MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012848	GATAA	2	10	539533	539542	60 %	20 %	20 %	0 %	241113476
10502	NC_012848	GCC	2	6	539546	539551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113476
10503	NC_012848	CGG	2	6	539562	539567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113476
10504	NC_012848	CAG	2	6	539569	539574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10505	NC_012848	GCC	2	6	539601	539606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113476
10506	NC_012848	TTC	2	6	539615	539620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113476
10507	NC_012848	TCC	2	6	539624	539629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113476
10508	NC_012848	CGC	2	6	539659	539664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113476
10509	NC_012848	GAA	2	6	539686	539691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113476
10510	NC_012848	GCC	2	6	539698	539703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113476
10511	NC_012848	TCT	2	6	539718	539723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113476
10512	NC_012848	GCC	2	6	539819	539824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113476
10513	NC_012848	GGC	2	6	539831	539836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113476
10514	NC_012848	CTG	2	6	539840	539845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10515	NC_012848	GTC	2	6	539894	539899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10516	NC_012848	ATC	2	6	539981	539986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113476
10517	NC_012848	CGA	2	6	540048	540053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10518	NC_012848	CGA	2	6	540081	540086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10519	NC_012848	CGA	2	6	540093	540098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10520	NC_012848	CCTG	2	8	540099	540106	0 %	25 %	25 %	50 %	241113476
10521	NC_012848	CATC	2	8	540159	540166	25 %	25 %	0 %	50 %	241113476
10522	NC_012848	CGG	2	6	540223	540228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113476
10523	NC_012848	CAC	2	6	540259	540264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113476
10524	NC_012848	CAC	2	6	540269	540274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113476
10525	NC_012848	CAC	2	6	540316	540321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113476
10526	NC_012848	TCGG	2	8	540329	540336	0 %	25 %	50 %	25 %	241113476
10527	NC_012848	CGCC	2	8	540342	540349	0 %	0 %	25 %	75 %	241113476
10528	NC_012848	GAA	2	6	540367	540372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113476
10529	NC_012848	GCA	2	6	540411	540416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10530	NC_012848	CCA	2	6	540418	540423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113476
10531	NC_012848	GCA	2	6	540441	540446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113476
10532	NC_012848	GCGG	2	8	540500	540507	0 %	0 %	75 %	25 %	241113477
10533	NC_012848	CGC	2	6	540520	540525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113477
10534	NC_012848	CGA	2	6	540547	540552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113477
10535	NC_012848	GTC	2	6	540575	540580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113477
10536	NC_012848	AG	3	6	540657	540662	50 %	0 %	50 %	0 %	241113477
10537	NC_012848	CCT	2	6	540667	540672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113477
10538	NC_012848	CG	3	6	540673	540678	0 %	0 %	50 %	50 %	241113477
10539	NC_012848	ACC	2	6	540837	540842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113477
10540	NC_012848	CAG	2	6	540860	540865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113477
10541	NC_012848	AGCCC	2	10	540878	540887	20 %	0 %	20 %	60 %	241113477
10542	NC_012848	CCA	2	6	540899	540904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113477
10543	NC_012848	CAC	2	6	540920	540925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113477
10544	NC_012848	TCA	2	6	540958	540963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113477
10545	NC_012848	GCC	2	6	541002	541007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113478
10546	NC_012848	CAG	2	6	541021	541026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10547	NC_012848	GCG	2	6	541038	541043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113478
10548	NC_012848	CGG	2	6	541053	541058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113478
10549	NC_012848	TCGA	2	8	541136	541143	25 %	25 %	25 %	25 %	241113478
10550	NC_012848	GCC	3	9	541186	541194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113478
10551	NC_012848	GAC	2	6	541198	541203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10552	NC_012848	CGT	2	6	541263	541268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10553	NC_012848	CAG	2	6	541285	541290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10554	NC_012848	CGT	2	6	541300	541305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10555	NC_012848	GACCAC	2	12	541330	541341	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113478
10556	NC_012848	GTG	2	6	541351	541356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113478
10557	NC_012848	CCG	2	6	541371	541376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113478
10558	NC_012848	GC	3	6	541424	541429	0 %	0 %	50 %	50 %	241113478
10559	NC_012848	CTCG	2	8	541501	541508	0 %	25 %	25 %	50 %	241113478
10560	NC_012848	GCC	2	6	541531	541536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113478
10561	NC_012848	ATCG	2	8	541607	541614	25 %	25 %	25 %	25 %	241113478
10562	NC_012848	CTG	2	6	541616	541621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10563	NC_012848	GAA	2	6	541624	541629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113478
10564	NC_012848	CGA	2	6	541647	541652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10565	NC_012848	ACC	2	6	541694	541699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113478
10566	NC_012848	CTG	2	6	541703	541708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10567	NC_012848	CG	3	6	541712	541717	0 %	0 %	50 %	50 %	241113478
10568	NC_012848	GTC	2	6	541744	541749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10569	NC_012848	TTC	2	6	541771	541776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113478
10570	NC_012848	GCT	2	6	541824	541829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113478
10571	NC_012848	GC	3	6	541837	541842	0 %	0 %	50 %	50 %	241113478
10572	NC_012848	CGTC	2	8	541893	541900	0 %	25 %	25 %	50 %	241113478
10573	NC_012848	CCA	2	6	541934	541939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113479
