MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012848	TCG	2	6	467497	467502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113420
9002	NC_012848	TGC	2	6	467503	467508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113420
9003	NC_012848	GC	3	6	467507	467512	0 %	0 %	50 %	50 %	241113420
9004	NC_012848	CGGG	2	8	467513	467520	0 %	0 %	75 %	25 %	241113420
9005	NC_012848	GC	3	6	467533	467538	0 %	0 %	50 %	50 %	241113420
9006	NC_012848	TCG	2	6	467572	467577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113420
9007	NC_012848	CGC	2	6	467593	467598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113420
9008	NC_012848	CAT	2	6	467606	467611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113420
9009	NC_012848	GGC	2	6	467640	467645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113420
9010	NC_012848	GTC	2	6	467646	467651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113420
9011	NC_012848	TGG	2	6	467666	467671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113420
9012	NC_012848	GTC	2	6	467676	467681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113420
9013	NC_012848	CCG	2	6	467695	467700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113420
9014	NC_012848	ATC	2	6	467853	467858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113420
9015	NC_012848	GGCC	2	8	467867	467874	0 %	0 %	50 %	50 %	241113420
9016	NC_012848	GCC	2	6	467913	467918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113420
9017	NC_012848	CGG	2	6	467967	467972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113420
9018	NC_012848	GGC	2	6	467998	468003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113421
9019	NC_012848	CAGG	2	8	468029	468036	25 %	0 %	50 %	25 %	241113421
9020	NC_012848	TTCC	2	8	468155	468162	0 %	50 %	0 %	50 %	241113421
9021	NC_012848	GATCGC	2	12	468163	468174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9022	NC_012848	CGG	2	6	468193	468198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113421
9023	NC_012848	TCG	2	6	468228	468233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9024	NC_012848	GCT	2	6	468253	468258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9025	NC_012848	TG	3	6	468316	468321	0 %	50 %	50 %	0 %	241113421
9026	NC_012848	GTC	2	6	468350	468355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9027	NC_012848	GC	3	6	468410	468415	0 %	0 %	50 %	50 %	241113421
9028	NC_012848	CTT	2	6	468418	468423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113421
9029	NC_012848	TTC	2	6	468434	468439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113421
9030	NC_012848	CGT	2	6	468460	468465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9031	NC_012848	GCT	2	6	468505	468510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9032	NC_012848	CTT	2	6	468517	468522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113421
9033	NC_012848	GAT	2	6	468526	468531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113421
9034	NC_012848	CTT	2	6	468577	468582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113421
9035	NC_012848	CGT	2	6	468583	468588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9036	NC_012848	GGCC	2	8	468637	468644	0 %	0 %	50 %	50 %	241113421
9037	NC_012848	GCC	2	6	468689	468694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113421
9038	NC_012848	CGC	2	6	468696	468701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113421
9039	NC_012848	CTG	2	6	468731	468736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9040	NC_012848	TTC	2	6	468762	468767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113421
9041	NC_012848	TGA	2	6	468768	468773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113421
9042	NC_012848	CGA	2	6	468793	468798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113421
9043	NC_012848	GGC	2	6	468818	468823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113421
9044	NC_012848	AT	3	6	468856	468861	50 %	50 %	0 %	0 %	241113421
9045	NC_012848	CCG	2	6	468909	468914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113421
9046	NC_012848	GCCGG	2	10	469024	469033	0 %	0 %	60 %	40 %	241113422
9047	NC_012848	CGG	2	6	469076	469081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113422
9048	NC_012848	TCG	2	6	469087	469092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9049	NC_012848	CTC	2	6	469121	469126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113422
9050	NC_012848	GCCG	2	8	469133	469140	0 %	0 %	50 %	50 %	241113422
9051	NC_012848	GCT	2	6	469166	469171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9052	NC_012848	GCC	2	6	469179	469184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113422
9053	NC_012848	CCG	2	6	469271	469276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113422
9054	NC_012848	TCG	2	6	469450	469455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9055	NC_012848	GCT	2	6	469460	469465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9056	NC_012848	GGC	2	6	469487	469492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113422
9057	NC_012848	ACG	2	6	469527	469532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9058	NC_012848	TCA	3	9	469540	469548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113422
9059	NC_012848	TGA	2	6	469558	469563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113422
9060	NC_012848	CGT	2	6	469574	469579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9061	NC_012848	TCG	2	6	469603	469608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9062	NC_012848	CCG	2	6	469666	469671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113422
9063	NC_012848	CTG	2	6	469677	469682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9064	NC_012848	AT	3	6	469688	469693	50 %	50 %	0 %	0 %	241113422
9065	NC_012848	CGA	2	6	469706	469711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9066	NC_012848	GGC	2	6	469721	469726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113422
9067	NC_012848	GC	3	6	469725	469730	0 %	0 %	50 %	50 %	241113422
9068	NC_012848	GCG	2	6	469737	469742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113422
9069	NC_012848	TCT	2	6	469756	469761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113422
9070	NC_012848	CAT	2	6	469766	469771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113422
9071	NC_012848	GGTC	2	8	469889	469896	0 %	25 %	50 %	25 %	241113422
9072	NC_012848	CTG	2	6	469962	469967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113422
9073	NC_012848	TTCCTG	2	12	469983	469994	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113422
9074	NC_012848	CAC	2	6	470006	470011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113422
