MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012848	CCAA	2	8	515969	515976	50 %	0 %	0 %	50 %	241113452
10002	NC_012848	GCT	2	6	516055	516060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113452
10003	NC_012848	CGG	2	6	516072	516077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113452
10004	NC_012848	GGA	2	6	516085	516090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113452
10005	NC_012848	ATC	3	9	516335	516343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113453
10006	NC_012848	GCG	2	6	516400	516405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113453
10007	NC_012848	TGG	2	6	516414	516419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113453
10008	NC_012848	CGA	2	6	516448	516453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113453
10009	NC_012848	AGC	2	6	516651	516656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113454
10010	NC_012848	GAA	2	6	516657	516662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113454
10011	NC_012848	GAT	2	6	516692	516697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113454
10012	NC_012848	CGGGA	2	10	516701	516710	20 %	0 %	60 %	20 %	241113454
10013	NC_012848	ATC	2	6	516751	516756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113454
10014	NC_012848	CAGC	2	8	516767	516774	25 %	0 %	25 %	50 %	241113454
10015	NC_012848	GCG	2	6	516830	516835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113454
10016	NC_012848	GAA	2	6	516875	516880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113454
10017	NC_012848	GGA	2	6	516951	516956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113454
10018	NC_012848	GCC	2	6	516979	516984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113454
10019	NC_012848	AGC	2	6	516990	516995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113454
10020	NC_012848	GCAG	2	8	517390	517397	25 %	0 %	50 %	25 %	241113455
10021	NC_012848	TCG	2	6	517402	517407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113455
10022	NC_012848	GCA	2	6	517430	517435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113455
10023	NC_012848	CTTC	2	8	517487	517494	0 %	50 %	0 %	50 %	241113455
10024	NC_012848	GAG	2	6	517531	517536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113455
10025	NC_012848	CAT	2	6	517542	517547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113455
10026	NC_012848	TTG	2	6	517564	517569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113455
10027	NC_012848	CCGG	2	8	517587	517594	0 %	0 %	50 %	50 %	241113455
10028	NC_012848	TCT	2	6	517595	517600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113455
10029	NC_012848	CGA	3	9	517605	517613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113455
10030	NC_012848	GCCGC	2	10	517719	517728	0 %	0 %	40 %	60 %	241113456
10031	NC_012848	GAC	3	9	517740	517748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113456
10032	NC_012848	TCGG	2	8	517816	517823	0 %	25 %	50 %	25 %	241113456
10033	NC_012848	GCC	2	6	517912	517917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113456
10034	NC_012848	GCG	2	6	517963	517968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113456
10035	NC_012848	GCT	3	9	517992	518000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113456
10036	NC_012848	CGG	2	6	518006	518011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113456
10037	NC_012848	CGT	2	6	518038	518043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113456
10038	NC_012848	GCC	2	6	518044	518049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113456
10039	NC_012848	CAT	3	9	518199	518207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113457
10040	NC_012848	GC	3	6	518213	518218	0 %	0 %	50 %	50 %	241113457
10041	NC_012848	GAC	2	6	518278	518283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113457
10042	NC_012848	CGA	2	6	518286	518291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113457
10043	NC_012848	GCAC	2	8	518374	518381	25 %	0 %	25 %	50 %	241113457
10044	NC_012848	CATTG	2	10	518429	518438	20 %	40 %	20 %	20 %	241113457
10045	NC_012848	CAT	2	6	518717	518722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113458
10046	NC_012848	GGT	2	6	518726	518731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113458
10047	NC_012848	ACG	2	6	518737	518742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113458
10048	NC_012848	CCA	2	6	518989	518994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113459
10049	NC_012848	CG	4	8	519042	519049	0 %	0 %	50 %	50 %	241113459
10050	NC_012848	GCC	2	6	519073	519078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113459
10051	NC_012848	GAG	2	6	519100	519105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113459
10052	NC_012848	GCA	2	6	519112	519117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113459
10053	NC_012848	GCC	2	6	519127	519132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113459
10054	NC_012848	CAA	2	6	519150	519155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113459
10055	NC_012848	GA	3	6	519156	519161	50 %	0 %	50 %	0 %	241113459
10056	NC_012848	CGA	2	6	519174	519179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113459
10057	NC_012848	GCC	2	6	519199	519204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113459
10058	NC_012848	CGG	2	6	520822	520827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113460
10059	NC_012848	ATC	2	6	520865	520870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113460
10060	NC_012848	CGA	2	6	520929	520934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113460
10061	NC_012848	CAG	2	6	520948	520953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113460
10062	NC_012848	GTCT	2	8	520999	521006	0 %	50 %	25 %	25 %	241113460
10063	NC_012848	CGG	2	6	521103	521108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113460
10064	NC_012848	CGC	2	6	521139	521144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113460
10065	NC_012848	AGGCG	2	10	521169	521178	20 %	0 %	60 %	20 %	241113460
10066	NC_012848	CGC	2	6	521209	521214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113460
10067	NC_012848	GTC	2	6	521230	521235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113460
10068	NC_012848	CGGCG	2	10	521298	521307	0 %	0 %	60 %	40 %	241113460
