437
78962	NC_012850	GGA	2	6	3802998	3803003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241206437
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78964	NC_012850	TTTTA	2	10	3803162	3803171	20 %	80 %	0 %	0 %	241206438
78965	NC_012850	TGC	2	6	3803207	3803212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206438
78966	NC_012850	CTGC	2	8	3803214	3803221	0 %	25 %	25 %	50 %	241206438
78967	NC_012850	CTG	2	6	3803266	3803271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206438
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78975	NC_012850	CGA	2	6	3803670	3803675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206438
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78978	NC_012850	AAG	2	6	3803894	3803899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206438
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78982	NC_012850	CGT	2	6	3804147	3804152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206438
78983	NC_012850	GCA	2	6	3804177	3804182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206438
78984	NC_012850	CGT	2	6	3804234	3804239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206438
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78988	NC_012850	TTC	2	6	3804329	3804334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206438
78989	NC_012850	ATC	2	6	3804343	3804348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206438
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78994	NC_012850	CGACG	2	10	3804771	3804780	20 %	0 %	40 %	40 %	241206439
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