MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012848	CAGC	2	8	764991	764998	25 %	0 %	25 %	50 %	241113682
15002	NC_012848	T	6	6	765018	765023	0 %	100 %	0 %	0 %	241113682
15003	NC_012848	TG	3	6	765037	765042	0 %	50 %	50 %	0 %	241113682
15004	NC_012848	AGC	2	6	765082	765087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113683
15005	NC_012848	ATG	2	6	765115	765120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113683
15006	NC_012848	ATG	2	6	765142	765147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113683
15007	NC_012848	ACG	2	6	765157	765162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113683
15008	NC_012848	CGA	3	9	765230	765238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113683
15009	NC_012848	GGC	2	6	765255	765260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113683
15010	NC_012848	GCA	2	6	765290	765295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113683
15011	NC_012848	TGAA	2	8	765313	765320	50 %	25 %	25 %	0 %	241113683
15012	NC_012848	GAT	2	6	765321	765326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113683
15013	NC_012848	ATC	2	6	765388	765393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113683
15014	NC_012848	ACC	2	6	765403	765408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113683
15015	NC_012848	GTTCCC	2	12	765472	765483	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113683
15016	NC_012848	GCCA	2	8	765535	765542	25 %	0 %	25 %	50 %	241113683
15017	NC_012848	GAA	2	6	765573	765578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113683
15018	NC_012848	CGC	2	6	765599	765604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113683
15019	NC_012848	CGC	2	6	765615	765620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113683
15020	NC_012848	CAGC	2	8	765671	765678	25 %	0 %	25 %	50 %	241113683
15021	NC_012848	TGAC	2	8	765738	765745	25 %	25 %	25 %	25 %	241113683
15022	NC_012848	GAT	2	6	765789	765794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113683
15023	NC_012848	GGT	2	6	765843	765848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113683
15024	NC_012848	ATCG	2	8	765852	765859	25 %	25 %	25 %	25 %	241113683
15025	NC_012848	GGTC	2	8	765869	765876	0 %	25 %	50 %	25 %	241113683
15026	NC_012848	GAA	2	6	765900	765905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113683
15027	NC_012848	CAC	2	6	765921	765926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113683
15028	NC_012848	CG	3	6	765948	765953	0 %	0 %	50 %	50 %	241113683
15029	NC_012848	CGG	2	6	766148	766153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113684
15030	NC_012848	AAT	2	6	766184	766189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113684
15031	NC_012848	ACG	2	6	766272	766277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113684
15032	NC_012848	GC	3	6	766332	766337	0 %	0 %	50 %	50 %	241113684
15033	NC_012848	GCA	2	6	766423	766428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113684
15034	NC_012848	CCG	2	6	766505	766510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113684
15035	NC_012848	TGGC	2	8	766521	766528	0 %	25 %	50 %	25 %	241113684
15036	NC_012848	AGC	2	6	766560	766565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113684
15037	NC_012848	ATG	2	6	766596	766601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113684
15038	NC_012848	CGAGAA	2	12	766681	766692	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113684
15039	NC_012848	CGA	2	6	766750	766755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113684
15040	NC_012848	CGCA	2	8	766787	766794	25 %	0 %	25 %	50 %	241113684
15041	NC_012848	GAC	2	6	766856	766861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113684
15042	NC_012848	AAG	2	6	766862	766867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113684
15043	NC_012848	ATC	2	6	766893	766898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113684
15044	NC_012848	GCA	2	6	766918	766923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113684
15045	NC_012848	CCA	2	6	766966	766971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113684
15046	NC_012848	CGTT	2	8	767296	767303	0 %	50 %	25 %	25 %	241113685
15047	NC_012848	TGG	2	6	767322	767327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113685
15048	NC_012848	ATG	2	6	767334	767339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113685
15049	NC_012848	CTGC	2	8	767362	767369	0 %	25 %	25 %	50 %	241113685
15050	NC_012848	CG	3	6	767374	767379	0 %	0 %	50 %	50 %	241113685
15051	NC_012848	CGA	2	6	767434	767439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113685
15052	NC_012848	CCT	2	6	767464	767469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113685
15053	NC_012848	CGA	2	6	767521	767526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113685
15054	NC_012848	GTT	2	6	767649	767654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113685
15055	NC_012848	TCAA	2	8	767715	767722	50 %	25 %	0 %	25 %	241113685
15056	NC_012848	CG	3	6	767805	767810	0 %	0 %	50 %	50 %	241113686
15057	NC_012848	ACC	2	6	767817	767822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113686
15058	NC_012848	GTG	2	6	767865	767870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113686
15059	NC_012848	CCATT	2	10	767872	767881	20 %	40 %	0 %	40 %	241113686
15060	NC_012848	TCGA	2	8	767930	767937	25 %	25 %	25 %	25 %	241113686
15061	NC_012848	GCC	2	6	768038	768043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113686
15062	NC_012848	TCT	2	6	768053	768058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113686
15063	NC_012848	TCCA	2	8	768269	768276	25 %	25 %	0 %	50 %	241113687
15064	NC_012848	GCA	2	6	768292	768297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113687
