MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012848	GCA	2	6	637898	637903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113560
12502	NC_012848	GGT	2	6	637918	637923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113560
12503	NC_012848	GTTTCC	2	12	638038	638049	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113560
12504	NC_012848	ATG	2	6	638064	638069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113560
12505	NC_012848	CGT	2	6	638182	638187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113560
12506	NC_012848	GTCG	2	8	638227	638234	0 %	25 %	50 %	25 %	241113560
12507	NC_012848	GTT	2	6	638271	638276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113560
12508	NC_012848	GC	3	6	638306	638311	0 %	0 %	50 %	50 %	241113560
12509	NC_012848	CGA	2	6	638343	638348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113560
12510	NC_012848	GGC	2	6	638363	638368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113560
12511	NC_012848	GCA	3	9	638393	638401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113560
12512	NC_012848	ATC	2	6	638498	638503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113560
12513	NC_012848	CGAC	2	8	638533	638540	25 %	0 %	25 %	50 %	241113560
12514	NC_012848	GGC	2	6	638611	638616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113560
12515	NC_012848	TCG	2	6	638637	638642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113560
12516	NC_012848	GCT	2	6	638648	638653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113560
12517	NC_012848	CGG	2	6	638679	638684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113560
12518	NC_012848	GGA	2	6	639210	639215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113561
12519	NC_012848	CCATG	2	10	639227	639236	20 %	20 %	20 %	40 %	241113561
12520	NC_012848	TTG	2	6	639265	639270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113561
12521	NC_012848	CTG	2	6	639271	639276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113561
12522	NC_012848	TGA	2	6	639347	639352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113561
12523	NC_012848	CG	3	6	639402	639407	0 %	0 %	50 %	50 %	241113561
12524	NC_012848	ATT	2	6	639409	639414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113561
12525	NC_012848	CGCTGC	2	12	639506	639517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113561
12526	NC_012848	AGC	2	6	639572	639577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113561
12527	NC_012848	GGAC	2	8	639593	639600	25 %	0 %	50 %	25 %	241113561
12528	NC_012848	GCTG	2	8	639643	639650	0 %	25 %	50 %	25 %	241113561
12529	NC_012848	GGC	2	6	639697	639702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113561
12530	NC_012848	GCC	2	6	639774	639779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113561
12531	NC_012848	GGC	2	6	639794	639799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113561
12532	NC_012848	GCATC	2	10	639801	639810	20 %	20 %	20 %	40 %	241113561
12533	NC_012848	ATCGG	2	10	639838	639847	20 %	20 %	40 %	20 %	241113561
12534	NC_012848	TGA	2	6	639880	639885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113561
12535	NC_012848	TGCGCC	2	12	639958	639969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113561
12536	NC_012848	GC	3	6	639985	639990	0 %	0 %	50 %	50 %	241113561
12537	NC_012848	GGT	2	6	639995	640000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113561
12538	NC_012848	CGGC	2	8	640198	640205	0 %	0 %	50 %	50 %	241113561
12539	NC_012848	ATG	2	6	640405	640410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113562
12540	NC_012848	CGG	2	6	640478	640483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113562
12541	NC_012848	TGCG	2	8	640508	640515	0 %	25 %	50 %	25 %	241113562
12542	NC_012848	TGGG	2	8	640522	640529	0 %	25 %	75 %	0 %	241113562
12543	NC_012848	GAT	2	6	640554	640559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113562
12544	NC_012848	GC	3	6	640674	640679	0 %	0 %	50 %	50 %	241113562
12545	NC_012848	GC	3	6	640690	640695	0 %	0 %	50 %	50 %	241113562
12546	NC_012848	TTC	2	6	640700	640705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113562
12547	NC_012848	ATC	2	6	640922	640927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113563
12548	NC_012848	TTC	2	6	640963	640968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113563
12549	NC_012848	GC	3	6	640985	640990	0 %	0 %	50 %	50 %	241113563
12550	NC_012848	CGC	2	6	641015	641020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113563
12551	NC_012848	CGA	2	6	641021	641026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12552	NC_012848	CGA	2	6	641057	641062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12553	NC_012848	CGA	2	6	641065	641070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12554	NC_012848	GCT	2	6	641111	641116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12555	NC_012848	CCG	2	6	641227	641232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113563
12556	NC_012848	CGA	2	6	641243	641248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12557	NC_012848	ATCG	2	8	641250	641257	25 %	25 %	25 %	25 %	241113563
12558	NC_012848	CAC	2	6	641313	641318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113563
12559	NC_012848	CGC	2	6	641343	641348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113563
12560	NC_012848	GAT	2	6	641406	641411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113563
12561	NC_012848	GCCGA	2	10	641413	641422	20 %	0 %	40 %	40 %	241113563
12562	NC_012848	CGC	2	6	641423	641428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113563
