MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012848	TCG	2	6	662276	662281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13002	NC_012848	GCA	2	6	662289	662294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13003	NC_012848	TCG	3	9	662319	662327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13004	NC_012848	CGA	2	6	662505	662510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13005	NC_012848	GAG	2	6	662513	662518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113583
13006	NC_012848	CAG	2	6	662527	662532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13007	NC_012848	TCG	2	6	662543	662548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13008	NC_012848	TTG	2	6	662597	662602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113583
13009	NC_012848	GCC	2	6	662603	662608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113583
13010	NC_012848	CAG	2	6	662620	662625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13011	NC_012848	TG	3	6	662645	662650	0 %	50 %	50 %	0 %	241113583
13012	NC_012848	GCG	2	6	662729	662734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113583
13013	NC_012848	GCG	2	6	662750	662755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113583
13014	NC_012848	TGC	2	6	662760	662765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13015	NC_012848	CTG	2	6	662794	662799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13016	NC_012848	GCC	2	6	662842	662847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113583
13017	NC_012848	CTG	2	6	662887	662892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13018	NC_012848	AGC	2	6	662930	662935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13019	NC_012848	GAC	2	6	662962	662967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13020	NC_012848	CGT	2	6	662986	662991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13021	NC_012848	TCG	2	6	663042	663047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13022	NC_012848	GCT	2	6	663055	663060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113583
13023	NC_012848	TTG	2	6	663074	663079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113583
13024	NC_012848	CCCT	2	8	663128	663135	0 %	25 %	0 %	75 %	241113584
13025	NC_012848	ATC	2	6	663222	663227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113584
13026	NC_012848	TGGA	2	8	663279	663286	25 %	25 %	50 %	0 %	241113584
13027	NC_012848	AGC	2	6	663363	663368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13028	NC_012848	AG	3	6	663412	663417	50 %	0 %	50 %	0 %	241113584
13029	NC_012848	CCGT	2	8	663456	663463	0 %	25 %	25 %	50 %	241113584
13030	NC_012848	CTG	2	6	663505	663510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13031	NC_012848	GGA	2	6	663530	663535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113584
13032	NC_012848	AAT	2	6	663553	663558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113584
13033	NC_012848	CGA	2	6	663589	663594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13034	NC_012848	TGTCGG	2	12	663595	663606	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113584
13035	NC_012848	CGT	2	6	663683	663688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13036	NC_012848	TGC	2	6	663736	663741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13037	NC_012848	CGC	2	6	663751	663756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113584
13038	NC_012848	CGTC	2	8	663760	663767	0 %	25 %	25 %	50 %	241113584
13039	NC_012848	GCC	2	6	663809	663814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113584
13040	NC_012848	TCT	2	6	663841	663846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113584
13041	NC_012848	GTC	2	6	663851	663856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13042	NC_012848	CGT	3	9	663887	663895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13043	NC_012848	GAC	2	6	663902	663907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13044	NC_012848	GCT	2	6	663944	663949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13045	NC_012848	GAC	2	6	664013	664018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113584
13046	NC_012848	CCG	2	6	664021	664026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113584
13047	NC_012848	GAA	2	6	664154	664159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113584
13048	NC_012848	CGC	2	6	664249	664254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113584
13049	NC_012848	GGT	2	6	664325	664330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113584
13050	NC_012848	CGG	2	6	664396	664401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113584
13051	NC_012848	CGT	2	6	664837	664842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
13052	NC_012848	TCCG	2	8	664886	664893	0 %	25 %	25 %	50 %	241113585
13053	NC_012848	GTCATC	2	12	664925	664936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113585
13054	NC_012848	CGG	3	9	664946	664954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113585
13055	NC_012848	CTC	2	6	665063	665068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113585
13056	NC_012848	CCGTCG	2	12	665118	665129	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113585
13057	NC_012848	ATCGTC	2	12	665159	665170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113585
13058	NC_012848	GGC	2	6	665187	665192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113585
13059	NC_012848	CTG	2	6	665210	665215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
