MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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67002	NC_012850	GGA	2	6	3230839	3230844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205919
67003	NC_012850	GAT	2	6	3230885	3230890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205919
67004	NC_012850	GAC	2	6	3230940	3230945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205919
67005	NC_012850	GTC	2	6	3230948	3230953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205919
67006	NC_012850	ATATCG	2	12	3230970	3230981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241205919
67007	NC_012850	GCC	2	6	3231116	3231121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205919
67008	NC_012850	TGTCGT	2	12	3231133	3231144	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241205919
67009	NC_012850	CCG	3	9	3231186	3231194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205919
67010	NC_012850	GGT	2	6	3231280	3231285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205919
67011	NC_012850	TGC	2	6	3231304	3231309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205919
67012	NC_012850	TGA	2	6	3231352	3231357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205919
67013	NC_012850	ATT	2	6	3231362	3231367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241205919
67014	NC_012850	ATCC	2	8	3231392	3231399	25 %	25 %	0 %	50 %	241205919
67015	NC_012850	GCT	2	6	3231455	3231460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205919
67016	NC_012850	AT	3	6	3231548	3231553	50 %	50 %	0 %	0 %	241205919
67017	NC_012850	CGC	2	6	3231554	3231559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205919
67018	NC_012850	GAT	2	6	3231593	3231598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205919
67019	NC_012850	TGC	2	6	3231631	3231636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205919
67020	NC_012850	CGG	2	6	3231739	3231744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205919
67021	NC_012850	AGC	2	6	3231747	3231752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205919
67022	NC_012850	GCTC	2	8	3231814	3231821	0 %	25 %	25 %	50 %	241205919
67023	NC_012850	TAG	2	6	3231861	3231866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205919
67024	NC_012850	CGA	2	6	3232579	3232584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205920
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67026	NC_012850	CTT	2	6	3232744	3232749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205920
67027	NC_012850	TGC	2	6	3232789	3232794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205920
67028	NC_012850	CGA	2	6	3232930	3232935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205920
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67032	NC_012850	CGAC	2	8	3233064	3233071	25 %	0 %	25 %	50 %	241205920
67033	NC_012850	GGAT	2	8	3233107	3233114	25 %	25 %	50 %	0 %	241205920
67034	NC_012850	TCACG	2	10	3233155	3233164	20 %	20 %	20 %	40 %	241205920
67035	NC_012850	TGC	2	6	3233413	3233418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205921
67036	NC_012850	TCGA	2	8	3233468	3233475	25 %	25 %	25 %	25 %	241205921
67037	NC_012850	TC	3	6	3233500	3233505	0 %	50 %	0 %	50 %	241205921
67038	NC_012850	GC	5	10	3233569	3233578	0 %	0 %	50 %	50 %	241205921
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67042	NC_012850	TCG	2	6	3233752	3233757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205921
67043	NC_012850	GC	3	6	3233789	3233794	0 %	0 %	50 %	50 %	241205921
67044	NC_012850	CGT	2	6	3233818	3233823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205921
67045	NC_012850	ATTGAC	2	12	3233825	3233836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241205921
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67048	NC_012850	CAT	2	6	3233950	3233955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205921
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67050	NC_012850	CAC	2	6	3234044	3234049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241205921
67051	NC_012850	GAC	2	6	3234053	3234058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205921
67052	NC_012850	GACT	2	8	3234096	3234103	25 %	25 %	25 %	25 %	241205921
67053	NC_012850	CAG	2	6	3234250	3234255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205922
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67055	NC_012850	GC	4	8	3234332	3234339	0 %	0 %	50 %	50 %	241205922
67056	NC_012850	CGA	2	6	3234369	3234374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205922
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67058	NC_012850	CGA	2	6	3234442	3234447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205922
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67069	NC_012850	CAT	2	6	3234936	3234941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205922
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67099	NC_012850	GTCGG	2	10	3236477	3236486	0 %	20 %	60 %	20 %	241205923
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67102	NC_012850	CGA	2	6	3236536	3236541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205923
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67108	NC_012850	GCCC	2	8	3236840	3236847	0 %	0 %	25 %	75 %	241205923
