MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012850	TTTGC	2	10	318240	318249	0 %	60 %	20 %	20 %	241203063
6502	NC_012850	GAT	2	6	318266	318271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203063
6503	NC_012850	GAC	2	6	318302	318307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203063
6504	NC_012850	CAG	2	6	318319	318324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203063
6505	NC_012850	CATC	2	8	318445	318452	25 %	25 %	0 %	50 %	241203063
6506	NC_012850	TGC	2	6	318472	318477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203063
6507	NC_012850	GTCA	2	8	318482	318489	25 %	25 %	25 %	25 %	241203063
6508	NC_012850	CCCG	2	8	318658	318665	0 %	0 %	25 %	75 %	241203064
6509	NC_012850	CCG	2	6	318676	318681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203064
6510	NC_012850	CCA	2	6	318718	318723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203064
6511	NC_012850	GCCT	2	8	318801	318808	0 %	25 %	25 %	50 %	241203064
6512	NC_012850	CGC	2	6	318827	318832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203064
6513	NC_012850	CG	3	6	318910	318915	0 %	0 %	50 %	50 %	241203064
6514	NC_012850	CGA	2	6	318956	318961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203064
6515	NC_012850	GCC	2	6	318987	318992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203064
6516	NC_012850	CGA	3	9	319045	319053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203064
6517	NC_012850	ATA	2	6	319078	319083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203064
6518	NC_012850	GGA	2	6	319103	319108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203064
6519	NC_012850	CCA	2	6	319163	319168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203064
6520	NC_012850	CGT	2	6	319203	319208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6521	NC_012850	CAT	2	6	319212	319217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203065
6522	NC_012850	CGG	3	9	319218	319226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203065
6523	NC_012850	CCGGCG	2	12	319232	319243	0 %	0 %	50 %	50 %	241203065
6524	NC_012850	ATC	2	6	319250	319255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203065
6525	NC_012850	GCG	2	6	319271	319276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203065
6526	NC_012850	GCC	2	6	319372	319377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203065
6527	NC_012850	CCTGG	2	10	319413	319422	0 %	20 %	40 %	40 %	241203065
6528	NC_012850	GCTC	2	8	319475	319482	0 %	25 %	25 %	50 %	241203065
6529	NC_012850	GCT	2	6	319521	319526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6530	NC_012850	GCT	2	6	319533	319538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6531	NC_012850	GCGT	2	8	319550	319557	0 %	25 %	50 %	25 %	241203065
6532	NC_012850	GCCG	2	8	319594	319601	0 %	0 %	50 %	50 %	241203065
6533	NC_012850	CGA	2	6	319614	319619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6534	NC_012850	GGC	2	6	319624	319629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203065
6535	NC_012850	TCG	2	6	319646	319651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6536	NC_012850	CCA	2	6	319658	319663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203065
6537	NC_012850	CCG	3	9	319669	319677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203065
6538	NC_012850	TGC	2	6	319707	319712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6539	NC_012850	TCG	2	6	319724	319729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6540	NC_012850	ACC	2	6	319735	319740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203065
6541	NC_012850	CCGC	2	8	319764	319771	0 %	0 %	25 %	75 %	241203065
6542	NC_012850	GCC	2	6	319807	319812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203065
6543	NC_012850	CGC	2	6	319870	319875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203065
6544	NC_012850	CCG	2	6	319949	319954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203065
6545	NC_012850	GCT	2	6	319959	319964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6546	NC_012850	GCG	2	6	319990	319995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203065
6547	NC_012850	ACG	2	6	320082	320087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6548	NC_012850	GC	3	6	320218	320223	0 %	0 %	50 %	50 %	241203065
6549	NC_012850	TCA	2	6	320262	320267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203065
6550	NC_012850	GCG	2	6	320283	320288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203065
6551	NC_012850	CGT	3	9	320298	320306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6552	NC_012850	CAC	2	6	320307	320312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203065
6553	NC_012850	GCA	2	6	320356	320361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6554	NC_012850	CGACC	2	10	320388	320397	20 %	0 %	20 %	60 %	241203065
