MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61002	NC_012850	CTC	2	6	2942463	2942468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205655
61003	NC_012850	GCA	2	6	2942485	2942490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205655
61004	NC_012850	TGC	2	6	2942524	2942529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205655
61005	NC_012850	GTT	2	6	2942536	2942541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241205655
61006	NC_012850	GGTTT	2	10	2942545	2942554	0 %	60 %	40 %	0 %	241205655
61007	NC_012850	GAG	2	6	2942561	2942566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241205655
61008	NC_012850	CGG	2	6	2942676	2942681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205655
61009	NC_012850	AGGCGG	2	12	2942682	2942693	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241205655
61010	NC_012850	GGT	2	6	2942698	2942703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205655
61011	NC_012850	GGC	2	6	2942704	2942709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205655
61012	NC_012850	CTT	2	6	2942733	2942738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205655
61013	NC_012850	CGG	2	6	2942748	2942753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205655
61014	NC_012850	CTT	2	6	2942787	2942792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205655
61015	NC_012850	CTC	2	6	2942793	2942798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205655
61016	NC_012850	CGG	3	9	2942799	2942807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205655
61017	NC_012850	CAA	2	6	2942900	2942905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241205655
61018	NC_012850	CGA	2	6	2942912	2942917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205655
61019	NC_012850	GCT	2	6	2942939	2942944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205655
61020	NC_012850	TGC	2	6	2942956	2942961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205655
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61022	NC_012850	TCT	3	9	2942980	2942988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205655
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61024	NC_012850	TCG	2	6	2943090	2943095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205656
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61026	NC_012850	CGA	2	6	2943142	2943147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205656
61027	NC_012850	TGT	2	6	2943205	2943210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241205656
61028	NC_012850	TGC	2	6	2943223	2943228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205656
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61032	NC_012850	CGA	2	6	2943463	2943468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205656
61033	NC_012850	GCA	2	6	2943522	2943527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205656
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61038	NC_012850	CGGCAA	2	12	2943677	2943688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205656
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61050	NC_012850	CTG	2	6	2944705	2944710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205658
61051	NC_012850	CTT	2	6	2944716	2944721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205658
61052	NC_012850	GT	3	6	2944725	2944730	0 %	50 %	50 %	0 %	241205658
61053	NC_012850	ATGCCG	2	12	2944742	2944753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241205658
61054	NC_012850	GCA	2	6	2944764	2944769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205658
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61056	NC_012850	GCGAG	2	10	2944791	2944800	20 %	0 %	60 %	20 %	241205658
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61101	NC_012850	TCTT	2	8	2946290	2946297	0 %	75 %	0 %	25 %	241205658
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61230	NC_012850	GC	3	6	2952288	2952293	0 %	0 %	50 %	50 %	241205663
61231	NC_012850	CGA	2	6	2952303	2952308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205663
61232	NC_012850	CTC	2	6	2952310	2952315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205663
61233	NC_012850	TGC	2	6	2952337	2952342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205663
61234	NC_012850	GCT	2	6	2952357	2952362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205663
61235	NC_012850	GCG	2	6	2952399	2952404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205663
61236	NC_012850	ACG	2	6	2952407	2952412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241205663
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61241	NC_012850	CTTG	2	8	2952561	2952568	0 %	50 %	25 %	25 %	241205663
61242	NC_012850	GCG	2	6	2952579	2952584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205663
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61245	NC_012850	TTCGT	2	10	2952628	2952637	0 %	60 %	20 %	20 %	241205663
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61250	NC_012850	CG	3	6	2952756	2952761	0 %	0 %	50 %	50 %	241205664
61251	NC_012850	TCGCC	2	10	2952776	2952785	0 %	20 %	20 %	60 %	241205664
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61253	NC_012850	TCT	2	6	2952830	2952835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205664
61254	NC_012850	TCGC	2	8	2952851	2952858	0 %	25 %	25 %	50 %	241205664
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61256	NC_012850	CTC	2	6	2952912	2952917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241205664
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61259	NC_012850	GCT	2	6	2953045	2953050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205664
61260	NC_012850	TCG	2	6	2953120	2953125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205664
61261	NC_012850	ATC	2	6	2953126	2953131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205664
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61264	NC_012850	ATTGCC	2	12	2953290	2953301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241205664
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61330	NC_012850	CG	4	8	2957332	2957339	0 %	0 %	50 %	50 %	241205667
61331	NC_012850	TCG	2	6	2957481	2957486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205667
61332	NC_012850	CGT	2	6	2957570	2957575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205667
61333	NC_012850	GCCG	2	8	2957648	2957655	0 %	0 %	50 %	50 %	241205667
61334	NC_012850	CGG	2	6	2957725	2957730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205667
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61336	NC_012850	ACC	2	6	2957875	2957880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241205667
61337	NC_012850	TCT	2	6	2958034	2958039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241205667
61338	NC_012850	CCG	2	6	2958095	2958100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205667
61339	NC_012850	TCA	2	6	2958103	2958108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241205667
61340	NC_012850	GAA	2	6	2958122	2958127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241205667
61341	NC_012850	CTTT	2	8	2958439	2958446	0 %	75 %	0 %	25 %	241205668
61342	NC_012850	CGG	3	9	2958469	2958477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205668
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61344	NC_012850	GTC	2	6	2958624	2958629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241205668
61345	NC_012850	GC	4	8	2958632	2958639	0 %	0 %	50 %	50 %	241205668
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61349	NC_012850	CGG	3	9	2958829	2958837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205669
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61459	NC_012850	GCC	2	6	2963799	2963804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205672
61460	NC_012850	CGGCG	2	10	2963807	2963816	0 %	0 %	60 %	40 %	241205672
61461	NC_012850	CCG	3	9	2963821	2963829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205672
61462	NC_012850	GCC	3	9	2963844	2963852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205672
61463	NC_012850	CCG	3	9	2963863	2963871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241205672
61464	NC_012850	GCG	2	6	2963883	2963888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241205672
61465	NC_012850	TCCAT	2	10	2963921	2963930	20 %	40 %	0 %	40 %	241205672
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61490	NC_012850	GGT	2	6	2965133	2965138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241205674
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