MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74002	NC_012850	CAT	2	6	3570238	3570243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206222
74003	NC_012850	GCT	2	6	3570245	3570250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206222
74004	NC_012850	CGA	2	6	3570286	3570291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206222
74005	NC_012850	CTC	2	6	3570328	3570333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241206222
74006	NC_012850	GTCCT	2	10	3570383	3570392	0 %	40 %	20 %	40 %	241206222
74007	NC_012850	TTG	2	6	3570514	3570519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241206223
74008	NC_012850	CGAA	2	8	3570530	3570537	50 %	0 %	25 %	25 %	241206223
74009	NC_012850	TGGA	2	8	3570710	3570717	25 %	25 %	50 %	0 %	241206224
74010	NC_012850	TTACT	2	10	3570718	3570727	20 %	60 %	0 %	20 %	241206224
74011	NC_012850	GCCG	2	8	3570737	3570744	0 %	0 %	50 %	50 %	241206224
74012	NC_012850	TTC	2	6	3570791	3570796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206224
74013	NC_012850	CGA	2	6	3570814	3570819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206224
74014	NC_012850	CT	3	6	3570849	3570854	0 %	50 %	0 %	50 %	241206224
74015	NC_012850	ACC	2	6	3570890	3570895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206224
74016	NC_012850	AAGC	2	8	3570900	3570907	50 %	0 %	25 %	25 %	241206224
74017	NC_012850	CGA	3	9	3570931	3570939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206224
74018	NC_012850	TCG	2	6	3570966	3570971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206224
74019	NC_012850	CGA	2	6	3571000	3571005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206224
74020	NC_012850	AGA	2	6	3571018	3571023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206224
74021	NC_012850	CAC	2	6	3571246	3571251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206225
74022	NC_012850	CGG	2	6	3571259	3571264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206225
74023	NC_012850	CGC	2	6	3571336	3571341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206225
74024	NC_012850	GTG	2	6	3571908	3571913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241206226
74025	NC_012850	CTT	2	6	3571935	3571940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206226
74026	NC_012850	C	6	6	3571978	3571983	0 %	0 %	0 %	100 %	241206226
74027	NC_012850	TGC	3	9	3571984	3571992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74028	NC_012850	TGA	2	6	3571999	3572004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206226
74029	NC_012850	TGC	2	6	3572012	3572017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74030	NC_012850	AAT	2	6	3572049	3572054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241206226
74031	NC_012850	CT	3	6	3572153	3572158	0 %	50 %	0 %	50 %	241206226
74032	NC_012850	TCGG	2	8	3572169	3572176	0 %	25 %	50 %	25 %	241206226
74033	NC_012850	CGC	2	6	3572207	3572212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206226
74034	NC_012850	CTGG	2	8	3572234	3572241	0 %	25 %	50 %	25 %	241206226
74035	NC_012850	GCTCG	2	10	3572252	3572261	0 %	20 %	40 %	40 %	241206226
74036	NC_012850	TCG	2	6	3572263	3572268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
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74038	NC_012850	TCT	2	6	3572290	3572295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206226
74039	NC_012850	CTG	2	6	3572298	3572303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74040	NC_012850	CGG	2	6	3572309	3572314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206226
74041	NC_012850	TCG	2	6	3572401	3572406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74042	NC_012850	GCG	2	6	3572419	3572424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206226
74043	NC_012850	GCA	2	6	3572468	3572473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74044	NC_012850	CGG	2	6	3572504	3572509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206226
74045	NC_012850	ATG	2	6	3572511	3572516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206226
74046	NC_012850	CAG	2	6	3572531	3572536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74047	NC_012850	GCTC	2	8	3572579	3572586	0 %	25 %	25 %	50 %	241206226
74048	NC_012850	GGC	2	6	3572616	3572621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206226
74049	NC_012850	CTGG	2	8	3572717	3572724	0 %	25 %	50 %	25 %	241206226
74050	NC_012850	ATC	2	6	3572730	3572735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206226
74051	NC_012850	CGCCA	2	10	3572759	3572768	20 %	0 %	20 %	60 %	241206226
74052	NC_012850	TCA	2	6	3572782	3572787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206226
74053	NC_012850	TCG	2	6	3572824	3572829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74054	NC_012850	GCT	2	6	3572855	3572860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74055	NC_012850	GCA	2	6	3572876	3572881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206226
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74057	NC_012850	CAT	2	6	3572939	3572944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206226
74058	NC_012850	CGG	2	6	3572954	3572959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206226
