MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_012850	CGA	2	6	3037504	3037509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205741
63003	NC_012850	AGA	2	6	3037510	3037515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241205741
63004	NC_012850	GCAT	2	8	3037530	3037537	25 %	25 %	25 %	25 %	241205741
63005	NC_012850	GCA	2	6	3037543	3037548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205741
63006	NC_012850	TCACG	2	10	3037561	3037570	20 %	20 %	20 %	40 %	241205741
63007	NC_012850	CGA	2	6	3037601	3037606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205741
63008	NC_012850	CAC	2	6	3037652	3037657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241205741
63009	NC_012850	CGA	2	6	3037723	3037728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205741
63010	NC_012850	GC	3	6	3037760	3037765	0 %	0 %	50 %	50 %	241205741
63011	NC_012850	GATCTT	2	12	3037840	3037851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241205742
63012	NC_012850	GCG	2	6	3037893	3037898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205742
63013	NC_012850	CGGC	2	8	3037916	3037923	0 %	0 %	50 %	50 %	241205742
63014	NC_012850	AACC	2	8	3037955	3037962	50 %	0 %	0 %	50 %	241205742
63015	NC_012850	CCTTGC	2	12	3038037	3038048	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241205742
63016	NC_012850	GC	3	6	3038101	3038106	0 %	0 %	50 %	50 %	241205742
63017	NC_012850	GTG	2	6	3038342	3038347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205742
63018	NC_012850	GA	3	6	3038699	3038704	50 %	0 %	50 %	0 %	241205743
63019	NC_012850	T	6	6	3038710	3038715	0 %	100 %	0 %	0 %	241205743
63020	NC_012850	TCTT	2	8	3038790	3038797	0 %	75 %	0 %	25 %	241205743
63021	NC_012850	CTG	2	6	3038880	3038885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205743
63022	NC_012850	GGT	2	6	3038900	3038905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205743
63023	NC_012850	TGA	2	6	3038926	3038931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205743
63024	NC_012850	TCG	2	6	3038941	3038946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205743
63025	NC_012850	GAG	2	6	3038958	3038963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205743
63026	NC_012850	GCC	2	6	3038965	3038970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205743
63027	NC_012850	GCT	2	6	3039092	3039097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205743
63028	NC_012850	GCG	2	6	3039145	3039150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205743
63029	NC_012850	CGA	2	6	3039253	3039258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205743
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63031	NC_012850	TTA	2	6	3039311	3039316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241205743
63032	NC_012850	CGA	2	6	3039317	3039322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205743
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63034	NC_012850	CGAT	2	8	3039514	3039521	25 %	25 %	25 %	25 %	241205743
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63041	NC_012850	TCG	2	6	3039779	3039784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205744
63042	NC_012850	TCG	2	6	3039886	3039891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205744
63043	NC_012850	CGCTGC	2	12	3039940	3039951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241205744
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63045	NC_012850	CTG	2	6	3040008	3040013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205744
63046	NC_012850	GC	3	6	3040048	3040053	0 %	0 %	50 %	50 %	241205744
63047	NC_012850	GCC	2	6	3040057	3040062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205744
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63051	NC_012850	GAC	2	6	3040149	3040154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205744
63052	NC_012850	GA	3	6	3040170	3040175	50 %	0 %	50 %	0 %	241205744
63053	NC_012850	GCA	3	9	3040244	3040252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205744
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63055	NC_012850	CGA	2	6	3040289	3040294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205744
63056	NC_012850	CGA	2	6	3040337	3040342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205744
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63060	NC_012850	CGG	2	6	3040463	3040468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205744
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63089	NC_012850	TCG	2	6	3041755	3041760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205745
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63114	NC_012850	CGGC	2	8	3042611	3042618	0 %	0 %	50 %	50 %	241205746
63115	NC_012850	GCA	2	6	3042636	3042641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63116	NC_012850	TCA	2	6	3042648	3042653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205746
63117	NC_012850	CGT	2	6	3042655	3042660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63118	NC_012850	GACCA	2	10	3042682	3042691	40 %	0 %	20 %	40 %	241205746
63119	NC_012850	CTT	2	6	3042787	3042792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205746
63120	NC_012850	GGGT	2	8	3042801	3042808	0 %	25 %	75 %	0 %	241205746
63121	NC_012850	CGA	2	6	3042822	3042827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63122	NC_012850	TCA	2	6	3042843	3042848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205746
63123	NC_012850	CGATGG	3	18	3042945	3042962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241205746
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63126	NC_012850	CCT	2	6	3043128	3043133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205746
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63129	NC_012850	CGA	2	6	3043263	3043268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63130	NC_012850	ATC	2	6	3043304	3043309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205746
