MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_012850	TGCCGA	2	12	3129381	3129392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241205828
65002	NC_012850	GC	3	6	3129473	3129478	0 %	0 %	50 %	50 %	241205828
65003	NC_012850	TTC	2	6	3129952	3129957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205829
65004	NC_012850	CCG	2	6	3130008	3130013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205829
65005	NC_012850	CTGC	2	8	3130069	3130076	0 %	25 %	25 %	50 %	241205829
65006	NC_012850	CGT	2	6	3130098	3130103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65007	NC_012850	GCC	2	6	3130182	3130187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205829
65008	NC_012850	GTC	2	6	3130206	3130211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65009	NC_012850	TTC	2	6	3130219	3130224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205829
65010	NC_012850	CG	3	6	3130337	3130342	0 %	0 %	50 %	50 %	241205829
65011	NC_012850	GCG	2	6	3130358	3130363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205829
65012	NC_012850	CCT	2	6	3130397	3130402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205829
65013	NC_012850	GAT	2	6	3130452	3130457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205829
65014	NC_012850	GTC	2	6	3130525	3130530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65015	NC_012850	TGG	2	6	3130553	3130558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205829
65016	NC_012850	CAG	2	6	3130560	3130565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65017	NC_012850	AGC	2	6	3130613	3130618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65018	NC_012850	TCA	2	6	3130637	3130642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205829
65019	NC_012850	GCC	2	6	3130675	3130680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205829
65020	NC_012850	AGC	2	6	3130713	3130718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65021	NC_012850	CGG	2	6	3130751	3130756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205829
65022	NC_012850	GCA	2	6	3130775	3130780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65023	NC_012850	GGC	2	6	3130782	3130787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205829
65024	NC_012850	TGT	2	6	3130838	3130843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241205829
65025	NC_012850	TGG	2	6	3130865	3130870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205829
65026	NC_012850	GCC	2	6	3130901	3130906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205829
65027	NC_012850	GGC	2	6	3130950	3130955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205829
65028	NC_012850	GC	4	8	3130954	3130961	0 %	0 %	50 %	50 %	241205829
65029	NC_012850	CG	3	6	3130963	3130968	0 %	0 %	50 %	50 %	241205829
65030	NC_012850	TCT	2	6	3131036	3131041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205829
65031	NC_012850	CGGC	2	8	3131130	3131137	0 %	0 %	50 %	50 %	241205829
65032	NC_012850	GAC	2	6	3131154	3131159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65033	NC_012850	TGGT	2	8	3131173	3131180	0 %	50 %	50 %	0 %	241205829
65034	NC_012850	CATG	2	8	3131339	3131346	25 %	25 %	25 %	25 %	241205829
65035	NC_012850	CGT	2	6	3131376	3131381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205829
65036	NC_012850	GATC	2	8	3131387	3131394	25 %	25 %	25 %	25 %	241205829
65037	NC_012850	GTC	3	9	3131584	3131592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205830
65038	NC_012850	CCA	2	6	3131600	3131605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241205830
65039	NC_012850	ACA	2	6	3131651	3131656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241205830
65040	NC_012850	TCA	2	6	3131660	3131665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205830
65041	NC_012850	TCG	2	6	3131699	3131704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205830
65042	NC_012850	ATC	2	6	3131741	3131746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205830
65043	NC_012850	CCG	2	6	3131765	3131770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205830
65044	NC_012850	GCC	2	6	3131794	3131799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205830
65045	NC_012850	CGG	2	6	3131808	3131813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205830
65046	NC_012850	CAA	2	6	3131829	3131834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241205830
65047	NC_012850	GATCA	2	10	3131887	3131896	40 %	20 %	20 %	20 %	241205830
65048	NC_012850	GC	3	6	3131931	3131936	0 %	0 %	50 %	50 %	241205830
65049	NC_012850	TGA	2	6	3131948	3131953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205830
65050	NC_012850	GAA	2	6	3131958	3131963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241205830
65051	NC_012850	CAT	2	6	3131973	3131978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205830
65052	NC_012850	TCG	2	6	3132002	3132007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205830
65053	NC_012850	TCG	2	6	3132140	3132145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205830
65054	NC_012850	GC	3	6	3132172	3132177	0 %	0 %	50 %	50 %	241205830
65055	NC_012850	GCGA	2	8	3132280	3132287	25 %	0 %	50 %	25 %	241205830
65056	NC_012850	T	6	6	3132456	3132461	0 %	100 %	0 %	0 %	241205831
65057	NC_012850	AAGG	2	8	3132490	3132497	50 %	0 %	50 %	0 %	241205831
65058	NC_012850	GCG	2	6	3132515	3132520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205831
65059	NC_012850	TCG	2	6	3132533	3132538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205831
65060	NC_012850	GCA	2	6	3132669	3132674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205831
65061	NC_012850	AGCCG	2	10	3132764	3132773	20 %	0 %	40 %	40 %	241205831
65062	NC_012850	GCC	2	6	3132841	3132846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205831
65063	NC_012850	ATC	2	6	3133036	3133041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205831
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65065	NC_012850	TCA	2	6	3133109	3133114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205831
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65068	NC_012850	GATC	2	8	3133236	3133243	25 %	25 %	25 %	25 %	241205831
65069	NC_012850	CGG	2	6	3133248	3133253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205831
65070	NC_012850	GGC	2	6	3133282	3133287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205831
65071	NC_012850	CGC	3	9	3133322	3133330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205831
65072	NC_012850	GACGCT	2	12	3133347	3133358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241205831
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65075	NC_012850	GCA	2	6	3133471	3133476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205831
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65082	NC_012850	GCA	2	6	3133642	3133647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205831
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65084	NC_012850	GC	3	6	3133731	3133736	0 %	0 %	50 %	50 %	241205831
65085	NC_012850	CGG	2	6	3133739	3133744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205831
