MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_012850	GCC	2	6	3615138	3615143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206269
75003	NC_012850	GATC	2	8	3615146	3615153	25 %	25 %	25 %	25 %	241206269
75004	NC_012850	CGG	2	6	3615191	3615196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206269
75005	NC_012850	GAC	2	6	3615212	3615217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206269
75006	NC_012850	ATT	2	6	3615220	3615225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241206269
75007	NC_012850	TCG	2	6	3615229	3615234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206269
75008	NC_012850	ACG	2	6	3615235	3615240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206269
75009	NC_012850	GTC	2	6	3615294	3615299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206269
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75011	NC_012850	GAA	2	6	3615410	3615415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206269
75012	NC_012850	CGC	2	6	3615418	3615423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206269
75013	NC_012850	CGA	2	6	3615439	3615444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206269
75014	NC_012850	CGG	2	6	3615488	3615493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206269
75015	NC_012850	CAT	2	6	3615500	3615505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206269
75016	NC_012850	GTC	2	6	3615534	3615539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206269
75017	NC_012850	TCAG	2	8	3615556	3615563	25 %	25 %	25 %	25 %	241206269
75018	NC_012850	CCA	3	9	3615584	3615592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206269
75019	NC_012850	GCC	2	6	3615657	3615662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206269
75020	NC_012850	GGC	2	6	3615681	3615686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206269
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75027	NC_012850	GCCG	2	8	3616080	3616087	0 %	0 %	50 %	50 %	241206270
75028	NC_012850	GCA	2	6	3616115	3616120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206270
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75115	NC_012850	GCA	2	6	3620113	3620118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206274
75116	NC_012850	GCC	2	6	3620280	3620285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206274
75117	NC_012850	CCG	2	6	3620301	3620306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206274
75118	NC_012850	GCC	2	6	3620329	3620334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206274
75119	NC_012850	TCA	2	6	3620349	3620354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206274
75120	NC_012850	GCA	2	6	3620377	3620382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206274
75121	NC_012850	AGCGA	2	10	3620397	3620406	40 %	0 %	40 %	20 %	241206274
75122	NC_012850	CGC	2	6	3620419	3620424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206274
75123	NC_012850	CAG	2	6	3620564	3620569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206274
75124	NC_012850	ACC	2	6	3620583	3620588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206274
75125	NC_012850	GCA	2	6	3620644	3620649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206274
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75128	NC_012850	GCC	2	6	3620721	3620726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206274
75129	NC_012850	TCG	2	6	3620727	3620732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206274
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75132	NC_012850	CTT	2	6	3620843	3620848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206274
75133	NC_012850	CACT	2	8	3620857	3620864	25 %	25 %	0 %	50 %	241206274
75134	NC_012850	GCC	2	6	3620892	3620897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206274
75135	NC_012850	CGTC	2	8	3620960	3620967	0 %	25 %	25 %	50 %	241206274
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75140	NC_012850	CGG	2	6	3621347	3621352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206275
75141	NC_012850	CCGG	2	8	3621385	3621392	0 %	0 %	50 %	50 %	241206275
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75146	NC_012850	GC	3	6	3621642	3621647	0 %	0 %	50 %	50 %	241206276
75147	NC_012850	GGC	2	6	3621742	3621747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206276
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75149	NC_012850	ATG	2	6	3621906	3621911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206276
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75152	NC_012850	GCT	2	6	3621989	3621994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206277
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75218	NC_012850	GC	3	6	3625903	3625908	0 %	0 %	50 %	50 %	241206281
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75220	NC_012850	GAGAC	2	10	3626037	3626046	40 %	0 %	40 %	20 %	241206281
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75222	NC_012850	ACG	2	6	3626121	3626126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206281
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75224	NC_012850	AAC	2	6	3626190	3626195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241206282
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75227	NC_012850	TCG	2	6	3626229	3626234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206282
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75229	NC_012850	CG	3	6	3626367	3626372	0 %	0 %	50 %	50 %	241206282
75230	NC_012850	GAA	2	6	3626404	3626409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206282