13060	NC_012848	CGAC	2	8	665242	665249	25 %	0 %	25 %	50 %	241113585
13061	NC_012848	TCC	2	6	665301	665306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113585
13062	NC_012848	GCC	2	6	665396	665401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113585
13063	NC_012848	CTG	2	6	665405	665410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
13064	NC_012848	CGCTG	2	10	665500	665509	0 %	20 %	40 %	40 %	241113585
13065	NC_012848	T	7	7	665525	665531	0 %	100 %	0 %	0 %	241113585
13066	NC_012848	AGGAT	2	10	665548	665557	40 %	20 %	40 %	0 %	241113585
13067	NC_012848	TAGGAA	2	12	665589	665600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113585
13068	NC_012848	GTC	2	6	665625	665630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
13069	NC_012848	CGA	2	6	665807	665812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13070	NC_012848	GGCC	2	8	665838	665845	0 %	0 %	50 %	50 %	241113586
13071	NC_012848	CGA	2	6	665858	665863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13072	NC_012848	TCG	2	6	665881	665886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13073	NC_012848	CGC	2	6	665895	665900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113586
13074	NC_012848	GTC	2	6	665940	665945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13075	NC_012848	GC	3	6	666025	666030	0 %	0 %	50 %	50 %	241113586
13076	NC_012848	CTG	2	6	666061	666066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13077	NC_012848	TCG	2	6	666190	666195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13078	NC_012848	TGA	2	6	666284	666289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113586
13079	NC_012848	CGG	2	6	666329	666334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113586
13080	NC_012848	CCG	2	6	666342	666347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113586
13081	NC_012848	GC	3	6	666353	666358	0 %	0 %	50 %	50 %	241113586
13082	NC_012848	GGCCT	2	10	666362	666371	0 %	20 %	40 %	40 %	241113586
13083	NC_012848	TGC	2	6	666382	666387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
13084	NC_012848	TTGCA	2	10	666404	666413	20 %	40 %	20 %	20 %	241113586
13085	NC_012848	CGG	2	6	666421	666426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113586
13086	NC_012848	TC	3	6	666706	666711	0 %	50 %	0 %	50 %	241113587
13087	NC_012848	CGA	2	6	666787	666792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13088	NC_012848	GACAT	2	10	666848	666857	40 %	20 %	20 %	20 %	241113587
13089	NC_012848	GCC	3	9	666953	666961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113587
13090	NC_012848	GAG	2	6	667031	667036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113587
13091	NC_012848	GAC	2	6	667055	667060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13092	NC_012848	TCG	2	6	667097	667102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13093	NC_012848	CGA	2	6	667114	667119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13094	NC_012848	GAA	2	6	667141	667146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113587
13095	NC_012848	CGA	2	6	667255	667260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13096	NC_012848	CTTCAA	2	12	667288	667299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113587
13097	NC_012848	CGAC	2	8	667311	667318	25 %	0 %	25 %	50 %	241113587
13098	NC_012848	AGATC	2	10	667336	667345	40 %	20 %	20 %	20 %	241113587
13099	NC_012848	CGA	2	6	667380	667385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13100	NC_012848	TGA	2	6	667464	667469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113587
13101	NC_012848	CGA	2	6	667471	667476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13102	NC_012848	ACG	2	6	667596	667601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13103	NC_012848	CAGAC	2	10	667656	667665	40 %	0 %	20 %	40 %	241113587
13104	NC_012848	CGA	2	6	667687	667692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13105	NC_012848	TCGA	2	8	667772	667779	25 %	25 %	25 %	25 %	241113587
13106	NC_012848	ACGATG	2	12	667797	667808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113587
13107	NC_012848	GAC	3	9	667811	667819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13108	NC_012848	ACG	2	6	667821	667826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13109	NC_012848	GC	3	6	667855	667860	0 %	0 %	50 %	50 %	241113587
13110	NC_012848	CGA	3	9	667954	667962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13111	NC_012848	CGA	2	6	667996	668001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13112	NC_012848	CGT	2	6	668044	668049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13113	NC_012848	CGA	2	6	668050	668055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13114	NC_012848	GCC	2	6	668060	668065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113587
13115	NC_012848	CGA	2	6	668166	668171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13116	NC_012848	ACG	2	6	668174	668179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13117	NC_012848	CGA	2	6	668197	668202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
13118	NC_012848	TGA	2	6	668245	668250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113587
13119	NC_012848	TTC	2	6	668281	668286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113587
13120	NC_012848	CGA	3	9	668293	668301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
