MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012848	CGG	2	6	687509	687514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113611
13502	NC_012848	CTG	2	6	687547	687552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13503	NC_012848	CGA	2	6	687624	687629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13504	NC_012848	TGG	2	6	687672	687677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113611
13505	NC_012848	TCG	2	6	687701	687706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13506	NC_012848	TCGC	2	8	687741	687748	0 %	25 %	25 %	50 %	241113611
13507	NC_012848	TCG	2	6	687788	687793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13508	NC_012848	CTGT	2	8	688144	688151	0 %	50 %	25 %	25 %	241113612
13509	NC_012848	CGC	2	6	688216	688221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113612
13510	NC_012848	CAC	2	6	688227	688232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113612
13511	NC_012848	TTC	2	6	688233	688238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113612
13512	NC_012848	CTT	2	6	688247	688252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113612
13513	NC_012848	GCC	2	6	688411	688416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113612
13514	NC_012848	CTT	2	6	688454	688459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113612
13515	NC_012848	TGC	3	9	688476	688484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113612
13516	NC_012848	CTT	2	6	688525	688530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113612
13517	NC_012848	AGG	2	6	688587	688592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113612
13518	NC_012848	TGG	2	6	688610	688615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113612
13519	NC_012848	TCT	2	6	688630	688635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113612
13520	NC_012848	GCCT	2	8	688865	688872	0 %	25 %	25 %	50 %	241113612
13521	NC_012848	GCTG	2	8	688929	688936	0 %	25 %	50 %	25 %	241113613
13522	NC_012848	TCA	2	6	688939	688944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113613
13523	NC_012848	TCAT	2	8	688977	688984	25 %	50 %	0 %	25 %	241113613
13524	NC_012848	GTCC	2	8	688988	688995	0 %	25 %	25 %	50 %	241113613
13525	NC_012848	CGG	2	6	689077	689082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113613
13526	NC_012848	TGC	2	6	689096	689101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113613
13527	NC_012848	GCT	2	6	689102	689107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113613
13528	NC_012848	CGA	2	6	689132	689137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113613
13529	NC_012848	GTC	2	6	689166	689171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113613
13530	NC_012848	CCG	2	6	689487	689492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13531	NC_012848	AG	3	6	689503	689508	50 %	0 %	50 %	0 %	241113614
13532	NC_012848	CGG	2	6	689532	689537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113614
13533	NC_012848	TTC	2	6	689594	689599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113614
13534	NC_012848	CGC	2	6	689692	689697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13535	NC_012848	GGCATA	2	12	689776	689787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113614
13536	NC_012848	CT	3	6	689828	689833	0 %	50 %	0 %	50 %	241113614
13537	NC_012848	GCT	2	6	689889	689894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113614
13538	NC_012848	GCGT	2	8	689983	689990	0 %	25 %	50 %	25 %	241113614
13539	NC_012848	TGCC	2	8	690024	690031	0 %	25 %	25 %	50 %	241113614
13540	NC_012848	GCCC	2	8	690164	690171	0 %	0 %	25 %	75 %	241113614
13541	NC_012848	CCT	2	6	690201	690206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113614
13542	NC_012848	GC	3	6	690255	690260	0 %	0 %	50 %	50 %	241113614
13543	NC_012848	AGCGCC	2	12	690278	690289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113614
13544	NC_012848	TCG	2	6	690353	690358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113614
13545	NC_012848	CAG	2	6	690367	690372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113614
13546	NC_012848	CGC	2	6	690449	690454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13547	NC_012848	TGA	2	6	690464	690469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113614
13548	NC_012848	CCG	2	6	690475	690480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13549	NC_012848	CCA	2	6	690510	690515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113614
13550	NC_012848	GCC	2	6	690575	690580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13551	NC_012848	GTT	2	6	690655	690660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113614
13552	NC_012848	CGC	2	6	690694	690699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13553	NC_012848	ACC	2	6	690700	690705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113614
13554	NC_012848	CAG	2	6	690721	690726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113614
13555	NC_012848	ACG	2	6	690727	690732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113614
13556	NC_012848	GCC	2	6	690764	690769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113614
13557	NC_012848	CCGG	2	8	690784	690791	0 %	0 %	50 %	50 %	241113614
13558	NC_012848	CGCT	2	8	690830	690837	0 %	25 %	25 %	50 %	241113614
13559	NC_012848	CGC	2	6	691204	691209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113615
13560	NC_012848	CAC	2	6	691215	691220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113615
13561	NC_012848	TTC	2	6	691221	691226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113615
13562	NC_012848	CTT	2	6	691235	691240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113615
13563	NC_012848	GCC	2	6	691399	691404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113615
13564	NC_012848	CTT	2	6	691442	691447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113615
13565	NC_012848	A	6	6	691453	691458	100 %	0 %	0 %	0 %	241113615