75231	NC_012850	GCT	2	6	3626444	3626449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206282
75232	NC_012850	TGAAC	2	10	3626452	3626461	40 %	20 %	20 %	20 %	241206282
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75234	NC_012850	GAA	3	9	3626634	3626642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206283
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75238	NC_012850	AAG	2	6	3626739	3626744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206283
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75243	NC_012850	GC	3	6	3627173	3627178	0 %	0 %	50 %	50 %	241206284
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75345	NC_012850	CGA	2	6	3633022	3633027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206287
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75440	NC_012850	ATCGA	2	10	3638276	3638285	40 %	20 %	20 %	20 %	241206293
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75446	NC_012850	GCTC	2	8	3638439	3638446	0 %	25 %	25 %	50 %	241206293
75447	NC_012850	AGCCGA	2	12	3638470	3638481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75448	NC_012850	TGA	2	6	3638493	3638498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206293
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75450	NC_012850	CCTT	2	8	3638559	3638566	0 %	50 %	0 %	50 %	241206293
75451	NC_012850	CGG	2	6	3638662	3638667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206293
75452	NC_012850	AGA	2	6	3638670	3638675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206293
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75454	NC_012850	TCC	2	6	3638717	3638722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241206293
75455	NC_012850	CAA	2	6	3638800	3638805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241206293
75456	NC_012850	ATC	2	6	3638807	3638812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206293
75457	NC_012850	CGATGT	2	12	3638866	3638877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241206293
75458	NC_012850	CGT	2	6	3638878	3638883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75459	NC_012850	CGA	2	6	3638943	3638948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75460	NC_012850	CGG	2	6	3638962	3638967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206293
75461	NC_012850	GTC	2	6	3638981	3638986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75462	NC_012850	CCT	2	6	3638994	3638999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241206293
75463	NC_012850	TCG	2	6	3639021	3639026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75464	NC_012850	CGA	2	6	3639034	3639039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75465	NC_012850	GCG	2	6	3639042	3639047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206293
75466	NC_012850	CGATC	2	10	3639067	3639076	20 %	20 %	20 %	40 %	241206293
75467	NC_012850	TGG	2	6	3639240	3639245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241206293
75468	NC_012850	CGG	3	9	3639301	3639309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206293
75469	NC_012850	TGCG	2	8	3639312	3639319	0 %	25 %	50 %	25 %	241206293
75470	NC_012850	TCGA	2	8	3639320	3639327	25 %	25 %	25 %	25 %	241206293
75471	NC_012850	CGG	2	6	3639328	3639333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206293
75472	NC_012850	TCA	2	6	3639354	3639359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206293
75473	NC_012850	CGCT	2	8	3639381	3639388	0 %	25 %	25 %	50 %	241206293
75474	NC_012850	CGT	2	6	3639412	3639417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75475	NC_012850	GCCG	2	8	3639458	3639465	0 %	0 %	50 %	50 %	241206293
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75478	NC_012850	AAGG	2	8	3639644	3639651	50 %	0 %	50 %	0 %	241206293
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75481	NC_012850	CTG	2	6	3639807	3639812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75482	NC_012850	GCT	2	6	3639848	3639853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75483	NC_012850	TCCA	2	8	3639859	3639866	25 %	25 %	0 %	50 %	241206293
75484	NC_012850	CTG	2	6	3639885	3639890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206293
75485	NC_012850	CGA	2	6	3639966	3639971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206293
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75487	NC_012850	CGC	2	6	3639991	3639996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206293
75488	NC_012850	CAG	2	6	3640261	3640266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206294
75489	NC_012850	ATC	2	6	3640288	3640293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206294
75490	NC_012850	TGC	2	6	3640321	3640326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206294
75491	NC_012850	CGC	2	6	3640401	3640406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206294
75492	NC_012850	CCCG	2	8	3640465	3640472	0 %	0 %	25 %	75 %	241206294
75493	NC_012850	GAA	2	6	3640514	3640519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206294
75494	NC_012850	AGA	2	6	3640658	3640663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206294
75495	NC_012850	GCG	3	9	3640707	3640715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206294
75496	NC_012850	GCT	2	6	3640751	3640756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206294
75497	NC_012850	GAC	2	6	3640803	3640808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206294
75498	NC_012850	TGC	2	6	3640879	3640884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206294
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