10069	NC_012848	GTG	2	6	521311	521316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113460
10070	NC_012848	GAT	2	6	521319	521324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113460
10071	NC_012848	AGG	2	6	521381	521386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113460
10072	NC_012848	GAT	2	6	521431	521436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113460
10073	NC_012848	GGCG	2	8	521454	521461	0 %	0 %	75 %	25 %	241113460
10074	NC_012848	GAA	2	6	521491	521496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113460
10075	NC_012848	GAT	2	6	521527	521532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113460
10076	NC_012848	GTTC	2	8	521565	521572	0 %	50 %	25 %	25 %	241113460
10077	NC_012848	GCG	3	9	521588	521596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113460
10078	NC_012848	GCC	2	6	521597	521602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113460
10079	NC_012848	GCC	2	6	521641	521646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113460
10080	NC_012848	GGC	2	6	521656	521661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113460
10081	NC_012848	T	6	6	521932	521937	0 %	100 %	0 %	0 %	241113461
10082	NC_012848	CAT	2	6	521943	521948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113461
10083	NC_012848	GGCC	2	8	521961	521968	0 %	0 %	50 %	50 %	241113461
10084	NC_012848	CTT	2	6	521980	521985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113461
10085	NC_012848	CGG	2	6	522095	522100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113461
10086	NC_012848	GTT	2	6	522129	522134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113461
10087	NC_012848	CGT	2	6	522141	522146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113461
10088	NC_012848	GTCG	2	8	522213	522220	0 %	25 %	50 %	25 %	241113461
10089	NC_012848	CGTTGC	2	12	522237	522248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113461
10090	NC_012848	ACC	2	6	522259	522264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113461
10091	NC_012848	AAG	2	6	522274	522279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113461
10092	NC_012848	TC	3	6	522315	522320	0 %	50 %	0 %	50 %	241113461
10093	NC_012848	ACA	2	6	522455	522460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113461
10094	NC_012848	CAA	2	6	522480	522485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113461
10095	NC_012848	GCC	2	6	522520	522525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113461
10096	NC_012848	CCT	2	6	522575	522580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113461
10097	NC_012848	CTG	2	6	522590	522595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113461
10098	NC_012848	GC	3	6	522644	522649	0 %	0 %	50 %	50 %	241113461
10099	NC_012848	CGATG	2	10	522654	522663	20 %	20 %	40 %	20 %	241113461
10100	NC_012848	AAG	2	6	522736	522741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113461
10101	NC_012848	TGAA	2	8	522832	522839	50 %	25 %	25 %	0 %	241113462
10102	NC_012848	GAA	2	6	522921	522926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113462
10103	NC_012848	TCA	2	6	522965	522970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113462
10104	NC_012848	GCTG	2	8	523010	523017	0 %	25 %	50 %	25 %	241113462
10105	NC_012848	GC	3	6	523027	523032	0 %	0 %	50 %	50 %	241113462
10106	NC_012848	ATC	2	6	523081	523086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113462
10107	NC_012848	TCCGG	2	10	523193	523202	0 %	20 %	40 %	40 %	241113462
10108	NC_012848	GGGCA	2	10	523261	523270	20 %	0 %	60 %	20 %	241113462
10109	NC_012848	TCAA	2	8	523322	523329	50 %	25 %	0 %	25 %	241113462
10110	NC_012848	CGT	2	6	523422	523427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113462
10111	NC_012848	GCT	3	9	523446	523454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113462
10112	NC_012848	GGCG	2	8	523455	523462	0 %	0 %	75 %	25 %	241113462
10113	NC_012848	TCT	2	6	523463	523468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113462
10114	NC_012848	TCA	2	6	523475	523480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113462
10115	NC_012848	GAG	2	6	523621	523626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113462
10116	NC_012848	CGC	2	6	523631	523636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113462
10117	NC_012848	GGC	2	6	523645	523650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113462
10118	NC_012848	CAT	2	6	523743	523748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113462
10119	NC_012848	GCT	2	6	523776	523781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113462
10120	NC_012848	GGC	2	6	523813	523818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113462
10121	NC_012848	AAG	2	6	523960	523965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113462
10122	NC_012848	AGG	2	6	523976	523981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113462
10123	NC_012848	GGTC	2	8	524013	524020	0 %	25 %	50 %	25 %	241113462
10124	NC_012848	ATC	2	6	524036	524041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113462
10125	NC_012848	GCA	3	9	524064	524072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113462
10126	NC_012848	CG	3	6	524089	524094	0 %	0 %	50 %	50 %	241113462
10127	NC_012848	CGA	2	6	524124	524129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113462
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10130	NC_012848	TCG	2	6	524285	524290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113462
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10132	NC_012848	CCA	2	6	524474	524479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113463
10133	NC_012848	GTC	3	9	524491	524499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
10134	NC_012848	CGG	3	9	524502	524510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113463
10135	NC_012848	TCA	2	6	524567	524572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113463
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10138	NC_012848	GGC	2	6	524734	524739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113463
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10140	NC_012848	TGC	2	6	524841	524846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