10574	NC_012848	GTG	2	6	541972	541977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113479
10575	NC_012848	CGT	2	6	542024	542029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113479
10576	NC_012848	TCA	2	6	542047	542052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113479
10577	NC_012848	CACC	2	8	542132	542139	25 %	0 %	0 %	75 %	241113479
10578	NC_012848	GCA	2	6	542141	542146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113479
10579	NC_012848	CCA	2	6	542201	542206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113479
10580	NC_012848	CGG	2	6	542295	542300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113479
10581	NC_012848	CGC	2	6	542306	542311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113479
10582	NC_012848	ATG	2	6	542347	542352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113479
10583	NC_012848	TCG	2	6	542368	542373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113479
10584	NC_012848	GCG	2	6	542480	542485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113479
10585	NC_012848	GCC	2	6	542502	542507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113479
10586	NC_012848	CTC	2	6	542523	542528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113479
10587	NC_012848	AGC	2	6	542539	542544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113479
10588	NC_012848	GC	3	6	542564	542569	0 %	0 %	50 %	50 %	241113479
10589	NC_012848	CTG	2	6	542613	542618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113479
10590	NC_012848	GCC	2	6	542637	542642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113479
10591	NC_012848	CGGC	2	8	542675	542682	0 %	0 %	50 %	50 %	241113479
10592	NC_012848	CCA	2	6	542780	542785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113479
10593	NC_012848	AGC	2	6	542803	542808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113479
10594	NC_012848	GAG	3	9	542811	542819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113479
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10598	NC_012848	CGG	2	6	543055	543060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113480
10599	NC_012848	CAG	2	6	543112	543117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10600	NC_012848	ACG	2	6	543158	543163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10601	NC_012848	ACC	2	6	543275	543280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113480
10602	NC_012848	GTC	2	6	543286	543291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10603	NC_012848	TCA	2	6	543317	543322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113480
10604	NC_012848	AGT	2	6	543327	543332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113480
10605	NC_012848	GTTG	2	8	543381	543388	0 %	50 %	50 %	0 %	241113480
10606	NC_012848	CTG	2	6	543413	543418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10607	NC_012848	GAG	2	6	543445	543450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113480
10608	NC_012848	CGG	2	6	543474	543479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113480
10609	NC_012848	AGC	2	6	543485	543490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10610	NC_012848	CAT	2	6	543514	543519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113480
10611	NC_012848	CGC	2	6	543628	543633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113480
10612	NC_012848	GAC	2	6	543676	543681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10613	NC_012848	TCG	2	6	543707	543712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113480
10614	NC_012848	CTT	2	6	543715	543720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113480
10615	NC_012848	CGTG	2	8	543813	543820	0 %	25 %	50 %	25 %	241113480
10616	NC_012848	CTT	2	6	543862	543867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113480
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10618	NC_012848	TCG	3	9	543914	543922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113480
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10648	NC_012848	TCA	2	6	544962	544967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113481
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10855	NC_012848	GAT	2	6	558465	558470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113490
10856	NC_012848	GTG	2	6	558471	558476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113490
10857	NC_012848	CGC	2	6	558477	558482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113490
10858	NC_012848	GCGGA	2	10	558531	558540	20 %	0 %	60 %	20 %	241113490
10859	NC_012848	ATC	2	6	558549	558554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113490
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10861	NC_012848	GC	3	6	558738	558743	0 %	0 %	50 %	50 %	241113490
10862	NC_012848	GCAG	2	8	558752	558759	25 %	0 %	50 %	25 %	241113490
10863	NC_012848	GGCG	2	8	558764	558771	0 %	0 %	75 %	25 %	241113490
10864	NC_012848	GACCG	2	10	558863	558872	20 %	0 %	40 %	40 %	241113490
10865	NC_012848	CGG	2	6	558924	558929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113490
10866	NC_012848	TCG	2	6	558966	558971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113490
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10868	NC_012848	CAG	2	6	558987	558992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113490
10869	NC_012848	GCT	2	6	559094	559099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113490
10870	NC_012848	CG	3	6	559109	559114	0 %	0 %	50 %	50 %	241113490
10871	NC_012848	CGGCAT	2	12	559118	559129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113490
10872	NC_012848	CGT	2	6	559130	559135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113490
10873	NC_012848	TCG	2	6	559140	559145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113490
10874	NC_012848	GGCGA	2	10	559221	559230	20 %	0 %	60 %	20 %	241113490
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10876	NC_012848	CGG	2	6	559268	559273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113490
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10879	NC_012848	CTGG	2	8	559382	559389	0 %	25 %	50 %	25 %	241113491
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10883	NC_012848	CTG	2	6	559552	559557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113491
10884	NC_012848	TCG	2	6	559559	559564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113491
10885	NC_012848	GTCG	2	8	559578	559585	0 %	25 %	50 %	25 %	241113491
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10964	NC_012848	CGGC	2	8	563113	563120	0 %	0 %	50 %	50 %	241113494
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