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9076	NC_012848	GAGT	2	8	470469	470476	25 %	25 %	50 %	0 %	241113423
9077	NC_012848	CGC	2	6	470486	470491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113423
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9085	NC_012848	CG	3	6	471286	471291	0 %	0 %	50 %	50 %	241113423
9086	NC_012848	TG	3	6	471418	471423	0 %	50 %	50 %	0 %	241113423
9087	NC_012848	A	6	6	471430	471435	100 %	0 %	0 %	0 %	241113423
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9091	NC_012848	CAA	2	6	472091	472096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113424
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9093	NC_012848	CTGGA	2	10	472155	472164	20 %	20 %	40 %	20 %	241113424
9094	NC_012848	TGG	2	6	472192	472197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113424
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9098	NC_012848	CG	3	6	472533	472538	0 %	0 %	50 %	50 %	241113424
9099	NC_012848	AGC	2	6	472607	472612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113424
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9101	NC_012848	CG	3	6	472732	472737	0 %	0 %	50 %	50 %	241113424
9102	NC_012848	GCCG	2	8	472880	472887	0 %	0 %	50 %	50 %	241113425
9103	NC_012848	GCG	2	6	472974	472979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113425
9104	NC_012848	GGC	2	6	472980	472985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113425
9105	NC_012848	GTC	2	6	473005	473010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113425
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9107	NC_012848	CGG	2	6	473106	473111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113425
9108	NC_012848	AGC	2	6	473141	473146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113425
9109	NC_012848	CGA	2	6	473193	473198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113425
9110	NC_012848	GCG	2	6	473225	473230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113425
9111	NC_012848	TCG	2	6	473268	473273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113425
9112	NC_012848	CAG	2	6	473320	473325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113425
9113	NC_012848	ACA	2	6	473411	473416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113425
9114	NC_012848	AGGCG	2	10	473425	473434	20 %	0 %	60 %	20 %	241113425
9115	NC_012848	TCG	2	6	473459	473464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113425
9116	NC_012848	CCTGA	2	10	473509	473518	20 %	20 %	20 %	40 %	241113425
9117	NC_012848	GCCG	2	8	473532	473539	0 %	0 %	50 %	50 %	241113425
9118	NC_012848	TCG	2	6	473645	473650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113425
9119	NC_012848	TCG	2	6	473685	473690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113425
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9121	NC_012848	CGG	2	6	473702	473707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113425
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9359	NC_012848	TTTTC	2	10	484503	484512	0 %	80 %	0 %	20 %	241113432
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9361	NC_012848	AGGCG	2	10	484545	484554	20 %	0 %	60 %	20 %	241113432
9362	NC_012848	TTC	2	6	484621	484626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113432
9363	NC_012848	AGA	2	6	484685	484690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113432
9364	NC_012848	GAC	2	6	484734	484739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113432
9365	NC_012848	CG	3	6	485250	485255	0 %	0 %	50 %	50 %	241113433
9366	NC_012848	CGT	2	6	485298	485303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9367	NC_012848	GCC	2	6	485308	485313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113433
9368	NC_012848	AGA	2	6	485352	485357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113433
9369	NC_012848	TGC	3	9	485423	485431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9370	NC_012848	TCG	2	6	485534	485539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9371	NC_012848	ATC	2	6	485569	485574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113433
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9373	NC_012848	GTC	2	6	485611	485616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9374	NC_012848	GCA	2	6	485680	485685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9375	NC_012848	TCG	2	6	485732	485737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
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9377	NC_012848	TGC	2	6	485798	485803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9378	NC_012848	CTG	2	6	485842	485847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9379	NC_012848	GCT	2	6	485856	485861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
9380	NC_012848	GTG	2	6	485878	485883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113433
9381	NC_012848	CGG	2	6	485902	485907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113433
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9383	NC_012848	TGA	2	6	486044	486049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113433
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9385	NC_012848	GGC	2	6	486096	486101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113433
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9393	NC_012848	GT	3	6	487639	487644	0 %	50 %	50 %	0 %	241113434
9394	NC_012848	ATGA	2	8	487653	487660	50 %	25 %	25 %	0 %	241113434
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9399	NC_012848	GGC	2	6	487848	487853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113434
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9402	NC_012848	ACGAT	2	10	488041	488050	40 %	20 %	20 %	20 %	241113434
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9405	NC_012848	GCG	2	6	488517	488522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113435
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9483	NC_012848	TCA	2	6	492333	492338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113437
9484	NC_012848	GC	3	6	492370	492375	0 %	0 %	50 %	50 %	241113437
9485	NC_012848	ATT	2	6	492455	492460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113437
9486	NC_012848	CTA	2	6	492511	492516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113437
9487	NC_012848	GGA	2	6	492574	492579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113437
9488	NC_012848	CTGG	2	8	492601	492608	0 %	25 %	50 %	25 %	241113437
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9491	NC_012848	TGC	2	6	492750	492755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113437
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