67109	NC_012850	CGC	2	6	3236863	3236868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205923
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67112	NC_012850	GC	3	6	3236940	3236945	0 %	0 %	50 %	50 %	241205923
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67114	NC_012850	AGGC	2	8	3237047	3237054	25 %	0 %	50 %	25 %	241205923
67115	NC_012850	ACAT	2	8	3237083	3237090	50 %	25 %	0 %	25 %	241205923
67116	NC_012850	TCAA	2	8	3237219	3237226	50 %	25 %	0 %	25 %	241205924
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67118	NC_012850	GAT	2	6	3237290	3237295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205924
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67121	NC_012850	GAT	2	6	3237427	3237432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205924
67122	NC_012850	TCG	2	6	3237459	3237464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205924
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67211	NC_012850	GC	3	6	3242536	3242541	0 %	0 %	50 %	50 %	241205927
67212	NC_012850	CGA	2	6	3242578	3242583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205927
67213	NC_012850	CGATGC	2	12	3242839	3242850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241205928
67214	NC_012850	CAGGA	2	10	3242900	3242909	40 %	0 %	40 %	20 %	241205928
67215	NC_012850	TTCA	2	8	3242921	3242928	25 %	50 %	0 %	25 %	241205928
67216	NC_012850	CTT	2	6	3242969	3242974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205928
67217	NC_012850	GAC	2	6	3243011	3243016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205928
67218	NC_012850	GCC	2	6	3243114	3243119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205928
67219	NC_012850	GCA	2	6	3243124	3243129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205928
67220	NC_012850	TCGATA	2	12	3243135	3243146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241205928
67221	NC_012850	CGG	3	9	3243269	3243277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205928
67222	NC_012850	GC	3	6	3243368	3243373	0 %	0 %	50 %	50 %	241205928
67223	NC_012850	GCG	2	6	3243389	3243394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205928
67224	NC_012850	T	6	6	3243488	3243493	0 %	100 %	0 %	0 %	241205928
67225	NC_012850	GCCA	2	8	3243500	3243507	25 %	0 %	25 %	50 %	241205928
67226	NC_012850	GTATCT	2	12	3243508	3243519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241205928
67227	NC_012850	ACG	2	6	3244322	3244327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205929
67228	NC_012850	CGT	3	9	3244398	3244406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205929
67229	NC_012850	TCC	2	6	3244467	3244472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205929
67230	NC_012850	GCG	2	6	3244625	3244630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205930
67231	NC_012850	CCG	2	6	3244642	3244647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205930
67232	NC_012850	TCA	2	6	3244748	3244753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205930
67233	NC_012850	TTC	2	6	3244760	3244765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205930
67234	NC_012850	GCG	2	6	3244772	3244777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205930
67235	NC_012850	GGC	2	6	3244938	3244943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205930
67236	NC_012850	TCT	2	6	3244946	3244951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205930
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67238	NC_012850	CCGCG	2	10	3245010	3245019	0 %	0 %	40 %	60 %	241205930
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67240	NC_012850	GCG	2	6	3245042	3245047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205930
67241	NC_012850	TCG	2	6	3245054	3245059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205930
67242	NC_012850	GCA	2	6	3245066	3245071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205930
67243	NC_012850	CCGA	2	8	3245076	3245083	25 %	0 %	25 %	50 %	241205930
67244	NC_012850	TCG	2	6	3245101	3245106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205930
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67249	NC_012850	GC	3	6	3245236	3245241	0 %	0 %	50 %	50 %	241205931
67250	NC_012850	TGC	3	9	3245253	3245261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205931
67251	NC_012850	TCG	2	6	3245298	3245303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205931
67252	NC_012850	CGC	2	6	3245344	3245349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205931
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67257	NC_012850	GC	3	6	3245545	3245550	0 %	0 %	50 %	50 %	241205931
67258	NC_012850	GCC	2	6	3245572	3245577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205931
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67262	NC_012850	GCCATC	2	12	3245756	3245767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241205931
67263	NC_012850	GCC	2	6	3245819	3245824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205931
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67346	NC_012850	AAG	2	6	3250404	3250409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241205935
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67461	NC_012850	CGA	2	6	3256394	3256399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205942
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