15065	NC_012848	AGC	2	6	768304	768309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113687
15066	NC_012848	GTT	2	6	768318	768323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113687
15067	NC_012848	GGA	2	6	768338	768343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113687
15068	NC_012848	TCG	2	6	768354	768359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113687
15069	NC_012848	GC	3	6	768823	768828	0 %	0 %	50 %	50 %	241113688
15070	NC_012848	TG	3	6	768918	768923	0 %	50 %	50 %	0 %	241113688
15071	NC_012848	CGCA	2	8	768935	768942	25 %	0 %	25 %	50 %	241113688
15072	NC_012848	AGC	2	6	768993	768998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113688
15073	NC_012848	GGC	2	6	769036	769041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113688
15074	NC_012848	CGA	2	6	769129	769134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113688
15075	NC_012848	TCG	2	6	769173	769178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113688
15076	NC_012848	TC	3	6	769249	769254	0 %	50 %	0 %	50 %	241113688
15077	NC_012848	CGG	2	6	769269	769274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113688
15078	NC_012848	ATC	2	6	769277	769282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113688
15079	NC_012848	GCC	2	6	769283	769288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113688
15080	NC_012848	GC	3	6	769449	769454	0 %	0 %	50 %	50 %	241113689
15081	NC_012848	GAC	2	6	769544	769549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113689
15082	NC_012848	GC	3	6	769612	769617	0 %	0 %	50 %	50 %	241113689
15083	NC_012848	CGC	2	6	769631	769636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113689
15084	NC_012848	CGGCAG	2	12	769640	769651	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113689
15085	NC_012848	CCTC	2	8	769652	769659	0 %	25 %	0 %	75 %	241113689
15086	NC_012848	CGA	2	6	769732	769737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113689
15087	NC_012848	GCG	2	6	769780	769785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113689
15088	NC_012848	CGA	2	6	769798	769803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113689
15089	NC_012848	CAA	2	6	769819	769824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113689
15090	NC_012848	CGTTGG	2	12	770013	770024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113689
15091	NC_012848	GCT	2	6	770085	770090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113689
15092	NC_012848	TGC	2	6	770242	770247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113689
15093	NC_012848	ATC	2	6	770289	770294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113689
15094	NC_012848	CAA	2	6	770297	770302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113689
15095	NC_012848	CGGA	2	8	770320	770327	25 %	0 %	50 %	25 %	241113689
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15098	NC_012848	TCA	2	6	770650	770655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113690
15099	NC_012848	GCG	2	6	770683	770688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113690
15100	NC_012848	GCT	2	6	770753	770758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113690
15101	NC_012848	GCC	2	6	770769	770774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113690
15102	NC_012848	GCCC	2	8	770781	770788	0 %	0 %	25 %	75 %	241113690
15103	NC_012848	T	6	6	770813	770818	0 %	100 %	0 %	0 %	241113690
15104	NC_012848	GTC	2	6	770824	770829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113690
15105	NC_012848	GTC	2	6	771021	771026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113690
15106	NC_012848	ACG	2	6	771158	771163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113690
15107	NC_012848	CGC	2	6	771189	771194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113690
15108	NC_012848	GTGC	2	8	771224	771231	0 %	25 %	50 %	25 %	241113690
15109	NC_012848	GGC	2	6	771247	771252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113690
15110	NC_012848	GAT	2	6	771264	771269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113690
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15115	NC_012848	GCG	2	6	771448	771453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113690
15116	NC_012848	GCA	2	6	771455	771460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113690
15117	NC_012848	CCT	2	6	771464	771469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113690
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15119	NC_012848	GAT	2	6	771519	771524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113690
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15358	NC_012848	CGA	2	6	783112	783117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113701
15359	NC_012848	GACC	2	8	783126	783133	25 %	0 %	25 %	50 %	241113702
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15474	NC_012848	CGA	2	6	788808	788813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113707
15475	NC_012848	GCC	2	6	788887	788892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113707
15476	NC_012848	GGC	3	9	788893	788901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113707
15477	NC_012848	CGGC	2	8	789000	789007	0 %	0 %	50 %	50 %	241113707
15478	NC_012848	TCC	2	6	789071	789076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113707
15479	NC_012848	GC	3	6	789107	789112	0 %	0 %	50 %	50 %	241113707
15480	NC_012848	GCGTCG	2	12	789188	789199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113707
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15482	NC_012848	CTC	2	6	789263	789268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113707
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15500	NC_012848	GC	3	6	790144	790149	0 %	0 %	50 %	50 %	241113708

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