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65088	NC_012850	GAG	2	6	3133828	3133833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205831
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65105	NC_012850	GCC	2	6	3134393	3134398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205833
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65107	NC_012850	GC	3	6	3134463	3134468	0 %	0 %	50 %	50 %	241205833
65108	NC_012850	TCA	2	6	3134490	3134495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205833
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65115	NC_012850	GCG	2	6	3134748	3134753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205833
65116	NC_012850	CGG	2	6	3134758	3134763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205833
65117	NC_012850	GCG	2	6	3134798	3134803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205833
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65229	NC_012850	ACCTG	2	10	3140261	3140270	20 %	20 %	20 %	40 %	241205839
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65231	NC_012850	GATC	2	8	3140355	3140362	25 %	25 %	25 %	25 %	241205839
65232	NC_012850	GCCC	2	8	3140381	3140388	0 %	0 %	25 %	75 %	241205839
65233	NC_012850	GTC	2	6	3140431	3140436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205839
65234	NC_012850	TCTGC	2	10	3140442	3140451	0 %	40 %	20 %	40 %	241205839
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65236	NC_012850	GCCGC	2	10	3140546	3140555	0 %	0 %	40 %	60 %	241205839
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65245	NC_012850	GACCTG	2	12	3140871	3140882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241205839
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65255	NC_012850	GCCAT	2	10	3141167	3141176	20 %	20 %	20 %	40 %	241205839
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65262	NC_012850	GGC	2	6	3141357	3141362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205840
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65268	NC_012850	ATACCT	2	12	3141553	3141564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205840
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65300	NC_012850	TGA	2	6	3143087	3143092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205841
65301	NC_012850	TCG	2	6	3143105	3143110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205841
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65324	NC_012850	CATC	2	8	3144011	3144018	25 %	25 %	0 %	50 %	241205842
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65330	NC_012850	TCG	2	6	3144144	3144149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205842
65331	NC_012850	TGC	2	6	3144150	3144155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205842
65332	NC_012850	CGC	2	6	3144232	3144237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205842
65333	NC_012850	CCG	2	6	3144252	3144257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205842
65334	NC_012850	CGA	2	6	3144277	3144282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205842
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65336	NC_012850	ACGA	2	8	3144479	3144486	50 %	0 %	25 %	25 %	241205842
65337	NC_012850	TC	3	6	3144493	3144498	0 %	50 %	0 %	50 %	241205842
65338	NC_012850	GCG	2	6	3144533	3144538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205842
65339	NC_012850	CAA	2	6	3144559	3144564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241205842
65340	NC_012850	GCG	2	6	3144605	3144610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205842
65341	NC_012850	GGA	2	6	3144646	3144651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205842
65342	NC_012850	TCG	2	6	3144681	3144686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205842
65343	NC_012850	CGTCT	2	10	3144724	3144733	0 %	40 %	20 %	40 %	241205842
65344	NC_012850	GATC	2	8	3144772	3144779	25 %	25 %	25 %	25 %	241205842
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65346	NC_012850	CGCC	2	8	3144889	3144896	0 %	0 %	25 %	75 %	241205842
65347	NC_012850	CAGC	2	8	3144952	3144959	25 %	0 %	25 %	50 %	241205842
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65350	NC_012850	TGC	2	6	3144988	3144993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205842
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65444	NC_012850	GGC	2	6	3149131	3149136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205847
65445	NC_012850	CGT	2	6	3149155	3149160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205847
65446	NC_012850	GCC	2	6	3149161	3149166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205847
65447	NC_012850	TGA	2	6	3149169	3149174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205847
65448	NC_012850	TCACC	2	10	3149202	3149211	20 %	20 %	0 %	60 %	241205847
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65450	NC_012850	CTCA	2	8	3149269	3149276	25 %	25 %	0 %	50 %	241205847
65451	NC_012850	ATCG	2	8	3149303	3149310	25 %	25 %	25 %	25 %	241205848
65452	NC_012850	AAG	2	6	3149315	3149320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241205848
65453	NC_012850	GATCGA	2	12	3149362	3149373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241205848
65454	NC_012850	CGC	2	6	3149540	3149545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205848
65455	NC_012850	CCG	2	6	3149556	3149561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205848
65456	NC_012850	TGC	2	6	3149582	3149587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205848
65457	NC_012850	CG	3	6	3149615	3149620	0 %	0 %	50 %	50 %	241205848
65458	NC_012850	GCA	2	6	3149643	3149648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205849
65459	NC_012850	TCA	2	6	3149652	3149657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205849
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65461	NC_012850	TTC	2	6	3149704	3149709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205849
65462	NC_012850	GAT	2	6	3149779	3149784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205849
65463	NC_012850	TTCC	2	8	3149881	3149888	0 %	50 %	0 %	50 %	241205849
65464	NC_012850	GCC	2	6	3149978	3149983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205849
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65468	NC_012850	CAT	2	6	3150124	3150129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205849
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65474	NC_012850	CAT	2	6	3150288	3150293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205850
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65490	NC_012850	CGC	2	6	3150932	3150937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205850
65491	NC_012850	CCT	2	6	3150938	3150943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205850
65492	NC_012850	TGA	2	6	3150950	3150955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205850
65493	NC_012850	GC	4	8	3151179	3151186	0 %	0 %	50 %	50 %	241205851
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65500	NC_012850	GCCAA	2	10	3151803	3151812	40 %	0 %	20 %	40 %	241205851

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