12563	NC_012848	GCA	2	6	641508	641513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12564	NC_012848	CGA	2	6	641549	641554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12565	NC_012848	CGGC	2	8	641567	641574	0 %	0 %	50 %	50 %	241113563
12566	NC_012848	CCG	2	6	641596	641601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113563
12567	NC_012848	GTC	3	9	641640	641648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113563
12568	NC_012848	CG	3	6	641690	641695	0 %	0 %	50 %	50 %	241113563
12569	NC_012848	GCCGAC	2	12	641712	641723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113563
12570	NC_012848	TTGCC	2	10	641773	641782	0 %	40 %	20 %	40 %	241113563
12571	NC_012848	GCC	2	6	641971	641976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113563
12572	NC_012848	CCG	2	6	642043	642048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12573	NC_012848	CCT	2	6	642070	642075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113564
12574	NC_012848	CGC	2	6	642142	642147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12575	NC_012848	GAG	2	6	642152	642157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113564
12576	NC_012848	CGGC	2	8	642186	642193	0 %	0 %	50 %	50 %	241113564
12577	NC_012848	GAA	2	6	642197	642202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113564
12578	NC_012848	GTC	2	6	642209	642214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113564
12579	NC_012848	CGA	2	6	642223	642228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113564
12580	NC_012848	CGC	2	6	642253	642258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12581	NC_012848	GCC	2	6	642281	642286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12582	NC_012848	TCG	2	6	642354	642359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113564
12583	NC_012848	GCA	2	6	642387	642392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113564
12584	NC_012848	CCGAA	2	10	642565	642574	40 %	0 %	20 %	40 %	241113564
12585	NC_012848	GAC	2	6	642602	642607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113564
12586	NC_012848	TCT	2	6	642655	642660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113564
12587	NC_012848	CGG	3	9	642674	642682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113564
12588	NC_012848	GCC	2	6	642689	642694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12589	NC_012848	GCG	2	6	642723	642728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113564
12590	NC_012848	GAT	2	6	642749	642754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113564
12591	NC_012848	CTC	2	6	642794	642799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113564
12592	NC_012848	GCG	2	6	642818	642823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113564
12593	NC_012848	ATA	2	6	642827	642832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113564
12594	NC_012848	GCA	2	6	642847	642852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113564
12595	NC_012848	GAT	2	6	642950	642955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113564
12596	NC_012848	CTT	3	9	642956	642964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113564
12597	NC_012848	TGT	3	9	642982	642990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113564
12598	NC_012848	GA	3	6	643035	643040	50 %	0 %	50 %	0 %	241113564
12599	NC_012848	CGG	2	6	643063	643068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113564
12600	NC_012848	GAT	2	6	643079	643084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113564
12601	NC_012848	CCGTG	2	10	643111	643120	0 %	20 %	40 %	40 %	241113564
12602	NC_012848	TCT	2	6	643180	643185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113564
12603	NC_012848	GGC	2	6	643186	643191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113564
12604	NC_012848	TGTCG	2	10	643247	643256	0 %	40 %	40 %	20 %	241113564
12605	NC_012848	CGC	2	6	643273	643278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12606	NC_012848	CGC	2	6	643303	643308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113564
12607	NC_012848	GCCC	2	8	643315	643322	0 %	0 %	25 %	75 %	241113564
12608	NC_012848	GAA	2	6	643340	643345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113564
12609	NC_012848	GGC	2	6	643437	643442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113565
12610	NC_012848	GCC	2	6	643527	643532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113565
12611	NC_012848	GC	3	6	643592	643597	0 %	0 %	50 %	50 %	241113565
12612	NC_012848	TGA	2	6	643676	643681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113565
12613	NC_012848	CCG	2	6	643754	643759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113565
12614	NC_012848	CAG	2	6	643770	643775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113565
12615	NC_012848	A	6	6	643787	643792	100 %	0 %	0 %	0 %	241113565
12616	NC_012848	GCCG	2	8	643793	643800	0 %	0 %	50 %	50 %	241113565
12617	NC_012848	GCC	2	6	643815	643820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113565
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12619	NC_012848	CG	3	6	643838	643843	0 %	0 %	50 %	50 %	241113565
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12854	NC_012848	CGG	4	12	654994	655005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113576
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12860	NC_012848	CG	3	6	655251	655256	0 %	0 %	50 %	50 %	241113576
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12975	NC_012848	GGCT	2	8	661221	661228	0 %	25 %	50 %	25 %	241113582
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