13566	NC_012848	TGC	3	9	691464	691472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113615
13567	NC_012848	CTT	2	6	691513	691518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113615
13568	NC_012848	AGG	2	6	691575	691580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113615
13569	NC_012848	TGG	2	6	691598	691603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113615
13570	NC_012848	TCT	2	6	691618	691623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113615
13571	NC_012848	GCCT	2	8	691853	691860	0 %	25 %	25 %	50 %	241113615
13572	NC_012848	GCTG	2	8	691917	691924	0 %	25 %	50 %	25 %	241113616
13573	NC_012848	TCA	2	6	691927	691932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113616
13574	NC_012848	TCAT	2	8	691965	691972	25 %	50 %	0 %	25 %	241113616
13575	NC_012848	GTCC	2	8	691976	691983	0 %	25 %	25 %	50 %	241113616
13576	NC_012848	GCG	2	6	692069	692074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113616
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13578	NC_012848	GCT	2	6	692092	692097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113616
13579	NC_012848	CGA	2	6	692122	692127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113616
13580	NC_012848	GTC	2	6	692138	692143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113616
13581	NC_012848	GACC	2	8	692177	692184	25 %	0 %	25 %	50 %	241113616
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13584	NC_012848	TCGG	2	8	692298	692305	0 %	25 %	50 %	25 %	241113616
13585	NC_012848	CTTC	2	8	692365	692372	0 %	50 %	0 %	50 %	241113616
13586	NC_012848	CGGT	2	8	692411	692418	0 %	25 %	50 %	25 %	241113616
13587	NC_012848	TTGC	2	8	692441	692448	0 %	50 %	25 %	25 %	241113616
13588	NC_012848	TGC	2	6	692739	692744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113616
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13590	NC_012848	TCG	2	6	692826	692831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113616
13591	NC_012848	ACC	2	6	692872	692877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113616
13592	NC_012848	GCCG	2	8	692923	692930	0 %	0 %	50 %	50 %	241113616
13593	NC_012848	CTC	2	6	693116	693121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113616
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13598	NC_012848	GC	3	6	693928	693933	0 %	0 %	50 %	50 %	241113617
13599	NC_012848	GCC	2	6	693936	693941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113617
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13601	NC_012848	CGT	2	6	694004	694009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113617
13602	NC_012848	GCC	2	6	694024	694029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113617
13603	NC_012848	GCA	2	6	694088	694093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113617
13604	NC_012848	TCG	2	6	694204	694209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113617
13605	NC_012848	ATCTTC	2	12	694225	694236	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241113617
13606	NC_012848	TGT	2	6	694289	694294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113617
13607	NC_012848	TAG	3	9	694306	694314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113617
13608	NC_012848	CCG	2	6	694315	694320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113617
13609	NC_012848	GCG	2	6	694321	694326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113617
13610	NC_012848	AG	3	6	694382	694387	50 %	0 %	50 %	0 %	241113617
13611	NC_012848	CCG	2	6	694465	694470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113617
13612	NC_012848	TCAT	2	8	694477	694484	25 %	50 %	0 %	25 %	241113617
13613	NC_012848	CAT	3	9	694482	694490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113617
13614	NC_012848	CGT	2	6	694529	694534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113617
13615	NC_012848	CTGC	2	8	694553	694560	0 %	25 %	25 %	50 %	241113617
13616	NC_012848	GCC	2	6	694593	694598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113617
13617	NC_012848	ACG	2	6	694636	694641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113617
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13619	NC_012848	GAC	2	6	694656	694661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113617
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13739	NC_012848	CGT	2	6	702240	702245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113625
13740	NC_012848	GTC	2	6	702256	702261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113625
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13977	NC_012848	TGA	2	6	715096	715101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113641
13978	NC_012848	CAT	2	6	715141	715146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113641
13979	NC_012848	GCT	2	6	715156	715161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113641
13980	NC_012848	CAA	2	6	715168	715173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113641
13981	NC_012848	CGA	2	6	715183	715188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113641
13982	NC_012848	GAT	2	6	715353	715358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113642
13983	NC_012848	CTT	2	6	715377	715382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113642
13984	NC_012848	CGG	2	6	715409	715414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113642
13985	NC_012848	CTG	2	6	715534	715539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113642
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13989	NC_012848	ATC	2	6	715903	715908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113642
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13997	NC_012848	CG	3	6	716495	716500	0 %	0 %	50 %	50 %	241113642
13998	NC_012848	GGC	2	6	716562	716567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113642
13999	NC_012848	CAG	2	6	716571	716576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113642
14000	NC_012848	GC	5	10	716656	716665	0 %	0 %	50 %	50 %	241113642

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