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74060	NC_012850	GCT	2	6	3573014	3573019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206226
74061	NC_012850	AAG	2	6	3573051	3573056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206226
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74065	NC_012850	TCA	2	6	3573151	3573156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206226
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74106	NC_012850	GGCG	2	8	3574659	3574666	0 %	0 %	75 %	25 %	241206227
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74115	NC_012850	GCT	2	6	3575026	3575031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206227
74116	NC_012850	TGCAG	2	10	3575286	3575295	20 %	20 %	40 %	20 %	241206228
74117	NC_012850	GGC	2	6	3575305	3575310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206228
74118	NC_012850	GCT	2	6	3575316	3575321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206228
74119	NC_012850	CGC	2	6	3575322	3575327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206228
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74122	NC_012850	CGA	2	6	3575427	3575432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206228
74123	NC_012850	GAA	2	6	3575439	3575444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206228
74124	NC_012850	AT	3	6	3575445	3575450	50 %	50 %	0 %	0 %	241206228
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74145	NC_012850	ATT	2	6	3576575	3576580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241206229
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74147	NC_012850	CCGC	2	8	3576623	3576630	0 %	0 %	25 %	75 %	241206229
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74151	NC_012850	CG	3	6	3576823	3576828	0 %	0 %	50 %	50 %	241206229
74152	NC_012850	ACC	2	6	3576913	3576918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206229
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74204	NC_012850	CGA	2	6	3579170	3579175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206232
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74210	NC_012850	GCCGC	2	10	3579803	3579812	0 %	0 %	40 %	60 %	241206233
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74216	NC_012850	CGC	2	6	3579999	3580004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206233
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74218	NC_012850	CAA	2	6	3580182	3580187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241206233
74219	NC_012850	AGGCCG	2	12	3580385	3580396	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241206234
74220	NC_012850	TTG	2	6	3580406	3580411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241206234
74221	NC_012850	GCT	2	6	3580443	3580448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206234
74222	NC_012850	GCC	2	6	3580453	3580458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206234
74223	NC_012850	ACC	2	6	3580559	3580564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206234
74224	NC_012850	GATG	2	8	3580584	3580591	25 %	25 %	50 %	0 %	241206234
74225	NC_012850	AAG	2	6	3580825	3580830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206235
74226	NC_012850	TGG	2	6	3580886	3580891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241206235
74227	NC_012850	GCC	2	6	3580918	3580923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206235
74228	NC_012850	TCA	2	6	3580997	3581002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206235
74229	NC_012850	GC	3	6	3581054	3581059	0 %	0 %	50 %	50 %	241206235
74230	NC_012850	TAT	2	6	3581065	3581070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241206235
74231	NC_012850	TCA	2	6	3581075	3581080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206235
74232	NC_012850	TCG	2	6	3581096	3581101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206235
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74242	NC_012850	GCC	2	6	3581527	3581532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206235
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74329	NC_012850	TCGC	2	8	3585453	3585460	0 %	25 %	25 %	50 %	241206239
74330	NC_012850	GGCGA	2	10	3585462	3585471	20 %	0 %	60 %	20 %	241206239
74331	NC_012850	TGC	2	6	3585499	3585504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206239
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74334	NC_012850	GCT	2	6	3585656	3585661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206239
74335	NC_012850	GCG	2	6	3585729	3585734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206239
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74337	NC_012850	GAC	2	6	3585770	3585775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206239
74338	NC_012850	TGA	3	9	3585793	3585801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206239
74339	NC_012850	GTGC	2	8	3585930	3585937	0 %	25 %	50 %	25 %	241206239
74340	NC_012850	GCC	2	6	3586014	3586019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206239
74341	NC_012850	CG	3	6	3586052	3586057	0 %	0 %	50 %	50 %	241206239
74342	NC_012850	TCAGCT	2	12	3586088	3586099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241206240
74343	NC_012850	GCG	2	6	3586104	3586109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206240
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