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63133	NC_012850	GAC	2	6	3043360	3043365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63134	NC_012850	TCA	2	6	3043389	3043394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205746
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63137	NC_012850	GCA	2	6	3043482	3043487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63138	NC_012850	ATC	2	6	3043514	3043519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205746
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63142	NC_012850	GCC	2	6	3043598	3043603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205746
63143	NC_012850	TC	4	8	3043625	3043632	0 %	50 %	0 %	50 %	241205746
63144	NC_012850	CGA	2	6	3043668	3043673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205746
63145	NC_012850	CGG	2	6	3043798	3043803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205746
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63149	NC_012850	CCG	2	6	3044352	3044357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205747
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63152	NC_012850	GCC	3	9	3044472	3044480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205747
63153	NC_012850	CCTCG	2	10	3044485	3044494	0 %	20 %	20 %	60 %	241205747
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63216	NC_012850	GAAGA	2	10	3047052	3047061	60 %	0 %	40 %	0 %	241205750
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63222	NC_012850	GTC	2	6	3047418	3047423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205750
63223	NC_012850	ACC	2	6	3047424	3047429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241205750
63224	NC_012850	CGG	3	9	3047441	3047449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205750
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63226	NC_012850	AGG	2	6	3047488	3047493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205750
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63229	NC_012850	CGA	2	6	3047582	3047587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205750
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63231	NC_012850	CGG	2	6	3047627	3047632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205750
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63334	NC_012850	ATCAC	2	10	3051713	3051722	40 %	20 %	0 %	40 %	241205756
63335	NC_012850	CTG	2	6	3051835	3051840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205756
63336	NC_012850	CGC	2	6	3051867	3051872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205756
63337	NC_012850	GAC	2	6	3051894	3051899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205756
63338	NC_012850	CCGC	2	8	3052025	3052032	0 %	0 %	25 %	75 %	241205756
63339	NC_012850	CGAC	2	8	3052052	3052059	25 %	0 %	25 %	50 %	241205756
63340	NC_012850	ATG	2	6	3052102	3052107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205756
63341	NC_012850	GC	5	10	3052112	3052121	0 %	0 %	50 %	50 %	241205756
63342	NC_012850	CG	3	6	3052123	3052128	0 %	0 %	50 %	50 %	241205756
63343	NC_012850	CGC	2	6	3052215	3052220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205756
63344	NC_012850	GTC	2	6	3052249	3052254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205756
63345	NC_012850	GCC	2	6	3052367	3052372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205757
63346	NC_012850	TGG	2	6	3052389	3052394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205757
63347	NC_012850	CGC	2	6	3052439	3052444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205757
63348	NC_012850	CCGC	2	8	3052527	3052534	0 %	0 %	25 %	75 %	241205757
63349	NC_012850	GAC	2	6	3052535	3052540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205757
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63352	NC_012850	GAT	2	6	3052612	3052617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241205757
63353	NC_012850	TCA	2	6	3052665	3052670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205757
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63356	NC_012850	CGC	2	6	3052753	3052758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205757
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63443	NC_012850	CAT	2	6	3055947	3055952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205758
63444	NC_012850	GACC	2	8	3055980	3055987	25 %	0 %	25 %	50 %	241205758
63445	NC_012850	CCT	2	6	3056004	3056009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205758
63446	NC_012850	GTC	2	6	3056084	3056089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205759
63447	NC_012850	CGC	2	6	3056101	3056106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205759
63448	NC_012850	GCA	2	6	3056153	3056158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205759
63449	NC_012850	TCCTG	2	10	3056185	3056194	0 %	40 %	20 %	40 %	241205759
63450	NC_012850	AGG	2	6	3056199	3056204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205759
63451	NC_012850	CGA	2	6	3056220	3056225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205759
63452	NC_012850	TCGA	2	8	3056241	3056248	25 %	25 %	25 %	25 %	241205759
63453	NC_012850	AGCCAG	2	12	3056249	3056260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205759
63454	NC_012850	CGA	2	6	3056287	3056292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205759
63455	NC_012850	TCG	2	6	3056349	3056354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205759
63456	NC_012850	CCCG	3	12	3056431	3056442	0 %	0 %	25 %	75 %	241205759
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63458	NC_012850	CAT	2	6	3056455	3056460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205759
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63460	NC_012850	GCC	2	6	3056492	3056497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205759
63461	NC_012850	TCA	2	6	3056535	3056540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205759
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63494	NC_012850	TGC	2	6	3057846	3057851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205759
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