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13122	NC_012848	GAC	2	6	668324	668329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
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13125	NC_012848	GCA	2	6	668407	668412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
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13129	NC_012848	ACG	2	6	668582	668587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
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13131	NC_012848	CGA	2	6	668692	668697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113587
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13135	NC_012848	GCT	2	6	668803	668808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113587
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13146	NC_012848	GC	3	6	669791	669796	0 %	0 %	50 %	50 %	241113588
13147	NC_012848	AAC	2	6	669810	669815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113588
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13149	NC_012848	CGA	2	6	670006	670011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113588
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13153	NC_012848	ACG	3	9	670079	670087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113588
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13172	NC_012848	CCG	2	6	671041	671046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113589
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13181	NC_012848	CGC	2	6	671494	671499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113589
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13227	NC_012848	CCG	2	6	674083	674088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113592
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13235	NC_012848	GGC	2	6	674399	674404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113593
13236	NC_012848	GTT	2	6	674405	674410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113593
13237	NC_012848	CGTG	2	8	674422	674429	0 %	25 %	50 %	25 %	241113593
13238	NC_012848	ATC	2	6	674441	674446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113593
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13246	NC_012848	CGG	2	6	674715	674720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113593
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13254	NC_012848	CAT	2	6	675034	675039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113594
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13342	NC_012848	CGA	2	6	680096	680101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113600
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13349	NC_012848	CTG	2	6	680570	680575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113601
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13351	NC_012848	CAT	2	6	680639	680644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113601
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13353	NC_012848	ATCC	2	8	680691	680698	25 %	25 %	0 %	50 %	241113601
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13474	NC_012848	CGG	2	6	686339	686344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113610
13475	NC_012848	GGC	2	6	686346	686351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113610
13476	NC_012848	AAC	2	6	686400	686405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113610
13477	NC_012848	CGG	2	6	686408	686413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113610
13478	NC_012848	AGG	2	6	686437	686442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113610
13479	NC_012848	GTCAAC	2	12	686568	686579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113610
13480	NC_012848	TCG	2	6	686616	686621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113610
13481	NC_012848	CGG	2	6	686630	686635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113610
13482	NC_012848	GC	4	8	686686	686693	0 %	0 %	50 %	50 %	241113611
13483	NC_012848	CGA	2	6	686739	686744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13484	NC_012848	GCC	2	6	686746	686751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113611
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13486	NC_012848	GAT	2	6	686833	686838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113611
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13488	NC_012848	GACC	2	8	687048	687055	25 %	0 %	25 %	50 %	241113611
13489	NC_012848	TCG	2	6	687116	687121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13490	NC_012848	GAG	2	6	687181	687186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113611
13491	NC_012848	ACG	2	6	687196	687201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13492	NC_012848	TGCAG	2	10	687219	687228	20 %	20 %	40 %	20 %	241113611
13493	NC_012848	GCT	2	6	687320	687325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13494	NC_012848	TGC	2	6	687350	687355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13495	NC_012848	TCG	2	6	687398	687403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113611
13496	NC_012848	CAA	2	6	687429	687434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113611
13497	NC_012848	CTCTG	2	10	687446	687455	0 %	40 %	20 %	40 %	241113611
13498	NC_012848	ATC	2	6	687470	687475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113611
13499	NC_012848	GCTA	2	8	687487	687494	25 %	25 %	25 %	25 %	241113611
13500	NC_012848	GAC	2	6	687502	687507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113611

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