MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012848	ATGCG	2	10	349156	349165	20 %	20 %	40 %	20 %	241113308
6502	NC_012848	CGA	2	6	349183	349188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113308
6503	NC_012848	AGCG	2	8	349572	349579	25 %	0 %	50 %	25 %	241113309
6504	NC_012848	GTT	2	6	349603	349608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113309
6505	NC_012848	GA	3	6	349676	349681	50 %	0 %	50 %	0 %	241113309
6506	NC_012848	TCG	2	6	349956	349961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113310
6507	NC_012848	GGC	2	6	349990	349995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113310
6508	NC_012848	CAGGG	2	10	350104	350113	20 %	0 %	60 %	20 %	241113310
6509	NC_012848	ACC	2	6	350234	350239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113310
6510	NC_012848	TGC	2	6	350244	350249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113310
6511	NC_012848	AT	3	6	350298	350303	50 %	50 %	0 %	0 %	241113310
6512	NC_012848	CAT	2	6	350323	350328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113310
6513	NC_012848	TCA	2	6	350364	350369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113310
6514	NC_012848	GCGGA	2	10	350456	350465	20 %	0 %	60 %	20 %	241113310
6515	NC_012848	ATC	2	6	350501	350506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113310
6516	NC_012848	CGA	2	6	350599	350604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113310
6517	NC_012848	CGGC	2	8	350631	350638	0 %	0 %	50 %	50 %	241113310
6518	NC_012848	AGG	2	6	350751	350756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113310
6519	NC_012848	CG	3	6	350769	350774	0 %	0 %	50 %	50 %	241113310
6520	NC_012848	TCG	2	6	350781	350786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113310
6521	NC_012848	TGC	2	6	351241	351246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113311
6522	NC_012848	CAG	2	6	351373	351378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113311
6523	NC_012848	CGGC	2	8	351443	351450	0 %	0 %	50 %	50 %	241113311
6524	NC_012848	TGC	2	6	351493	351498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113311
6525	NC_012848	TCG	2	6	351684	351689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113312
6526	NC_012848	GCC	2	6	351722	351727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113312
6527	NC_012848	GC	3	6	351792	351797	0 %	0 %	50 %	50 %	241113312
6528	NC_012848	CAGGG	2	10	351832	351841	20 %	0 %	60 %	20 %	241113312
6529	NC_012848	ACC	2	6	351962	351967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113312
6530	NC_012848	TGC	2	6	351972	351977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113312
6531	NC_012848	AT	3	6	352026	352031	50 %	50 %	0 %	0 %	241113312
6532	NC_012848	ATC	2	6	352052	352057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113312
6533	NC_012848	CCGG	2	8	352096	352103	0 %	0 %	50 %	50 %	241113312
6534	NC_012848	GCGGA	2	10	352184	352193	20 %	0 %	60 %	20 %	241113312
6535	NC_012848	CGA	2	6	352207	352212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113312
6536	NC_012848	ATC	2	6	352229	352234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113312
6537	NC_012848	GAT	2	6	352328	352333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113312
6538	NC_012848	CGGC	2	8	352359	352366	0 %	0 %	50 %	50 %	241113312
6539	NC_012848	CG	3	6	352497	352502	0 %	0 %	50 %	50 %	241113312
6540	NC_012848	TCG	2	6	352509	352514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113312
6541	NC_012848	CGGC	2	8	352535	352542	0 %	0 %	50 %	50 %	241113312
6542	NC_012848	GCAG	2	8	352823	352830	25 %	0 %	50 %	25 %	241113313
6543	NC_012848	CCAA	2	8	352835	352842	50 %	0 %	0 %	50 %	241113313
6544	NC_012848	ATC	2	6	352876	352881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113313
6545	NC_012848	GAC	2	6	352923	352928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113313
6546	NC_012848	CTG	3	9	352999	353007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113313
6547	NC_012848	TCA	2	6	353038	353043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113313
6548	NC_012848	CGG	2	6	353076	353081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113313
6549	NC_012848	GTTC	2	8	353126	353133	0 %	50 %	25 %	25 %	241113313
6550	NC_012848	GAC	2	6	353145	353150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113313
6551	NC_012848	GTTCC	2	10	353179	353188	0 %	40 %	20 %	40 %	241113313
6552	NC_012848	GAC	2	6	353245	353250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113313
6553	NC_012848	GCCG	2	8	353290	353297	0 %	0 %	50 %	50 %	241113313
6554	NC_012848	CTT	2	6	353298	353303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113313
6555	NC_012848	GC	3	6	353315	353320	0 %	0 %	50 %	50 %	241113313
6556	NC_012848	GGA	2	6	353332	353337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113313
6557	NC_012848	TAT	2	6	353347	353352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113313
6558	NC_012848	ATGCC	2	10	353377	353386	20 %	20 %	20 %	40 %	241113313
6559	NC_012848	CCG	2	6	353450	353455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113313
6560	NC_012848	GAG	2	6	353518	353523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113313
6561	NC_012848	TGGC	2	8	353616	353623	0 %	25 %	50 %	25 %	241113313
6562	NC_012848	GC	3	6	353646	353651	0 %	0 %	50 %	50 %	241113313
6563	NC_012848	TCT	2	6	353654	353659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113313
6564	NC_012848	CGG	3	9	353660	353668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113313
6565	NC_012848	GC	3	6	353679	353684	0 %	0 %	50 %	50 %	241113313
6566	NC_012848	GAG	3	9	353722	353730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113313
6567	NC_012848	GCG	2	6	353731	353736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113313
6568	NC_012848	TCT	2	6	353894	353899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113314
6569	NC_012848	TTC	2	6	353995	354000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113314
6570	NC_012848	ATA	2	6	354184	354189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113315