10141	NC_012848	GTG	2	6	524872	524877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113463
10142	NC_012848	GAA	2	6	524950	524955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113463
10143	NC_012848	GCG	2	6	524969	524974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113463
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10146	NC_012848	GGCG	2	8	525016	525023	0 %	0 %	75 %	25 %	241113463
10147	NC_012848	TGC	2	6	525074	525079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
10148	NC_012848	TGC	2	6	525081	525086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
10149	NC_012848	CGG	2	6	525087	525092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113463
10150	NC_012848	GGCC	2	8	525117	525124	0 %	0 %	50 %	50 %	241113463
10151	NC_012848	GAG	3	9	525268	525276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113463
10152	NC_012848	GCT	2	6	525330	525335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
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10154	NC_012848	GCG	2	6	525482	525487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113463
10155	NC_012848	CTG	2	6	525514	525519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
10156	NC_012848	GCT	2	6	525552	525557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113463
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10189	NC_012848	TCAGCC	2	12	526807	526818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113465
10190	NC_012848	CGC	2	6	526862	526867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113465
10191	NC_012848	TGAT	3	12	526901	526912	25 %	50 %	25 %	0 %	241113465
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10196	NC_012848	TGCAC	2	10	527200	527209	20 %	20 %	20 %	40 %	241113466
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10200	NC_012848	TCA	2	6	527315	527320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113466
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10208	NC_012848	GCCT	2	8	527707	527714	0 %	25 %	25 %	50 %	241113466
10209	NC_012848	AGG	2	6	527858	527863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113466
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10215	NC_012848	TGC	2	6	528075	528080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113467
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10221	NC_012848	GGA	2	6	528319	528324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113467
10222	NC_012848	GAT	2	6	528352	528357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113467
10223	NC_012848	CACCTC	2	12	528376	528387	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	241113467
10224	NC_012848	TC	3	6	528393	528398	0 %	50 %	0 %	50 %	241113467
10225	NC_012848	ACG	2	6	528419	528424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113467
10226	NC_012848	ATA	2	6	528427	528432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113467
10227	NC_012848	GGC	2	6	528468	528473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113467
10228	NC_012848	GCC	2	6	528493	528498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113467
10229	NC_012848	GAT	2	6	528541	528546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113467
10230	NC_012848	GAC	2	6	528547	528552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113467
10231	NC_012848	TCC	3	9	528563	528571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113467
10232	NC_012848	GCCGC	2	10	528576	528585	0 %	0 %	40 %	60 %	241113467
10233	NC_012848	AGG	2	6	528606	528611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113467
10234	NC_012848	GCC	2	6	528639	528644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113467
10235	NC_012848	GGT	2	6	528804	528809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113467
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10356	NC_012848	ACG	2	6	533612	533617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113471
10357	NC_012848	CCAG	2	8	533736	533743	25 %	0 %	25 %	50 %	241113471
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10470	NC_012848	ATCGG	2	10	538371	538380	20 %	20 %	40 %	20 %	241113475
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10472	NC_012848	AGC	3	9	538509	538517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10473	NC_012848	CAC	2	6	538529	538534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113475
10474	NC_012848	CGCGAC	2	12	538562	538573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113475
10475	NC_012848	CCA	2	6	538586	538591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113475
10476	NC_012848	TGC	2	6	538642	538647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10477	NC_012848	GTC	3	9	538679	538687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10478	NC_012848	GA	3	6	538782	538787	50 %	0 %	50 %	0 %	241113475
10479	NC_012848	GCCC	2	8	538813	538820	0 %	0 %	25 %	75 %	241113475
10480	NC_012848	GAC	2	6	538844	538849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10481	NC_012848	CGC	2	6	538855	538860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113475
10482	NC_012848	CAG	2	6	538879	538884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10483	NC_012848	CAG	3	9	538904	538912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10484	NC_012848	CAG	2	6	538940	538945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10485	NC_012848	AGC	2	6	538956	538961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10486	NC_012848	ATG	2	6	538995	539000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113475
10487	NC_012848	AGC	2	6	539031	539036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
10488	NC_012848	TCGG	2	8	539046	539053	0 %	25 %	50 %	25 %	241113475
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10491	NC_012848	GAT	2	6	539207	539212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113475
10492	NC_012848	CGA	2	6	539230	539235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113475
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10497	NC_012848	CGGC	2	8	539434	539441	0 %	0 %	50 %	50 %	241113475
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10499	NC_012848	GCC	3	9	539495	539503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113476
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