6555	NC_012850	GCT	2	6	320463	320468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6556	NC_012850	GC	3	6	320485	320490	0 %	0 %	50 %	50 %	241203065
6557	NC_012850	TCG	2	6	320543	320548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6558	NC_012850	CGA	2	6	320582	320587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203065
6559	NC_012850	CCTG	2	8	320596	320603	0 %	25 %	25 %	50 %	241203065
6560	NC_012850	GCC	2	6	320829	320834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203066
6561	NC_012850	GCG	2	6	320877	320882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203066
6562	NC_012850	CGG	2	6	320891	320896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203066
6563	NC_012850	CGG	2	6	320906	320911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203066
6564	NC_012850	ATCGTC	2	12	320991	321002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241203066
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6569	NC_012850	GC	3	6	321199	321204	0 %	0 %	50 %	50 %	241203066
6570	NC_012850	CGT	2	6	321251	321256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203066
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6580	NC_012850	CCTGG	2	10	321617	321626	0 %	20 %	40 %	40 %	241203066
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6588	NC_012850	CTCG	2	8	321861	321868	0 %	25 %	25 %	50 %	241203067
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6604	NC_012850	AGCG	2	8	322540	322547	25 %	0 %	50 %	25 %	241203067
6605	NC_012850	CATG	2	8	322562	322569	25 %	25 %	25 %	25 %	241203067
6606	NC_012850	AGC	2	6	322615	322620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203067
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6610	NC_012850	CG	3	6	322691	322696	0 %	0 %	50 %	50 %	241203067
6611	NC_012850	GGC	2	6	322884	322889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203067
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6615	NC_012850	CCGGC	2	10	323080	323089	0 %	0 %	40 %	60 %	241203067
6616	NC_012850	CAG	2	6	323121	323126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203067
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6618	NC_012850	GCGTC	2	10	323171	323180	0 %	20 %	40 %	40 %	241203067
6619	NC_012850	CGTGA	2	10	323268	323277	20 %	20 %	40 %	20 %	241203067
6620	NC_012850	CGC	2	6	323411	323416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203068
6621	NC_012850	CAA	2	6	323421	323426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203068
6622	NC_012850	TGC	2	6	323464	323469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203068
6623	NC_012850	CGG	2	6	323475	323480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203068
6624	NC_012850	GC	4	8	323494	323501	0 %	0 %	50 %	50 %	241203068
6625	NC_012850	CGC	2	6	323518	323523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203068
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6981	NC_012850	GCA	2	6	339887	339892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203082
6982	NC_012850	AAG	2	6	339893	339898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203082
6983	NC_012850	CTC	2	6	339965	339970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203082
6984	NC_012850	GC	3	6	340023	340028	0 %	0 %	50 %	50 %	241203082
6985	NC_012850	CCG	2	6	340050	340055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203082
6986	NC_012850	AGA	2	6	340056	340061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203082
6987	NC_012850	AGC	2	6	340077	340082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203082
6988	NC_012850	ACC	2	6	340149	340154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203082
6989	NC_012850	GAA	2	6	340179	340184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203082
6990	NC_012850	A	6	6	340183	340188	100 %	0 %	0 %	0 %	241203083
6991	NC_012850	GAT	2	6	340201	340206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203083
6992	NC_012850	CCG	2	6	340380	340385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203083
6993	NC_012850	CGATCC	2	12	340403	340414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203083
6994	NC_012850	AGA	2	6	340445	340450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203083
6995	NC_012850	TCT	2	6	340631	340636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203084
6996	NC_012850	ATGA	2	8	340641	340648	50 %	25 %	25 %	0 %	241203084
6997	NC_012850	GCGATC	2	12	340651	340662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203084
6998	NC_012850	CCGTG	2	10	340685	340694	0 %	20 %	40 %	40 %	241203084
6999	NC_012850	GCG	2	6	340708	340713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203084
7000	NC_012850	CAA	2	6	340787	340792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203084

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