6571	NC_012848	TCG	2	6	354198	354203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6572	NC_012848	CAG	2	6	354232	354237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6573	NC_012848	GCAT	2	8	354248	354255	25 %	25 %	25 %	25 %	241113315
6574	NC_012848	TCG	2	6	354266	354271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6575	NC_012848	CAG	2	6	354277	354282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6576	NC_012848	GGC	2	6	354285	354290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6577	NC_012848	TGC	2	6	354296	354301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6578	NC_012848	GC	5	10	354336	354345	0 %	0 %	50 %	50 %	241113315
6579	NC_012848	GAC	2	6	354358	354363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6580	NC_012848	GCA	2	6	354429	354434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6581	NC_012848	GC	3	6	354461	354466	0 %	0 %	50 %	50 %	241113315
6582	NC_012848	GC	3	6	354479	354484	0 %	0 %	50 %	50 %	241113315
6583	NC_012848	TGA	2	6	354488	354493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113315
6584	NC_012848	GAT	2	6	354502	354507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113315
6585	NC_012848	GCG	2	6	354578	354583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6586	NC_012848	TCG	2	6	354587	354592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6587	NC_012848	CGG	2	6	354607	354612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6588	NC_012848	GATG	2	8	354617	354624	25 %	25 %	50 %	0 %	241113315
6589	NC_012848	TCAG	2	8	354650	354657	25 %	25 %	25 %	25 %	241113315
6590	NC_012848	CCA	2	6	354666	354671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113315
6591	NC_012848	GGC	2	6	354710	354715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6592	NC_012848	GT	3	6	354815	354820	0 %	50 %	50 %	0 %	241113315
6593	NC_012848	GCC	2	6	354827	354832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113315
6594	NC_012848	CGC	2	6	354840	354845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113315
6595	NC_012848	GGC	2	6	354880	354885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6596	NC_012848	GCACG	2	10	354933	354942	20 %	0 %	40 %	40 %	241113315
6597	NC_012848	GCG	2	6	354991	354996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6598	NC_012848	GCA	3	9	355023	355031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6599	NC_012848	TCG	2	6	355091	355096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6600	NC_012848	CCG	2	6	355190	355195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113315
6601	NC_012848	TC	3	6	355236	355241	0 %	50 %	0 %	50 %	241113315
6602	NC_012848	GAT	2	6	355255	355260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113315
6603	NC_012848	GAT	2	6	355288	355293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113315
6604	NC_012848	CGG	2	6	355302	355307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6605	NC_012848	GAT	2	6	355321	355326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113315
6606	NC_012848	GCA	2	6	355392	355397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6607	NC_012848	CAG	2	6	355426	355431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6608	NC_012848	GCG	2	6	355452	355457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113315
6609	NC_012848	TC	3	6	355461	355466	0 %	50 %	0 %	50 %	241113315
6610	NC_012848	CGGC	2	8	355469	355476	0 %	0 %	50 %	50 %	241113315
6611	NC_012848	GC	3	6	355480	355485	0 %	0 %	50 %	50 %	241113315
6612	NC_012848	ACA	2	6	355539	355544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113315
6613	NC_012848	AGC	2	6	355553	355558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6614	NC_012848	ACC	2	6	355577	355582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113315
6615	NC_012848	CGA	2	6	355740	355745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113315
6616	NC_012848	GCC	2	6	355766	355771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113315
6617	NC_012848	CAT	2	6	355777	355782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113315
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6619	NC_012848	ATC	2	6	355817	355822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113315
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6621	NC_012848	CAG	2	6	355887	355892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113316
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6742	NC_012848	CG	3	6	363063	363068	0 %	0 %	50 %	50 %	241113319
6743	NC_012848	CGC	2	6	363116	363121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113319
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6745	NC_012848	TGC	2	6	363342	363347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113319
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6850	NC_012848	CCGTA	2	10	368784	368793	20 %	20 %	20 %	40 %	241113324
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6982	NC_012848	ACG	2	6	375513	375518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113331
6983	NC_012848	CGG	2	6	375542	375547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113331
6984	NC_012848	TCGGT	2	10	375607	375616	0 %	40 %	40 %	20 %	241113331
6985	NC_012848	ACG	2	6	375720	375725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113331
6986	NC_012848	GC	3	6	375736	375741	0 %	0 %	50 %	50 %	241113331
6987	NC_012848	TTC	2	6	375846	375851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113331
6988	NC_012848	CGC	2	6	375866	375871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
6989	NC_012848	CGC	2	6	375878	375883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
6990	NC_012848	TAT	2	6	375920	375925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113331
6991	NC_012848	GCC	2	6	375966	375971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
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6994	NC_012848	GGGGC	2	10	376089	376098	0 %	0 %	80 %	20 %	241113332
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7000	NC_012848	GAT	2	6	376456	376461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113332

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